data_2YIA
#
_model_server_result.job_id            3dJOrmEuTYfoPEiHU5lbrg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-07-16 12:31:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2yia 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":1002}' 
#
_entry.id    2YIA 
#
_exptl.entry_id    2YIA 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              39.098 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'POTASSIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2YIA 
_cell.length_a            200.938 
_cell.length_b            209.467 
_cell.length_c            243.393 
_cell.Z_PDB               32 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2YIA 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 5 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 6 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 7 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 8 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,I 1 1 
B,J 2 1 
C,K 3 1 
D,L 4 1 
E,M 5 1 
F,N 6 1 
G,O 7 1 
H,P 8 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O VAL 177 A VAL 177 1_555 I K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.8 ? 
metalc ? metalc2 A O ASN 182 A ASN 182 1_555 I K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASN 184 A ASN 184 1_555 I K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASN 409 A ASN 409 1_555 I K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? 
metalc ? metalc5 A O GLY 512 A GLY 512 1_555 I K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASN 514 A ASN 514 1_555 I K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? 
metalc ? metalc7 B O VAL 177 B VAL 177 1_555 J K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? 
metalc ? metalc8 B O ASN 182 B ASN 182 1_555 J K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? 
metalc ? metalc9 B OD1 ASN 184 B ASN 184 1_555 J K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc10 B OD1 ASN 409 B ASN 409 1_555 J K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? 
metalc ? metalc11 B O GLY 512 B GLY 512 1_555 J K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? 
metalc ? metalc12 B OD1 ASN 514 B ASN 514 1_555 J K K . B K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? 
metalc ? metalc13 C O VAL 177 C VAL 177 1_555 K K K . C K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? 
metalc ? metalc14 C O ASN 182 C ASN 182 1_555 K K K . C K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? 
metalc ? metalc15 C OD1 ASN 184 C ASN 184 1_555 K K K . C K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? 
metalc ? metalc16 C OD1 ASN 409 C ASN 409 1_555 K K K . C K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? 
metalc ? metalc17 C O GLY 512 C GLY 512 1_555 K K K . C K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? 
metalc ? metalc18 C OD1 ASN 514 C ASN 514 1_555 K K K . C K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? 
metalc ? metalc19 D O VAL 177 D VAL 177 1_555 L K K . D K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? 
metalc ? metalc20 D O ASN 182 D ASN 182 1_555 L K K . D K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc21 D OD1 ASN 184 D ASN 184 1_555 L K K . D K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? 
metalc ? metalc22 D OD1 ASN 409 D ASN 409 1_555 L K K . D K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? 
metalc ? metalc23 D O GLY 512 D GLY 512 1_555 L K K . D K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? 
metalc ? metalc24 D OD1 ASN 514 D ASN 514 1_555 L K K . D K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.736 ? 
metalc ? metalc25 E O VAL 177 E VAL 177 1_555 M K K . E K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? 
metalc ? metalc26 E O ASN 182 E ASN 182 1_555 M K K . E K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc27 E OD1 ASN 184 E ASN 184 1_555 M K K . E K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? 
metalc ? metalc28 E OD1 ASN 409 E ASN 409 1_555 M K K . E K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc29 E O GLY 512 E GLY 512 1_555 M K K . E K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? 
metalc ? metalc30 E OD1 ASN 514 E ASN 514 1_555 M K K . E K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? 
metalc ? metalc31 F O VAL 177 F VAL 177 1_555 N K K . F K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? 
metalc ? metalc32 F O ASN 182 F ASN 182 1_555 N K K . F K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? 
metalc ? metalc33 F OD1 ASN 184 F ASN 184 1_555 N K K . F K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc34 F OD1 ASN 409 F ASN 409 1_555 N K K . F K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? 
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metalc ? metalc36 F OD1 ASN 514 F ASN 514 1_555 N K K . F K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? 
metalc ? metalc37 G O VAL 177 G VAL 177 1_555 O K K . G K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? 
metalc ? metalc38 G O ASN 182 G ASN 182 1_555 O K K . G K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? 
metalc ? metalc39 G OD1 ASN 184 G ASN 184 1_555 O K K . G K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? 
metalc ? metalc40 G OD1 ASN 409 G ASN 409 1_555 O K K . G K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.77 ? 
metalc ? metalc41 G O GLY 512 G GLY 512 1_555 O K K . G K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc42 G OD1 ASN 514 G ASN 514 1_555 O K K . G K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc43 H O VAL 177 H VAL 177 1_555 P K K . H K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc44 H O ASN 182 H ASN 182 1_555 P K K . H K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? 
metalc ? metalc45 H OD1 ASN 184 H ASN 184 1_555 P K K . H K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? 
metalc ? metalc46 H OD1 ASN 409 H ASN 409 1_555 P K K . H K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? 
metalc ? metalc47 H O GLY 512 H GLY 512 1_555 P K K . H K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? 
metalc ? metalc48 H OD1 ASN 514 H ASN 514 1_555 P K K . H K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? 
#
_chem_comp.formula           'K 1' 
_chem_comp.formula_weight    39.098 
_chem_comp.id                K 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'POTASSIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     2YIA 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.004977 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.004774 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004109 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 2 K A 1 1002 1002 K K . 
J 2 K B 1 1002 1002 K K . 
K 2 K C 1 1002 1002 K K . 
L 2 K D 1 1002 1002 K K . 
M 2 K E 1 1002 1002 K K . 
N 2 K F 1 1002 1002 K K . 
O 2 K G 1 1002 1002 K K . 
P 2 K H 1 1002 1002 K K . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           K 
_atom_site.label_atom_id         K 
_atom_site.label_comp_id         K 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               29.19 
_atom_site.Cartn_y               74.651 
_atom_site.Cartn_z               144.022 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        74.62 
_atom_site.pdbx_formal_charge    1 
_atom_site.auth_atom_id          K 
_atom_site.auth_comp_id          K 
_atom_site.auth_seq_id           1002 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              96 
_model_server_stats.parse_time_ms           25 
_model_server_stats.create_model_time_ms    76 
_model_server_stats.query_time_ms           337 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#