data_2RAN # _model_server_result.job_id m4XUOjVQWZnLd_1PXumfwg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 01:19:17' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2ran # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":322}' # _entry.id 2RAN # _exptl.entry_id 2RAN _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 2RAN _cell.length_a 156.9 _cell.length_b 156.9 _cell.length_c 37.03 _cell.Z_PDB 9 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2RAN _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 146 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O MET 25 A MET 26 1_555 B CA CA . A CA 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc2 A O GLY 27 A GLY 28 1_555 B CA CA . A CA 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc3 A O GLY 29 A GLY 30 1_555 B CA CA . A CA 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc4 A O LYS 67 A LYS 68 1_555 C CA CA . A CA 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 69 A GLU 70 1_555 B CA CA . A CA 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 69 A GLU 70 1_555 B CA CA . A CA 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? metalc ? metalc7 A O LEU 70 A LEU 71 1_555 C CA CA . A CA 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc8 A OE1 GLU 75 A GLU 76 1_555 C CA CA . A CA 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc9 A OE2 GLU 75 A GLU 76 1_555 C CA CA . A CA 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.989 ? metalc ? metalc10 A O LEU 97 A LEU 98 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc11 A O GLY 99 A GLY 100 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc12 A O ALA 100 A ALA 101 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? metalc ? metalc13 A O GLY 101 A GLY 102 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc14 A OG1 THR 102 A THR 103 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? metalc ? metalc15 A O VAL 139 A VAL 140 1_555 E CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 141 A ASP 142 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 141 A ASP 142 1_555 D CA CA . A CA 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? metalc ? metalc18 A O THR 142 A THR 143 1_555 E CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc19 A OE1 GLN 147 A GLN 148 1_555 E CA CA . A CA 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc20 A O GLY 180 A GLY 181 1_555 F CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc21 A O LYS 183 A LYS 184 1_555 F CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc22 A O GLY 185 A GLY 186 1_555 F CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc23 A O ASP 223 A ASP 224 1_555 G CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 223 A ASP 224 1_555 G CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.212 ? metalc ? metalc25 A OE1 GLU 225 A GLU 226 1_555 F CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc ? metalc26 A OE2 GLU 225 A GLU 226 1_555 F CA CA . A CA 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc27 A O THR 226 A THR 227 1_555 G CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc28 A OE2 GLU 231 A GLU 232 1_555 G CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.225 ? metalc ? metalc29 A OE1 GLU 231 A GLU 232 1_555 G CA CA . A CA 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc30 A O MET 256 A MET 257 1_555 H CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc31 A O LYS 257 A LYS 258 1_555 H CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc ? metalc32 A O ALA 259 A ALA 260 1_555 H CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc33 A O GLY 260 A GLY 261 1_555 H CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc34 A OD1 ASP 300 A ASP 301 1_555 H CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc35 A OD2 ASP 300 A ASP 301 1_555 H CA CA . A CA 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc36 B CA CA . A CA 320 1_555 K O HOH . A HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc37 C CA CA . A CA 321 1_555 K O HOH . A HOH 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc ? metalc38 D CA CA . A CA 322 1_555 K O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc39 E CA CA . A CA 323 1_555 K O HOH . A HOH 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc ? metalc40 E CA CA . A CA 323 1_555 K O HOH . A HOH 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc41 E CA CA . A CA 323 1_555 K O HOH . A HOH 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc42 F CA CA . A CA 324 1_555 K O HOH . A HOH 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc43 F CA CA . A CA 324 1_555 K O HOH . A HOH 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc44 G CA CA . A CA 325 1_555 K O HOH . A HOH 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc ? metalc45 G CA CA . A CA 325 1_555 K O HOH . A HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? metalc ? metalc46 H CA CA . A CA 326 1_555 K O HOH . A HOH 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2RAN _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006373 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.00368 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007359 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.027005 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 320 320 CA CA . C 2 CA A 1 321 321 CA CA . D 2 CA A 1 322 322 CA CA . E 2 CA A 1 323 323 CA CA . F 2 CA A 1 324 324 CA CA . G 2 CA A 1 325 325 CA CA . H 2 CA A 1 326 326 CA CA . I 3 SO4 A 1 327 326 SO4 SO4 . J 3 SO4 A 1 328 327 SO4 SO4 . K 4 HOH A 1 400 400 HOH HOH . K 4 HOH A 2 401 401 HOH HOH . K 4 HOH A 3 402 402 HOH HOH . K 4 HOH A 4 403 403 HOH HOH . K 4 HOH A 5 404 404 HOH HOH . K 4 HOH A 6 405 405 HOH HOH . K 4 HOH A 7 406 406 HOH HOH . K 4 HOH A 8 407 407 HOH HOH . K 4 HOH A 9 408 408 HOH HOH . K 4 HOH A 10 409 409 HOH HOH . K 4 HOH A 11 410 410 HOH HOH . K 4 HOH A 12 411 411 HOH HOH . K 4 HOH A 13 412 412 HOH HOH . K 4 HOH A 14 413 413 HOH HOH . K 4 HOH A 15 414 414 HOH HOH . K 4 HOH A 16 415 415 HOH HOH . K 4 HOH A 17 416 416 HOH HOH . K 4 HOH A 18 417 417 HOH HOH . K 4 HOH A 19 418 418 HOH HOH . K 4 HOH A 20 419 419 HOH HOH . K 4 HOH A 21 420 420 HOH HOH . K 4 HOH A 22 421 421 HOH HOH . K 4 HOH A 23 422 422 HOH HOH . K 4 HOH A 24 423 423 HOH HOH . K 4 HOH A 25 424 424 HOH HOH . K 4 HOH A 26 425 425 HOH HOH . K 4 HOH A 27 426 426 HOH HOH . K 4 HOH A 28 427 427 HOH HOH . K 4 HOH A 29 428 428 HOH HOH . K 4 HOH A 30 429 429 HOH HOH . K 4 HOH A 31 430 430 HOH HOH . K 4 HOH A 32 431 431 HOH HOH . K 4 HOH A 33 432 432 HOH HOH . K 4 HOH A 34 433 433 HOH HOH . K 4 HOH A 35 434 434 HOH HOH . K 4 HOH A 36 435 435 HOH HOH . K 4 HOH A 37 436 436 HOH HOH . K 4 HOH A 38 437 437 HOH HOH . K 4 HOH A 39 438 438 HOH HOH . K 4 HOH A 40 439 439 HOH HOH . K 4 HOH A 41 440 440 HOH HOH . K 4 HOH A 42 441 441 HOH HOH . K 4 HOH A 43 442 442 HOH HOH . K 4 HOH A 44 443 443 HOH HOH . K 4 HOH A 45 444 444 HOH HOH . K 4 HOH A 46 445 445 HOH HOH . K 4 HOH A 47 446 446 HOH HOH . K 4 HOH A 48 447 447 HOH HOH . K 4 HOH A 49 448 448 HOH HOH . K 4 HOH A 50 449 449 HOH HOH . K 4 HOH A 51 450 450 HOH HOH . K 4 HOH A 52 451 451 HOH HOH . K 4 HOH A 53 452 452 HOH HOH . K 4 HOH A 54 453 453 HOH HOH . K 4 HOH A 55 454 454 HOH HOH . K 4 HOH A 56 455 455 HOH HOH . K 4 HOH A 57 456 456 HOH HOH . K 4 HOH A 58 457 457 HOH HOH . K 4 HOH A 59 458 458 HOH HOH . K 4 HOH A 60 459 459 HOH HOH . K 4 HOH A 61 460 460 HOH HOH . K 4 HOH A 62 461 461 HOH HOH . K 4 HOH A 63 462 462 HOH HOH . K 4 HOH A 64 463 463 HOH HOH . K 4 HOH A 65 464 464 HOH HOH . K 4 HOH A 66 465 465 HOH HOH . K 4 HOH A 67 466 466 HOH HOH . K 4 HOH A 68 467 467 HOH HOH . K 4 HOH A 69 468 468 HOH HOH . K 4 HOH A 70 469 469 HOH HOH . K 4 HOH A 71 470 470 HOH HOH . K 4 HOH A 72 471 471 HOH HOH . K 4 HOH A 73 472 472 HOH HOH . K 4 HOH A 74 473 473 HOH HOH . K 4 HOH A 75 474 474 HOH HOH . K 4 HOH A 76 475 475 HOH HOH . K 4 HOH A 77 476 476 HOH HOH . K 4 HOH A 78 477 477 HOH HOH . K 4 HOH A 79 478 478 HOH HOH . K 4 HOH A 80 479 479 HOH HOH . K 4 HOH A 81 480 480 HOH HOH . K 4 HOH A 82 481 481 HOH HOH . K 4 HOH A 83 482 482 HOH HOH . K 4 HOH A 84 483 483 HOH HOH . K 4 HOH A 85 484 484 HOH HOH . K 4 HOH A 86 485 485 HOH HOH . K 4 HOH A 87 486 486 HOH HOH . K 4 HOH A 88 487 487 HOH HOH . K 4 HOH A 89 488 488 HOH HOH . K 4 HOH A 90 489 489 HOH HOH . K 4 HOH A 91 490 490 HOH HOH . K 4 HOH A 92 491 491 HOH HOH . K 4 HOH A 93 492 492 HOH HOH . K 4 HOH A 94 493 493 HOH HOH . K 4 HOH A 95 494 494 HOH HOH . K 4 HOH A 96 495 495 HOH HOH . K 4 HOH A 97 496 496 HOH HOH . K 4 HOH A 98 497 497 HOH HOH . K 4 HOH A 99 498 498 HOH HOH . K 4 HOH A 100 499 499 HOH HOH . K 4 HOH A 101 500 500 HOH HOH . K 4 HOH A 102 501 501 HOH HOH . K 4 HOH A 103 502 502 HOH HOH . K 4 HOH A 104 503 503 HOH HOH . K 4 HOH A 105 504 504 HOH HOH . K 4 HOH A 106 505 505 HOH HOH . K 4 HOH A 107 506 506 HOH HOH . K 4 HOH A 108 507 507 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 1.678 _atom_site.Cartn_y 71.832 _atom_site.Cartn_z 20.397 _atom_site.occupancy 0.82 _atom_site.B_iso_or_equiv 57.7 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 322 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 314 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #