data_2ZPR # _model_server_result.job_id NzrhIQyTc9iZ51qk2TU86Q _model_server_result.datetime_utc '2025-02-05 14:08:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2zpr # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":2001}' # _entry.id 2ZPR # _exptl.entry_id 2ZPR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2ZPR _cell.length_a 61.381 _cell.length_b 75.292 _cell.length_c 82.003 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2ZPR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,G 1 1 B,E,F,H 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 7 A CYS 7 1_555 A SG CYS 136 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 25 A CYS 25 1_555 A SG CYS 41 A CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 109 A CYS 109 1_555 A SG CYS 209 A CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 116 A CYS 116 1_555 A SG CYS 182 A CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 147 A CYS 147 1_555 A SG CYS 161 A CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 172 A CYS 172 1_555 A SG CYS 196 A CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 7 B CYS 7 1_555 B SG CYS 136 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 25 B CYS 25 1_555 B SG CYS 41 B CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 109 B CYS 109 1_555 B SG CYS 209 B CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 116 B CYS 116 1_555 B SG CYS 182 B CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 147 B CYS 147 1_555 B SG CYS 161 B CYS 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 172 B CYS 172 1_555 B SG CYS 196 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 52 A GLU 52 1_555 C CA CA . A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc2 A O ASN 54 A ASN 54 1_555 C CA CA . A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc3 A O VAL 57 A VAL 57 1_555 C CA CA . A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 59 A GLU 59 1_555 C CA CA . A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 62 A GLU 62 1_555 C CA CA . A CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc6 C CA CA . A CA 2001 1_555 G O HOH . A HOH 2077 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc7 B OE1 GLU 52 B GLU 52 1_555 E CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? metalc ? metalc8 B O ASN 54 B ASN 54 1_555 E CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc9 B O VAL 57 B VAL 57 1_555 E CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc10 B OE1 GLU 59 B GLU 59 1_555 E CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc11 B OE2 GLU 62 B GLU 62 1_555 E CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc12 E CA CA . B CA 2002 1_555 H O HOH . B HOH 2181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2ZPR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016292 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013282 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012195 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 2001 2001 CA CA . D 3 BEN A 1 1001 1001 BEN BDN . E 2 CA B 1 2002 2002 CA CA . F 3 BEN B 1 1002 1002 BEN BDN . G 4 HOH A 1 2002 1 HOH WAT . G 4 HOH A 2 2003 2 HOH WAT . G 4 HOH A 3 2004 3 HOH WAT . G 4 HOH A 4 2005 5 HOH WAT . G 4 HOH A 5 2006 10 HOH WAT . G 4 HOH A 6 2007 14 HOH WAT . G 4 HOH A 7 2008 16 HOH WAT . G 4 HOH A 8 2009 19 HOH WAT . G 4 HOH A 9 2010 20 HOH WAT . G 4 HOH A 10 2011 23 HOH WAT . G 4 HOH A 11 2012 25 HOH WAT . G 4 HOH A 12 2013 26 HOH WAT . G 4 HOH A 13 2014 31 HOH WAT . G 4 HOH A 14 2015 36 HOH WAT . G 4 HOH A 15 2016 37 HOH WAT . G 4 HOH A 16 2017 40 HOH WAT . G 4 HOH A 17 2018 42 HOH WAT . G 4 HOH A 18 2019 43 HOH WAT . G 4 HOH A 19 2020 44 HOH WAT . G 4 HOH A 20 2021 45 HOH WAT . G 4 HOH A 21 2022 50 HOH WAT . G 4 HOH A 22 2023 51 HOH WAT . G 4 HOH A 23 2024 55 HOH WAT . G 4 HOH A 24 2025 57 HOH WAT . G 4 HOH A 25 2026 58 HOH WAT . G 4 HOH A 26 2027 61 HOH WAT . G 4 HOH A 27 2028 62 HOH WAT . G 4 HOH A 28 2029 65 HOH WAT . G 4 HOH A 29 2030 66 HOH WAT . G 4 HOH A 30 2031 67 HOH WAT . G 4 HOH A 31 2032 69 HOH WAT . G 4 HOH A 32 2033 71 HOH WAT . G 4 HOH A 33 2034 73 HOH WAT . G 4 HOH A 34 2035 74 HOH WAT . G 4 HOH A 35 2036 75 HOH WAT . G 4 HOH A 36 2037 76 HOH WAT . G 4 HOH A 37 2038 77 HOH WAT . G 4 HOH A 38 2039 80 HOH WAT . G 4 HOH A 39 2040 85 HOH WAT . G 4 HOH A 40 2041 87 HOH WAT . G 4 HOH A 41 2042 89 HOH WAT . G 4 HOH A 42 2043 92 HOH WAT . G 4 HOH A 43 2044 93 HOH WAT . G 4 HOH A 44 2045 94 HOH WAT . G 4 HOH A 45 2046 96 HOH WAT . G 4 HOH A 46 2047 97 HOH WAT . G 4 HOH A 47 2048 100 HOH WAT . G 4 HOH A 48 2049 101 HOH WAT . G 4 HOH A 49 2050 105 HOH WAT . G 4 HOH A 50 2051 106 HOH WAT . G 4 HOH A 51 2052 107 HOH WAT . G 4 HOH A 52 2053 109 HOH WAT . G 4 HOH A 53 2054 110 HOH WAT . G 4 HOH A 54 2055 111 HOH WAT . G 4 HOH A 55 2056 114 HOH WAT . G 4 HOH A 56 2057 116 HOH WAT . G 4 HOH A 57 2058 118 HOH WAT . G 4 HOH A 58 2059 121 HOH WAT . G 4 HOH A 59 2060 126 HOH WAT . G 4 HOH A 60 2061 127 HOH WAT . G 4 HOH A 61 2062 136 HOH WAT . G 4 HOH A 62 2063 137 HOH WAT . G 4 HOH A 63 2064 138 HOH WAT . G 4 HOH A 64 2065 142 HOH WAT . G 4 HOH A 65 2066 145 HOH WAT . G 4 HOH A 66 2067 148 HOH WAT . G 4 HOH A 67 2068 151 HOH WAT . G 4 HOH A 68 2069 152 HOH WAT . G 4 HOH A 69 2070 153 HOH WAT . G 4 HOH A 70 2071 155 HOH WAT . G 4 HOH A 71 2072 156 HOH WAT . G 4 HOH A 72 2073 160 HOH WAT . G 4 HOH A 73 2074 161 HOH WAT . G 4 HOH A 74 2075 164 HOH WAT . G 4 HOH A 75 2076 170 HOH WAT . G 4 HOH A 76 2077 172 HOH WAT . G 4 HOH A 77 2078 173 HOH WAT . G 4 HOH A 78 2080 175 HOH WAT . G 4 HOH A 79 2081 177 HOH WAT . G 4 HOH A 80 2082 179 HOH WAT . G 4 HOH A 81 2083 180 HOH WAT . G 4 HOH A 82 2084 181 HOH WAT . G 4 HOH A 83 2085 182 HOH WAT . G 4 HOH A 84 2086 183 HOH WAT . G 4 HOH A 85 2087 188 HOH WAT . G 4 HOH A 86 2088 189 HOH WAT . G 4 HOH A 87 2089 190 HOH WAT . G 4 HOH A 88 2090 196 HOH WAT . G 4 HOH A 89 2091 197 HOH WAT . G 4 HOH A 90 2092 198 HOH WAT . G 4 HOH A 91 2093 165 HOH WAT . G 4 HOH A 92 2094 202 HOH WAT . G 4 HOH A 93 2095 206 HOH WAT . G 4 HOH A 94 2096 210 HOH WAT . G 4 HOH A 95 2097 211 HOH WAT . G 4 HOH A 96 2098 212 HOH WAT . G 4 HOH A 97 2101 215 HOH WAT . G 4 HOH A 98 2102 216 HOH WAT . G 4 HOH A 99 2103 217 HOH WAT . G 4 HOH A 100 2104 219 HOH WAT . G 4 HOH A 101 2106 221 HOH WAT . G 4 HOH A 102 2107 222 HOH WAT . G 4 HOH A 103 2108 223 HOH WAT . G 4 HOH A 104 2110 200 HOH WAT . G 4 HOH A 105 2114 205 HOH WAT . H 4 HOH B 1 2079 174 HOH WAT . H 4 HOH B 2 2080 199 HOH WAT . H 4 HOH B 3 2081 213 HOH WAT . H 4 HOH B 4 2082 214 HOH WAT . H 4 HOH B 5 2083 220 HOH WAT . H 4 HOH B 6 2084 4 HOH WAT . H 4 HOH B 7 2085 6 HOH WAT . H 4 HOH B 8 2086 7 HOH WAT . H 4 HOH B 9 2087 8 HOH WAT . H 4 HOH B 10 2088 9 HOH WAT . H 4 HOH B 11 2089 11 HOH WAT . H 4 HOH B 12 2090 12 HOH WAT . H 4 HOH B 13 2091 13 HOH WAT . H 4 HOH B 14 2092 15 HOH WAT . H 4 HOH B 15 2093 17 HOH WAT . H 4 HOH B 16 2094 18 HOH WAT . H 4 HOH B 17 2095 21 HOH WAT . H 4 HOH B 18 2096 22 HOH WAT . H 4 HOH B 19 2097 24 HOH WAT . H 4 HOH B 20 2098 27 HOH WAT . H 4 HOH B 21 2099 28 HOH WAT . H 4 HOH B 22 2100 29 HOH WAT . H 4 HOH B 23 2101 30 HOH WAT . H 4 HOH B 24 2102 32 HOH WAT . H 4 HOH B 25 2103 33 HOH WAT . H 4 HOH B 26 2104 34 HOH WAT . H 4 HOH B 27 2105 35 HOH WAT . H 4 HOH B 28 2106 38 HOH WAT . H 4 HOH B 29 2107 39 HOH WAT . H 4 HOH B 30 2108 41 HOH WAT . H 4 HOH B 31 2109 46 HOH WAT . H 4 HOH B 32 2110 47 HOH WAT . H 4 HOH B 33 2111 48 HOH WAT . H 4 HOH B 34 2112 49 HOH WAT . H 4 HOH B 35 2113 52 HOH WAT . H 4 HOH B 36 2114 53 HOH WAT . H 4 HOH B 37 2115 54 HOH WAT . H 4 HOH B 38 2116 56 HOH WAT . H 4 HOH B 39 2117 59 HOH WAT . H 4 HOH B 40 2118 60 HOH WAT . H 4 HOH B 41 2119 63 HOH WAT . H 4 HOH B 42 2120 64 HOH WAT . H 4 HOH B 43 2121 68 HOH WAT . H 4 HOH B 44 2122 70 HOH WAT . H 4 HOH B 45 2123 72 HOH WAT . H 4 HOH B 46 2124 78 HOH WAT . H 4 HOH B 47 2125 79 HOH WAT . H 4 HOH B 48 2126 81 HOH WAT . H 4 HOH B 49 2127 82 HOH WAT . H 4 HOH B 50 2128 83 HOH WAT . H 4 HOH B 51 2129 84 HOH WAT . H 4 HOH B 52 2130 86 HOH WAT . H 4 HOH B 53 2131 88 HOH WAT . H 4 HOH B 54 2132 90 HOH WAT . H 4 HOH B 55 2133 91 HOH WAT . H 4 HOH B 56 2134 95 HOH WAT . H 4 HOH B 57 2135 98 HOH WAT . H 4 HOH B 58 2136 99 HOH WAT . H 4 HOH B 59 2137 102 HOH WAT . H 4 HOH B 60 2138 103 HOH WAT . H 4 HOH B 61 2139 104 HOH WAT . H 4 HOH B 62 2140 108 HOH WAT . H 4 HOH B 63 2141 112 HOH WAT . H 4 HOH B 64 2142 113 HOH WAT . H 4 HOH B 65 2143 115 HOH WAT . H 4 HOH B 66 2144 117 HOH WAT . H 4 HOH B 67 2145 119 HOH WAT . H 4 HOH B 68 2146 120 HOH WAT . H 4 HOH B 69 2147 122 HOH WAT . H 4 HOH B 70 2148 123 HOH WAT . H 4 HOH B 71 2149 124 HOH WAT . H 4 HOH B 72 2150 125 HOH WAT . H 4 HOH B 73 2151 128 HOH WAT . H 4 HOH B 74 2152 129 HOH WAT . H 4 HOH B 75 2153 130 HOH WAT . H 4 HOH B 76 2154 131 HOH WAT . H 4 HOH B 77 2155 132 HOH WAT . H 4 HOH B 78 2156 133 HOH WAT . H 4 HOH B 79 2157 134 HOH WAT . H 4 HOH B 80 2158 135 HOH WAT . H 4 HOH B 81 2159 139 HOH WAT . H 4 HOH B 82 2160 140 HOH WAT . H 4 HOH B 83 2161 141 HOH WAT . H 4 HOH B 84 2162 143 HOH WAT . H 4 HOH B 85 2163 144 HOH WAT . H 4 HOH B 86 2164 146 HOH WAT . H 4 HOH B 87 2165 147 HOH WAT . H 4 HOH B 88 2166 149 HOH WAT . H 4 HOH B 89 2167 150 HOH WAT . H 4 HOH B 90 2168 154 HOH WAT . H 4 HOH B 91 2169 157 HOH WAT . H 4 HOH B 92 2170 158 HOH WAT . H 4 HOH B 93 2171 159 HOH WAT . H 4 HOH B 94 2172 162 HOH WAT . H 4 HOH B 95 2173 163 HOH WAT . H 4 HOH B 96 2174 166 HOH WAT . H 4 HOH B 97 2175 167 HOH WAT . H 4 HOH B 98 2176 168 HOH WAT . H 4 HOH B 99 2177 169 HOH WAT . H 4 HOH B 100 2178 171 HOH WAT . H 4 HOH B 101 2179 176 HOH WAT . H 4 HOH B 102 2180 178 HOH WAT . H 4 HOH B 103 2181 184 HOH WAT . H 4 HOH B 104 2182 185 HOH WAT . H 4 HOH B 105 2183 186 HOH WAT . H 4 HOH B 106 2184 187 HOH WAT . H 4 HOH B 107 2185 191 HOH WAT . H 4 HOH B 108 2186 192 HOH WAT . H 4 HOH B 109 2187 193 HOH WAT . H 4 HOH B 110 2188 194 HOH WAT . H 4 HOH B 111 2189 195 HOH WAT . H 4 HOH B 112 2190 201 HOH WAT . H 4 HOH B 113 2191 203 HOH WAT . H 4 HOH B 114 2192 204 HOH WAT . H 4 HOH B 115 2193 207 HOH WAT . H 4 HOH B 116 2194 208 HOH WAT . H 4 HOH B 117 2195 209 HOH WAT . H 4 HOH B 118 2196 218 HOH WAT . H 4 HOH B 119 2197 224 HOH WAT . H 4 HOH B 120 2198 225 HOH WAT . H 4 HOH B 121 2199 226 HOH WAT . H 4 HOH B 122 2200 227 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 7.131 _atom_site.Cartn_y 42.594 _atom_site.Cartn_z 27.511 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 22.91 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 2001 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 320 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #