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_model_server_params.name     atom_site 
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CADMIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    18 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_cell.length_c            148.121 
_cell.Z_PDB               6 
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_symmetry.Int_Tables_number        169 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
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#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 C N N 
? 3 D N N 
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 H N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 N N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
? 3 Q N N 
? 3 R N N 
? 3 S N N 
? 3 T N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
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_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 B OG SER 6 P SER 149 1_555 U C1 NAG . P NAG 1153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLU 23 A GLU 51 1_555 O CD CD . A CD 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 23 A GLU 51 1_555 O CD CD . A CD 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 26 A GLU 54 5_554 R CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 30 A ASP 58 1_555 Q CD CD . A CD 1634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 30 A ASP 58 1_555 Q CD CD . A CD 1634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? 
metalc ? metalc6 A O LEU 40 A LEU 68 1_555 C CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 43 A GLU 71 1_555 C CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? 
metalc ? metalc8 A OE2 GLU 43 A GLU 71 1_555 C CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.011 ? 
metalc ? metalc9 A O GLU 45 A GLU 73 1_555 D CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? 
metalc ? metalc10 A OE1 GLU 80 A GLU 108 1_555 D CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 83 A ASP 111 1_555 D CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? 
metalc ? metalc12 A OD2 ASP 83 A ASP 111 1_555 D CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? 
metalc ? metalc13 A OD2 ASP 84 A ASP 112 1_555 E CD CD . A CD 1622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASP 89 A ASP 117 1_555 F CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 89 A ASP 117 1_555 F CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? 
metalc ? metalc16 A OD2 ASP 111 A ASP 139 1_555 G CD CD . A CD 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? 
metalc ? metalc17 A OD1 ASP 111 A ASP 139 1_555 G CD CD . A CD 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? 
metalc ? metalc18 A OE1 GLU 117 A GLU 145 1_555 F CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.192 ? 
metalc ? metalc19 A OE2 GLU 117 A GLU 145 1_555 F CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc20 A OE1 GLU 142 A GLU 170 1_555 I CD CD . A CD 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc21 A OE2 GLU 142 A GLU 170 1_555 I CD CD . A CD 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? 
metalc ? metalc22 A OD1 ASP 224 A ASP 252 1_555 H CD CD . A CD 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc23 A OD2 ASP 238 A ASP 266 1_555 R CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? 
metalc ? metalc24 A OD1 ASP 240 A ASP 268 6_555 G CD CD . A CD 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.148 ? 
metalc ? metalc25 A OD2 ASP 240 A ASP 268 6_555 G CD CD . A CD 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? 
metalc ? metalc26 A OE2 GLU 244 A GLU 272 1_555 J CD CD . A CD 1627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc27 A OE2 GLU 244 A GLU 272 6_555 Q CD CD . A CD 1634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? 
metalc ? metalc28 A OE1 GLU 244 A GLU 272 6_555 Q CD CD . A CD 1634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? 
metalc ? metalc29 A NE2 HIS 248 A HIS 276 1_555 J CD CD . A CD 1627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? 
metalc ? metalc30 A OE2 GLU 254 A GLU 282 1_555 K CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? 
metalc ? metalc31 A OD2 ASP 258 A ASP 286 1_555 K CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? 
metalc ? metalc32 A OD1 ASP 258 A ASP 286 1_555 K CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? 
metalc ? metalc33 A NZ LYS 278 A LYS 306 1_555 R CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? 
metalc ? metalc34 A OE1 GLU 334 A GLU 362 1_555 L CD CD . A CD 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? 
metalc ? metalc35 A OE2 GLU 334 A GLU 362 1_555 L CD CD . A CD 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc36 A O LYS 376 A LYS 404 1_555 N CD CD . A CD 1631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? 
metalc ? metalc37 A NE2 HIS 385 A HIS 413 1_555 M CD CD . A CD 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc38 A OD1 ASP 396 A ASP 424 1_555 L CD CD . A CD 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? 
metalc ? metalc39 A OD2 ASP 396 A ASP 424 1_555 L CD CD . A CD 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? 
metalc ? metalc40 A NE2 HIS 405 A HIS 433 1_555 N CD CD . A CD 1631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? 
metalc ? metalc41 A OD1 ASN 422 A ASN 450 1_555 O CD CD . A CD 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? 
metalc ? metalc42 A OD1 ASP 424 A ASP 452 1_555 O CD CD . A CD 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc43 A OD2 ASP 446 A ASP 474 1_555 S CD CD . A CD 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc44 A OD1 ASP 446 A ASP 474 1_555 S CD CD . A CD 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? 
metalc ? metalc45 A OE1 GLU 506 A GLU 534 1_555 S CD CD . A CD 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? 
metalc ? metalc46 A OE2 GLU 506 A GLU 534 1_555 S CD CD . A CD 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.245 ? 
metalc ? metalc47 A OE1 GLU 517 A GLU 545 2_545 F CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.865 ? 
metalc ? metalc48 A OE2 GLU 517 A GLU 545 2_545 F CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? 
metalc ? metalc49 A OE2 GLU 517 A GLU 545 2_545 T CD CD . A CD 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? 
metalc ? metalc50 A OE2 GLU 521 A GLU 549 2_545 T CD CD . A CD 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc51 A OE1 GLU 521 A GLU 549 2_545 T CD CD . A CD 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? 
metalc ? metalc52 A OE2 GLU 522 A GLU 550 2_545 E CD CD . A CD 1622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc53 A OE1 GLU 553 A GLU 581 1_555 P CD CD . A CD 1633 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc54 A OE1 GLU 560 A GLU 588 2_545 K CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? 
metalc ? metalc55 A OE2 GLU 560 A GLU 588 2_545 K CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc56 C CD CD . A CD 1620 1_555 V O HOH . A HOH 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc57 I CD CD . A CD 1626 1_555 V O HOH . A HOH 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc58 J CD CD . A CD 1627 1_555 V O HOH . A HOH 2046 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.869 ? 
metalc ? metalc59 J CD CD . A CD 1627 1_555 V O HOH . A HOH 2047 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc60 L CD CD . A CD 1629 1_555 V O HOH . A HOH 2062 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.137 ? 
metalc ? metalc61 N CD CD . A CD 1631 1_555 V O HOH . A HOH 2096 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.956 ? 
metalc ? metalc62 Q CD CD . A CD 1634 1_555 V O HOH . A HOH 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2YDR 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004895 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00979 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006751 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 CD A 1 1620 1620 CD CD . 
D 3 CD A 1 1621 1621 CD CD . 
E 3 CD A 1 1622 1622 CD CD . 
F 3 CD A 1 1623 1623 CD CD . 
G 3 CD A 1 1624 1624 CD CD . 
H 3 CD A 1 1625 1625 CD CD . 
I 3 CD A 1 1626 1626 CD CD . 
J 3 CD A 1 1627 1627 CD CD . 
K 3 CD A 1 1628 1628 CD CD . 
L 3 CD A 1 1629 1629 CD CD . 
M 3 CD A 1 1630 1630 CD CD . 
N 3 CD A 1 1631 1631 CD CD . 
O 3 CD A 1 1632 1632 CD CD . 
P 3 CD A 1 1633 1633 CD CD . 
Q 3 CD A 1 1634 1634 CD CD . 
R 3 CD A 1 1635 1635 CD CD . 
S 3 CD A 1 1636 1636 CD CD . 
T 3 CD A 1 1637 1637 CD CD . 
U 4 NAG P 1 1153 1153 NAG NAG . 
V 5 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
V 5 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
V 5 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . 
V 5 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . 
V 5 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . 
V 5 HOH A 6 2006 2006 HOH HOH . 
V 5 HOH A 7 2007 2007 HOH HOH . 
V 5 HOH A 8 2008 2008 HOH HOH . 
V 5 HOH A 9 2009 2009 HOH HOH . 
V 5 HOH A 10 2010 2010 HOH HOH . 
V 5 HOH A 11 2011 2011 HOH HOH . 
V 5 HOH A 12 2012 2012 HOH HOH . 
V 5 HOH A 13 2013 2013 HOH HOH . 
V 5 HOH A 14 2014 2014 HOH HOH . 
V 5 HOH A 15 2015 2015 HOH HOH . 
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