data_2W7P # _model_server_result.job_id 2YargyFKvm4xqB65jGRzBQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 19:14:39' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2w7p # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":1522}' # _entry.id 2W7P # _exptl.entry_id 2W7P _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2W7P _cell.length_a 167.829 _cell.length_b 220.847 _cell.length_c 119.208 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2W7P _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,G,H,I,M,O 1 1 B,C,D,J,K,L,N 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 H N N ? 5 I N N ? 5 K N N ? 5 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 D O3' DC 4 F DC 4 1_555 D P 8OG 5 F 8OG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.599 ? covale ? covale2 D O3' 8OG 5 F 8OG 5 1_555 D P DG 6 F DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.615 ? covale ? covale3 F O3' DC 4 T DC 4 1_555 F P 8OG 5 T 8OG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.604 ? covale ? covale4 F O3' 8OG 5 T 8OG 5 1_555 F P DG 6 T DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.6 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 89 A ASP 107 1_555 H CA CA . A CA 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? metalc ? metalc2 A O MET 90 A MET 108 1_555 I CA CA . A CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 180 A ASP 198 1_555 I CA CA . A CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 307 A ASP 325 1_555 H CA CA . A CA 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 307 A ASP 325 1_555 H CA CA . A CA 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.915 ? metalc ? metalc6 G O1B DTP . A DTP 1521 1_555 H CA CA . A CA 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.121 ? metalc ? metalc7 G O3' DTP . A DTP 1521 1_555 I CA CA . A CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.139 ? metalc ? metalc8 G O3B DTP . A DTP 1521 1_555 I CA CA . A CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.888 ? metalc ? metalc9 G O2B DTP . A DTP 1521 1_555 I CA CA . A CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? metalc ? metalc10 B OD1 ASP 89 B ASP 107 1_555 L CA CA . B CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc11 B O MET 90 B MET 108 1_555 L CA CA . B CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc12 B OD2 ASP 180 B ASP 198 1_555 L CA CA . B CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? metalc ? metalc13 B OD1 ASP 307 B ASP 325 1_555 K CA CA . B CA 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? metalc ? metalc14 J O2A DTP . B DTP 1521 1_555 K CA CA . B CA 1522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? metalc ? metalc15 J O3A DTP . B DTP 1521 1_555 L CA CA . B CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.063 ? metalc ? metalc16 J O2B DTP . B DTP 1521 1_555 L CA CA . B CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc ? metalc17 J O2G DTP . B DTP 1521 1_555 L CA CA . B CA 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog1 C N2 DG 3 E DG 3 1_555 D N3 DC 16 F DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog2 C N1 DG 4 E DG 4 1_555 D O2 DC 15 F DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C N1 DG 5 E DG 5 1_555 D N3 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N2 DG 5 E DG 5 1_555 D O2 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C O6 DG 5 E DG 5 1_555 D N4 DC 14 F DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog6 C N6 DA 6 E DA 6 1_555 D O4 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog7 C N1 DA 6 E DA 6 1_555 D N3 DT 13 F DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N1 DA 7 E DA 7 1_555 D N3 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N6 DA 7 E DA 7 1_555 D O4 DT 12 F DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog10 C N2 DG 8 E DG 8 1_555 D O2 DC 11 F DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N1 DG 9 E DG 9 1_555 D N3 DC 10 F DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N2 DG 9 E DG 9 1_555 D O2 DC 10 F DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C O6 DG 9 E DG 9 1_555 D N4 DC 10 F DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C N1 DA 10 E DA 10 1_555 D N3 DT 9 F DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N6 DA 10 E DA 10 1_555 D O4 DT 9 F DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N3 DT 11 E DT 11 1_555 D N1 DA 8 F DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C O4 DT 11 E DT 11 1_555 D N6 DA 8 F DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N3 DT 12 E DT 12 1_555 D N1 DA 7 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C O4 DT 12 E DT 12 1_555 D N6 DA 7 F DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N3 DC 13 E DC 13 1_555 D N1 DG 6 F DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N4 DC 13 E DC 13 1_555 D O6 DG 6 F DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C O2 DC 13 E DC 13 1_555 D N2 DG 6 F DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 E N1 DG 1 P DG 1 1_555 F N3 DC 18 T DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 E N2 DG 1 P DG 1 1_555 F O2 DC 18 T DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 E O6 DG 1 P DG 1 1_555 F N4 DC 18 T DC 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog26 E N2 DG 2 P DG 2 1_555 F N3 DC 17 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 E N1 DG 3 P DG 3 1_555 F N3 DC 16 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 E N2 DG 3 P DG 3 1_555 F O2 DC 16 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 E O6 DG 3 P DG 3 1_555 F N4 DC 16 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 E N1 DG 4 P DG 4 1_555 F N3 DC 15 T DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 E N2 DG 4 P DG 4 1_555 F O2 DC 15 T DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 E O6 DG 4 P DG 4 1_555 F N4 DC 15 T DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 E N1 DG 5 P DG 5 1_555 F N3 DC 14 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 E N2 DG 5 P DG 5 1_555 F O2 DC 14 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 E O6 DG 5 P DG 5 1_555 F N4 DC 14 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 E N1 DA 6 P DA 6 1_555 F N3 DT 13 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 E N6 DA 6 P DA 6 1_555 F O4 DT 13 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog38 E N1 DA 7 P DA 7 1_555 F N3 DT 12 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog39 E N1 DA 7 P DA 7 1_555 F N3 DT 13 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 E N1 DG 8 P DG 8 1_555 F N3 DC 11 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 E N2 DG 8 P DG 8 1_555 F O2 DC 11 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 E O6 DG 8 P DG 8 1_555 F N4 DC 11 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 E N1 DG 9 P DG 9 1_555 F N3 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 E N2 DG 9 P DG 9 1_555 F O2 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 E O6 DG 9 P DG 9 1_555 F N4 DC 10 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 E N1 DA 10 P DA 10 1_555 F N3 DT 9 T DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 E N6 DA 10 P DA 10 1_555 F O4 DT 9 T DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 E N3 DT 11 P DT 11 1_555 F N1 DA 8 T DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 E O4 DT 11 P DT 11 1_555 F N6 DA 8 T DA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 E N3 DT 12 P DT 12 1_555 F N1 DA 7 T DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 E O4 DT 12 P DT 12 1_555 F N6 DA 7 T DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 E N3 DC 13 P DC 13 1_555 F N1 DG 6 T DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 E N4 DC 13 P DC 13 1_555 F O6 DG 6 T DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 E O2 DC 13 P DC 13 1_555 F N2 DG 6 T DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2W7P _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005958 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004528 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008389 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 DTP A 1 1521 1521 DTP DTP . H 5 CA A 1 1522 1522 CA CA . I 5 CA A 1 1523 1523 CA CA . J 4 DTP B 1 1521 1521 DTP DTP . K 5 CA B 1 1522 1522 CA CA . L 5 CA B 1 1523 1523 CA CA . M 6 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . M 6 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . M 6 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . M 6 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . M 6 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . M 6 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . M 6 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . M 6 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . M 6 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . M 6 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . N 6 HOH F 1 2001 2001 HOH HOH . O 6 HOH T 1 2001 2001 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x -42.497 _atom_site.Cartn_y 60.411 _atom_site.Cartn_z 32.061 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 88.49 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1522 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 57 _model_server_stats.query_time_ms 318 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #