data_2ZRS # _model_server_result.job_id XkHtVdiB9Xejb9HPaTwk1Q _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 00:33:46' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 2zrs # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"FA","auth_seq_id":991}' # _entry.id 2ZRS # _exptl.entry_id 2ZRS _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 25 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 2ZRS _cell.length_a 54.78 _cell.length_b 154.425 _cell.length_c 237.676 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2ZRS _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,I,J,K,L,M,N 1 1 C,D,O,P,Q,R,S,T 2 1 E,F,U,V,W,X,Y,Z 3 1 G,H,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N ? 2 GA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A N GLY 18 A GLY 41 1_555 J CA CA . A CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc ? metalc2 A O VAL 19 A VAL 42 1_555 J CA CA . A CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 24 A GLU 47 1_555 J CA CA . A CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 24 A GLU 47 1_555 J CA CA . A CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.887 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 80 A ASP 103 1_555 I CA CA . A CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc6 A O MET 86 A MET 109 1_555 I CA CA . A CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 91 A GLU 114 1_555 I CA CA . A CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? metalc ? metalc8 B OD2 ASP 13 B ASP 36 1_555 M CA CA . B CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc9 B O VAL 19 B VAL 42 1_555 M CA CA . B CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc10 B OD1 ASP 80 B ASP 103 1_555 K CA CA . B CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc11 B OD1 ASP 82 B ASP 105 1_555 K CA CA . B CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc12 B OD2 ASP 82 B ASP 105 1_555 K CA CA . B CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc13 B O MET 86 B MET 109 1_555 K CA CA . B CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.982 ? metalc ? metalc14 B OE1 GLU 91 B GLU 114 1_555 K CA CA . B CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? metalc ? metalc15 B OD1 ASP 146 B ASP 169 1_555 L CA CA . B CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc16 B OD1 ASP 148 B ASP 171 1_555 L CA CA . B CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc17 C OD1 ASP 13 C ASP 36 1_555 O CA CA . C CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.919 ? metalc ? metalc18 C O VAL 19 C VAL 42 1_555 O CA CA . C CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc19 C OE2 GLU 24 C GLU 47 1_555 O CA CA . C CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.99 ? metalc ? metalc20 C OG SER 84 C SER 107 1_555 P CA CA . C CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc21 C OD2 ASP 150 C ASP 173 1_555 Q CA CA . C CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.816 ? metalc ? metalc22 D OD2 ASP 15 D ASP 38 1_555 R CA CA . D CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc ? metalc23 D OG SER 17 D SER 40 1_555 R CA CA . D CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? metalc ? metalc24 D O VAL 19 D VAL 42 1_555 R CA CA . D CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.837 ? metalc ? metalc25 D OE1 GLU 24 D GLU 47 1_555 R CA CA . D CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? metalc ? metalc26 D OE2 GLU 24 D GLU 47 1_555 R CA CA . D CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc27 D OD2 ASP 82 D ASP 105 1_555 S CA CA . D CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc28 D OG SER 84 D SER 107 1_555 S CA CA . D CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc29 D O MET 86 D MET 109 1_555 S CA CA . D CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? metalc ? metalc30 D OE2 GLU 91 D GLU 114 1_555 S CA CA . D CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc31 D OD1 ASP 146 D ASP 169 1_555 T CA CA . D CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc32 D OD1 ASP 148 D ASP 171 1_555 T CA CA . D CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc33 D OD1 ASP 150 D ASP 173 1_555 T CA CA . D CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.813 ? metalc ? metalc34 D OD2 ASP 150 D ASP 173 1_555 T CA CA . D CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc ? metalc35 E OD1 ASP 13 E ASP 36 1_555 U CA CA . E CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc36 E OD1 ASP 15 E ASP 38 1_555 U CA CA . E CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc37 E OG SER 17 E SER 40 1_555 U CA CA . E CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc38 E O VAL 19 E VAL 42 1_555 U CA CA . E CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? metalc ? metalc39 E OD1 ASP 82 E ASP 105 1_555 V CA CA . E CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc40 E OG SER 84 E SER 107 1_555 V CA CA . E CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc ? metalc41 E O MET 86 E MET 109 1_555 V CA CA . E CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc42 E OD1 ASP 150 E ASP 173 1_555 W CA CA . E CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? metalc ? metalc43 E O TRP 152 E TRP 175 1_555 W CA CA . E CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc44 F OD1 ASP 13 F ASP 36 1_555 X CA CA . F CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc45 F OE1 GLU 24 F GLU 47 1_555 X CA CA . F CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc ? metalc46 F OE2 GLU 24 F GLU 47 1_555 X CA CA . F CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc47 F OD1 ASP 80 F ASP 103 1_555 Y CA CA . F CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc48 F OD1 ASP 82 F ASP 105 1_555 Y CA CA . F CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc ? metalc49 F OD1 ASN 83 F ASN 106 1_555 DA CA CA . G CA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? metalc ? metalc50 F O MET 86 F MET 109 1_555 Y CA CA . F CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc51 F OD1 ASP 150 F ASP 173 1_555 Z CA CA . F CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc52 F O TRP 152 F TRP 175 1_555 Z CA CA . F CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc53 G OD1 ASP 13 G ASP 36 1_555 AA CA CA . G CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc54 G OD2 ASP 15 G ASP 38 1_555 AA CA CA . G CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc ? metalc55 G OG SER 17 G SER 40 1_555 AA CA CA . G CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc56 G O VAL 19 G VAL 42 1_555 AA CA CA . G CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc57 G OE1 GLU 24 G GLU 47 1_555 AA CA CA . G CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? metalc ? metalc58 G OE2 GLU 24 G GLU 47 1_555 AA CA CA . G CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.942 ? metalc ? metalc59 G OD1 ASP 80 G ASP 103 1_555 BA CA CA . G CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc60 G OD2 ASP 82 G ASP 105 1_555 BA CA CA . G CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc61 G O MET 86 G MET 109 1_555 BA CA CA . G CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? metalc ? metalc62 H OD1 ASP 13 H ASP 36 1_555 EA CA CA . H CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc63 H O VAL 19 H VAL 42 1_555 EA CA CA . H CA 990 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc64 H OD2 ASP 80 H ASP 103 1_555 FA CA CA . H CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc65 H O MET 86 H MET 109 1_555 FA CA CA . H CA 991 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc66 H O TRP 152 H TRP 175 1_555 GA CA CA . H CA 992 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 2ZRS _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018255 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006476 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004207 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 2 CA A 1 990 990 CA CA . J 2 CA A 1 991 991 CA CA . K 2 CA B 1 990 990 CA CA . L 2 CA B 1 991 991 CA CA . M 2 CA B 1 992 992 CA CA . N 2 CA B 1 2 2 CA CA . O 2 CA C 1 990 990 CA CA . P 2 CA C 1 991 991 CA CA . Q 2 CA C 1 992 992 CA CA . R 2 CA D 1 990 990 CA CA . S 2 CA D 1 991 991 CA CA . T 2 CA D 1 992 992 CA CA . U 2 CA E 1 990 990 CA CA . V 2 CA E 1 991 991 CA CA . W 2 CA E 1 992 992 CA CA . X 2 CA F 1 990 990 CA CA . Y 2 CA F 1 991 991 CA CA . Z 2 CA F 1 992 992 CA CA . AA 2 CA G 1 990 990 CA CA . BA 2 CA G 1 991 991 CA CA . CA 2 CA G 1 992 992 CA CA . DA 2 CA G 1 1 1 CA CA . EA 2 CA H 1 990 990 CA CA . FA 2 CA H 1 991 991 CA CA . GA 2 CA H 1 992 992 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id FA _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 16.792 _atom_site.Cartn_y -22.497 _atom_site.Cartn_z -30.193 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 98.05 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 991 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #