data_2Z4Q # _model_server_result.job_id kBBWlLAU7d0F9xfYNoF7OA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-17 15:30:51' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2z4q # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 2Z4Q # _exptl.entry_id 2Z4Q _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 112.411 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CADMIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 2Z4Q _cell.length_a 126.6 _cell.length_b 126.6 _cell.length_c 68.278 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2Z4Q _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 171 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 62' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 C N N ? 3 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 23 A CYS 23 1_555 A SG CYS 93 A CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 139 A CYS 139 1_555 A SG CYS 199 A CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 219 A CYS 219 1_555 B SG CYS 133 B CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 22 B CYS 22 1_555 B SG CYS 96 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 145 B CYS 145 1_555 B SG CYS 200 B CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? # _chem_comp.formula 'Cd 2' _chem_comp.formula_weight 112.411 _chem_comp.id CD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CADMIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2Z4Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007899 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.00456 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009121 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014646 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 CD A 1 1002 1002 CD CD . D 4 CL A 1 2001 2001 CL CL . E 3 CD B 1 1001 1001 CD CD . F 5 HOH A 1 2002 2 HOH WAT . F 5 HOH A 2 2003 3 HOH WAT . F 5 HOH A 3 2004 4 HOH WAT . F 5 HOH A 4 2005 7 HOH WAT . F 5 HOH A 5 2006 10 HOH WAT . F 5 HOH A 6 2007 11 HOH WAT . F 5 HOH A 7 2008 12 HOH WAT . F 5 HOH A 8 2009 14 HOH WAT . F 5 HOH A 9 2010 15 HOH WAT . F 5 HOH A 10 2011 16 HOH WAT . F 5 HOH A 11 2012 17 HOH WAT . F 5 HOH A 12 2013 19 HOH WAT . F 5 HOH A 13 2014 21 HOH WAT . F 5 HOH A 14 2015 23 HOH WAT . F 5 HOH A 15 2016 24 HOH WAT . F 5 HOH A 16 2017 27 HOH WAT . F 5 HOH A 17 2018 28 HOH WAT . F 5 HOH A 18 2019 32 HOH WAT . F 5 HOH A 19 2020 33 HOH WAT . F 5 HOH A 20 2021 35 HOH WAT . F 5 HOH A 21 2022 36 HOH WAT . F 5 HOH A 22 2023 37 HOH WAT . F 5 HOH A 23 2024 39 HOH WAT . F 5 HOH A 24 2025 41 HOH WAT . F 5 HOH A 25 2026 42 HOH WAT . F 5 HOH A 26 2027 43 HOH WAT . F 5 HOH A 27 2028 45 HOH WAT . F 5 HOH A 28 2029 47 HOH WAT . F 5 HOH A 29 2030 48 HOH WAT . F 5 HOH A 30 2031 51 HOH WAT . F 5 HOH A 31 2032 52 HOH WAT . F 5 HOH A 32 2033 53 HOH WAT . F 5 HOH A 33 2034 54 HOH WAT . F 5 HOH A 34 2035 56 HOH WAT . F 5 HOH A 35 2036 58 HOH WAT . F 5 HOH A 36 2037 62 HOH WAT . F 5 HOH A 37 2038 63 HOH WAT . F 5 HOH A 38 2039 64 HOH WAT . F 5 HOH A 39 2040 65 HOH WAT . F 5 HOH A 40 2041 66 HOH WAT . F 5 HOH A 41 2042 67 HOH WAT . F 5 HOH A 42 2043 68 HOH WAT . F 5 HOH A 43 2044 69 HOH WAT . F 5 HOH A 44 2045 70 HOH WAT . F 5 HOH A 45 2046 71 HOH WAT . F 5 HOH A 46 2047 74 HOH WAT . F 5 HOH A 47 2048 75 HOH WAT . F 5 HOH A 48 2049 76 HOH WAT . F 5 HOH A 49 2050 77 HOH WAT . F 5 HOH A 50 2051 78 HOH WAT . F 5 HOH A 51 2052 81 HOH WAT . F 5 HOH A 52 2053 82 HOH WAT . F 5 HOH A 53 2054 85 HOH WAT . F 5 HOH A 54 2055 87 HOH WAT . F 5 HOH A 55 2056 88 HOH WAT . F 5 HOH A 56 2057 90 HOH WAT . F 5 HOH A 57 2058 92 HOH WAT . F 5 HOH A 58 2059 94 HOH WAT . F 5 HOH A 59 2060 95 HOH WAT . F 5 HOH A 60 2061 96 HOH WAT . F 5 HOH A 61 2062 99 HOH WAT . F 5 HOH A 62 2063 100 HOH WAT . F 5 HOH A 63 2064 101 HOH WAT . F 5 HOH A 64 2065 103 HOH WAT . F 5 HOH A 65 2066 104 HOH WAT . F 5 HOH A 66 2067 109 HOH WAT . F 5 HOH A 67 2068 110 HOH WAT . F 5 HOH A 68 2069 111 HOH WAT . F 5 HOH A 69 2070 113 HOH WAT . F 5 HOH A 70 2071 118 HOH WAT . F 5 HOH A 71 2072 119 HOH WAT . F 5 HOH A 72 2073 121 HOH WAT . F 5 HOH A 73 2074 124 HOH WAT . F 5 HOH A 74 2075 126 HOH WAT . F 5 HOH A 75 2076 127 HOH WAT . F 5 HOH A 76 2077 128 HOH WAT . F 5 HOH A 77 2078 130 HOH WAT . F 5 HOH A 78 2079 134 HOH WAT . F 5 HOH A 79 2080 135 HOH WAT . F 5 HOH A 80 2081 138 HOH WAT . F 5 HOH A 81 2082 139 HOH WAT . F 5 HOH A 82 2083 140 HOH WAT . F 5 HOH A 83 2084 142 HOH WAT . F 5 HOH A 84 2085 143 HOH WAT . F 5 HOH A 85 2086 144 HOH WAT . F 5 HOH A 86 2087 147 HOH WAT . F 5 HOH A 87 2088 150 HOH WAT . F 5 HOH A 88 2089 154 HOH WAT . F 5 HOH A 89 2090 156 HOH WAT . F 5 HOH A 90 2091 158 HOH WAT . F 5 HOH A 91 2092 159 HOH WAT . F 5 HOH A 92 2093 160 HOH WAT . F 5 HOH A 93 2094 161 HOH WAT . F 5 HOH A 94 2095 162 HOH WAT . F 5 HOH A 95 2096 165 HOH WAT . F 5 HOH A 96 2097 168 HOH WAT . F 5 HOH A 97 2098 169 HOH WAT . F 5 HOH A 98 2099 171 HOH WAT . F 5 HOH A 99 2100 172 HOH WAT . F 5 HOH A 100 2101 176 HOH WAT . F 5 HOH A 101 2102 180 HOH WAT . F 5 HOH A 102 2103 182 HOH WAT . F 5 HOH A 103 2104 183 HOH WAT . F 5 HOH A 104 2105 186 HOH WAT . F 5 HOH A 105 2106 187 HOH WAT . F 5 HOH A 106 2107 188 HOH WAT . F 5 HOH A 107 2108 189 HOH WAT . F 5 HOH A 108 2109 190 HOH WAT . F 5 HOH A 109 2110 191 HOH WAT . F 5 HOH A 110 2111 192 HOH WAT . F 5 HOH A 111 2112 193 HOH WAT . F 5 HOH A 112 2113 194 HOH WAT . F 5 HOH A 113 2114 195 HOH WAT . F 5 HOH A 114 2115 196 HOH WAT . F 5 HOH A 115 2116 199 HOH WAT . F 5 HOH A 116 2117 200 HOH WAT . F 5 HOH A 117 2118 203 HOH WAT . F 5 HOH A 118 2119 206 HOH WAT . F 5 HOH A 119 2120 208 HOH WAT . F 5 HOH A 120 2121 212 HOH WAT . F 5 HOH A 121 2122 213 HOH WAT . F 5 HOH A 122 2123 214 HOH WAT . F 5 HOH A 123 2124 215 HOH WAT . F 5 HOH A 124 2125 216 HOH WAT . F 5 HOH A 125 2126 217 HOH WAT . F 5 HOH A 126 2127 218 HOH WAT . F 5 HOH A 127 2128 219 HOH WAT . F 5 HOH A 128 2129 220 HOH WAT . F 5 HOH A 129 2130 221 HOH WAT . F 5 HOH A 130 2131 222 HOH WAT . F 5 HOH A 131 2132 223 HOH WAT . F 5 HOH A 132 2133 224 HOH WAT . F 5 HOH A 133 2134 225 HOH WAT . F 5 HOH A 134 2135 227 HOH WAT . F 5 HOH A 135 2136 228 HOH WAT . F 5 HOH A 136 2137 232 HOH WAT . F 5 HOH A 137 2138 237 HOH WAT . F 5 HOH A 138 2139 238 HOH WAT . F 5 HOH A 139 2140 239 HOH WAT . G 5 HOH B 1 1002 1 HOH WAT . G 5 HOH B 2 1003 5 HOH WAT . G 5 HOH B 3 1004 6 HOH WAT . G 5 HOH B 4 1005 8 HOH WAT . G 5 HOH B 5 1006 9 HOH WAT . G 5 HOH B 6 1007 13 HOH WAT . G 5 HOH B 7 1008 18 HOH WAT . G 5 HOH B 8 1009 20 HOH WAT . G 5 HOH B 9 1010 22 HOH WAT . G 5 HOH B 10 1011 25 HOH WAT . G 5 HOH B 11 1012 26 HOH WAT . G 5 HOH B 12 1013 29 HOH WAT . G 5 HOH B 13 1014 30 HOH WAT . G 5 HOH B 14 1015 31 HOH WAT . G 5 HOH B 15 1016 34 HOH WAT . G 5 HOH B 16 1017 38 HOH WAT . G 5 HOH B 17 1018 40 HOH WAT . G 5 HOH B 18 1019 44 HOH WAT . G 5 HOH B 19 1020 46 HOH WAT . G 5 HOH B 20 1021 49 HOH WAT . G 5 HOH B 21 1022 50 HOH WAT . G 5 HOH B 22 1023 55 HOH WAT . G 5 HOH B 23 1024 57 HOH WAT . G 5 HOH B 24 1025 59 HOH WAT . G 5 HOH B 25 1026 60 HOH WAT . G 5 HOH B 26 1027 61 HOH WAT . G 5 HOH B 27 1028 72 HOH WAT . G 5 HOH B 28 1029 73 HOH WAT . G 5 HOH B 29 1030 79 HOH WAT . G 5 HOH B 30 1031 80 HOH WAT . G 5 HOH B 31 1032 83 HOH WAT . G 5 HOH B 32 1033 84 HOH WAT . G 5 HOH B 33 1034 86 HOH WAT . G 5 HOH B 34 1035 89 HOH WAT . G 5 HOH B 35 1036 91 HOH WAT . G 5 HOH B 36 1037 93 HOH WAT . G 5 HOH B 37 1038 97 HOH WAT . G 5 HOH B 38 1039 98 HOH WAT . G 5 HOH B 39 1040 102 HOH WAT . G 5 HOH B 40 1041 105 HOH WAT . G 5 HOH B 41 1042 106 HOH WAT . G 5 HOH B 42 1043 107 HOH WAT . G 5 HOH B 43 1044 108 HOH WAT . G 5 HOH B 44 1045 112 HOH WAT . G 5 HOH B 45 1046 114 HOH WAT . G 5 HOH B 46 1047 115 HOH WAT . G 5 HOH B 47 1048 116 HOH WAT . G 5 HOH B 48 1049 117 HOH WAT . G 5 HOH B 49 1050 120 HOH WAT . G 5 HOH B 50 1051 122 HOH WAT . G 5 HOH B 51 1052 123 HOH WAT . G 5 HOH B 52 1053 125 HOH WAT . G 5 HOH B 53 1054 129 HOH WAT . G 5 HOH B 54 1055 131 HOH WAT . G 5 HOH B 55 1056 132 HOH WAT . G 5 HOH B 56 1057 133 HOH WAT . G 5 HOH B 57 1058 136 HOH WAT . G 5 HOH B 58 1059 137 HOH WAT . G 5 HOH B 59 1060 141 HOH WAT . G 5 HOH B 60 1061 145 HOH WAT . G 5 HOH B 61 1062 146 HOH WAT . G 5 HOH B 62 1063 148 HOH WAT . G 5 HOH B 63 1064 149 HOH WAT . G 5 HOH B 64 1065 151 HOH WAT . G 5 HOH B 65 1066 152 HOH WAT . G 5 HOH B 66 1067 153 HOH WAT . G 5 HOH B 67 1068 155 HOH WAT . G 5 HOH B 68 1069 157 HOH WAT . G 5 HOH B 69 1070 163 HOH WAT . G 5 HOH B 70 1071 164 HOH WAT . G 5 HOH B 71 1072 166 HOH WAT . G 5 HOH B 72 1073 167 HOH WAT . G 5 HOH B 73 1074 170 HOH WAT . G 5 HOH B 74 1075 173 HOH WAT . G 5 HOH B 75 1076 174 HOH WAT . G 5 HOH B 76 1077 175 HOH WAT . G 5 HOH B 77 1078 177 HOH WAT . G 5 HOH B 78 1079 178 HOH WAT . G 5 HOH B 79 1080 179 HOH WAT . G 5 HOH B 80 1081 181 HOH WAT . G 5 HOH B 81 1082 184 HOH WAT . G 5 HOH B 82 1083 185 HOH WAT . G 5 HOH B 83 1084 197 HOH WAT . G 5 HOH B 84 1085 198 HOH WAT . G 5 HOH B 85 1086 201 HOH WAT . G 5 HOH B 86 1087 202 HOH WAT . G 5 HOH B 87 1088 204 HOH WAT . G 5 HOH B 88 1089 205 HOH WAT . G 5 HOH B 89 1090 207 HOH WAT . G 5 HOH B 90 1091 209 HOH WAT . G 5 HOH B 91 1092 210 HOH WAT . G 5 HOH B 92 1093 211 HOH WAT . G 5 HOH B 93 1094 226 HOH WAT . G 5 HOH B 94 1095 229 HOH WAT . G 5 HOH B 95 1096 230 HOH WAT . G 5 HOH B 96 1097 231 HOH WAT . G 5 HOH B 97 1098 233 HOH WAT . G 5 HOH B 98 1099 234 HOH WAT . G 5 HOH B 99 1100 235 HOH WAT . G 5 HOH B 100 1101 236 HOH WAT . G 5 HOH B 101 1102 240 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CD _atom_site.label_atom_id CD _atom_site.label_comp_id CD _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -35.129 _atom_site.Cartn_y -6.395 _atom_site.Cartn_z -16.882 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 23.12 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CD _atom_site.auth_comp_id CD _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 11 _model_server_stats.query_time_ms 277 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #