data_2PY2
#
_model_server_result.job_id            KODnIs5lQ96VYCPquSD2eA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-21 12:37:33' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2py2 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":903}' 
#
_entry.id    2PY2 
#
_exptl.entry_id    2PY2 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2PY2 
_cell.length_a            31.279 
_cell.length_b            146.415 
_cell.length_c            192.406 
_cell.Z_PDB               24 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2PY2 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
? monomeric 1 author_defined_assembly 5 
? monomeric 1 author_defined_assembly 6 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,G,M 1 1 
B,H,N 2 1 
C,I,O 3 1 
D,J,P 4 1 
E,K,Q 5 1 
F,L,R 6 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 4 A CYS 4 1_555 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 32 A CYS 32 1_555 A SG CYS 125 A CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 69 A CYS 69 1_555 A SG CYS 100 A CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 89 A CYS 89 1_555 A SG CYS 111 A CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 101 A CYS 101 1_555 A SG CYS 117 A CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf6 B SG CYS 4 B CYS 4 1_555 B SG CYS 15 B CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf7 B SG CYS 32 B CYS 32 1_555 B SG CYS 125 B CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 69 B CYS 69 1_555 B SG CYS 100 B CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
disulf ? disulf9 B SG CYS 89 B CYS 89 1_555 B SG CYS 111 B CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf10 B SG CYS 101 B CYS 101 1_555 B SG CYS 117 B CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf11 C SG CYS 4 C CYS 4 1_555 C SG CYS 15 C CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf12 C SG CYS 32 C CYS 32 1_555 C SG CYS 125 C CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf13 C SG CYS 69 C CYS 69 1_555 C SG CYS 100 C CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf14 C SG CYS 89 C CYS 89 1_555 C SG CYS 111 C CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf15 C SG CYS 101 C CYS 101 1_555 C SG CYS 117 C CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf16 D SG CYS 4 D CYS 4 1_555 D SG CYS 15 D CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf17 D SG CYS 32 D CYS 32 1_555 D SG CYS 125 D CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf18 D SG CYS 69 D CYS 69 1_555 D SG CYS 100 D CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf19 D SG CYS 89 D CYS 89 1_555 D SG CYS 111 D CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf20 D SG CYS 101 D CYS 101 1_555 D SG CYS 117 D CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf21 E SG CYS 4 E CYS 4 1_555 E SG CYS 15 E CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf22 E SG CYS 32 E CYS 32 1_555 E SG CYS 125 E CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf23 E SG CYS 69 E CYS 69 1_555 E SG CYS 100 E CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
disulf ? disulf24 E SG CYS 89 E CYS 89 1_555 E SG CYS 111 E CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf25 E SG CYS 101 E CYS 101 1_555 E SG CYS 117 E CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf26 F SG CYS 4 F CYS 4 1_555 F SG CYS 15 F CYS 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf27 F SG CYS 32 F CYS 32 1_555 F SG CYS 125 F CYS 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf28 F SG CYS 69 F CYS 69 1_555 F SG CYS 100 F CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf29 F SG CYS 89 F CYS 89 1_555 F SG CYS 111 F CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
disulf ? disulf30 F SG CYS 101 F CYS 101 1_555 F SG CYS 117 F CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 92 A GLN 92 1_555 G CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 94 A ASP 94 1_555 G CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 99 A GLU 99 1_555 G CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASN 113 A ASN 113 1_555 G CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? 
metalc ? metalc5 A O ASP 114 A ASP 114 1_555 G CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASP 114 A ASP 114 1_555 G CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc7 G CA CA . A CA 901 1_555 M O HOH . A HOH 937 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLN 92 B GLN 92 1_555 H CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? 
metalc ? metalc9 B OD2 ASP 94 B ASP 94 1_555 H CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? 
metalc ? metalc10 B OE1 GLU 99 B GLU 99 1_555 H CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? 
metalc ? metalc11 B OD1 ASN 113 B ASN 113 1_555 H CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? 
metalc ? metalc12 B O ASP 114 B ASP 114 1_555 H CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASP 114 B ASP 114 1_555 H CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? 
metalc ? metalc14 H CA CA . B CA 902 1_555 N O HOH . B HOH 978 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.878 ? 
metalc ? metalc15 C OE1 GLN 92 C GLN 92 1_555 I CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? 
metalc ? metalc16 C OD2 ASP 94 C ASP 94 1_555 I CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? 
metalc ? metalc17 C OE1 GLU 99 C GLU 99 1_555 I CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? 
metalc ? metalc18 C OD1 ASN 113 C ASN 113 1_555 I CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc19 C O ASP 114 C ASP 114 1_555 I CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? 
metalc ? metalc20 C OD1 ASP 114 C ASP 114 1_555 I CA CA . C CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc21 I CA CA . C CA 903 1_555 O O HOH . C HOH 975 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? 
metalc ? metalc22 D OE1 GLN 92 D GLN 92 1_555 J CA CA . D CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc23 D OD2 ASP 94 D ASP 94 1_555 J CA CA . D CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? 
metalc ? metalc24 D OE1 GLU 99 D GLU 99 1_555 J CA CA . D CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? 
metalc ? metalc25 D OD1 ASN 113 D ASN 113 1_555 J CA CA . D CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc26 D O ASP 114 D ASP 114 1_555 J CA CA . D CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc27 D OD1 ASP 114 D ASP 114 1_555 J CA CA . D CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc28 J CA CA . D CA 904 1_555 P O HOH . D HOH 951 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? 
metalc ? metalc29 E OE1 GLN 92 E GLN 92 1_555 K CA CA . E CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.585 ? 
metalc ? metalc30 E OD2 ASP 94 E ASP 94 1_555 K CA CA . E CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? 
metalc ? metalc31 E OE1 GLU 99 E GLU 99 1_555 K CA CA . E CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? 
metalc ? metalc32 E OD1 ASN 113 E ASN 113 1_555 K CA CA . E CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? 
metalc ? metalc33 E O ASP 114 E ASP 114 1_555 K CA CA . E CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc34 E OD1 ASP 114 E ASP 114 1_555 K CA CA . E CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc35 K CA CA . E CA 905 1_555 Q O HOH . E HOH 932 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? 
metalc ? metalc36 F OE1 GLN 92 F GLN 92 1_555 L CA CA . F CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc37 F OD2 ASP 94 F ASP 94 1_555 L CA CA . F CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? 
metalc ? metalc38 F OE1 GLU 99 F GLU 99 1_555 L CA CA . F CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.714 ? 
metalc ? metalc39 F OD1 ASN 113 F ASN 113 1_555 L CA CA . F CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.702 ? 
metalc ? metalc40 F O ASP 114 F ASP 114 1_555 L CA CA . F CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? 
metalc ? metalc41 F OD1 ASP 114 F ASP 114 1_555 L CA CA . F CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? 
metalc ? metalc42 L CA CA . F CA 906 1_555 R O HOH . F HOH 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2PY2 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.03197 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00683 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005197 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 CA A 1 901 1 CA CA . 
H 2 CA B 1 902 2 CA CA . 
I 2 CA C 1 903 3 CA CA . 
J 2 CA D 1 904 4 CA CA . 
K 2 CA E 1 905 5 CA CA . 
L 2 CA F 1 906 6 CA CA . 
M 3 HOH A 1 902 17 HOH TIP . 
M 3 HOH A 2 903 18 HOH TIP . 
M 3 HOH A 3 904 25 HOH TIP . 
M 3 HOH A 4 905 27 HOH TIP . 
M 3 HOH A 5 906 32 HOH TIP . 
M 3 HOH A 6 907 37 HOH TIP . 
M 3 HOH A 7 908 39 HOH TIP . 
M 3 HOH A 8 909 54 HOH TIP . 
M 3 HOH A 9 910 55 HOH TIP . 
M 3 HOH A 10 911 62 HOH TIP . 
M 3 HOH A 11 912 63 HOH TIP . 
M 3 HOH A 12 913 67 HOH TIP . 
M 3 HOH A 13 914 73 HOH TIP . 
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P 3 HOH D 5 909 24 HOH TIP . 
P 3 HOH D 6 910 30 HOH TIP . 
P 3 HOH D 7 911 36 HOH TIP . 
P 3 HOH D 8 912 41 HOH TIP . 
P 3 HOH D 9 913 42 HOH TIP . 
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P 3 HOH D 13 917 53 HOH TIP . 
P 3 HOH D 14 918 56 HOH TIP . 
P 3 HOH D 15 919 78 HOH TIP . 
P 3 HOH D 16 920 96 HOH TIP . 
P 3 HOH D 17 921 99 HOH TIP . 
P 3 HOH D 18 922 104 HOH TIP . 
P 3 HOH D 19 923 107 HOH TIP . 
P 3 HOH D 20 924 110 HOH TIP . 
P 3 HOH D 21 925 111 HOH TIP . 
P 3 HOH D 22 926 115 HOH TIP . 
P 3 HOH D 23 927 120 HOH TIP . 
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P 3 HOH D 30 934 165 HOH TIP . 
P 3 HOH D 31 935 188 HOH TIP . 
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P 3 HOH D 64 968 374 HOH TIP . 
P 3 HOH D 65 969 379 HOH TIP . 
P 3 HOH D 66 970 380 HOH TIP . 
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