data_3A94
#
_model_server_result.job_id            uFKAl3kNDJA7eku5JKjcMQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-23 09:30:11' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3a94 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":130}' 
#
_entry.id    3A94 
#
_exptl.entry_id    3A94 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3A94 
_cell.length_a            77.912 
_cell.length_b            77.912 
_cell.length_c            37.426 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3A94 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 6 A CYS 6 1_555 A SG CYS 127 A CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 30 A CYS 30 1_555 A SG CYS 115 A CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 64 A CYS 64 1_555 A SG CYS 80 A CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 76 A CYS 76 1_555 A SG CYS 94 A CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
metalc ? metalc1 A NH1 ARG 14 A ARG 14 1_555 Q RH RH3 . A RH3 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? 
metalc ? metalc2 A NH2 ARG 14 A ARG 14 1_555 Q RH RH3 . A RH3 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? 
metalc ? metalc3 A NE2 HIS 15 A HIS 15 1_555 Q RH RH3 . A RH3 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 18 A ASP 18 1_555 H RH RH3 . A RH3 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASN 19 A ASN 19 1_555 O RH RH3 . A RH3 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASN 46 A ASN 46 1_555 L RH RH3 . A RH3 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 52 A ASP 52 1_555 L RH RH3 . A RH3 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc8 A O SER 60 A SER 60 1_555 B NA NA . A NA 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc9 A O CYS 64 A CYS 64 1_555 B NA NA . A NA 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc10 A OD1 ASN 65 A ASN 65 1_555 J RH RH3 . A RH3 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc11 A ND2 ASN 65 A ASN 65 1_555 M RH RH3 . A RH3 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? 
metalc ? metalc12 A OG SER 72 A SER 72 1_555 B NA NA . A NA 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc13 A O ARG 73 A ARG 73 1_555 B NA NA . A NA 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? 
metalc ? metalc14 A OD2 ASP 87 A ASP 87 1_555 I RH RH3 . A RH3 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 119 A ASP 119 1_555 K RH RH3 . A RH3 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? 
metalc ? metalc16 B NA NA . A NA 130 1_555 R O HOH . A HOH 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? 
metalc ? metalc17 B NA NA . A NA 130 1_555 R O HOH . A HOH 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc18 G RH RH3 . A RH3 135 1_555 R O HOH . A HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
metalc ? metalc19 G RH RH3 . A RH3 135 1_555 R O HOH . A HOH 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc20 G RH RH3 . A RH3 135 1_555 R O HOH . A HOH 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.87 ? 
metalc ? metalc21 H RH RH3 . A RH3 136 1_555 R O HOH . A HOH 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? 
metalc ? metalc22 H RH RH3 . A RH3 136 1_555 R O HOH . A HOH 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc23 H RH RH3 . A RH3 136 1_555 R O HOH . A HOH 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc24 I RH RH3 . A RH3 137 1_555 R O HOH . A HOH 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? 
metalc ? metalc25 I RH RH3 . A RH3 137 1_555 R O HOH . A HOH 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? 
metalc ? metalc26 J RH RH3 . A RH3 138 1_555 R O HOH . A HOH 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? 
metalc ? metalc27 J RH RH3 . A RH3 138 1_555 R O HOH . A HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc28 J RH RH3 . A RH3 138 1_555 R O HOH . A HOH 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? 
metalc ? metalc29 K RH RH3 . A RH3 139 1_555 R O HOH . A HOH 235 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc30 L RH RH3 . A RH3 140 1_555 R O HOH . A HOH 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc31 N RH RH3 . A RH3 142 1_555 R O HOH . A HOH 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc32 N RH RH3 . A RH3 142 1_555 R O HOH . A HOH 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? 
metalc ? metalc33 N RH RH3 . A RH3 142 1_555 R O HOH . A HOH 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? 
metalc ? metalc34 N RH RH3 . A RH3 142 1_555 R O HOH . A HOH 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc35 O RH RH3 . A RH3 143 1_555 R O HOH . A HOH 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? 
metalc ? metalc36 O RH RH3 . A RH3 143 1_555 R O HOH . A HOH 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc37 P RH RH3 . A RH3 144 1_555 R O HOH . A HOH 159 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc38 P RH RH3 . A RH3 144 1_555 R O HOH . A HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc39 P RH RH3 . A RH3 144 1_555 R O HOH . A HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? 
metalc ? metalc40 P RH RH3 . A RH3 144 1_555 R O HOH . A HOH 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc41 P RH RH3 . A RH3 144 1_555 R O HOH . A HOH 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? 
metalc ? metalc42 Q RH RH3 . A RH3 145 1_555 R O HOH . A HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.663 ? 
metalc ? metalc43 Q RH RH3 . A RH3 145 1_555 R O HOH . A HOH 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3A94 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012835 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012835 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.026719 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 NA A 1 130 1 NA NA . 
C 3 CL A 1 131 1 CL CL . 
D 3 CL A 1 132 2 CL CL . 
E 3 CL A 1 133 3 CL CL . 
F 3 CL A 1 134 4 CL CL . 
G 4 RH3 A 1 135 1 RH3 RH3 . 
H 4 RH3 A 1 136 2 RH3 RH3 . 
I 4 RH3 A 1 137 4 RH3 RH3 . 
J 4 RH3 A 1 138 5 RH3 RH3 . 
K 4 RH3 A 1 139 6 RH3 RH3 . 
L 4 RH3 A 1 140 7 RH3 RH3 . 
M 4 RH3 A 1 141 8 RH3 RH3 . 
N 4 RH3 A 1 142 9 RH3 RH3 . 
O 4 RH3 A 1 143 10 RH3 RH3 . 
P 4 RH3 A 1 144 11 RH3 RH3 . 
Q 4 RH3 A 1 145 12 RH3 RH3 . 
R 5 HOH A 1 146 1 HOH HOH . 
R 5 HOH A 2 147 2 HOH HOH . 
R 5 HOH A 3 148 3 HOH HOH . 
R 5 HOH A 4 149 4 HOH HOH . 
R 5 HOH A 5 150 5 HOH HOH . 
R 5 HOH A 6 151 6 HOH HOH . 
R 5 HOH A 7 152 7 HOH HOH . 
R 5 HOH A 8 153 8 HOH HOH . 
R 5 HOH A 9 154 9 HOH HOH . 
R 5 HOH A 10 155 10 HOH HOH . 
R 5 HOH A 11 156 11 HOH HOH . 
R 5 HOH A 12 157 12 HOH HOH . 
R 5 HOH A 13 158 13 HOH HOH . 
R 5 HOH A 14 159 14 HOH HOH . 
R 5 HOH A 15 160 15 HOH HOH . 
R 5 HOH A 16 161 16 HOH HOH . 
R 5 HOH A 17 162 17 HOH HOH . 
R 5 HOH A 18 163 18 HOH HOH . 
R 5 HOH A 19 164 19 HOH HOH . 
R 5 HOH A 20 165 20 HOH HOH . 
R 5 HOH A 21 166 21 HOH HOH . 
R 5 HOH A 22 167 22 HOH HOH . 
R 5 HOH A 23 168 23 HOH HOH . 
R 5 HOH A 24 169 24 HOH HOH . 
R 5 HOH A 25 170 25 HOH HOH . 
R 5 HOH A 26 171 26 HOH HOH . 
R 5 HOH A 27 172 27 HOH HOH . 
R 5 HOH A 28 173 28 HOH HOH . 
R 5 HOH A 29 174 29 HOH HOH . 
R 5 HOH A 30 175 30 HOH HOH . 
R 5 HOH A 31 176 31 HOH HOH . 
R 5 HOH A 32 177 32 HOH HOH . 
R 5 HOH A 33 178 33 HOH HOH . 
R 5 HOH A 34 179 34 HOH HOH . 
R 5 HOH A 35 180 35 HOH HOH . 
R 5 HOH A 36 181 36 HOH HOH . 
R 5 HOH A 37 182 37 HOH HOH . 
R 5 HOH A 38 183 38 HOH HOH . 
R 5 HOH A 39 184 39 HOH HOH . 
R 5 HOH A 40 185 40 HOH HOH . 
R 5 HOH A 41 186 41 HOH HOH . 
R 5 HOH A 42 187 42 HOH HOH . 
R 5 HOH A 43 188 43 HOH HOH . 
R 5 HOH A 44 189 44 HOH HOH . 
R 5 HOH A 45 190 45 HOH HOH . 
R 5 HOH A 46 191 46 HOH HOH . 
R 5 HOH A 47 192 47 HOH HOH . 
R 5 HOH A 48 193 48 HOH HOH . 
R 5 HOH A 49 194 49 HOH HOH . 
R 5 HOH A 50 195 50 HOH HOH . 
R 5 HOH A 51 196 51 HOH HOH . 
R 5 HOH A 52 197 52 HOH HOH . 
R 5 HOH A 53 198 53 HOH HOH . 
R 5 HOH A 54 199 54 HOH HOH . 
R 5 HOH A 55 200 55 HOH HOH . 
R 5 HOH A 56 201 56 HOH HOH . 
R 5 HOH A 57 202 57 HOH HOH . 
R 5 HOH A 58 203 58 HOH HOH . 
R 5 HOH A 59 204 59 HOH HOH . 
R 5 HOH A 60 205 60 HOH HOH . 
R 5 HOH A 61 206 61 HOH HOH . 
R 5 HOH A 62 207 62 HOH HOH . 
R 5 HOH A 63 208 63 HOH HOH . 
R 5 HOH A 64 209 64 HOH HOH . 
R 5 HOH A 65 210 65 HOH HOH . 
R 5 HOH A 66 211 66 HOH HOH . 
R 5 HOH A 67 212 67 HOH HOH . 
R 5 HOH A 68 213 68 HOH HOH . 
R 5 HOH A 69 214 69 HOH HOH . 
R 5 HOH A 70 215 70 HOH HOH . 
R 5 HOH A 71 216 71 HOH HOH . 
R 5 HOH A 72 217 72 HOH HOH . 
R 5 HOH A 73 218 73 HOH HOH . 
R 5 HOH A 74 219 74 HOH HOH . 
R 5 HOH A 75 220 75 HOH HOH . 
R 5 HOH A 76 221 76 HOH HOH . 
R 5 HOH A 77 222 77 HOH HOH . 
R 5 HOH A 78 223 78 HOH HOH . 
R 5 HOH A 79 224 79 HOH HOH . 
R 5 HOH A 80 225 80 HOH HOH . 
R 5 HOH A 81 226 81 HOH HOH . 
R 5 HOH A 82 227 82 HOH HOH . 
R 5 HOH A 83 228 83 HOH HOH . 
R 5 HOH A 84 229 84 HOH HOH . 
R 5 HOH A 85 230 85 HOH HOH . 
R 5 HOH A 86 231 86 HOH HOH . 
R 5 HOH A 87 232 87 HOH HOH . 
R 5 HOH A 88 233 88 HOH HOH . 
R 5 HOH A 89 234 89 HOH HOH . 
R 5 HOH A 90 235 90 HOH HOH . 
R 5 HOH A 91 236 91 HOH HOH . 
R 5 HOH A 92 237 92 HOH HOH . 
R 5 HOH A 93 238 93 HOH HOH . 
R 5 HOH A 94 239 94 HOH HOH . 
R 5 HOH A 95 240 95 HOH HOH . 
R 5 HOH A 96 241 96 HOH HOH . 
R 5 HOH A 97 242 97 HOH HOH . 
R 5 HOH A 98 243 98 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           NA 
_atom_site.label_atom_id         NA 
_atom_site.label_comp_id         NA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         B 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -13.747 
_atom_site.Cartn_y               7.365 
_atom_site.Cartn_z               3.472 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        16.73 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          NA 
_atom_site.auth_comp_id          NA 
_atom_site.auth_seq_id           130 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              33 
_model_server_stats.parse_time_ms           46 
_model_server_stats.create_model_time_ms    49 
_model_server_stats.query_time_ms           351 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#