data_2WW0
#
_model_server_result.job_id            viZEUsolxVqNrr3bMYa60A 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 23:02:32' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2ww0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":803}' 
#
_entry.id    2WW0 
#
_exptl.entry_id    2WW0 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    17 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          93.43 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2WW0 
_cell.length_a            107.81 
_cell.length_b            151.96 
_cell.length_c            218.619 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2WW0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 5 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 6 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 7 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 8 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,I,J,K,L,M,N,O,PA 1 1 
B,P,Q,R,S,T,QA 2 1 
C,U,V,W,X,Y,RA 3 1 
D,Z,AA,BA,CA,DA,SA 4 1 
E,EA,FA,GA,HA,TA 5 1 
F,IA,JA,KA,UA 6 1 
G,LA,MA,VA 7 1 
H,NA,OA,WA 8 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 K N N 
? 4 L N N 
? 4 M N N 
? 4 N N N 
? 4 O N N 
? 4 R N N 
? 4 S N N 
? 4 T N N 
? 4 W N N 
? 4 X N N 
? 4 Y N N 
? 4 BA N N 
? 4 CA N N 
? 4 DA N N 
? 4 GA N N 
? 4 HA N N 
? 4 KA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASN 582 A ASN 601 1_555 I CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 583 A GLN 602 1_555 I CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 625 A ASP 644 1_555 I CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc4 I CA CA . A CA 800 1_555 J O13 SWA . A SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc5 I CA CA . A CA 800 1_555 J O11 SWA . A SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? 
metalc ? metalc6 I CA CA . A CA 800 1_555 PA O HOH . A HOH 2097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? 
metalc ? metalc7 B OD1 ASN 582 B ASN 601 1_555 P CA CA . B CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLN 583 B GLN 602 1_555 P CA CA . B CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? 
metalc ? metalc9 B OD2 ASP 625 B ASP 644 1_555 P CA CA . B CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc10 P CA CA . B CA 800 1_555 Q O13 SWA . B SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? 
metalc ? metalc11 P CA CA . B CA 800 1_555 Q O11 SWA . B SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? 
metalc ? metalc12 P CA CA . B CA 800 1_555 QA O HOH . B HOH 2096 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc13 C OD1 ASN 582 C ASN 601 1_555 U CA CA . C CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? 
metalc ? metalc14 C OE1 GLN 583 C GLN 602 1_555 U CA CA . C CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.805 ? 
metalc ? metalc15 C OD2 ASP 625 C ASP 644 1_555 U CA CA . C CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? 
metalc ? metalc16 U CA CA . C CA 800 1_555 V O13 SWA . C SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? 
metalc ? metalc17 U CA CA . C CA 800 1_555 V O11 SWA . C SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? 
metalc ? metalc18 U CA CA . C CA 800 1_555 RA O HOH . C HOH 2061 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? 
metalc ? metalc19 D OD1 ASN 582 D ASN 601 1_555 Z CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? 
metalc ? metalc20 D OE1 GLN 583 D GLN 602 1_555 Z CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? 
metalc ? metalc21 D OD2 ASP 625 D ASP 644 1_555 Z CA CA . D CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
metalc ? metalc22 Z CA CA . D CA 800 1_555 AA O13 SWA . D SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? 
metalc ? metalc23 Z CA CA . D CA 800 1_555 AA O11 SWA . D SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.801 ? 
metalc ? metalc24 Z CA CA . D CA 800 1_555 SA O HOH . D HOH 2094 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? 
metalc ? metalc25 E OD1 ASN 582 E ASN 601 1_555 EA CA CA . E CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? 
metalc ? metalc26 E OE1 GLN 583 E GLN 602 1_555 EA CA CA . E CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? 
metalc ? metalc27 E OD2 ASP 625 E ASP 644 1_555 EA CA CA . E CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? 
metalc ? metalc28 EA CA CA . E CA 800 1_555 FA O13 SWA . E SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? 
metalc ? metalc29 F OD1 ASN 582 F ASN 601 1_555 IA CA CA . F CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc30 F OE1 GLN 583 F GLN 602 1_555 IA CA CA . F CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc31 F OD2 ASP 625 F ASP 644 1_555 IA CA CA . F CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
metalc ? metalc32 IA CA CA . F CA 800 1_555 JA O13 SWA . F SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? 
metalc ? metalc33 IA CA CA . F CA 800 1_555 JA O11 SWA . F SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? 
metalc ? metalc34 G OD1 ASN 582 G ASN 601 1_555 LA CA CA . G CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc35 G OE1 GLN 583 G GLN 602 1_555 LA CA CA . G CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? 
metalc ? metalc36 G OD2 ASP 625 G ASP 644 1_555 LA CA CA . G CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc37 LA CA CA . G CA 800 1_555 MA O13 SWA . G SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc38 LA CA CA . G CA 800 1_555 MA O11 SWA . G SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.809 ? 
metalc ? metalc39 H OD1 ASN 582 H ASN 601 1_555 NA CA CA . H CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc40 H OE1 GLN 583 H GLN 602 1_555 NA CA CA . H CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc41 H OD2 ASP 625 H ASP 644 1_555 NA CA CA . H CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc42 NA CA CA . H CA 800 1_555 OA O11 SWA . H SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc43 NA CA CA . H CA 800 1_555 OA O13 SWA . H SWA 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 129 n n 
C1 C2 GOL sing 130 n n 
C1 H11 GOL sing 131 n n 
C1 H12 GOL sing 132 n n 
O1 HO1 GOL sing 133 n n 
C2 O2 GOL sing 134 n n 
C2 C3 GOL sing 135 n n 
C2 H2 GOL sing 136 n n 
O2 HO2 GOL sing 137 n n 
C3 O3 GOL sing 138 n n 
C3 H31 GOL sing 139 n n 
C3 H32 GOL sing 140 n n 
O3 HO3 GOL sing 141 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2WW0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009276 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000556 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006581 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004582 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 2 CA A 1 800 800 CA CA . 
J 3 SWA A 1 801 801 SWA SWA . 
K 4 GOL A 1 802 802 GOL GOL . 
L 4 GOL A 1 803 803 GOL GOL . 
M 4 GOL A 1 804 804 GOL GOL . 
N 4 GOL A 1 805 805 GOL GOL . 
O 4 GOL A 1 806 806 GOL GOL . 
P 2 CA B 1 800 800 CA CA . 
Q 3 SWA B 1 801 801 SWA SWA . 
R 4 GOL B 1 802 802 GOL GOL . 
S 4 GOL B 1 803 803 GOL GOL . 
T 4 GOL B 1 804 804 GOL GOL . 
U 2 CA C 1 800 800 CA CA . 
V 3 SWA C 1 801 801 SWA SWA . 
W 4 GOL C 1 802 802 GOL GOL . 
X 4 GOL C 1 803 803 GOL GOL . 
Y 4 GOL C 1 804 804 GOL GOL . 
Z 2 CA D 1 800 800 CA CA . 
AA 3 SWA D 1 801 801 SWA SWA . 
BA 4 GOL D 1 802 802 GOL GOL . 
CA 4 GOL D 1 803 803 GOL GOL . 
DA 4 GOL D 1 804 804 GOL GOL . 
EA 2 CA E 1 800 800 CA CA . 
FA 3 SWA E 1 801 801 SWA SWA . 
GA 4 GOL E 1 802 802 GOL GOL . 
HA 4 GOL E 1 803 803 GOL GOL . 
IA 2 CA F 1 800 800 CA CA . 
JA 3 SWA F 1 801 801 SWA SWA . 
KA 4 GOL F 1 802 802 GOL GOL . 
LA 2 CA G 1 800 800 CA CA . 
MA 3 SWA G 1 801 801 SWA SWA . 
NA 2 CA H 1 800 800 CA CA . 
OA 3 SWA H 1 801 801 SWA SWA . 
PA 5 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 11 2011 2011 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 12 2012 2012 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 13 2013 2013 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 14 2014 2014 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 15 2015 2015 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 16 2016 2016 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 17 2017 2017 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 18 2018 2018 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 19 2019 2019 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 20 2020 2020 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 21 2021 2021 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 22 2022 2022 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 23 2023 2023 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 24 2024 2024 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 25 2025 2025 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 26 2026 2026 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 27 2027 2027 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 28 2028 2028 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 29 2029 2029 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 30 2030 2030 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 31 2031 2031 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 32 2032 2032 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 33 2033 2033 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 34 2034 2034 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 35 2035 2035 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 36 2036 2036 HOH HOH . 
PA 5 HOH A 37 2037 2037 HOH HOH . 
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