data_2ZAG # _model_server_result.job_id OBpn9FSeUWPz6h2La3d6xA _model_server_result.datetime_utc '2025-07-28 17:20:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2zag # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1}' # _entry.id 2ZAG # _exptl.entry_id 2ZAG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2ZAG _cell.length_a 137.402 _cell.length_b 266.397 _cell.length_c 73.982 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2ZAG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 5 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F 1 1 B,G,H 2 1 C,I,J 3 1 D,K,L 4 1 A,B,E,F,G,H 5 1 C,D,I,J,K,L 6 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 G N N ? 2 I N N ? 2 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 168 A CYS 638 1_555 A SG CYS 188 A CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 168 B CYS 638 1_555 B SG CYS 188 B CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 168 C CYS 638 1_555 C SG CYS 188 C CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 168 D CYS 638 1_555 D SG CYS 188 D CYS 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? covale ? covale1 A C LEU 171 A LEU 641 1_555 A N MSE 172 A MSE 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale2 A C MSE 172 A MSE 642 1_555 A N VAL 173 A VAL 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale3 A C HIS 320 A HIS 790 1_555 A N MSE 321 A MSE 791 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale4 A C MSE 321 A MSE 791 1_555 A N ASP 322 A ASP 792 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale5 A C GLN 420 A GLN 890 1_555 A N MSE 421 A MSE 891 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale6 A C MSE 421 A MSE 891 1_555 A N ASP 422 A ASP 892 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale7 A C LEU 486 A LEU 956 1_555 A N MSE 487 A MSE 957 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale8 A C MSE 487 A MSE 957 1_555 A N LEU 488 A LEU 958 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale9 B C LEU 171 B LEU 641 1_555 B N MSE 172 B MSE 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale10 B C MSE 172 B MSE 642 1_555 B N VAL 173 B VAL 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale11 B C HIS 320 B HIS 790 1_555 B N MSE 321 B MSE 791 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale12 B C MSE 321 B MSE 791 1_555 B N ASP 322 B ASP 792 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale13 B C GLN 420 B GLN 890 1_555 B N MSE 421 B MSE 891 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale14 B C MSE 421 B MSE 891 1_555 B N ASP 422 B ASP 892 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale15 B C LEU 486 B LEU 956 1_555 B N MSE 487 B MSE 957 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale16 B C MSE 487 B MSE 957 1_555 B N LEU 488 B LEU 958 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale17 C C LEU 171 C LEU 641 1_555 C N MSE 172 C MSE 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale18 C C MSE 172 C MSE 642 1_555 C N VAL 173 C VAL 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale19 C C HIS 320 C HIS 790 1_555 C N MSE 321 C MSE 791 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale20 C C MSE 321 C MSE 791 1_555 C N ASP 322 C ASP 792 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale21 C C GLN 420 C GLN 890 1_555 C N MSE 421 C MSE 891 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale22 C C MSE 421 C MSE 891 1_555 C N ASP 422 C ASP 892 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale23 C C LEU 486 C LEU 956 1_555 C N MSE 487 C MSE 957 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale24 C C MSE 487 C MSE 957 1_555 C N LEU 488 C LEU 958 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale25 D C LEU 171 D LEU 641 1_555 D N MSE 172 D MSE 642 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale26 D C MSE 172 D MSE 642 1_555 D N VAL 173 D VAL 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale27 D C HIS 320 D HIS 790 1_555 D N MSE 321 D MSE 791 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale28 D C MSE 321 D MSE 791 1_555 D N ASP 322 D ASP 792 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale29 D C GLN 420 D GLN 890 1_555 D N MSE 421 D MSE 891 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale30 D C MSE 421 D MSE 891 1_555 D N ASP 422 D ASP 892 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale31 D C LEU 486 D LEU 956 1_555 D N MSE 487 D MSE 957 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale32 D C MSE 487 D MSE 957 1_555 D N LEU 488 D LEU 958 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? metalc ? metalc1 E CA CA . A CA 1 1_555 A OE1 GLU 84 A GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? metalc ? metalc2 E CA CA . A CA 1 1_555 A OE2 GLU 84 A GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? metalc ? metalc3 E CA CA . A CA 1 1_555 A O ALA 289 A ALA 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc ? metalc4 E CA CA . A CA 1 1_555 A O TYR 323 A TYR 793 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? metalc ? metalc5 E CA CA . A CA 1 1_555 A OE2 GLU 326 A GLU 796 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? metalc ? metalc6 G CA CA . B CA 2 1_555 B OE1 GLU 84 B GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc7 G CA CA . B CA 2 1_555 B OE2 GLU 84 B GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? metalc ? metalc8 G CA CA . B CA 2 1_555 B O ALA 289 B ALA 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? metalc ? metalc9 G CA CA . B CA 2 1_555 B O TYR 323 B TYR 793 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc10 G CA CA . B CA 2 1_555 B OE2 GLU 326 B GLU 796 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc11 I CA CA . C CA 3 1_555 C OE1 GLU 84 C GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.878 ? metalc ? metalc12 I CA CA . C CA 3 1_555 C OE2 GLU 84 C GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc ? metalc13 I CA CA . C CA 3 1_555 C O ALA 289 C ALA 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.758 ? metalc ? metalc14 I CA CA . C CA 3 1_555 C O TYR 323 C TYR 793 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc15 I CA CA . C CA 3 1_555 C OE1 GLU 326 C GLU 796 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? metalc ? metalc16 K CA CA . D CA 4 1_555 D OE2 GLU 84 D GLU 554 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc17 K CA CA . D CA 4 1_555 D O ALA 289 D ALA 759 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc18 K CA CA . D CA 4 1_555 D O TYR 323 D TYR 793 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc19 K CA CA . D CA 4 1_555 D OE2 GLU 326 D GLU 796 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.972 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2ZAG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007278 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.003754 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013517 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 CA A 1 1 1 CA CA . F 3 CL A 1 5 5 CL CL . G 2 CA B 1 2 2 CA CA . H 3 CL B 1 6 6 CL CL . I 2 CA C 1 3 3 CA CA . J 3 CL C 1 7 7 CL CL . K 2 CA D 1 4 4 CA CA . L 3 CL D 1 8 8 CL CL . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 183.265 _atom_site.Cartn_y 75.851 _atom_site.Cartn_z 46.781 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 32.45 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 101 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 247 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #