data_3A0H
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_model_server_result.job_id            YRTze-WyCG3XIm3qWbbWhQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 06:56:22' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          3a0h 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"QD","auth_seq_id":6010}' 
#
_entry.id    3A0H 
#
_exptl.entry_id    3A0H 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              893.489 
_entity.id                          22 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLOROPHYLL A' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    70 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            3A0H 
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_cell.length_c            304.919 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3A0H 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    40-meric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      40 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 22 PA N N 
? 22 QA N N 
? 22 RA N N 
? 22 XA N N 
? 22 YA N N 
? 22 ZA N N 
? 22 AB N N 
? 22 BB N N 
? 22 CB N N 
? 22 DB N N 
? 22 EB N N 
? 22 FB N N 
? 22 GB N N 
? 22 HB N N 
? 22 IB N N 
? 22 JB N N 
? 22 KB N N 
? 22 LB N N 
? 22 SB N N 
? 22 TB N N 
? 22 UB N N 
? 22 VB N N 
? 22 WB N N 
? 22 XB N N 
? 22 YB N N 
? 22 ZB N N 
? 22 AC N N 
? 22 BC N N 
? 22 CC N N 
? 22 DC N N 
? 22 KC N N 
? 22 NC N N 
? 22 OC N N 
? 22 VC N N 
? 22 XC N N 
? 22 HD N N 
? 22 ID N N 
? 22 JD N N 
? 22 PD N N 
? 22 QD N N 
? 22 RD N N 
? 22 SD N N 
? 22 TD N N 
? 22 UD N N 
? 22 VD N N 
? 22 WD N N 
? 22 XD N N 
? 22 YD N N 
? 22 ZD N N 
? 22 AE N N 
? 22 BE N N 
? 22 CE N N 
? 22 DE N N 
? 22 JE N N 
? 22 KE N N 
? 22 LE N N 
? 22 ME N N 
? 22 NE N N 
? 22 OE N N 
? 22 PE N N 
? 22 QE N N 
? 22 RE N N 
? 22 SE N N 
? 22 TE N N 
? 22 UE N N 
? 22 ZE N N 
? 22 CF N N 
? 22 DF N N 
? 22 KF N N 
? 22 MF N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 M SG CYS 16 O CYS 45 1_555 M SG CYS 41 O CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf2 GA SG CYS 16 o CYS 5045 1_555 GA SG CYS 41 o CYS 5070 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 170 A ASP 170 1_555 OA MN4 OEC . A OEC 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc2 A NE2 HIS 215 A HIS 215 1_555 JC FE FE2 . D FE2 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc3 A NE2 HIS 272 A HIS 272 1_555 JC FE FE2 . D FE2 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc4 A OE2 GLU 333 A GLU 333 1_555 OA MN4 OEC . A OEC 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 342 A ASP 342 1_555 OA MN2 OEC . A OEC 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc6 A O ALA 344 A ALA 344 1_555 OA CA1 OEC . A OEC 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? 
metalc ? metalc7 A OXT ALA 344 A ALA 344 1_555 OA CA1 OEC . A OEC 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? 
metalc ? metalc8 A OXT ALA 344 A ALA 344 1_555 OA MN2 OEC . A OEC 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc9 OA MN3 OEC . A OEC 1001 1_555 C OE1 GLU 328 C GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? 
metalc ? metalc10 OA MN2 OEC . A OEC 1001 1_555 C OE2 GLU 328 C GLU 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? 
metalc ? metalc11 B NE2 HIS 25 B HIS 26 1_555 IB MG CLA . B CLA 1021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? 
metalc ? metalc12 B ND1 HIS 200 B HIS 201 1_555 YA MG CLA . B CLA 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc13 D NE2 HIS 256 D HIS 268 1_555 JC FE FE2 . D FE2 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc14 E NE2 HIS 22 E HIS 23 1_555 UC FE HEM . F HEM 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? 
metalc ? metalc15 P NE2 HIS 92 V HIS 118 1_555 DD FE HEM . V HEM 1041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc16 U OD1 ASP 170 a ASP 5170 1_555 FD MN4 OEC . a OEC 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc17 U NE2 HIS 215 a HIS 5215 1_555 GD FE FE2 . a FE2 6002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc18 U NE2 HIS 272 a HIS 5272 1_555 GD FE FE2 . a FE2 6002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? 
metalc ? metalc19 U OE2 GLU 333 a GLU 5333 1_555 FD MN4 OEC . a OEC 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc20 U OD1 ASP 342 a ASP 5342 1_555 FD MN2 OEC . a OEC 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc21 U O ALA 344 a ALA 5344 1_555 FD CA1 OEC . a OEC 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? 
metalc ? metalc22 U OXT ALA 344 a ALA 5344 1_555 FD MN2 OEC . a OEC 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc23 U OXT ALA 344 a ALA 5344 1_555 FD CA1 OEC . a OEC 6001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? 
metalc ? metalc24 FD MN3 OEC . a OEC 6001 1_555 W OE1 GLU 328 c GLU 5354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? 
metalc ? metalc25 FD MN2 OEC . a OEC 6001 1_555 W OE2 GLU 328 c GLU 5354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? 
metalc ? metalc26 GD FE FE2 . a FE2 6002 1_555 X NE2 HIS 202 d HIS 5214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc27 GD FE FE2 . a FE2 6002 1_555 X NE2 HIS 256 d HIS 5268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc28 V NE2 HIS 25 b HIS 5026 1_555 AE MG CLA . b CLA 6021 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? 
metalc ? metalc29 V ND1 HIS 200 b HIS 5201 1_555 QD MG CLA . b CLA 6010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc30 Y NE2 HIS 22 e HIS 5023 1_555 JF FE HEM . f HEM 6040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? 
metalc ? metalc31 JA NE2 HIS 92 v HIS 5118 1_555 SF FE HEM . v HEM 6041 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? 
#
_chem_comp.formula           'C55 H72 Mg N4 O5' 
_chem_comp.formula_weight    893.489 
_chem_comp.id                CLA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLOROPHYLL A' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
MG NA CLA sing 167 n n 
MG NB CLA sing 168 n n 
MG NC CLA sing 169 n n 
MG ND CLA sing 170 n n 
CHA C1A CLA sing 171 n n 
CHA C4D CLA doub 172 n n 
CHA CBD CLA sing 173 n n 
CHB C4A CLA doub 174 n n 
CHB C1B CLA sing 175 n n 
CHB HHB CLA sing 176 n n 
CHC C4B CLA sing 177 n n 
CHC C1C CLA doub 178 n n 
CHC HHC CLA sing 179 n n 
CHD C4C CLA sing 180 n n 
CHD C1D CLA doub 181 n n 
CHD HHD CLA sing 182 n n 
NA C1A CLA doub 183 n n 
NA C4A CLA sing 184 n n 
C1A C2A CLA sing 185 n n 
C2A C3A CLA sing 186 n n 
C2A CAA CLA sing 187 n n 
C2A H2A CLA sing 188 n n 
C3A C4A CLA sing 189 n n 
C3A CMA CLA sing 190 n n 
C3A H3A CLA sing 191 n n 
CMA HMA1 CLA sing 192 n n 
CMA HMA2 CLA sing 193 n n 
CMA HMA3 CLA sing 194 n n 
CAA CBA CLA sing 195 n n 
CAA HAA1 CLA sing 196 n n 
CAA HAA2 CLA sing 197 n n 
CBA CGA CLA sing 198 n n 
CBA HBA1 CLA sing 199 n n 
CBA HBA2 CLA sing 200 n n 
CGA O1A CLA doub 201 n n 
CGA O2A CLA sing 202 n n 
O2A C1 CLA sing 203 n n 
NB C1B CLA sing 204 n y 
NB C4B CLA sing 205 n y 
C1B C2B CLA doub 206 n y 
C2B C3B CLA sing 207 n y 
C2B CMB CLA sing 208 n n 
C3B C4B CLA doub 209 n y 
C3B CAB CLA sing 210 n n 
CMB HMB1 CLA sing 211 n n 
CMB HMB2 CLA sing 212 n n 
CMB HMB3 CLA sing 213 n n 
CAB CBB CLA doub 214 n n 
CAB HAB CLA sing 215 n n 
CBB HBB1 CLA sing 216 n n 
CBB HBB2 CLA sing 217 n n 
NC C1C CLA sing 218 n n 
NC C4C CLA doub 219 n n 
C1C C2C CLA sing 220 n n 
C2C C3C CLA doub 221 n n 
C2C CMC CLA sing 222 n n 
C3C C4C CLA sing 223 n n 
C3C CAC CLA sing 224 n n 
CMC HMC1 CLA sing 225 n n 
CMC HMC2 CLA sing 226 n n 
CMC HMC3 CLA sing 227 n n 
CAC CBC CLA sing 228 n n 
CAC HAC1 CLA sing 229 n n 
CAC HAC2 CLA sing 230 n n 
CBC HBC1 CLA sing 231 n n 
CBC HBC2 CLA sing 232 n n 
CBC HBC3 CLA sing 233 n n 
ND C1D CLA sing 234 n n 
ND C4D CLA sing 235 n n 
C1D C2D CLA sing 236 n n 
C2D C3D CLA doub 237 n n 
C2D CMD CLA sing 238 n n 
C3D C4D CLA sing 239 n n 
C3D CAD CLA sing 240 n n 
CMD HMD1 CLA sing 241 n n 
CMD HMD2 CLA sing 242 n n 
CMD HMD3 CLA sing 243 n n 
CAD OBD CLA doub 244 n n 
CAD CBD CLA sing 245 n n 
CBD CGD CLA sing 246 n n 
CBD HBD CLA sing 247 n n 
CGD O1D CLA doub 248 n n 
CGD O2D CLA sing 249 n n 
O2D CED CLA sing 250 n n 
CED HED1 CLA sing 251 n n 
CED HED2 CLA sing 252 n n 
CED HED3 CLA sing 253 n n 
C1 C2 CLA sing 254 n n 
C1 H11 CLA sing 255 n n 
C1 H12 CLA sing 256 n n 
C2 C3 CLA doub 257 e n 
C2 H2 CLA sing 258 n n 
C3 C4 CLA sing 259 n n 
C3 C5 CLA sing 260 n n 
C4 H41 CLA sing 261 n n 
C4 H42 CLA sing 262 n n 
C4 H43 CLA sing 263 n n 
C5 C6 CLA sing 264 n n 
C5 H51 CLA sing 265 n n 
C5 H52 CLA sing 266 n n 
C6 C7 CLA sing 267 n n 
C6 H61 CLA sing 268 n n 
C6 H62 CLA sing 269 n n 
C7 C8 CLA sing 270 n n 
C7 H71 CLA sing 271 n n 
C7 H72 CLA sing 272 n n 
C8 C9 CLA sing 273 n n 
C8 C10 CLA sing 274 n n 
C8 H8 CLA sing 275 n n 
C9 H91 CLA sing 276 n n 
C9 H92 CLA sing 277 n n 
C9 H93 CLA sing 278 n n 
C10 C11 CLA sing 279 n n 
C10 H101 CLA sing 280 n n 
C10 H102 CLA sing 281 n n 
C11 C12 CLA sing 282 n n 
C11 H111 CLA sing 283 n n 
C11 H112 CLA sing 284 n n 
C12 C13 CLA sing 285 n n 
C12 H121 CLA sing 286 n n 
C12 H122 CLA sing 287 n n 
C13 C14 CLA sing 288 n n 
C13 C15 CLA sing 289 n n 
C13 H13 CLA sing 290 n n 
C14 H141 CLA sing 291 n n 
C14 H142 CLA sing 292 n n 
C14 H143 CLA sing 293 n n 
C15 C16 CLA sing 294 n n 
C15 H151 CLA sing 295 n n 
C15 H152 CLA sing 296 n n 
C16 C17 CLA sing 297 n n 
C16 H161 CLA sing 298 n n 
C16 H162 CLA sing 299 n n 
C17 C18 CLA sing 300 n n 
C17 H171 CLA sing 301 n n 
C17 H172 CLA sing 302 n n 
C18 C19 CLA sing 303 n n 
C18 C20 CLA sing 304 n n 
C18 H18 CLA sing 305 n n 
C19 H191 CLA sing 306 n n 
C19 H192 CLA sing 307 n n 
C19 H193 CLA sing 308 n n 
C20 H201 CLA sing 309 n n 
C20 H202 CLA sing 310 n n 
C20 H203 CLA sing 311 n n 
#
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OA 21 OEC A 1 1001 1001 OEC OEC . 
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RA 22 CLA A 1 1007 1007 CLA CLA . 
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VA 26 LHG A 1 1063 1063 LHG LHG . 
WA 27 IOD A 1 1065 1065 IOD IOD . 
XA 22 CLA B 1 1009 1009 CLA CLA . 
YA 22 CLA B 1 1010 1010 CLA CLA . 
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HB 22 CLA B 1 1020 1020 CLA CLA . 
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JB 22 CLA B 1 1022 1022 CLA CLA . 
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NB 25 BCR B 1 1047 1047 BCR BCR . 
OB 25 BCR B 1 1048 1048 BCR BCR . 
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QB 28 MGE B 1 1060 1060 MGE MGE . 
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TB 22 CLA C 1 1026 1026 CLA CLA . 
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WB 22 CLA C 1 1029 1029 CLA CLA . 
XB 22 CLA C 1 1030 1030 CLA CLA . 
YB 22 CLA C 1 1031 1031 CLA CLA . 
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AC 22 CLA C 1 1033 1033 CLA CLA . 
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FC 25 BCR C 1 1054 1054 BCR BCR . 
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HC 29 DGD C 1 1056 1056 DGD DGD . 
IC 29 DGD C 1 1057 1057 DGD DGD . 
JC 30 FE2 D 1 1002 1002 FE2 FE2 . 
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JD 22 CLA a 1 6007 6007 CLA CLA . 
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ND 26 LHG a 1 6063 6063 LHG LHG . 
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EF 24 PQ9 d 1 6042 6042 PQ9 PQ9 . 
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GF 28 MGE d 1 6059 6059 MGE MGE . 
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KF 22 CLA h 1 6017 6017 CLA CLA . 
LF 25 BCR h 1 6049 6049 BCR BCR . 
MF 22 CLA k 1 6034 6034 CLA CLA . 
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OF 25 BCR k 1 6051 6051 BCR BCR . 
PF 28 MGE l 1 6061 6061 MGE MGE . 
QF 25 BCR t 1 1046 1046 BCR BCR . 
RF 27 IOD t 1 6066 6066 IOD IOD . 
SF 31 HEM v 1 6041 6041 HEM HEM . 
TF 25 BCR z 1 6053 6053 BCR BCR . 
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HETATM 7 C C1A CLA . . . QD 22 54.035 -8.45 23.143 1 184.3 ? C1A CLA 6010 b 1 
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HETATM 9 C C3A CLA . . . QD 22 54.384 -9.971 24.876 1 184.69 ? C3A CLA 6010 b 1 
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