data_2ZUQ
#
_model_server_result.job_id            yujvCDIXyJ5AqrzGX5GRzg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-23 13:07:45' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          2zuq 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":177}' 
#
_entry.id    2ZUQ 
#
_exptl.entry_id    2ZUQ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              250.29 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            UBIQUINONE-1 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          106.89 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            2ZUQ 
_cell.length_a            269.307 
_cell.length_b            51.48 
_cell.length_c            125.845 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 2ZUQ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? trimeric 3 author_defined_assembly 1 
? trimeric 3 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,G 1 1 
D,E,F,H 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 G N N 
? 4 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 104 A CYS 104 1_555 A SG CYS 130 A CYS 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 43 B CYS 43 1_555 B SG CYS 114 B CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 159 B CYS 159 1_555 B SG CYS 219 B CYS 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 239 B CYS 239 1_555 C SG CYS 134 C CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 22 C CYS 22 1_555 C SG CYS 96 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
disulf ? disulf6 C SG CYS 146 C CYS 146 1_555 C SG CYS 201 C CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
disulf ? disulf7 D SG CYS 104 D CYS 104 1_555 D SG CYS 130 D CYS 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf8 E SG CYS 43 E CYS 43 1_555 E SG CYS 114 E CYS 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf9 E SG CYS 159 E CYS 159 1_555 E SG CYS 219 E CYS 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
disulf ? disulf10 E SG CYS 239 E CYS 239 1_555 F SG CYS 134 F CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf11 F SG CYS 22 F CYS 22 1_555 F SG CYS 96 F CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf12 F SG CYS 146 F CYS 146 1_555 F SG CYS 201 F CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
#
_chem_comp.formula           'C14 H18 O4' 
_chem_comp.formula_weight    250.29 
_chem_comp.id                UQ1 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              UBIQUINONE-1 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 UQ1 doub 356 n n 
C1 C2 UQ1 sing 357 n n 
C1 C6 UQ1 sing 358 n n 
C2 O2 UQ1 sing 359 n n 
C2 C3 UQ1 doub 360 n n 
O2 CM2 UQ1 sing 361 n n 
CM2 HM21 UQ1 sing 362 n n 
CM2 HM22 UQ1 sing 363 n n 
CM2 HM23 UQ1 sing 364 n n 
C3 O3 UQ1 sing 365 n n 
C3 C4 UQ1 sing 366 n n 
O3 CM3 UQ1 sing 367 n n 
CM3 HM31 UQ1 sing 368 n n 
CM3 HM32 UQ1 sing 369 n n 
CM3 HM33 UQ1 sing 370 n n 
C4 O4 UQ1 doub 371 n n 
C4 C5 UQ1 sing 372 n n 
C5 CM5 UQ1 sing 373 n n 
C5 C6 UQ1 doub 374 n n 
CM5 HM51 UQ1 sing 375 n n 
CM5 HM52 UQ1 sing 376 n n 
CM5 HM53 UQ1 sing 377 n n 
C6 C7 UQ1 sing 378 n n 
C7 C8 UQ1 sing 379 n n 
C7 H71 UQ1 sing 380 n n 
C7 H72 UQ1 sing 381 n n 
C8 C9 UQ1 doub 382 n n 
C8 H8 UQ1 sing 383 n n 
C9 C10 UQ1 sing 384 n n 
C9 C11 UQ1 sing 385 n n 
C10 H101 UQ1 sing 386 n n 
C10 H102 UQ1 sing 387 n n 
C10 H103 UQ1 sing 388 n n 
C11 H111 UQ1 sing 389 n n 
C11 H112 UQ1 sing 390 n n 
C11 H113 UQ1 sing 391 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     2ZUQ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.003713 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001127 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.019425 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008304 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 4 UQ1 A 1 177 1 UQ1 UQ1 . 
H 4 UQ1 D 1 177 1 UQ1 UQ1 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 UQ1 . . . H 4 -137.101 -42.012 -124.039 1 268.54 ? C1 UQ1 177 D 1 
HETATM 2 O O1 UQ1 . . . H 4 -138.009 -42.233 -124.871 1 268.62 ? O1 UQ1 177 D 1 
HETATM 3 C C2 UQ1 . . . H 4 -136.935 -42.948 -122.894 1 268.56 ? C2 UQ1 177 D 1 
HETATM 4 O O2 UQ1 . . . H 4 -137.769 -44.03 -122.775 1 268.53 ? O2 UQ1 177 D 1 
HETATM 5 C CM2 UQ1 . . . H 4 -137.379 -45.282 -123.34 1 268.3 ? CM2 UQ1 177 D 1 
HETATM 6 C C3 UQ1 . . . H 4 -135.866 -42.71 -121.886 1 268.59 ? C3 UQ1 177 D 1 
HETATM 7 O O3 UQ1 . . . H 4 -135.705 -43.574 -120.831 1 268.78 ? O3 UQ1 177 D 1 
HETATM 8 C CM3 UQ1 . . . H 4 -136.175 -43.254 -119.52 1 268.63 ? CM3 UQ1 177 D 1 
HETATM 9 C C4 UQ1 . . . H 4 -134.961 -41.539 -122.034 1 268.5 ? C4 UQ1 177 D 1 
HETATM 10 O O4 UQ1 . . . H 4 -134.063 -41.343 -121.19 1 268.56 ? O4 UQ1 177 D 1 
HETATM 11 C C5 UQ1 . . . H 4 -135.122 -40.6 -123.176 1 268.44 ? C5 UQ1 177 D 1 
HETATM 12 C CM5 UQ1 . . . H 4 -134.187 -39.421 -123.292 1 268.44 ? CM5 UQ1 177 D 1 
HETATM 13 C C6 UQ1 . . . H 4 -136.194 -40.834 -124.188 1 268.49 ? C6 UQ1 177 D 1 
HETATM 14 C C7 UQ1 . . . H 4 -136.362 -39.876 -125.354 1 268.47 ? C7 UQ1 177 D 1 
HETATM 15 C C8 UQ1 . . . H 4 -135.851 -40.485 -126.644 1 268.32 ? C8 UQ1 177 D 1 
HETATM 16 C C9 UQ1 . . . H 4 -135.459 -39.76 -127.712 1 268.09 ? C9 UQ1 177 D 1 
HETATM 17 C C10 UQ1 . . . H 4 -134.977 -40.478 -128.938 1 267.98 ? C10 UQ1 177 D 1 
HETATM 18 C C11 UQ1 . . . H 4 -135.492 -38.257 -127.715 1 267.86 ? C11 UQ1 177 D 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           13 
_model_server_stats.create_model_time_ms    19 
_model_server_stats.query_time_ms           210 
_model_server_stats.encode_time_ms          9 
_model_server_stats.element_count           18 
#