data_3B1J # _model_server_result.job_id ywgcKyKNR5VURoNBBejonA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 01:52:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3b1j # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":341}' # _entry.id 3B1J # _exptl.entry_id 3B1J _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 63.546 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'COPPER (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3B1J _cell.length_a 69.999 _cell.length_b 161.603 _cell.length_c 146.876 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3B1J _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 8 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 3_554 -x,y,-z-1/2 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 0 0 -73.438 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 F N N ? 4 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 11 C CYS 61 1_555 C SG CYS 20 C CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf2 D SG CYS 11 D CYS 61 1_555 D SG CYS 20 D CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 155 A CYS 155 1_555 F CU CU . A CU 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? metalc ? metalc2 A N THR 156 A THR 156 1_555 F CU CU . A CU 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 156 A THR 156 1_555 F CU CU . A CU 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc ? metalc4 F CU CU . A CU 341 1_555 C O ASP 25 C ASP 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 155 B CYS 155 1_555 H CU CU . B CU 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc ? metalc6 B N THR 156 B THR 156 1_555 H CU CU . B CU 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc7 B OG1 THR 156 B THR 156 1_555 H CU CU . B CU 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? # _chem_comp.formula 'Cu 2' _chem_comp.formula_weight 63.546 _chem_comp.id CU _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'COPPER (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3B1J _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014286 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006188 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006808 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 NAD A 1 340 1 NAD NAD . F 4 CU A 1 341 2 CU CU . G 3 NAD B 1 340 2 NAD NAD . H 4 CU B 1 341 1 CU CU . I 5 HOH A 1 342 1 HOH WAT . I 5 HOH A 2 343 2 HOH WAT . I 5 HOH A 3 344 3 HOH WAT . I 5 HOH A 4 345 4 HOH WAT . I 5 HOH A 5 346 5 HOH WAT . I 5 HOH A 6 347 6 HOH WAT . I 5 HOH A 7 348 7 HOH WAT . I 5 HOH A 8 349 8 HOH WAT . I 5 HOH A 9 350 9 HOH WAT . I 5 HOH A 10 351 10 HOH WAT . I 5 HOH A 11 352 11 HOH WAT . I 5 HOH A 12 353 12 HOH WAT . I 5 HOH A 13 354 14 HOH WAT . I 5 HOH A 14 355 15 HOH WAT . I 5 HOH A 15 356 16 HOH WAT . I 5 HOH A 16 357 17 HOH WAT . I 5 HOH A 17 358 18 HOH WAT . I 5 HOH A 18 359 19 HOH WAT . I 5 HOH A 19 360 20 HOH WAT . I 5 HOH A 20 361 21 HOH WAT . I 5 HOH A 21 362 22 HOH WAT . I 5 HOH A 22 363 24 HOH WAT . I 5 HOH A 23 364 25 HOH WAT . I 5 HOH A 24 365 26 HOH WAT . I 5 HOH A 25 366 55 HOH WAT . I 5 HOH A 26 367 67 HOH WAT . I 5 HOH A 27 368 68 HOH WAT . I 5 HOH A 28 369 69 HOH WAT . I 5 HOH A 29 370 76 HOH WAT . I 5 HOH A 30 371 77 HOH WAT . I 5 HOH A 31 372 78 HOH WAT . I 5 HOH A 32 373 79 HOH WAT . I 5 HOH A 33 374 81 HOH WAT . I 5 HOH A 34 375 82 HOH WAT . I 5 HOH A 35 376 83 HOH WAT . I 5 HOH A 36 377 84 HOH WAT . I 5 HOH A 37 378 85 HOH WAT . I 5 HOH A 38 379 86 HOH WAT . I 5 HOH A 39 380 87 HOH WAT . I 5 HOH A 40 381 88 HOH WAT . I 5 HOH A 41 382 89 HOH WAT . I 5 HOH A 42 383 90 HOH WAT . I 5 HOH A 43 384 91 HOH WAT . I 5 HOH A 44 385 92 HOH WAT . I 5 HOH A 45 386 93 HOH WAT . I 5 HOH A 46 387 94 HOH WAT . I 5 HOH A 47 388 95 HOH WAT . I 5 HOH A 48 389 97 HOH WAT . I 5 HOH A 49 390 98 HOH WAT . I 5 HOH A 50 391 99 HOH WAT . I 5 HOH A 51 392 100 HOH WAT . I 5 HOH A 52 393 101 HOH WAT . I 5 HOH A 53 394 102 HOH WAT . I 5 HOH A 54 395 103 HOH WAT . I 5 HOH A 55 396 104 HOH WAT . I 5 HOH A 56 397 106 HOH WAT . I 5 HOH A 57 398 107 HOH WAT . I 5 HOH A 58 399 109 HOH WAT . I 5 HOH A 59 400 110 HOH WAT . I 5 HOH A 60 401 111 HOH WAT . I 5 HOH A 61 402 112 HOH WAT . I 5 HOH A 62 403 113 HOH WAT . I 5 HOH A 63 404 114 HOH WAT . I 5 HOH A 64 405 115 HOH WAT . I 5 HOH A 65 406 116 HOH WAT . I 5 HOH A 66 407 117 HOH WAT . I 5 HOH A 67 408 118 HOH WAT . I 5 HOH A 68 409 122 HOH WAT . I 5 HOH A 69 410 124 HOH WAT . I 5 HOH A 70 411 125 HOH WAT . I 5 HOH A 71 412 126 HOH WAT . I 5 HOH A 72 413 157 HOH WAT . I 5 HOH A 73 414 159 HOH WAT . I 5 HOH A 74 415 160 HOH WAT . I 5 HOH A 75 416 161 HOH WAT . I 5 HOH A 76 417 162 HOH WAT . I 5 HOH A 77 418 163 HOH WAT . I 5 HOH A 78 419 165 HOH WAT . I 5 HOH A 79 420 166 HOH WAT . I 5 HOH A 80 421 167 HOH WAT . I 5 HOH A 81 422 168 HOH WAT . I 5 HOH A 82 423 172 HOH WAT . I 5 HOH A 83 424 174 HOH WAT . I 5 HOH A 84 425 175 HOH WAT . I 5 HOH A 85 426 177 HOH WAT . I 5 HOH A 86 427 178 HOH WAT . I 5 HOH A 87 428 179 HOH WAT . I 5 HOH A 88 429 180 HOH WAT . I 5 HOH A 89 430 181 HOH WAT . I 5 HOH A 90 431 210 HOH WAT . I 5 HOH A 91 432 211 HOH WAT . I 5 HOH A 92 433 212 HOH WAT . I 5 HOH A 93 434 215 HOH WAT . I 5 HOH A 94 435 216 HOH WAT . I 5 HOH A 95 436 217 HOH WAT . I 5 HOH A 96 437 218 HOH WAT . J 5 HOH B 1 342 13 HOH WAT . J 5 HOH B 2 343 27 HOH WAT . J 5 HOH B 3 344 28 HOH WAT . J 5 HOH B 4 345 29 HOH WAT . J 5 HOH B 5 346 31 HOH WAT . J 5 HOH B 6 347 32 HOH WAT . J 5 HOH B 7 348 33 HOH WAT . J 5 HOH B 8 349 34 HOH WAT . J 5 HOH B 9 350 35 HOH WAT . J 5 HOH B 10 351 36 HOH WAT . J 5 HOH B 11 352 37 HOH WAT . J 5 HOH B 12 353 38 HOH WAT . J 5 HOH B 13 354 39 HOH WAT . J 5 HOH B 14 355 40 HOH WAT . J 5 HOH B 15 356 41 HOH WAT . J 5 HOH B 16 357 42 HOH WAT . J 5 HOH B 17 358 43 HOH WAT . J 5 HOH B 18 359 44 HOH WAT . J 5 HOH B 19 360 45 HOH WAT . J 5 HOH B 20 361 46 HOH WAT . J 5 HOH B 21 362 49 HOH WAT . J 5 HOH B 22 363 50 HOH WAT . J 5 HOH B 23 364 51 HOH WAT . J 5 HOH B 24 365 52 HOH WAT . J 5 HOH B 25 366 53 HOH WAT . J 5 HOH B 26 367 54 HOH WAT . J 5 HOH B 27 368 56 HOH WAT . J 5 HOH B 28 369 57 HOH WAT . J 5 HOH B 29 370 58 HOH WAT . J 5 HOH B 30 371 60 HOH WAT . J 5 HOH B 31 372 61 HOH WAT . J 5 HOH B 32 373 62 HOH WAT . J 5 HOH B 33 374 63 HOH WAT . J 5 HOH B 34 375 71 HOH WAT . J 5 HOH B 35 376 72 HOH WAT . J 5 HOH B 36 377 74 HOH WAT . J 5 HOH B 37 378 120 HOH WAT . J 5 HOH B 38 379 121 HOH WAT . J 5 HOH B 39 380 123 HOH WAT . J 5 HOH B 40 381 127 HOH WAT . J 5 HOH B 41 382 128 HOH WAT . J 5 HOH B 42 383 129 HOH WAT . J 5 HOH B 43 384 130 HOH WAT . J 5 HOH B 44 385 132 HOH WAT . J 5 HOH B 45 386 133 HOH WAT . J 5 HOH B 46 387 134 HOH WAT . J 5 HOH B 47 388 135 HOH WAT . J 5 HOH B 48 389 136 HOH WAT . J 5 HOH B 49 390 137 HOH WAT . J 5 HOH B 50 391 138 HOH WAT . J 5 HOH B 51 392 140 HOH WAT . J 5 HOH B 52 393 141 HOH WAT . J 5 HOH B 53 394 142 HOH WAT . J 5 HOH B 54 395 143 HOH WAT . J 5 HOH B 55 396 144 HOH WAT . J 5 HOH B 56 397 145 HOH WAT . J 5 HOH B 57 398 146 HOH WAT . J 5 HOH B 58 399 147 HOH WAT . J 5 HOH B 59 400 148 HOH WAT . J 5 HOH B 60 401 149 HOH WAT . J 5 HOH B 61 402 150 HOH WAT . J 5 HOH B 62 403 151 HOH WAT . J 5 HOH B 63 404 153 HOH WAT . J 5 HOH B 64 405 154 HOH WAT . J 5 HOH B 65 406 155 HOH WAT . J 5 HOH B 66 407 158 HOH WAT . J 5 HOH B 67 408 164 HOH WAT . J 5 HOH B 68 409 169 HOH WAT . J 5 HOH B 69 410 170 HOH WAT . J 5 HOH B 70 411 171 HOH WAT . J 5 HOH B 71 412 183 HOH WAT . J 5 HOH B 72 413 184 HOH WAT . J 5 HOH B 73 414 185 HOH WAT . J 5 HOH B 74 415 186 HOH WAT . J 5 HOH B 75 416 187 HOH WAT . J 5 HOH B 76 417 188 HOH WAT . J 5 HOH B 77 418 189 HOH WAT . J 5 HOH B 78 419 190 HOH WAT . J 5 HOH B 79 420 191 HOH WAT . J 5 HOH B 80 421 192 HOH WAT . J 5 HOH B 81 422 193 HOH WAT . J 5 HOH B 82 423 194 HOH WAT . J 5 HOH B 83 424 195 HOH WAT . J 5 HOH B 84 425 196 HOH WAT . J 5 HOH B 85 426 197 HOH WAT . J 5 HOH B 86 427 198 HOH WAT . J 5 HOH B 87 428 199 HOH WAT . J 5 HOH B 88 429 200 HOH WAT . J 5 HOH B 89 430 202 HOH WAT . J 5 HOH B 90 431 203 HOH WAT . J 5 HOH B 91 432 204 HOH WAT . J 5 HOH B 92 433 205 HOH WAT . J 5 HOH B 93 434 206 HOH WAT . J 5 HOH B 94 435 207 HOH WAT . J 5 HOH B 95 436 208 HOH WAT . J 5 HOH B 96 437 209 HOH WAT . J 5 HOH B 97 438 213 HOH WAT . J 5 HOH B 98 439 219 HOH WAT . J 5 HOH B 99 440 220 HOH WAT . J 5 HOH B 100 441 221 HOH WAT . K 5 HOH C 1 76 64 HOH WAT . K 5 HOH C 2 77 66 HOH WAT . K 5 HOH C 3 96 96 HOH WAT . K 5 HOH C 4 105 105 HOH WAT . K 5 HOH C 5 108 108 HOH WAT . K 5 HOH C 6 173 173 HOH WAT . L 5 HOH D 1 47 47 HOH WAT . L 5 HOH D 2 76 70 HOH WAT . L 5 HOH D 3 77 73 HOH WAT . L 5 HOH D 4 78 75 HOH WAT . L 5 HOH D 5 139 139 HOH WAT . L 5 HOH D 6 152 152 HOH WAT . L 5 HOH D 7 156 156 HOH WAT . L 5 HOH D 8 214 214 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CU _atom_site.label_atom_id CU _atom_site.label_comp_id CU _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -5.253 _atom_site.Cartn_y 14.906 _atom_site.Cartn_z -23.855 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 81.09 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CU _atom_site.auth_comp_id CU _atom_site.auth_seq_id 341 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 317 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #