data_2PYL # _model_server_result.job_id qiOAzbUNECApYjfHrWcNHA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-29 11:20:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2pyl # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":3204}' # _entry.id 2PYL # _exptl.entry_id 2PYL _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 482.168 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2PYL _cell.length_a 58.922 _cell.length_b 78.199 _cell.length_c 157.813 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2PYL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 5 _struct_asym.id F _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A O3' DC 10 X DC 10 1_555 A P 2DA 11 X 2DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.579 ? metalc ? metalc1 C OD2 ASP 249 A ASP 249 1_555 D MG MG . A MG 3202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc2 C OD2 ASP 249 A ASP 249 1_555 E MG MG . A MG 3203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc3 C OD1 ASP 458 A ASP 458 1_555 D MG MG . A MG 3202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc ? metalc4 C OD1 ASP 458 A ASP 458 1_555 E MG MG . A MG 3203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc5 D MG MG . A MG 3202 1_555 E MG MG . A MG 3203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? metalc ? metalc6 D MG MG . A MG 3202 1_555 F O1A TTP . A TTP 3204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc7 D MG MG . A MG 3202 1_555 F O2B TTP . A TTP 3204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc8 D MG MG . A MG 3202 1_555 F O1G TTP . A TTP 3204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc9 D MG MG . A MG 3202 1_555 O O HOH . A HOH 3274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? metalc ? metalc10 D MG MG . A MG 3202 1_555 O O HOH . A HOH 3523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? metalc ? metalc11 D MG MG . A MG 3202 1_555 O O HOH . A HOH 3525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc12 E MG MG . A MG 3203 1_555 F O1A TTP . A TTP 3204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc13 E MG MG . A MG 3203 1_555 O O HOH . A HOH 3525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog1 A N1 DA 2 X DA 2 1_555 B N3 DT 13 Y DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N3 DC 3 X DC 3 1_555 B N1 DG 12 Y DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A N4 DC 3 X DC 3 1_555 B O6 DG 12 Y DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A O2 DC 3 X DC 3 1_555 B N2 DG 12 Y DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N3 DT 4 X DT 4 1_555 B N1 DA 11 Y DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O4 DT 4 X DT 4 1_555 B N6 DA 11 Y DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 DG 5 X DG 5 1_555 B N3 DC 10 Y DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 DG 5 X DG 5 1_555 B O2 DC 10 Y DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 DG 5 X DG 5 1_555 B N4 DC 10 Y DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N3 DC 6 X DC 6 1_555 B N1 DG 9 Y DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N4 DC 6 X DC 6 1_555 B O6 DG 9 Y DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O2 DC 6 X DC 6 1_555 B N2 DG 9 Y DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N3 DT 7 X DT 7 1_555 B N1 DA 8 Y DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O4 DT 7 X DT 7 1_555 B N6 DA 8 Y DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 DT 8 X DT 8 1_555 B N1 DA 7 Y DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O4 DT 8 X DT 8 1_555 B N6 DA 7 Y DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 DA 9 X DA 9 1_555 B N3 DT 6 Y DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N6 DA 9 X DA 9 1_555 B O4 DT 6 Y DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N3 DC 10 X DC 10 1_555 B N1 DG 5 Y DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N4 DC 10 X DC 10 1_555 B O6 DG 5 Y DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O2 DC 10 X DC 10 1_555 B N2 DG 5 Y DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N1 2DA 11 X 2DA 11 1_555 B N3 DT 4 Y DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N6 2DA 11 X 2DA 11 1_555 B O4 DT 4 Y DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H17 N2 O14 P3' _chem_comp.formula_weight 482.168 _chem_comp.id TTP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A TTP doub 529 n n PA O2A TTP sing 530 n n PA O3A TTP sing 531 n n PA O5' TTP sing 532 n n O2A HOA2 TTP sing 533 n n O3A PB TTP sing 534 n n PB O1B TTP doub 535 n n PB O2B TTP sing 536 n n PB O3B TTP sing 537 n n O2B HOB2 TTP sing 538 n n O3B PG TTP sing 539 n n PG O1G TTP doub 540 n n PG O2G TTP sing 541 n n PG O3G TTP sing 542 n n O2G HOG2 TTP sing 543 n n O3G HOG3 TTP sing 544 n n O5' C5' TTP sing 545 n n C5' C4' TTP sing 546 n n C5' "H5'1" TTP sing 547 n n C5' "H5'2" TTP sing 548 n n C4' O4' TTP sing 549 n n C4' C3' TTP sing 550 n n C4' H4' TTP sing 551 n n O4' C1' TTP sing 552 n n C3' O3' TTP sing 553 n n C3' C2' TTP sing 554 n n C3' H3' TTP sing 555 n n O3' HO3' TTP sing 556 n n C2' C1' TTP sing 557 n n C2' "H2'1" TTP sing 558 n n C2' "H2'2" TTP sing 559 n n C1' N1 TTP sing 560 n n C1' H1' TTP sing 561 n n N1 C2 TTP sing 562 n n N1 C6 TTP sing 563 n n C2 O2 TTP doub 564 n n C2 N3 TTP sing 565 n n N3 C4 TTP sing 566 n n N3 HN3 TTP sing 567 n n C4 O4 TTP doub 568 n n C4 C5 TTP sing 569 n n C5 C5M TTP sing 570 n n C5 C6 TTP doub 571 n n C5M HM51 TTP sing 572 n n C5M HM52 TTP sing 573 n n C5M HM53 TTP sing 574 n n C6 H6 TTP sing 575 n n # _atom_sites.entry_id 2PYL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016972 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012788 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006337 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 MG A 1 3202 3202 MG MG . E 4 MG A 1 3203 3203 MG MG . F 5 TTP A 1 3204 501 TTP TTP . G 6 EDO A 1 1001 1001 EDO EDO . H 6 EDO A 1 1002 1002 EDO EDO . I 6 EDO A 1 1003 1003 EDO EDO . J 6 EDO A 1 1004 1004 EDO EDO . K 6 EDO A 1 1005 1005 EDO EDO . L 6 EDO A 1 1006 1006 EDO EDO . M 7 HOH X 1 61 61 HOH HOH . M 7 HOH X 2 341 341 HOH HOH . M 7 HOH X 3 375 375 HOH HOH . M 7 HOH X 4 386 386 HOH HOH . M 7 HOH X 5 389 389 HOH HOH . M 7 HOH X 6 390 390 HOH HOH . M 7 HOH X 7 391 391 HOH HOH . M 7 HOH X 8 394 394 HOH HOH . M 7 HOH X 9 395 395 HOH HOH . M 7 HOH X 10 464 464 HOH HOH . M 7 HOH X 11 503 503 HOH HOH . N 7 HOH Y 1 19 19 HOH HOH . N 7 HOH Y 2 56 56 HOH HOH . N 7 HOH Y 3 94 94 HOH HOH . N 7 HOH Y 4 109 109 HOH HOH . N 7 HOH Y 5 117 117 HOH HOH . N 7 HOH Y 6 126 126 HOH HOH . N 7 HOH Y 7 146 146 HOH HOH . N 7 HOH Y 8 219 219 HOH HOH . N 7 HOH Y 9 281 281 HOH HOH . N 7 HOH Y 10 334 334 HOH HOH . N 7 HOH Y 11 335 335 HOH HOH . N 7 HOH Y 12 371 371 HOH HOH . N 7 HOH Y 13 401 401 HOH HOH . N 7 HOH Y 14 402 402 HOH HOH . N 7 HOH Y 15 403 403 HOH HOH . N 7 HOH Y 16 405 405 HOH HOH . N 7 HOH Y 17 406 406 HOH HOH . N 7 HOH Y 18 407 407 HOH HOH . N 7 HOH Y 19 408 408 HOH HOH . N 7 HOH Y 20 492 492 HOH HOH . N 7 HOH Y 21 493 493 HOH HOH . N 7 HOH Y 22 510 510 HOH HOH . N 7 HOH Y 23 511 511 HOH HOH . O 7 HOH A 1 3205 4 HOH HOH . O 7 HOH A 2 3206 7 HOH HOH . O 7 HOH A 3 3207 8 HOH HOH . O 7 HOH A 4 3208 9 HOH HOH . O 7 HOH A 5 3209 10 HOH HOH . O 7 HOH A 6 3210 12 HOH HOH . O 7 HOH A 7 3211 13 HOH HOH . O 7 HOH A 8 3212 14 HOH HOH . O 7 HOH A 9 3213 16 HOH HOH . O 7 HOH A 10 3214 17 HOH HOH . O 7 HOH A 11 3215 18 HOH HOH . O 7 HOH A 12 3216 20 HOH HOH . O 7 HOH A 13 3217 21 HOH HOH . O 7 HOH A 14 3218 23 HOH HOH . O 7 HOH A 15 3219 24 HOH HOH . O 7 HOH A 16 3220 25 HOH HOH . O 7 HOH A 17 3221 26 HOH HOH . O 7 HOH A 18 3222 27 HOH HOH . O 7 HOH A 19 3223 28 HOH HOH . O 7 HOH A 20 3224 29 HOH HOH . O 7 HOH A 21 3225 30 HOH HOH . O 7 HOH A 22 3226 32 HOH HOH . O 7 HOH A 23 3227 33 HOH HOH . O 7 HOH A 24 3228 34 HOH HOH . O 7 HOH A 25 3229 36 HOH HOH . O 7 HOH A 26 3230 37 HOH HOH . O 7 HOH A 27 3231 38 HOH HOH . O 7 HOH A 28 3232 41 HOH HOH . O 7 HOH A 29 3233 42 HOH HOH . O 7 HOH A 30 3234 44 HOH HOH . O 7 HOH A 31 3235 46 HOH HOH . O 7 HOH A 32 3236 48 HOH HOH . O 7 HOH A 33 3237 49 HOH HOH . O 7 HOH A 34 3238 50 HOH HOH . O 7 HOH A 35 3239 51 HOH HOH . O 7 HOH A 36 3240 52 HOH HOH . O 7 HOH A 37 3241 53 HOH HOH . O 7 HOH A 38 3242 54 HOH HOH . O 7 HOH A 39 3243 55 HOH HOH . O 7 HOH A 40 3244 57 HOH HOH . O 7 HOH A 41 3245 58 HOH HOH . O 7 HOH A 42 3246 59 HOH HOH . O 7 HOH A 43 3247 60 HOH HOH . O 7 HOH A 44 3248 62 HOH HOH . O 7 HOH A 45 3249 63 HOH HOH . O 7 HOH A 46 3250 64 HOH HOH . O 7 HOH A 47 3251 65 HOH HOH . O 7 HOH A 48 3252 67 HOH HOH . O 7 HOH A 49 3253 68 HOH HOH . O 7 HOH A 50 3254 70 HOH HOH . O 7 HOH A 51 3255 71 HOH HOH . O 7 HOH A 52 3256 72 HOH HOH . O 7 HOH A 53 3257 73 HOH HOH . O 7 HOH A 54 3258 74 HOH HOH . O 7 HOH A 55 3259 76 HOH HOH . O 7 HOH A 56 3260 78 HOH HOH . O 7 HOH A 57 3261 79 HOH HOH . O 7 HOH A 58 3262 80 HOH HOH . O 7 HOH A 59 3263 81 HOH HOH . O 7 HOH A 60 3264 82 HOH HOH . O 7 HOH A 61 3265 83 HOH HOH . O 7 HOH A 62 3266 84 HOH HOH . O 7 HOH A 63 3267 86 HOH HOH . O 7 HOH A 64 3268 88 HOH HOH . O 7 HOH A 65 3269 89 HOH HOH . O 7 HOH A 66 3270 90 HOH HOH . O 7 HOH A 67 3271 92 HOH HOH . O 7 HOH A 68 3272 96 HOH HOH . O 7 HOH A 69 3273 97 HOH HOH . O 7 HOH A 70 3274 100 HOH HOH . O 7 HOH A 71 3275 101 HOH HOH . O 7 HOH A 72 3276 102 HOH HOH . O 7 HOH A 73 3277 103 HOH HOH . O 7 HOH A 74 3278 104 HOH HOH . O 7 HOH A 75 3279 105 HOH HOH . O 7 HOH A 76 3280 106 HOH HOH . O 7 HOH A 77 3281 108 HOH HOH . O 7 HOH A 78 3282 111 HOH HOH . O 7 HOH A 79 3283 112 HOH HOH . O 7 HOH A 80 3284 114 HOH HOH . O 7 HOH A 81 3285 116 HOH HOH . O 7 HOH A 82 3286 118 HOH HOH . O 7 HOH A 83 3287 119 HOH HOH . O 7 HOH A 84 3288 121 HOH HOH . O 7 HOH A 85 3289 123 HOH HOH . O 7 HOH A 86 3290 124 HOH HOH . O 7 HOH A 87 3291 125 HOH HOH . O 7 HOH A 88 3292 127 HOH HOH . O 7 HOH A 89 3293 133 HOH HOH . O 7 HOH A 90 3294 134 HOH HOH . O 7 HOH A 91 3295 135 HOH HOH . O 7 HOH A 92 3296 137 HOH HOH . O 7 HOH A 93 3297 139 HOH HOH . O 7 HOH A 94 3298 141 HOH HOH . O 7 HOH A 95 3299 142 HOH HOH . O 7 HOH A 96 3300 144 HOH HOH . O 7 HOH A 97 3301 149 HOH HOH . O 7 HOH A 98 3302 151 HOH HOH . O 7 HOH A 99 3303 201 HOH HOH . O 7 HOH A 100 3304 202 HOH HOH . O 7 HOH A 101 3305 203 HOH HOH . O 7 HOH A 102 3306 204 HOH HOH . O 7 HOH A 103 3307 205 HOH HOH . O 7 HOH A 104 3308 207 HOH HOH . O 7 HOH A 105 3309 208 HOH HOH . O 7 HOH A 106 3310 209 HOH HOH . O 7 HOH A 107 3311 210 HOH HOH . O 7 HOH A 108 3312 211 HOH HOH . O 7 HOH A 109 3313 212 HOH HOH . O 7 HOH A 110 3314 213 HOH HOH . O 7 HOH A 111 3315 217 HOH HOH . O 7 HOH A 112 3316 218 HOH HOH . O 7 HOH A 113 3317 221 HOH HOH . O 7 HOH A 114 3318 222 HOH HOH . O 7 HOH A 115 3319 223 HOH HOH . O 7 HOH A 116 3320 224 HOH HOH . O 7 HOH A 117 3321 227 HOH HOH . O 7 HOH A 118 3322 228 HOH HOH . O 7 HOH A 119 3323 230 HOH HOH . O 7 HOH A 120 3324 231 HOH HOH . O 7 HOH A 121 3325 233 HOH HOH . O 7 HOH A 122 3326 235 HOH HOH . O 7 HOH A 123 3327 237 HOH HOH . O 7 HOH A 124 3328 238 HOH HOH . O 7 HOH A 125 3329 239 HOH HOH . O 7 HOH A 126 3330 240 HOH HOH . O 7 HOH A 127 3331 241 HOH HOH . O 7 HOH A 128 3332 242 HOH HOH . O 7 HOH A 129 3333 244 HOH HOH . O 7 HOH A 130 3334 246 HOH HOH . O 7 HOH A 131 3335 248 HOH HOH . O 7 HOH A 132 3336 251 HOH HOH . O 7 HOH A 133 3337 253 HOH HOH . O 7 HOH A 134 3338 254 HOH HOH . O 7 HOH A 135 3339 255 HOH HOH . O 7 HOH A 136 3340 256 HOH HOH . O 7 HOH A 137 3341 258 HOH HOH . O 7 HOH A 138 3342 259 HOH HOH . O 7 HOH A 139 3343 260 HOH HOH . O 7 HOH A 140 3344 263 HOH HOH . O 7 HOH A 141 3345 265 HOH HOH . O 7 HOH A 142 3346 267 HOH HOH . O 7 HOH A 143 3347 270 HOH HOH . O 7 HOH A 144 3348 274 HOH HOH . O 7 HOH A 145 3349 275 HOH HOH . O 7 HOH A 146 3350 278 HOH HOH . O 7 HOH A 147 3351 279 HOH HOH . O 7 HOH A 148 3352 282 HOH HOH . O 7 HOH A 149 3353 285 HOH HOH . O 7 HOH A 150 3354 286 HOH HOH . O 7 HOH A 151 3355 290 HOH HOH . O 7 HOH A 152 3356 291 HOH HOH . O 7 HOH A 153 3357 292 HOH HOH . O 7 HOH A 154 3358 293 HOH HOH . O 7 HOH A 155 3359 294 HOH HOH . O 7 HOH A 156 3360 295 HOH HOH . O 7 HOH A 157 3361 296 HOH HOH . O 7 HOH A 158 3362 297 HOH HOH . O 7 HOH A 159 3363 299 HOH HOH . O 7 HOH A 160 3364 300 HOH HOH . O 7 HOH A 161 3365 301 HOH HOH . O 7 HOH A 162 3366 302 HOH HOH . O 7 HOH A 163 3367 304 HOH HOH . O 7 HOH A 164 3368 305 HOH HOH . O 7 HOH A 165 3369 307 HOH HOH . O 7 HOH A 166 3370 308 HOH HOH . O 7 HOH A 167 3371 309 HOH HOH . O 7 HOH A 168 3372 310 HOH HOH . O 7 HOH A 169 3373 315 HOH HOH . O 7 HOH A 170 3374 318 HOH HOH . O 7 HOH A 171 3375 319 HOH HOH . O 7 HOH A 172 3376 321 HOH HOH . O 7 HOH A 173 3377 322 HOH HOH . O 7 HOH A 174 3378 323 HOH HOH . O 7 HOH A 175 3379 324 HOH HOH . O 7 HOH A 176 3380 325 HOH HOH . O 7 HOH A 177 3381 326 HOH HOH . O 7 HOH A 178 3382 327 HOH HOH . O 7 HOH A 179 3383 328 HOH HOH . O 7 HOH A 180 3384 329 HOH HOH . O 7 HOH A 181 3385 330 HOH HOH . O 7 HOH A 182 3386 332 HOH HOH . O 7 HOH A 183 3387 333 HOH HOH . O 7 HOH A 184 3388 336 HOH HOH . O 7 HOH A 185 3389 339 HOH HOH . O 7 HOH A 186 3390 342 HOH HOH . O 7 HOH A 187 3391 343 HOH HOH . O 7 HOH A 188 3392 344 HOH HOH . O 7 HOH A 189 3393 347 HOH HOH . O 7 HOH A 190 3394 350 HOH HOH . O 7 HOH A 191 3395 351 HOH HOH . O 7 HOH A 192 3396 352 HOH HOH . O 7 HOH A 193 3397 353 HOH HOH . O 7 HOH A 194 3398 354 HOH HOH . O 7 HOH A 195 3399 355 HOH HOH . O 7 HOH A 196 3400 356 HOH HOH . O 7 HOH A 197 3401 357 HOH HOH . O 7 HOH A 198 3402 358 HOH HOH . O 7 HOH A 199 3403 360 HOH HOH . O 7 HOH A 200 3404 361 HOH HOH . O 7 HOH A 201 3405 362 HOH HOH . O 7 HOH A 202 3406 363 HOH HOH . O 7 HOH A 203 3407 364 HOH HOH . O 7 HOH A 204 3408 366 HOH HOH . O 7 HOH A 205 3409 367 HOH HOH . O 7 HOH A 206 3410 369 HOH HOH . O 7 HOH A 207 3411 370 HOH HOH . O 7 HOH A 208 3412 372 HOH HOH . O 7 HOH A 209 3413 373 HOH HOH . O 7 HOH A 210 3414 374 HOH HOH . O 7 HOH A 211 3415 376 HOH HOH . O 7 HOH A 212 3416 377 HOH HOH . O 7 HOH A 213 3417 378 HOH HOH . O 7 HOH A 214 3418 379 HOH HOH . O 7 HOH A 215 3419 380 HOH HOH . O 7 HOH A 216 3420 385 HOH HOH . O 7 HOH A 217 3421 387 HOH HOH . O 7 HOH A 218 3422 388 HOH HOH . O 7 HOH A 219 3423 392 HOH HOH . O 7 HOH A 220 3424 396 HOH HOH . O 7 HOH A 221 3425 398 HOH HOH . O 7 HOH A 222 3426 400 HOH HOH . O 7 HOH A 223 3427 404 HOH HOH . O 7 HOH A 224 3428 409 HOH HOH . O 7 HOH A 225 3429 411 HOH HOH . O 7 HOH A 226 3430 412 HOH HOH . O 7 HOH A 227 3431 414 HOH HOH . O 7 HOH A 228 3432 415 HOH HOH . O 7 HOH A 229 3433 416 HOH HOH . O 7 HOH A 230 3434 417 HOH HOH . O 7 HOH A 231 3435 418 HOH HOH . O 7 HOH A 232 3436 419 HOH HOH . O 7 HOH A 233 3437 420 HOH HOH . O 7 HOH A 234 3438 421 HOH HOH . O 7 HOH A 235 3439 422 HOH HOH . O 7 HOH A 236 3440 423 HOH HOH . O 7 HOH A 237 3441 424 HOH HOH . O 7 HOH A 238 3442 425 HOH HOH . O 7 HOH A 239 3443 426 HOH HOH . O 7 HOH A 240 3444 427 HOH HOH . O 7 HOH A 241 3445 428 HOH HOH . O 7 HOH A 242 3446 429 HOH HOH . O 7 HOH A 243 3447 430 HOH HOH . O 7 HOH A 244 3448 431 HOH HOH . O 7 HOH A 245 3449 434 HOH HOH . O 7 HOH A 246 3450 435 HOH HOH . O 7 HOH A 247 3451 436 HOH HOH . O 7 HOH A 248 3452 437 HOH HOH . O 7 HOH A 249 3453 439 HOH HOH . O 7 HOH A 250 3454 440 HOH HOH . O 7 HOH A 251 3455 441 HOH HOH . O 7 HOH A 252 3456 442 HOH HOH . O 7 HOH A 253 3457 443 HOH HOH . O 7 HOH A 254 3458 444 HOH HOH . O 7 HOH A 255 3459 446 HOH HOH . O 7 HOH A 256 3460 452 HOH HOH . O 7 HOH A 257 3461 455 HOH HOH . O 7 HOH A 258 3462 456 HOH HOH . O 7 HOH A 259 3463 457 HOH HOH . O 7 HOH A 260 3464 458 HOH HOH . O 7 HOH A 261 3465 459 HOH HOH . O 7 HOH A 262 3466 460 HOH HOH . O 7 HOH A 263 3467 461 HOH HOH . O 7 HOH A 264 3468 462 HOH HOH . O 7 HOH A 265 3469 463 HOH HOH . O 7 HOH A 266 3470 465 HOH HOH . O 7 HOH A 267 3471 466 HOH HOH . O 7 HOH A 268 3472 467 HOH HOH . O 7 HOH A 269 3473 468 HOH HOH . O 7 HOH A 270 3474 469 HOH HOH . O 7 HOH A 271 3475 472 HOH HOH . O 7 HOH A 272 3476 473 HOH HOH . O 7 HOH A 273 3477 474 HOH HOH . O 7 HOH A 274 3478 475 HOH HOH . O 7 HOH A 275 3479 476 HOH HOH . O 7 HOH A 276 3480 477 HOH HOH . O 7 HOH A 277 3481 478 HOH HOH . O 7 HOH A 278 3482 479 HOH HOH . O 7 HOH A 279 3483 480 HOH HOH . O 7 HOH A 280 3484 481 HOH HOH . O 7 HOH A 281 3485 482 HOH HOH . O 7 HOH A 282 3486 483 HOH HOH . O 7 HOH A 283 3487 484 HOH HOH . O 7 HOH A 284 3488 485 HOH HOH . O 7 HOH A 285 3489 486 HOH HOH . O 7 HOH A 286 3490 487 HOH HOH . O 7 HOH A 287 3491 488 HOH HOH . O 7 HOH A 288 3492 494 HOH HOH . O 7 HOH A 289 3493 496 HOH HOH . O 7 HOH A 290 3494 497 HOH HOH . O 7 HOH A 291 3495 499 HOH HOH . O 7 HOH A 292 3496 500 HOH HOH . O 7 HOH A 293 3497 9501 HOH HOH . O 7 HOH A 294 3498 502 HOH HOH . O 7 HOH A 295 3499 504 HOH HOH . O 7 HOH A 296 3500 506 HOH HOH . O 7 HOH A 297 3501 507 HOH HOH . O 7 HOH A 298 3502 508 HOH HOH . O 7 HOH A 299 3503 509 HOH HOH . O 7 HOH A 300 3504 512 HOH HOH . O 7 HOH A 301 3505 514 HOH HOH . O 7 HOH A 302 3506 515 HOH HOH . O 7 HOH A 303 3507 517 HOH HOH . O 7 HOH A 304 3508 518 HOH HOH . O 7 HOH A 305 3509 520 HOH HOH . O 7 HOH A 306 3510 521 HOH HOH . O 7 HOH A 307 3511 522 HOH HOH . O 7 HOH A 308 3512 523 HOH HOH . O 7 HOH A 309 3513 524 HOH HOH . O 7 HOH A 310 3514 525 HOH HOH . O 7 HOH A 311 3515 526 HOH HOH . O 7 HOH A 312 3516 527 HOH HOH . O 7 HOH A 313 3517 528 HOH HOH . O 7 HOH A 314 3518 529 HOH HOH . O 7 HOH A 315 3519 530 HOH HOH . O 7 HOH A 316 3520 531 HOH HOH . O 7 HOH A 317 3521 533 HOH HOH . O 7 HOH A 318 3522 534 HOH HOH . O 7 HOH A 319 3523 535 HOH HOH . O 7 HOH A 320 3524 536 HOH HOH . O 7 HOH A 321 3525 537 HOH HOH . O 7 HOH A 322 3526 538 HOH HOH . O 7 HOH A 323 3527 539 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PA TTP . . . F 5 -25.904 1.417 -5.891 1 14.16 ? PA TTP 3204 A 1 HETATM 2 O O1A TTP . . . F 5 -26.119 0.687 -4.585 1 18.25 ? O1A TTP 3204 A 1 HETATM 3 O O2A TTP . . . F 5 -27.184 2.038 -6.376 1 14.21 ? O2A TTP 3204 A 1 HETATM 4 O O3A TTP . . . F 5 -24.812 2.57 -5.769 1 15.63 ? O3A TTP 3204 A 1 HETATM 5 P PB TTP . . . F 5 -23.354 2.394 -5.125 1 16.94 ? PB TTP 3204 A 1 HETATM 6 O O1B TTP . . . F 5 -22.303 2.426 -6.194 1 17.35 ? O1B TTP 3204 A 1 HETATM 7 O O2B TTP . . . F 5 -23.25 1.233 -4.141 1 15.3 ? O2B TTP 3204 A 1 HETATM 8 O O3B TTP . . . F 5 -23.267 3.782 -4.312 1 20 ? O3B TTP 3204 A 1 HETATM 9 P PG TTP . . . F 5 -24.196 4.119 -3.03 1 18.13 ? PG TTP 3204 A 1 HETATM 10 O O1G TTP . . . F 5 -24.608 2.855 -2.331 1 18.7 ? O1G TTP 3204 A 1 HETATM 11 O O2G TTP . . . F 5 -25.433 4.863 -3.445 1 18.55 ? O2G TTP 3204 A 1 HETATM 12 O O3G TTP . . . F 5 -23.32 4.981 -2.159 1 19.9 ? O3G TTP 3204 A 1 HETATM 13 O O5' TTP . . . F 5 -25.285 0.453 -6.996 1 11.73 ? O5' TTP 3204 A 1 HETATM 14 C C5' TTP . . . F 5 -25.269 -0.954 -6.942 1 9.84 ? C5' TTP 3204 A 1 HETATM 15 C C4' TTP . . . F 5 -24.641 -1.443 -8.245 1 9.2 ? C4' TTP 3204 A 1 HETATM 16 O O4' TTP . . . F 5 -25.515 -1.221 -9.365 1 9 ? O4' TTP 3204 A 1 HETATM 17 C C3' TTP . . . F 5 -23.353 -0.728 -8.588 1 6.46 ? C3' TTP 3204 A 1 HETATM 18 O O3' TTP . . . F 5 -22.219 -1.32 -7.969 1 6.98 ? O3' TTP 3204 A 1 HETATM 19 C C2' TTP . . . F 5 -23.313 -0.83 -10.088 1 7.38 ? C2' TTP 3204 A 1 HETATM 20 C C1' TTP . . . F 5 -24.771 -0.822 -10.511 1 5.76 ? C1' TTP 3204 A 1 HETATM 21 N N1 TTP . . . F 5 -25.102 0.544 -10.915 1 5.88 ? N1 TTP 3204 A 1 HETATM 22 C C2 TTP . . . F 5 -24.703 1 -12.181 1 3.72 ? C2 TTP 3204 A 1 HETATM 23 O O2 TTP . . . F 5 -24.112 0.222 -12.95 1 2.15 ? O2 TTP 3204 A 1 HETATM 24 N N3 TTP . . . F 5 -24.984 2.255 -12.567 1 4.77 ? N3 TTP 3204 A 1 HETATM 25 C C4 TTP . . . F 5 -25.622 3.112 -11.764 1 4.41 ? C4 TTP 3204 A 1 HETATM 26 O O4 TTP . . . F 5 -25.852 4.277 -12.133 1 5.55 ? O4 TTP 3204 A 1 HETATM 27 C C5 TTP . . . F 5 -26.033 2.667 -10.417 1 5.47 ? C5 TTP 3204 A 1 HETATM 28 C C5M TTP . . . F 5 -26.758 3.582 -9.461 1 5.65 ? C5M TTP 3204 A 1 HETATM 29 C C6 TTP . . . F 5 -25.734 1.374 -10.057 1 6.02 ? C6 TTP 3204 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 64 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 29 #