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_model_server_params.name     atom_site 
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#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CADMIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    19 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_b            118.09 
_cell.length_c            148.26 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2YDS 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        169 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
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#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 D N N 
? 4 E N N 
? 4 F N N 
? 4 G N N 
? 4 H N N 
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? 4 K N N 
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? 4 P N N 
? 4 Q N N 
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? 4 T N N 
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? 4 V N N 
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loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
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_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
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_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 C C1 NAG . A NAG 1618 1_555 B OG SER 4 T SER 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 23 A GLU 51 1_555 D CD CD . A CD 1619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.53 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 26 A GLU 54 1_555 E CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.06 ? 
metalc ? metalc3 A OE2 GLU 26 A GLU 54 1_555 E CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.112 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 30 A ASP 58 1_555 F CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 30 A ASP 58 1_555 F CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? 
metalc ? metalc6 A O LEU 40 A LEU 68 1_555 G CD CD . A CD 1622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 43 A GLU 71 1_555 G CD CD . A CD 1622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? 
metalc ? metalc8 A OE2 GLU 43 A GLU 71 1_555 G CD CD . A CD 1622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? 
metalc ? metalc9 A O GLU 45 A GLU 73 1_555 H CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc10 A OE1 GLU 80 A GLU 108 1_555 H CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 83 A ASP 111 1_555 H CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? 
metalc ? metalc12 A OD2 ASP 83 A ASP 111 1_555 H CD CD . A CD 1623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? 
metalc ? metalc13 A OD2 ASP 84 A ASP 112 1_555 I CD CD . A CD 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASP 89 A ASP 117 1_555 J CD CD . A CD 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 89 A ASP 117 1_555 J CD CD . A CD 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.781 ? 
metalc ? metalc16 A OD2 ASP 111 A ASP 139 1_555 K CD CD . A CD 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? 
metalc ? metalc17 A OD1 ASP 111 A ASP 139 1_555 K CD CD . A CD 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? 
metalc ? metalc18 A OE2 GLU 117 A GLU 145 1_555 J CD CD . A CD 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? 
metalc ? metalc19 A OE2 GLU 142 A GLU 170 1_555 M CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.473 ? 
metalc ? metalc20 A OE1 GLU 142 A GLU 170 1_555 M CD CD . A CD 1628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc21 A OD1 ASP 224 A ASP 252 1_555 L CD CD . A CD 1627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? 
metalc ? metalc22 A OD2 ASP 238 A ASP 266 6_555 E CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? 
metalc ? metalc23 A OD2 ASP 240 A ASP 268 6_555 K CD CD . A CD 1626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
metalc ? metalc24 A OE2 GLU 244 A GLU 272 6_555 F CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.781 ? 
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metalc ? metalc26 A OE1 GLU 244 A GLU 272 6_555 F CD CD . A CD 1621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.133 ? 
metalc ? metalc27 A OE1 GLU 244 A GLU 272 1_555 N CD CD . A CD 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.001 ? 
metalc ? metalc28 A NE2 HIS 248 A HIS 276 1_555 N CD CD . A CD 1629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? 
metalc ? metalc29 A OE1 GLU 254 A GLU 282 1_555 O CD CD . A CD 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? 
metalc ? metalc30 A OD1 ASP 258 A ASP 286 1_555 O CD CD . A CD 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc31 A OD2 ASP 258 A ASP 286 1_555 O CD CD . A CD 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? 
metalc ? metalc32 A NZ LYS 278 A LYS 306 6_555 E CD CD . A CD 1620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? 
metalc ? metalc33 A OE1 GLU 334 A GLU 362 1_555 P CD CD . A CD 1631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? 
metalc ? metalc34 A OE2 GLU 334 A GLU 362 1_555 P CD CD . A CD 1631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? 
metalc ? metalc35 A OD1 ASP 360 A ASP 388 1_555 Q CD CD . A CD 1632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? 
metalc ? metalc36 A O LYS 376 A LYS 404 1_555 R CD CD . A CD 1633 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? 
metalc ? metalc37 A NE2 HIS 385 A HIS 413 1_555 S CD CD . A CD 1634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc38 A OD2 ASP 396 A ASP 424 1_555 P CD CD . A CD 1631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc39 A OD1 ASP 396 A ASP 424 1_555 P CD CD . A CD 1631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? 
metalc ? metalc40 A NE2 HIS 405 A HIS 433 1_555 R CD CD . A CD 1633 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.702 ? 
metalc ? metalc41 A OD1 ASN 422 A ASN 450 1_555 D CD CD . A CD 1619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? 
metalc ? metalc42 A OD1 ASP 424 A ASP 452 1_555 D CD CD . A CD 1619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? 
metalc ? metalc43 A OD2 ASP 429 A ASP 457 1_555 U CD CD . A CD 1636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? 
metalc ? metalc44 A OD2 ASP 446 A ASP 474 1_555 T CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc45 A OD1 ASP 446 A ASP 474 1_555 T CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? 
metalc ? metalc46 A OE2 GLU 506 A GLU 534 1_555 T CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? 
metalc ? metalc47 A OE1 GLU 506 A GLU 534 1_555 T CD CD . A CD 1635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? 
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metalc ? metalc49 A OE1 GLU 517 A GLU 545 2_545 J CD CD . A CD 1625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? 
metalc ? metalc50 A OE2 GLU 517 A GLU 545 2_545 V CD CD . A CD 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.122 ? 
metalc ? metalc51 A OE2 GLU 521 A GLU 549 2_545 V CD CD . A CD 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? 
metalc ? metalc52 A OE1 GLU 521 A GLU 549 2_545 V CD CD . A CD 1637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? 
metalc ? metalc53 A OE2 GLU 522 A GLU 550 2_545 I CD CD . A CD 1624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? 
metalc ? metalc54 A OE2 GLU 560 A GLU 588 2_545 O CD CD . A CD 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc55 A OE1 GLU 560 A GLU 588 2_545 O CD CD . A CD 1630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.73 ? 
metalc ? metalc56 D CD CD . A CD 1619 1_555 W O HOH . A HOH 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.872 ? 
metalc ? metalc57 F CD CD . A CD 1621 1_555 W O HOH . A HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc58 F CD CD . A CD 1621 1_555 W O HOH . A HOH 2059 6_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? 
metalc ? metalc59 G CD CD . A CD 1622 1_555 W O HOH . A HOH 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc60 H CD CD . A CD 1623 1_555 W O HOH . A HOH 2019 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
metalc ? metalc61 I CD CD . A CD 1624 1_555 W O HOH . A HOH 2020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? 
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metalc ? metalc63 K CD CD . A CD 1626 1_555 W O HOH . A HOH 2056 6_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? 
metalc ? metalc64 M CD CD . A CD 1628 1_555 W O HOH . A HOH 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.074 ? 
metalc ? metalc65 M CD CD . A CD 1628 1_555 W O HOH . A HOH 2026 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? 
metalc ? metalc66 M CD CD . A CD 1628 1_555 W O HOH . A HOH 2027 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc67 M CD CD . A CD 1628 1_555 W O HOH . A HOH 2033 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc68 N CD CD . A CD 1629 1_555 W O HOH . A HOH 2001 5_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.132 ? 
metalc ? metalc69 N CD CD . A CD 1629 1_555 W O HOH . A HOH 2058 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.851 ? 
metalc ? metalc70 O CD CD . A CD 1630 1_555 W O HOH . A HOH 2062 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc71 O CD CD . A CD 1630 1_555 W O HOH . A HOH 2063 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? 
metalc ? metalc72 R CD CD . A CD 1633 1_555 W O HOH . A HOH 2083 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? 
metalc ? metalc73 R CD CD . A CD 1633 1_555 W O HOH . A HOH 2091 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.097 ? 
metalc ? metalc74 T CD CD . A CD 1635 1_555 W O HOH . A HOH 2042 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.086 ? 
metalc ? metalc75 T CD CD . A CD 1635 1_555 W O HOH . A HOH 2106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.884 ? 
metalc ? metalc76 T CD CD . A CD 1635 1_555 W O HOH . A HOH 2115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.199 ? 
metalc ? metalc77 U CD CD . A CD 1636 1_555 W O HOH . A HOH 2099 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.206 ? 
metalc ? metalc78 U CD CD . A CD 1636 1_555 W O HOH . A HOH 2100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
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_atom_sites.entry_id                     2YDS 
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