data_2RAQ # _model_server_result.job_id a_yn4FFtTmxNEh_mnjJuqg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 05:26:01' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2raq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":98}' # _entry.id 2RAQ # _exptl.entry_id 2RAQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2RAQ _cell.length_a 113.569 _cell.length_b 113.569 _cell.length_c 114.53 _cell.Z_PDB 56 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2RAQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 94 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 42 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 8_665 -y+1,-x+1,-z 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 113.569 113.569 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C LEU 41 A LEU 41 1_555 A N MSE 42 A MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale2 A C MSE 42 A MSE 42 1_555 A N GLU 43 A GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale3 A C THR 87 A THR 87 1_555 A N MSE 88 A MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale4 A C MSE 88 A MSE 88 1_555 A N VAL 89 A VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 B C LEU 41 B LEU 41 1_555 B N MSE 42 B MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale6 B C MSE 42 B MSE 42 1_555 B N GLU 43 B GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale7 B C THR 87 B THR 87 1_555 B N MSE 88 B MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale8 B C MSE 88 B MSE 88 1_555 B N VAL 89 B VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale9 C C LEU 41 C LEU 41 1_555 C N MSE 42 C MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale10 C C MSE 42 C MSE 42 1_555 C N GLU 43 C GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale11 C C THR 87 C THR 87 1_555 C N MSE 88 C MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale12 C C MSE 88 C MSE 88 1_555 C N VAL 89 C VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale13 D C LEU 41 D LEU 41 1_555 D N MSE 42 D MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale14 D C MSE 42 D MSE 42 1_555 D N GLU 43 D GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale15 D C THR 87 D THR 87 1_555 D N MSE 88 D MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale16 D C MSE 88 D MSE 88 1_555 D N VAL 89 D VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? covale ? covale17 E C LEU 41 E LEU 41 1_555 E N MSE 42 E MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale18 E C MSE 42 E MSE 42 1_555 E N GLU 43 E GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale19 E C THR 87 E THR 87 1_555 E N MSE 88 E MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale20 E C MSE 88 E MSE 88 1_555 E N VAL 89 E VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale21 F C LEU 41 F LEU 41 1_555 F N MSE 42 F MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale22 F C MSE 42 F MSE 42 1_555 F N GLU 43 F GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale23 F C THR 87 F THR 87 1_555 F N MSE 88 F MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale24 F C MSE 88 F MSE 88 1_555 F N VAL 89 F VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale25 G C LEU 41 G LEU 41 1_555 G N MSE 42 G MSE 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale26 G C MSE 42 G MSE 42 1_555 G N GLU 43 G GLU 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale27 G C THR 87 G THR 87 1_555 G N MSE 88 G MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale28 G C MSE 88 G MSE 88 1_555 G N VAL 89 G VAL 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 12 A ASP 12 1_555 I CA CA . A CA 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 45 A ASP 45 1_555 H CA CA . A CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc3 A OG SER 78 A SER 78 1_555 I CA CA . A CA 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 91 A GLU 91 1_555 J CA CA . A CA 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc5 A O THR 93 A THR 93 1_555 K CA CA . A CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc ? metalc6 K CA CA . A CA 101 1_555 G OE2 GLU 91 G GLU 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc7 B OD1 ASP 12 B ASP 12 1_555 L CA CA . B CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc8 B OE2 GLU 43 B GLU 43 1_555 M CA CA . B CA 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.809 ? metalc ? metalc9 B OD2 ASP 45 B ASP 45 1_555 M CA CA . B CA 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc10 B OG SER 78 B SER 78 1_555 L CA CA . B CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc11 B OE2 GLU 91 B GLU 91 1_555 N CA CA . B CA 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? metalc ? metalc12 N CA CA . B CA 100 1_555 C O THR 93 C THR 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc ? metalc13 C OE2 GLU 91 C GLU 91 1_555 O CA CA . C CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc ? metalc14 O CA CA . C CA 98 1_555 D O THR 93 D THR 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc15 D OE2 GLU 91 D GLU 91 1_555 P CA CA . D CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc16 P CA CA . D CA 98 1_555 E O THR 93 E THR 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc17 E OD1 ASP 12 E ASP 12 1_555 Q CA CA . E CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc18 E OE2 GLU 43 E GLU 43 1_555 R CA CA . E CA 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc19 E OD2 ASP 45 E ASP 45 1_555 R CA CA . E CA 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.883 ? metalc ? metalc20 E OG SER 78 E SER 78 1_555 Q CA CA . E CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? metalc ? metalc21 E OE2 GLU 91 E GLU 91 1_555 S CA CA . E CA 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc22 S CA CA . E CA 100 1_555 F O THR 93 F THR 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc23 F OG SER 78 F SER 78 1_555 T CA CA . F CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? metalc ? metalc24 F OE2 GLU 91 F GLU 91 1_555 U CA CA . G CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc25 G O THR 93 G THR 93 1_555 U CA CA . G CA 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2RAQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008805 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008805 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008731 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code H 2 CA A 1 98 1 CA CA . I 2 CA A 1 99 4 CA CA . J 2 CA A 1 100 8 CA CA . K 2 CA A 1 101 14 CA CA . L 2 CA B 1 98 2 CA CA . M 2 CA B 1 99 3 CA CA . N 2 CA B 1 100 9 CA CA . O 2 CA C 1 98 10 CA CA . P 2 CA D 1 98 11 CA CA . Q 2 CA E 1 98 5 CA CA . R 2 CA E 1 99 6 CA CA . S 2 CA E 1 100 12 CA CA . T 2 CA F 1 98 7 CA CA . U 2 CA G 1 98 13 CA CA . V 3 HOH A 1 102 1 HOH HOH . V 3 HOH A 2 103 12 HOH HOH . V 3 HOH A 3 104 39 HOH HOH . V 3 HOH A 4 105 48 HOH HOH . W 3 HOH B 1 101 4 HOH HOH . W 3 HOH B 2 102 5 HOH HOH . W 3 HOH B 3 103 6 HOH HOH . W 3 HOH B 4 104 7 HOH HOH . W 3 HOH B 5 105 8 HOH HOH . W 3 HOH B 6 106 9 HOH HOH . W 3 HOH B 7 107 10 HOH HOH . W 3 HOH B 8 108 11 HOH HOH . W 3 HOH B 9 109 30 HOH HOH . X 3 HOH C 1 99 13 HOH HOH . X 3 HOH C 2 100 14 HOH HOH . X 3 HOH C 3 101 15 HOH HOH . Y 3 HOH D 1 99 53 HOH HOH . Y 3 HOH D 2 100 16 HOH HOH . Y 3 HOH D 3 101 19 HOH HOH . Y 3 HOH D 4 102 20 HOH HOH . Y 3 HOH D 5 103 21 HOH HOH . Y 3 HOH D 6 104 22 HOH HOH . Z 3 HOH E 1 101 17 HOH HOH . Z 3 HOH E 2 102 18 HOH HOH . Z 3 HOH E 3 103 23 HOH HOH . Z 3 HOH E 4 104 24 HOH HOH . Z 3 HOH E 5 105 25 HOH HOH . Z 3 HOH E 6 106 26 HOH HOH . Z 3 HOH E 7 107 27 HOH HOH . Z 3 HOH E 8 108 28 HOH HOH . Z 3 HOH E 9 109 29 HOH HOH . Z 3 HOH E 10 110 31 HOH HOH . Z 3 HOH E 11 111 32 HOH HOH . AA 3 HOH F 1 99 33 HOH HOH . AA 3 HOH F 2 100 34 HOH HOH . AA 3 HOH F 3 101 35 HOH HOH . AA 3 HOH F 4 102 37 HOH HOH . AA 3 HOH F 5 103 38 HOH HOH . AA 3 HOH F 6 104 40 HOH HOH . AA 3 HOH F 7 105 41 HOH HOH . AA 3 HOH F 8 106 42 HOH HOH . AA 3 HOH F 9 107 43 HOH HOH . AA 3 HOH F 10 108 44 HOH HOH . AA 3 HOH F 11 109 45 HOH HOH . AA 3 HOH F 12 110 46 HOH HOH . AA 3 HOH F 13 111 47 HOH HOH . BA 3 HOH G 1 99 2 HOH HOH . BA 3 HOH G 2 100 3 HOH HOH . BA 3 HOH G 3 101 36 HOH HOH . BA 3 HOH G 4 102 49 HOH HOH . BA 3 HOH G 5 103 50 HOH HOH . BA 3 HOH G 6 104 51 HOH HOH . BA 3 HOH G 7 105 52 HOH HOH . BA 3 HOH G 8 106 54 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 31.513 _atom_site.Cartn_y 66.404 _atom_site.Cartn_z -4.525 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 81.98 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 98 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 233 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #