data_2X19 # _model_server_result.job_id -k-FpZ_I_vt7v5iXNRsHgg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 00:38:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2x19 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1182}' # _entry.id 2X19 # _exptl.entry_id 2X19 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 2X19 _cell.length_a 99.93 _cell.length_b 99.93 _cell.length_c 276.84 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2X19 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 152 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B C LEU 49 B LEU 49 1_555 B N MSE 50 B MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale2 B C MSE 50 B MSE 50 1_555 B N GLN 51 B GLN 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale3 B C SER 133 B SER 133 1_555 B N MSE 134 B MSE 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale4 B C MSE 134 B MSE 134 1_555 B N MSE 135 B MSE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale5 B C MSE 135 B MSE 135 1_555 B N PRO 136 B PRO 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale6 B C ASP 145 B ASP 145 1_555 B N MSE 146 B MSE 146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale7 B C MSE 146 B MSE 146 1_555 B N VAL 147 B VAL 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale8 B C ASP 301 B ASP 301 1_555 B N MSE 302 B MSE 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale9 B C MSE 302 B MSE 302 1_555 B N GLU 303 B GLU 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale10 B C ASN 338 B ASN 338 1_555 B N MSE 339 B MSE 339 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale11 B C MSE 339 B MSE 339 1_555 B N ILE 340 B ILE 340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale12 B C ILE 340 B ILE 340 1_555 B N MSE 341 B MSE 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale13 B C MSE 341 B MSE 341 1_555 B N PHE 342 B PHE 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale14 B C LEU 431 B LEU 431 1_555 B N MSE 432 B MSE 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale15 B C MSE 432 B MSE 432 1_555 B N TYR 433 B TYR 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale16 B C GLU 436 B GLU 436 1_555 B N MSE 437 B MSE 437 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale17 B C MSE 437 B MSE 437 1_555 B N LEU 438 B LEU 438 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale18 B C VAL 509 B VAL 509 1_555 B N MSE 510 B MSE 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale19 B C MSE 510 B MSE 510 1_555 B N PHE 511 B PHE 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale20 B C VAL 525 B VAL 525 1_555 B N MSE 526 B MSE 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale21 B C MSE 526 B MSE 526 1_555 B N ILE 527 B ILE 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale22 B C LEU 577 B LEU 577 1_555 B N MSE 578 B MSE 578 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale23 B C MSE 578 B MSE 578 1_555 B N LYS 579 B LYS 579 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale24 B C CYS 587 B CYS 587 1_555 B N MSE 588 B MSE 588 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale25 B C MSE 588 B MSE 588 1_555 B N TRP 589 B TRP 589 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale26 B C LEU 590 B LEU 590 1_555 B N MSE 591 B MSE 591 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale27 B C MSE 591 B MSE 591 1_555 B N GLN 592 B GLN 592 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale28 B C PRO 722 B PRO 722 1_555 B N MSE 723 B MSE 723 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale29 B C MSE 723 B MSE 723 1_555 B N VAL 724 B VAL 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale30 B C GLU 729 B GLU 729 1_555 B N MSE 730 B MSE 730 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale31 B C MSE 730 B MSE 730 1_555 B N LEU 731 B LEU 731 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale32 B C ARG 733 B ARG 733 1_555 B N MSE 734 B MSE 734 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale33 B C MSE 734 B MSE 734 1_555 B N TYR 735 B TYR 735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale34 B C PHE 793 B PHE 793 1_555 B N MSE 794 B MSE 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale35 B C MSE 794 B MSE 794 1_555 B N GLN 795 B GLN 795 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale36 B C ARG 863 B ARG 863 1_555 B N MSE 864 B MSE 864 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale37 B C MSE 864 B MSE 864 1_555 B N LEU 865 B LEU 865 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale38 B C LEU 881 B LEU 881 1_555 B N MSE 882 B MSE 882 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale39 B C MSE 882 B MSE 882 1_555 B N ASP 883 B ASP 883 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale40 B C SER 901 B SER 901 1_555 B N MSE 902 B MSE 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale41 B C MSE 902 B MSE 902 1_555 B N TRP 903 B TRP 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale42 B C GLU 942 B GLU 942 1_555 B N MSE 943 B MSE 943 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale43 B C MSE 943 B MSE 943 1_555 B N VAL 944 B VAL 944 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? metalc ? metalc1 A OG1 THR 19 A THR 26 1_555 D MG MG . A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 37 A THR 44 1_555 D MG MG . A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc3 C O1G GTP . A GTP 1181 1_555 D MG MG . A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc4 C O3G GTP . A GTP 1181 1_555 D MG MG . A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc ? metalc5 C O2B GTP . A GTP 1181 1_555 D MG MG . A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2X19 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010007 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.005778 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011555 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003612 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 GTP A 1 1181 1181 GTP GTP . D 4 MG A 1 1182 1182 MG MG . E 5 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . E 5 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . E 5 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . E 5 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . E 5 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . E 5 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . E 5 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . E 5 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . E 5 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . E 5 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . E 5 HOH A 11 2011 2011 HOH HOH . E 5 HOH A 12 2012 2012 HOH HOH . E 5 HOH A 13 2013 2013 HOH HOH . E 5 HOH A 14 2014 2014 HOH HOH . E 5 HOH A 15 2015 2015 HOH HOH . E 5 HOH A 16 2016 2016 HOH HOH . F 5 HOH B 1 2001 2001 HOH HOH . F 5 HOH B 2 2002 2002 HOH HOH . F 5 HOH B 3 2003 2003 HOH HOH . F 5 HOH B 4 2004 2004 HOH HOH . F 5 HOH B 5 2005 2005 HOH HOH . F 5 HOH B 6 2006 2006 HOH HOH . F 5 HOH B 7 2007 2007 HOH HOH . F 5 HOH B 8 2008 2008 HOH HOH . F 5 HOH B 9 2009 2009 HOH HOH . F 5 HOH B 10 2010 2010 HOH HOH . F 5 HOH B 11 2011 2011 HOH HOH . F 5 HOH B 12 2012 2012 HOH HOH . F 5 HOH B 13 2013 2013 HOH HOH . F 5 HOH B 14 2014 2014 HOH HOH . F 5 HOH B 15 2015 2015 HOH HOH . F 5 HOH B 16 2016 2016 HOH HOH . F 5 HOH B 17 2017 2017 HOH HOH . F 5 HOH B 18 2018 2018 HOH HOH . F 5 HOH B 19 2019 2019 HOH HOH . F 5 HOH B 20 2020 2020 HOH HOH . F 5 HOH B 21 2021 2021 HOH HOH . F 5 HOH B 22 2022 2022 HOH HOH . F 5 HOH B 23 2023 2023 HOH HOH . F 5 HOH B 24 2024 2024 HOH HOH . F 5 HOH B 25 2025 2025 HOH HOH . F 5 HOH B 26 2026 2026 HOH HOH . F 5 HOH B 27 2027 2027 HOH HOH . F 5 HOH B 28 2028 2028 HOH HOH . F 5 HOH B 29 2029 2029 HOH HOH . F 5 HOH B 30 2030 2030 HOH HOH . F 5 HOH B 31 2031 2031 HOH HOH . F 5 HOH B 32 2032 2032 HOH HOH . F 5 HOH B 33 2033 2033 HOH HOH . F 5 HOH B 34 2034 2034 HOH HOH . F 5 HOH B 35 2035 2035 HOH HOH . F 5 HOH B 36 2036 2036 HOH HOH . F 5 HOH B 37 2037 2037 HOH HOH . F 5 HOH B 38 2038 2038 HOH HOH . F 5 HOH B 39 2039 2039 HOH HOH . F 5 HOH B 40 2040 2040 HOH HOH . F 5 HOH B 41 2041 2041 HOH HOH . F 5 HOH B 42 2042 2042 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -51.881 _atom_site.Cartn_y 18.592 _atom_site.Cartn_z 1.712 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 41.54 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1182 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 286 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #