data_2V3T
#
_model_server_result.job_id            qRs5J_RoxGJ3Ir6Xz-Ct5w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 02:19:50' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2v3t 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1264}' 
#
_entry.id    2V3T 
#
_exptl.entry_id    2V3T 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2V3T 
_cell.length_a            70.971 
_cell.length_b            91.031 
_cell.length_c            177.393 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2V3T 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        24 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'I 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PQS 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 208 A CYS 208 1_555 A SG CYS 263 A CYS 263 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
covale ? covale1 A C VAL 16 A VAL 16 1_555 A N MSE 17 A MSE 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale2 A C MSE 17 A MSE 17 1_555 A N VAL 18 A VAL 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale3 A C TYR 102 A TYR 102 1_555 A N MSE 103 A MSE 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale4 A C MSE 103 A MSE 103 1_555 A N ASP 104 A ASP 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale5 A C ARG 144 A ARG 144 1_555 A N MSE 145 A MSE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale6 A C MSE 145 A MSE 145 1_555 A N LYS 146 A LYS 146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale7 A C SER 155 A SER 155 1_555 A N MSE 156 A MSE 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale8 A C MSE 156 A MSE 156 1_555 A N TYR 157 A TYR 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale9 A C GLN 159 A GLN 159 1_555 A N MSE 160 A MSE 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale10 A C MSE 160 A MSE 160 1_555 A N TRP 161 A TRP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale11 A C ARG 162 A ARG 162 1_555 A N MSE 163 A MSE 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale12 A C MSE 163 A MSE 163 1_555 A N ILE 164 A ILE 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale13 A C ASP 248 A ASP 248 1_555 A N MSE 249 A MSE 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale14 A C MSE 249 A MSE 249 1_555 A N ASP 250 A ASP 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
metalc ? metalc1 C CA CA . A CA 1264 1_555 A O VAL 96 A VAL 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc2 C CA CA . A CA 1264 1_555 A OE2 GLU 93 A GLU 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc3 C CA CA . A CA 1264 1_555 A O GLU 93 A GLU 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? 
metalc ? metalc4 C CA CA . A CA 1264 1_555 B OD2 ASP 234 B ASP 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.007 ? 
metalc ? metalc5 C CA CA . A CA 1264 1_555 B OD1 ASP 234 B ASP 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
metalc ? metalc6 C CA CA . A CA 1264 1_555 A OD1 ASP 97 A ASP 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? 
covale ? covale15 B C VAL 16 B VAL 16 1_555 B N MSE 17 B MSE 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale16 B C MSE 17 B MSE 17 1_555 B N VAL 18 B VAL 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale17 B C TYR 102 B TYR 102 1_555 B N MSE 103 B MSE 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale18 B C MSE 103 B MSE 103 1_555 B N ASP 104 B ASP 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale19 B C ARG 144 B ARG 144 1_555 B N MSE 145 B MSE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale20 B C MSE 145 B MSE 145 1_555 B N LYS 146 B LYS 146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale21 B C SER 155 B SER 155 1_555 B N MSE 156 B MSE 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale22 B C MSE 156 B MSE 156 1_555 B N TYR 157 B TYR 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale23 B C GLN 159 B GLN 159 1_555 B N MSE 160 B MSE 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale24 B C MSE 160 B MSE 160 1_555 B N TRP 161 B TRP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale25 B C ARG 162 B ARG 162 1_555 B N MSE 163 B MSE 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale26 B C MSE 163 B MSE 163 1_555 B N ILE 164 B ILE 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale27 B C ASP 248 B ASP 248 1_555 B N MSE 249 B MSE 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale28 B C MSE 249 B MSE 249 1_555 B N ASP 250 B ASP 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
metalc ? metalc7 D CA CA . B CA 1264 1_555 A OD2 ASP 234 A ASP 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? 
metalc ? metalc8 D CA CA . B CA 1264 1_555 B O GLU 93 B GLU 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc9 D CA CA . B CA 1264 1_555 B OE2 GLU 93 B GLU 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? 
metalc ? metalc10 D CA CA . B CA 1264 1_555 B O VAL 96 B VAL 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? 
metalc ? metalc11 D CA CA . B CA 1264 1_555 B OD1 ASP 97 B ASP 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc12 D CA CA . B CA 1264 1_555 A OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.864 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2V3T 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.01409 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010985 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005637 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 1264 1264 CA CA . 
D 2 CA B 1 1264 1264 CA CA . 
E 3 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
E 3 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
E 3 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . 
E 3 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . 
E 3 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . 
E 3 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . 
E 3 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . 
E 3 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . 
E 3 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . 
E 3 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . 
E 3 HOH A 11 2011 2011 HOH HOH . 
E 3 HOH A 12 2012 2012 HOH HOH . 
E 3 HOH A 13 2013 2013 HOH HOH . 
E 3 HOH A 14 2014 2014 HOH HOH . 
E 3 HOH A 15 2015 2015 HOH HOH . 
E 3 HOH A 16 2016 2016 HOH HOH . 
F 3 HOH B 1 2001 2001 HOH HOH . 
F 3 HOH B 2 2002 2002 HOH HOH . 
F 3 HOH B 3 2003 2003 HOH HOH . 
F 3 HOH B 4 2004 2004 HOH HOH . 
F 3 HOH B 5 2005 2005 HOH HOH . 
F 3 HOH B 6 2006 2006 HOH HOH . 
F 3 HOH B 7 2007 2007 HOH HOH . 
F 3 HOH B 8 2008 2008 HOH HOH . 
F 3 HOH B 9 2009 2009 HOH HOH . 
F 3 HOH B 10 2010 2010 HOH HOH . 
F 3 HOH B 11 2011 2011 HOH HOH . 
F 3 HOH B 12 2012 2012 HOH HOH . 
F 3 HOH B 13 2013 2013 HOH HOH . 
F 3 HOH B 14 2014 2014 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         D 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               3.528 
_atom_site.Cartn_y               4.099 
_atom_site.Cartn_z               -28.708 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        34.66 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           1264 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              41 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    4 
_model_server_stats.query_time_ms           339 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#