data_2VQL
#
_model_server_result.job_id            5mjeVdcK2-aFAjrfINwGJA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-23 09:52:08' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2vql 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":1093}' 
#
_entry.id    2VQL 
#
_exptl.entry_id    2VQL 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              136.989 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CACODYLATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2VQL 
_cell.length_a            78.392 
_cell.length_b            78.392 
_cell.length_c            191.859 
_cell.Z_PDB               32 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2VQL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PQS monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,H,I,J 1 1 
B,K,L,M,N,O,P 2 1 
C,Q,R 3 1 
D,S,T 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 22 A CYS 22 1_555 A SG CYS 81 A CYS 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 22 B CYS 22 1_555 B SG CYS 81 B CYS 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf3 C SG CYS 22 C CYS 22 1_555 C SG CYS 81 C CYS 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf4 D SG CYS 22 D CYS 22 1_555 D SG CYS 81 D CYS 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 26 A GLU 26 1_555 F ZN ZN . A ZN 1090 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.908 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 37 A GLU 37 1_555 E ZN ZN . A ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc3 A OE2 GLU 46 A GLU 46 1_555 L ZN ZN . B ZN 1090 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 65 A ASP 65 1_555 H ZN ZN . A ZN 1092 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc5 A OE1 GLU 68 A GLU 68 1_555 K ZN ZN . B ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc6 A OE2 GLU 68 A GLU 68 1_555 K ZN ZN . B ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 69 A ASP 69 1_555 H ZN ZN . A ZN 1092 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc8 E ZN ZN . A ZN 1089 1_555 I O2 CAC . A CAC 1093 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc9 E ZN ZN . A ZN 1089 1_555 I O1 CAC . A CAC 1093 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc10 E ZN ZN . A ZN 1089 1_555 J O1 CAC . A CAC 1094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.702 ? 
metalc ? metalc11 E ZN ZN . A ZN 1089 1_555 D OE1 GLU 37 D GLU 37 5_454 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc12 E ZN ZN . A ZN 1089 1_555 D OE2 GLU 37 D GLU 37 5_454 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
metalc ? metalc13 F ZN ZN . A ZN 1090 1_555 I O1 CAC . A CAC 1093 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? 
metalc ? metalc14 F ZN ZN . A ZN 1090 1_555 J O2 CAC . A CAC 1094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.822 ? 
metalc ? metalc15 F ZN ZN . A ZN 1090 1_555 D OE2 GLU 26 D GLU 26 5_454 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.814 ? 
metalc ? metalc16 H ZN ZN . A ZN 1092 1_555 B OE2 GLU 46 B GLU 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
metalc ? metalc17 B OE2 GLU 26 B GLU 26 1_555 M ZN ZN . B ZN 1091 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? 
metalc ? metalc18 B OE2 GLU 37 B GLU 37 1_555 N ZN ZN . B ZN 1092 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? 
metalc ? metalc19 B OD2 ASP 65 B ASP 65 1_555 L ZN ZN . B ZN 1090 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc20 B OD1 ASP 65 B ASP 65 1_555 L ZN ZN . B ZN 1090 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? 
metalc ? metalc21 B OE1 GLU 68 B GLU 68 1_555 K ZN ZN . B ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc22 B OE2 GLU 68 B GLU 68 1_555 K ZN ZN . B ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc23 B OD2 ASP 69 B ASP 69 1_555 L ZN ZN . B ZN 1090 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc24 M ZN ZN . B ZN 1091 1_555 O O2 CAC . B CAC 1093 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc25 M ZN ZN . B ZN 1091 1_555 P O2 CAC . B CAC 1094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc26 M ZN ZN . B ZN 1091 1_555 C OE2 GLU 26 C GLU 26 3_454 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.958 ? 
metalc ? metalc27 N ZN ZN . B ZN 1092 1_555 O O1 CAC . B CAC 1093 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.795 ? 
metalc ? metalc28 N ZN ZN . B ZN 1092 1_555 P O1 CAC . B CAC 1094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
metalc ? metalc29 N ZN ZN . B ZN 1092 1_555 C OE2 GLU 37 C GLU 37 3_454 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? 
metalc ? metalc30 C OE2 GLU 46 C GLU 46 7_455 S ZN ZN . D ZN 1088 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc31 C OD2 ASP 65 C ASP 65 1_555 Q ZN ZN . C ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc32 C OD2 ASP 69 C ASP 69 1_555 Q ZN ZN . C ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? 
metalc ? metalc33 C OD2 ASP 87 C ASP 87 7_455 T ZN ZN . D ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? 
metalc ? metalc34 Q ZN ZN . C ZN 1089 1_555 D OE2 GLU 46 D GLU 46 7_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc35 R ZN ZN . C ZN 1090 1_555 D OE2 GLU 68 D GLU 68 7_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.86 ? 
metalc ? metalc36 D OD2 ASP 69 D ASP 69 1_555 S ZN ZN . D ZN 1088 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc37 D OD2 ASP 76 D ASP 76 1_555 T ZN ZN . D ZN 1089 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 As O2 -1' 
_chem_comp.formula_weight    136.989 
_chem_comp.id                CAC 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CACODYLATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     dimethylarsinate 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
AS O1 CAC doub 70 n n 
AS O2 CAC sing 71 n n 
AS C1 CAC sing 72 n n 
AS C2 CAC sing 73 n n 
C1 H11 CAC sing 74 n n 
C1 H12 CAC sing 75 n n 
C1 H13 CAC sing 76 n n 
C2 H21 CAC sing 77 n n 
C2 H22 CAC sing 78 n n 
C2 H23 CAC sing 79 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2VQL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012756 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012756 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005212 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 ZN A 1 1089 1089 ZN ZN . 
F 2 ZN A 1 1090 1090 ZN ZN . 
G 2 ZN A 1 1091 1091 ZN ZN . 
H 2 ZN A 1 1092 1092 ZN ZN . 
I 3 CAC A 1 1093 1093 CAC CAC . 
J 3 CAC A 1 1094 1094 CAC CAC . 
K 2 ZN B 1 1089 1089 ZN ZN . 
L 2 ZN B 1 1090 1090 ZN ZN . 
M 2 ZN B 1 1091 1091 ZN ZN . 
N 2 ZN B 1 1092 1092 ZN ZN . 
O 3 CAC B 1 1093 1093 CAC CAC . 
P 3 CAC B 1 1094 1094 CAC CAC . 
Q 2 ZN C 1 1089 1089 ZN ZN . 
R 2 ZN C 1 1090 1090 ZN ZN . 
S 2 ZN D 1 1088 1088 ZN ZN . 
T 2 ZN D 1 1089 1089 ZN ZN . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 AS AS CAC . . . I 3 -12.242 14.816 -29.98 1 105.85 ? AS CAC 1093 A 1 
HETATM 2 O O1 CAC . . . I 3 -10.702 15.592 -30.228 1 105.85 ? O1 CAC 1093 A 1 
HETATM 3 O O2 CAC . . . I 3 -12.033 13.095 -29.84 1 105.85 ? O2 CAC 1093 A 1 
HETATM 4 C C1 CAC . . . I 3 -13.06 15.536 -28.35 1 105.85 ? C1 CAC 1093 A 1 
HETATM 5 C C2 CAC . . . I 3 -13.357 15.219 -31.547 1 105.85 ? C2 CAC 1093 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           6 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           212 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           5 
#