data_2PF4
#
_model_server_result.job_id            ShIiBfG9aNva6zZCRiivUg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-16 05:56:21' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2pf4 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":801}' 
#
_entry.id    2PF4 
#
_exptl.entry_id    2PF4 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         115.64 
_cell.angle_beta          109.55 
_cell.angle_gamma         94.11 
_cell.entry_id            2PF4 
_cell.length_a            94.711 
_cell.length_b            105.501 
_cell.length_c            111.937 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2PF4 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? dimeric 2 author_defined_assembly 1 
? dimeric 2 author_defined_assembly 2 
? dimeric 2 author_defined_assembly 3 
? dimeric 2 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,I,J 1 1 
B,F,K,L 2 1 
C,G,M,N 3 1 
D,H,O,P 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 N N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 E SG CYS 103 E CYS 103 1_555 I ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc2 E SG CYS 111 E CYS 111 1_555 I ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? 
metalc ? metalc3 E SG CYS 113 E CYS 113 1_555 I ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc4 E SG CYS 116 E CYS 116 1_555 I ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc5 E SG CYS 138 E CYS 138 1_555 J ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc6 E SG CYS 140 E CYS 140 1_555 J ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc7 E SG CYS 143 E CYS 143 1_555 J ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc8 F SG CYS 103 F CYS 103 1_555 K ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc9 F SG CYS 111 F CYS 111 1_555 K ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc10 F SG CYS 113 F CYS 113 1_555 K ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc11 F SG CYS 116 F CYS 116 1_555 K ZN ZN . F ZN 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc12 F ND1 HIS 122 F HIS 122 1_555 L ZN ZN . F ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc13 F SG CYS 138 F CYS 138 1_555 L ZN ZN . F ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc14 F SG CYS 140 F CYS 140 1_555 L ZN ZN . F ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? 
metalc ? metalc15 F SG CYS 143 F CYS 143 1_555 L ZN ZN . F ZN 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc16 G SG CYS 103 G CYS 103 1_555 M ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc17 G SG CYS 111 G CYS 111 1_555 M ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc18 G SG CYS 113 G CYS 113 1_555 M ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc19 G SG CYS 116 G CYS 116 1_555 M ZN ZN . G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc20 G ND1 HIS 122 G HIS 122 1_555 N ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? 
metalc ? metalc21 G SG CYS 138 G CYS 138 1_555 N ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc22 G SG CYS 140 G CYS 140 1_555 N ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc23 G SG CYS 143 G CYS 143 1_555 N ZN ZN . G ZN 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc24 H SG CYS 103 H CYS 103 1_555 O ZN ZN . H ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc25 H SG CYS 111 H CYS 111 1_555 O ZN ZN . H ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc26 H SG CYS 113 H CYS 113 1_555 O ZN ZN . H ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc27 H SG CYS 116 H CYS 116 1_555 O ZN ZN . H ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? 
metalc ? metalc28 H ND1 HIS 122 H HIS 122 1_555 P ZN ZN . H ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
metalc ? metalc29 H SG CYS 138 H CYS 138 1_555 P ZN ZN . H ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc30 H SG CYS 140 H CYS 140 1_555 P ZN ZN . H ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc31 H SG CYS 143 H CYS 143 1_555 P ZN ZN . H ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2PF4 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.000759 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.004711 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009503 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0.005283 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.010847 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 3 ZN E 1 601 601 ZN ZN . 
J 3 ZN E 1 602 602 ZN ZN . 
K 3 ZN F 1 701 701 ZN ZN . 
L 3 ZN F 1 702 702 ZN ZN . 
M 3 ZN G 1 801 801 ZN ZN . 
N 3 ZN G 1 802 802 ZN ZN . 
O 3 ZN H 1 901 901 ZN ZN . 
P 3 ZN H 1 902 902 ZN ZN . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         M 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               -15.279 
_atom_site.Cartn_y               44.014 
_atom_site.Cartn_z               -9.192 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        108.45 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           801 
_atom_site.auth_asym_id          G 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              54 
_model_server_stats.parse_time_ms           14 
_model_server_stats.create_model_time_ms    27 
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_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           1 
#