data_2ZOY # _model_server_result.job_id gJS5-s5bxV1G5ADkBMh9Tw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-14 12:20:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2zoy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":187}' # _entry.id 2ZOY # _exptl.entry_id 2ZOY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2ZOY _cell.length_a 59.754 _cell.length_b 67.051 _cell.length_c 101.326 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2ZOY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 116 n n C1 C2 GOL sing 117 n n C1 H11 GOL sing 118 n n C1 H12 GOL sing 119 n n O1 HO1 GOL sing 120 n n C2 O2 GOL sing 121 n n C2 C3 GOL sing 122 n n C2 H2 GOL sing 123 n n O2 HO2 GOL sing 124 n n C3 O3 GOL sing 125 n n C3 H31 GOL sing 126 n n C3 H32 GOL sing 127 n n O3 HO3 GOL sing 128 n n # _atom_sites.entry_id 2ZOY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016735 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014914 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009869 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 GOL A 1 186 2 GOL GOL . D 2 GOL A 1 187 4 GOL GOL . E 2 GOL B 1 186 1 GOL GOL . F 2 GOL B 1 187 3 GOL GOL . G 3 HOH A 1 188 1 HOH WAT . G 3 HOH A 2 189 2 HOH WAT . G 3 HOH A 3 190 4 HOH WAT . G 3 HOH A 4 191 5 HOH WAT . G 3 HOH A 5 192 8 HOH WAT . G 3 HOH A 6 193 9 HOH WAT . G 3 HOH A 7 194 10 HOH WAT . G 3 HOH A 8 195 12 HOH WAT . G 3 HOH A 9 196 16 HOH WAT . G 3 HOH A 10 197 17 HOH WAT . G 3 HOH A 11 198 18 HOH WAT . G 3 HOH A 12 199 19 HOH WAT . G 3 HOH A 13 200 20 HOH WAT . G 3 HOH A 14 201 22 HOH WAT . G 3 HOH A 15 202 24 HOH WAT . G 3 HOH A 16 203 25 HOH WAT . G 3 HOH A 17 204 26 HOH WAT . G 3 HOH A 18 205 27 HOH WAT . G 3 HOH A 19 206 29 HOH WAT . G 3 HOH A 20 207 31 HOH WAT . G 3 HOH A 21 208 32 HOH WAT . G 3 HOH A 22 209 33 HOH WAT . G 3 HOH A 23 210 35 HOH WAT . G 3 HOH A 24 211 36 HOH WAT . G 3 HOH A 25 212 39 HOH WAT . G 3 HOH A 26 213 42 HOH WAT . G 3 HOH A 27 214 43 HOH WAT . G 3 HOH A 28 215 45 HOH WAT . G 3 HOH A 29 216 46 HOH WAT . G 3 HOH A 30 217 47 HOH WAT . G 3 HOH A 31 218 48 HOH WAT . G 3 HOH A 32 219 49 HOH WAT . G 3 HOH A 33 220 51 HOH WAT . G 3 HOH A 34 221 53 HOH WAT . G 3 HOH A 35 222 54 HOH WAT . G 3 HOH A 36 223 55 HOH WAT . G 3 HOH A 37 224 57 HOH WAT . G 3 HOH A 38 225 58 HOH WAT . G 3 HOH A 39 226 59 HOH WAT . G 3 HOH A 40 227 61 HOH WAT . G 3 HOH A 41 228 62 HOH WAT . G 3 HOH A 42 229 63 HOH WAT . G 3 HOH A 43 230 72 HOH WAT . G 3 HOH A 44 231 74 HOH WAT . G 3 HOH A 45 232 75 HOH WAT . G 3 HOH A 46 233 76 HOH WAT . G 3 HOH A 47 234 78 HOH WAT . G 3 HOH A 48 235 83 HOH WAT . G 3 HOH A 49 236 86 HOH WAT . G 3 HOH A 50 237 87 HOH WAT . G 3 HOH A 51 238 90 HOH WAT . G 3 HOH A 52 239 92 HOH WAT . G 3 HOH A 53 240 93 HOH WAT . G 3 HOH A 54 241 96 HOH WAT . G 3 HOH A 55 242 101 HOH WAT . G 3 HOH A 56 243 102 HOH WAT . G 3 HOH A 57 244 104 HOH WAT . G 3 HOH A 58 245 106 HOH WAT . G 3 HOH A 59 246 108 HOH WAT . G 3 HOH A 60 247 109 HOH WAT . G 3 HOH A 61 248 111 HOH WAT . G 3 HOH A 62 249 113 HOH WAT . G 3 HOH A 63 250 115 HOH WAT . G 3 HOH A 64 251 120 HOH WAT . G 3 HOH A 65 252 122 HOH WAT . G 3 HOH A 66 253 128 HOH WAT . G 3 HOH A 67 254 129 HOH WAT . G 3 HOH A 68 255 130 HOH WAT . G 3 HOH A 69 256 133 HOH WAT . G 3 HOH A 70 257 135 HOH WAT . G 3 HOH A 71 258 139 HOH WAT . G 3 HOH A 72 259 144 HOH WAT . G 3 HOH A 73 260 145 HOH WAT . G 3 HOH A 74 261 147 HOH WAT . G 3 HOH A 75 262 152 HOH WAT . G 3 HOH A 76 263 157 HOH WAT . G 3 HOH A 77 264 163 HOH WAT . G 3 HOH A 78 265 165 HOH WAT . G 3 HOH A 79 266 166 HOH WAT . G 3 HOH A 80 267 169 HOH WAT . G 3 HOH A 81 268 172 HOH WAT . G 3 HOH A 82 269 173 HOH WAT . G 3 HOH A 83 270 174 HOH WAT . G 3 HOH A 84 271 175 HOH WAT . G 3 HOH A 85 272 177 HOH WAT . G 3 HOH A 86 273 179 HOH WAT . G 3 HOH A 87 274 186 HOH WAT . G 3 HOH A 88 275 188 HOH WAT . G 3 HOH A 89 276 197 HOH WAT . G 3 HOH A 90 277 198 HOH WAT . G 3 HOH A 91 278 199 HOH WAT . G 3 HOH A 92 279 208 HOH WAT . G 3 HOH A 93 280 210 HOH WAT . G 3 HOH A 94 281 213 HOH WAT . G 3 HOH A 95 282 214 HOH WAT . G 3 HOH A 96 283 215 HOH WAT . G 3 HOH A 97 284 217 HOH WAT . G 3 HOH A 98 285 218 HOH WAT . G 3 HOH A 99 286 222 HOH WAT . G 3 HOH A 100 287 224 HOH WAT . G 3 HOH A 101 288 227 HOH WAT . G 3 HOH A 102 289 228 HOH WAT . G 3 HOH A 103 290 229 HOH WAT . G 3 HOH A 104 291 233 HOH WAT . G 3 HOH A 105 292 235 HOH WAT . G 3 HOH A 106 293 238 HOH WAT . G 3 HOH A 107 294 240 HOH WAT . G 3 HOH A 108 295 245 HOH WAT . G 3 HOH A 109 296 247 HOH WAT . G 3 HOH A 110 297 252 HOH WAT . G 3 HOH A 111 298 254 HOH WAT . G 3 HOH A 112 299 256 HOH WAT . G 3 HOH A 113 300 258 HOH WAT . G 3 HOH A 114 301 262 HOH WAT . G 3 HOH A 115 302 264 HOH WAT . G 3 HOH A 116 303 267 HOH WAT . G 3 HOH A 117 304 268 HOH WAT . G 3 HOH A 118 305 272 HOH WAT . G 3 HOH A 119 306 277 HOH WAT . G 3 HOH A 120 307 278 HOH WAT . G 3 HOH A 121 308 279 HOH WAT . G 3 HOH A 122 309 282 HOH WAT . G 3 HOH A 123 310 284 HOH WAT . G 3 HOH A 124 311 286 HOH WAT . G 3 HOH A 125 312 292 HOH WAT . G 3 HOH A 126 313 313 HOH WAT . G 3 HOH A 127 314 317 HOH WAT . G 3 HOH A 128 315 318 HOH WAT . G 3 HOH A 129 316 321 HOH WAT . G 3 HOH A 130 317 339 HOH WAT . G 3 HOH A 131 318 340 HOH WAT . G 3 HOH A 132 319 345 HOH WAT . G 3 HOH A 133 320 350 HOH WAT . G 3 HOH A 134 321 232 HOH WAT . G 3 HOH A 135 322 316 HOH WAT . G 3 HOH A 136 323 342 HOH WAT . H 3 HOH B 1 188 3 HOH WAT . H 3 HOH B 2 189 6 HOH WAT . H 3 HOH B 3 190 7 HOH WAT . H 3 HOH B 4 191 11 HOH WAT . H 3 HOH B 5 192 13 HOH WAT . H 3 HOH B 6 193 14 HOH WAT . H 3 HOH B 7 194 15 HOH WAT . H 3 HOH B 8 195 21 HOH WAT . H 3 HOH B 9 196 23 HOH WAT . H 3 HOH B 10 197 28 HOH WAT . H 3 HOH B 11 198 30 HOH WAT . H 3 HOH B 12 199 37 HOH WAT . H 3 HOH B 13 200 38 HOH WAT . H 3 HOH B 14 201 40 HOH WAT . H 3 HOH B 15 202 41 HOH WAT . H 3 HOH B 16 203 44 HOH WAT . H 3 HOH B 17 204 50 HOH WAT . H 3 HOH B 18 205 52 HOH WAT . H 3 HOH B 19 206 56 HOH WAT . H 3 HOH B 20 207 60 HOH WAT . H 3 HOH B 21 208 64 HOH WAT . H 3 HOH B 22 209 65 HOH WAT . H 3 HOH B 23 210 66 HOH WAT . H 3 HOH B 24 211 68 HOH WAT . H 3 HOH B 25 212 69 HOH WAT . H 3 HOH B 26 213 70 HOH WAT . H 3 HOH B 27 214 71 HOH WAT . H 3 HOH B 28 215 73 HOH WAT . H 3 HOH B 29 216 77 HOH WAT . H 3 HOH B 30 217 79 HOH WAT . H 3 HOH B 31 218 80 HOH WAT . H 3 HOH B 32 219 81 HOH WAT . H 3 HOH B 33 220 82 HOH WAT . H 3 HOH B 34 221 84 HOH WAT . H 3 HOH B 35 222 85 HOH WAT . H 3 HOH B 36 223 89 HOH WAT . H 3 HOH B 37 224 91 HOH WAT . H 3 HOH B 38 225 94 HOH WAT . H 3 HOH B 39 226 95 HOH WAT . H 3 HOH B 40 227 97 HOH WAT . H 3 HOH B 41 228 99 HOH WAT . H 3 HOH B 42 229 100 HOH WAT . H 3 HOH B 43 230 103 HOH WAT . H 3 HOH B 44 231 105 HOH WAT . H 3 HOH B 45 232 107 HOH WAT . H 3 HOH B 46 233 110 HOH WAT . H 3 HOH B 47 234 114 HOH WAT . H 3 HOH B 48 235 116 HOH WAT . H 3 HOH B 49 236 117 HOH WAT . H 3 HOH B 50 237 118 HOH WAT . H 3 HOH B 51 238 124 HOH WAT . H 3 HOH B 52 239 125 HOH WAT . H 3 HOH B 53 240 127 HOH WAT . H 3 HOH B 54 241 131 HOH WAT . H 3 HOH B 55 242 132 HOH WAT . H 3 HOH B 56 243 140 HOH WAT . H 3 HOH B 57 244 142 HOH WAT . H 3 HOH B 58 245 143 HOH WAT . H 3 HOH B 59 246 153 HOH WAT . H 3 HOH B 60 247 154 HOH WAT . H 3 HOH B 61 248 155 HOH WAT . H 3 HOH B 62 249 156 HOH WAT . H 3 HOH B 63 250 159 HOH WAT . H 3 HOH B 64 251 162 HOH WAT . H 3 HOH B 65 252 167 HOH WAT . H 3 HOH B 66 253 168 HOH WAT . H 3 HOH B 67 254 170 HOH WAT . H 3 HOH B 68 255 176 HOH WAT . H 3 HOH B 69 256 178 HOH WAT . H 3 HOH B 70 257 180 HOH WAT . H 3 HOH B 71 258 181 HOH WAT . H 3 HOH B 72 259 182 HOH WAT . H 3 HOH B 73 260 183 HOH WAT . H 3 HOH B 74 261 185 HOH WAT . H 3 HOH B 75 262 187 HOH WAT . H 3 HOH B 76 263 189 HOH WAT . H 3 HOH B 77 264 190 HOH WAT . H 3 HOH B 78 265 192 HOH WAT . H 3 HOH B 79 266 193 HOH WAT . H 3 HOH B 80 267 195 HOH WAT . H 3 HOH B 81 268 196 HOH WAT . H 3 HOH B 82 269 200 HOH WAT . H 3 HOH B 83 270 202 HOH WAT . H 3 HOH B 84 271 203 HOH WAT . H 3 HOH B 85 272 204 HOH WAT . H 3 HOH B 86 273 207 HOH WAT . H 3 HOH B 87 274 211 HOH WAT . H 3 HOH B 88 275 220 HOH WAT . H 3 HOH B 89 276 221 HOH WAT . H 3 HOH B 90 277 223 HOH WAT . H 3 HOH B 91 278 226 HOH WAT . H 3 HOH B 92 279 231 HOH WAT . H 3 HOH B 93 280 234 HOH WAT . H 3 HOH B 94 281 237 HOH WAT . H 3 HOH B 95 282 239 HOH WAT . H 3 HOH B 96 283 246 HOH WAT . H 3 HOH B 97 284 249 HOH WAT . H 3 HOH B 98 285 251 HOH WAT . H 3 HOH B 99 286 263 HOH WAT . H 3 HOH B 100 287 274 HOH WAT . H 3 HOH B 101 288 280 HOH WAT . H 3 HOH B 102 289 296 HOH WAT . H 3 HOH B 103 290 304 HOH WAT . H 3 HOH B 104 291 331 HOH WAT . H 3 HOH B 105 292 335 HOH WAT . H 3 HOH B 106 293 347 HOH WAT . H 3 HOH B 107 294 358 HOH WAT . H 3 HOH B 108 295 364 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . F 2 11.778 26.078 27.623 1 49.78 ? C1 GOL 187 B 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . F 2 12.707 26.04 26.54 1 47.11 ? O1 GOL 187 B 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . F 2 12.413 25.5 28.894 1 50.44 ? C2 GOL 187 B 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . F 2 13.579 26.253 29.249 1 52.67 ? O2 GOL 187 B 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . F 2 11.398 25.551 30.036 1 51.31 ? C3 GOL 187 B 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . F 2 11.977 25.02 31.225 1 51.96 ? O3 GOL 187 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 276 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 6 #