data_3B65 # _model_server_result.job_id AdAydqcMAcuwRDv77KFlkg _model_server_result.datetime_utc '2025-01-22 00:50:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3b65 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":1}' # _entry.id 3B65 # _exptl.entry_id 3B65 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 447.227 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description (2S)-N-(4-cyano-3-iodophenyl)-3-(4-cyanophenoxy)-2-hydroxy-2-methylpropanamide _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3B65 _cell.length_a 54.639 _cell.length_b 66.712 _cell.length_c 69.042 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3B65 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C18 H14 I N3 O3' _chem_comp.formula_weight 447.227 _chem_comp.id 3B6 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name (2S)-N-(4-cyano-3-iodophenyl)-3-(4-cyanophenoxy)-2-hydroxy-2-methylpropanamide _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C5 C4 3B6 doub 1 n y C5 C6 3B6 sing 2 n y C4 I7 3B6 sing 3 n n C4 C3 3B6 sing 4 n y C3 C8 3B6 sing 5 n n C3 C2 3B6 doub 6 n y C8 N8 3B6 trip 7 n n C2 C1 3B6 sing 8 n y C1 C6 3B6 doub 9 n y C6 N9 3B6 sing 10 n n N9 C10 3B6 sing 11 n n C10 O10 3B6 doub 12 n n C10 C11 3B6 sing 13 n n C11 O11 3B6 sing 14 n n C11 C12 3B6 sing 15 n n C11 C13 3B6 sing 16 n n C13 O14 3B6 sing 17 n n O14 C16 3B6 sing 18 n n C16 C17 3B6 doub 19 n y C16 C21 3B6 sing 20 n y C17 C18 3B6 sing 21 n y C18 C19 3B6 doub 22 n y C19 C22 3B6 sing 23 n n C19 C20 3B6 sing 24 n y C22 N22 3B6 trip 25 n n C20 C21 3B6 doub 26 n y C5 H5 3B6 sing 27 n n C2 H2 3B6 sing 28 n n C1 H1 3B6 sing 29 n n N9 HN9 3B6 sing 30 n n O11 HO11 3B6 sing 31 n n C12 H12 3B6 sing 32 n n C12 H12A 3B6 sing 33 n n C12 H12B 3B6 sing 34 n n C13 H13 3B6 sing 35 n n C13 H13A 3B6 sing 36 n n C17 H17 3B6 sing 37 n n C18 H18 3B6 sing 38 n n C20 H20 3B6 sing 39 n n C21 H21 3B6 sing 40 n n # _atom_sites.entry_id 3B65 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018302 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01499 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014484 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 3B6 A 1 1 1 3B6 DRG . C 3 HOH A 1 101 101 HOH WAT . C 3 HOH A 2 102 102 HOH WAT . C 3 HOH A 3 103 103 HOH WAT . C 3 HOH A 4 104 104 HOH WAT . C 3 HOH A 5 105 105 HOH WAT . C 3 HOH A 6 106 106 HOH WAT . C 3 HOH A 7 107 107 HOH WAT . C 3 HOH A 8 108 108 HOH WAT . C 3 HOH A 9 109 109 HOH WAT . C 3 HOH A 10 110 110 HOH WAT . C 3 HOH A 11 111 111 HOH WAT . C 3 HOH A 12 112 112 HOH WAT . C 3 HOH A 13 113 113 HOH WAT . C 3 HOH A 14 114 114 HOH WAT . C 3 HOH A 15 115 115 HOH WAT . C 3 HOH A 16 116 116 HOH WAT . C 3 HOH A 17 117 117 HOH WAT . C 3 HOH A 18 118 118 HOH WAT . C 3 HOH A 19 119 119 HOH WAT . C 3 HOH A 20 120 120 HOH WAT . C 3 HOH A 21 121 121 HOH WAT . C 3 HOH A 22 122 122 HOH WAT . C 3 HOH A 23 123 123 HOH WAT . C 3 HOH A 24 124 124 HOH WAT . C 3 HOH A 25 125 125 HOH WAT . C 3 HOH A 26 126 126 HOH WAT . C 3 HOH A 27 127 127 HOH WAT . C 3 HOH A 28 128 128 HOH WAT . C 3 HOH A 29 129 129 HOH WAT . C 3 HOH A 30 130 130 HOH WAT . C 3 HOH A 31 131 131 HOH WAT . C 3 HOH A 32 132 132 HOH WAT . C 3 HOH A 33 133 133 HOH WAT . C 3 HOH A 34 134 134 HOH WAT . C 3 HOH A 35 135 135 HOH WAT . C 3 HOH A 36 136 136 HOH WAT . C 3 HOH A 37 137 137 HOH WAT . C 3 HOH A 38 138 138 HOH WAT . C 3 HOH A 39 139 139 HOH WAT . C 3 HOH A 40 140 140 HOH WAT . C 3 HOH A 41 141 141 HOH WAT . C 3 HOH A 42 142 142 HOH WAT . C 3 HOH A 43 143 143 HOH WAT . C 3 HOH A 44 144 144 HOH WAT . C 3 HOH A 45 145 145 HOH WAT . C 3 HOH A 46 146 146 HOH WAT . C 3 HOH A 47 147 147 HOH WAT . C 3 HOH A 48 148 148 HOH WAT . C 3 HOH A 49 149 149 HOH WAT . C 3 HOH A 50 150 150 HOH WAT . C 3 HOH A 51 151 151 HOH WAT . C 3 HOH A 52 152 152 HOH WAT . C 3 HOH A 53 153 153 HOH WAT . C 3 HOH A 54 154 154 HOH WAT . C 3 HOH A 55 155 155 HOH WAT . C 3 HOH A 56 156 156 HOH WAT . C 3 HOH A 57 157 157 HOH WAT . C 3 HOH A 58 158 158 HOH WAT . C 3 HOH A 59 159 159 HOH WAT . C 3 HOH A 60 161 161 HOH WAT . C 3 HOH A 61 162 162 HOH WAT . C 3 HOH A 62 163 163 HOH WAT . C 3 HOH A 63 164 164 HOH WAT . C 3 HOH A 64 165 165 HOH WAT . C 3 HOH A 65 166 166 HOH WAT . C 3 HOH A 66 167 167 HOH WAT . C 3 HOH A 67 168 168 HOH WAT . C 3 HOH A 68 169 169 HOH WAT . C 3 HOH A 69 170 170 HOH WAT . C 3 HOH A 70 171 171 HOH WAT . C 3 HOH A 71 172 172 HOH WAT . C 3 HOH A 72 173 173 HOH WAT . C 3 HOH A 73 174 174 HOH WAT . C 3 HOH A 74 175 175 HOH WAT . C 3 HOH A 75 176 176 HOH WAT . C 3 HOH A 76 177 177 HOH WAT . C 3 HOH A 77 178 178 HOH WAT . C 3 HOH A 78 179 179 HOH WAT . C 3 HOH A 79 180 180 HOH WAT . C 3 HOH A 80 181 181 HOH WAT . C 3 HOH A 81 182 182 HOH WAT . C 3 HOH A 82 183 183 HOH WAT . C 3 HOH A 83 184 184 HOH WAT . C 3 HOH A 84 185 185 HOH WAT . C 3 HOH A 85 186 186 HOH WAT . C 3 HOH A 86 187 187 HOH WAT . C 3 HOH A 87 188 188 HOH WAT . C 3 HOH A 88 189 189 HOH WAT . C 3 HOH A 89 190 190 HOH WAT . C 3 HOH A 90 191 191 HOH WAT . C 3 HOH A 91 192 192 HOH WAT . C 3 HOH A 92 193 193 HOH WAT . C 3 HOH A 93 194 194 HOH WAT . C 3 HOH A 94 195 195 HOH WAT . C 3 HOH A 95 196 196 HOH WAT . C 3 HOH A 96 197 197 HOH WAT . C 3 HOH A 97 198 198 HOH WAT . C 3 HOH A 98 200 200 HOH WAT . C 3 HOH A 99 201 201 HOH WAT . C 3 HOH A 100 202 202 HOH WAT . C 3 HOH A 101 203 203 HOH WAT . C 3 HOH A 102 204 204 HOH WAT . C 3 HOH A 103 205 205 HOH WAT . C 3 HOH A 104 206 206 HOH WAT . C 3 HOH A 105 207 207 HOH WAT . C 3 HOH A 106 208 208 HOH WAT . C 3 HOH A 107 209 209 HOH WAT . C 3 HOH A 108 210 210 HOH WAT . C 3 HOH A 109 211 211 HOH WAT . C 3 HOH A 110 212 212 HOH WAT . C 3 HOH A 111 213 213 HOH WAT . C 3 HOH A 112 214 214 HOH WAT . C 3 HOH A 113 215 215 HOH WAT . C 3 HOH A 114 216 216 HOH WAT . C 3 HOH A 115 217 217 HOH WAT . C 3 HOH A 116 218 218 HOH WAT . C 3 HOH A 117 219 219 HOH WAT . C 3 HOH A 118 220 220 HOH WAT . C 3 HOH A 119 221 221 HOH WAT . C 3 HOH A 120 222 222 HOH WAT . C 3 HOH A 121 223 223 HOH WAT . C 3 HOH A 122 224 224 HOH WAT . C 3 HOH A 123 225 225 HOH WAT . C 3 HOH A 124 226 226 HOH WAT . C 3 HOH A 125 227 227 HOH WAT . C 3 HOH A 126 228 228 HOH WAT . C 3 HOH A 127 229 229 HOH WAT . C 3 HOH A 128 230 230 HOH WAT . C 3 HOH A 129 231 231 HOH WAT . C 3 HOH A 130 232 232 HOH WAT . C 3 HOH A 131 233 233 HOH WAT . C 3 HOH A 132 234 234 HOH WAT . C 3 HOH A 133 235 235 HOH WAT . C 3 HOH A 134 236 236 HOH WAT . C 3 HOH A 135 237 237 HOH WAT . C 3 HOH A 136 238 238 HOH WAT . C 3 HOH A 137 239 239 HOH WAT . C 3 HOH A 138 240 240 HOH WAT . C 3 HOH A 139 241 241 HOH WAT . C 3 HOH A 140 242 242 HOH WAT . C 3 HOH A 141 243 243 HOH WAT . C 3 HOH A 142 244 244 HOH WAT . C 3 HOH A 143 245 245 HOH WAT . C 3 HOH A 144 246 246 HOH WAT . C 3 HOH A 145 247 247 HOH WAT . C 3 HOH A 146 248 248 HOH WAT . C 3 HOH A 147 249 249 HOH WAT . C 3 HOH A 148 251 251 HOH WAT . C 3 HOH A 149 252 252 HOH WAT . C 3 HOH A 150 253 253 HOH WAT . C 3 HOH A 151 254 254 HOH WAT . C 3 HOH A 152 255 255 HOH WAT . C 3 HOH A 153 256 256 HOH WAT . C 3 HOH A 154 257 257 HOH WAT . C 3 HOH A 155 258 258 HOH WAT . C 3 HOH A 156 259 259 HOH WAT . C 3 HOH A 157 260 260 HOH WAT . C 3 HOH A 158 261 261 HOH WAT . C 3 HOH A 159 262 262 HOH WAT . C 3 HOH A 160 263 263 HOH WAT . C 3 HOH A 161 264 264 HOH WAT . C 3 HOH A 162 265 265 HOH WAT . C 3 HOH A 163 266 266 HOH WAT . C 3 HOH A 164 267 267 HOH WAT . C 3 HOH A 165 268 268 HOH WAT . C 3 HOH A 166 269 269 HOH WAT . C 3 HOH A 167 270 270 HOH WAT . C 3 HOH A 168 271 271 HOH WAT . C 3 HOH A 169 272 272 HOH WAT . C 3 HOH A 170 273 273 HOH WAT . C 3 HOH A 171 274 274 HOH WAT . C 3 HOH A 172 275 275 HOH WAT . C 3 HOH A 173 276 276 HOH WAT . C 3 HOH A 174 277 277 HOH WAT . C 3 HOH A 175 278 278 HOH WAT . C 3 HOH A 176 279 279 HOH WAT . C 3 HOH A 177 280 280 HOH WAT . C 3 HOH A 178 281 281 HOH WAT . C 3 HOH A 179 282 282 HOH WAT . C 3 HOH A 180 283 283 HOH WAT . C 3 HOH A 181 284 284 HOH WAT . C 3 HOH A 182 285 285 HOH WAT . C 3 HOH A 183 286 286 HOH WAT . C 3 HOH A 184 287 287 HOH WAT . C 3 HOH A 185 288 288 HOH WAT . C 3 HOH A 186 289 289 HOH WAT . C 3 HOH A 187 290 290 HOH WAT . C 3 HOH A 188 291 291 HOH WAT . C 3 HOH A 189 292 292 HOH WAT . C 3 HOH A 190 293 293 HOH WAT . C 3 HOH A 191 294 294 HOH WAT . C 3 HOH A 192 295 295 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C5 3B6 . . . B 2 26.214 3.382 3.921 1 18.52 ? C5 3B6 1 A 1 HETATM 2 C C4 3B6 . . . B 2 25.235 4.373 3.858 1 17.69 ? C4 3B6 1 A 1 HETATM 3 I I7 3B6 . . . B 2 23.218 3.878 4.163 1 24.03 ? I7 3B6 1 A 1 HETATM 4 C C3 3B6 . . . B 2 25.612 5.687 3.605 1 15.43 ? C3 3B6 1 A 1 HETATM 5 C C8 3B6 . . . B 2 24.646 6.74 3.508 1 16.35 ? C8 3B6 1 A 1 HETATM 6 N N8 3B6 . . . B 2 23.888 7.582 3.425 1 18.13 ? N8 3B6 1 A 1 HETATM 7 C C2 3B6 . . . B 2 26.954 6.008 3.422 1 17.42 ? C2 3B6 1 A 1 HETATM 8 C C1 3B6 . . . B 2 27.925 5.015 3.486 1 16.08 ? C1 3B6 1 A 1 HETATM 9 C C6 3B6 . . . B 2 27.559 3.695 3.736 1 17.91 ? C6 3B6 1 A 1 HETATM 10 N N9 3B6 . . . B 2 28.541 2.794 3.768 1 19.05 ? N9 3B6 1 A 1 HETATM 11 C C10 3B6 . . . B 2 28.402 1.487 3.976 1 18.18 ? C10 3B6 1 A 1 HETATM 12 O O10 3B6 . . . B 2 27.332 0.918 4.186 1 19.83 ? O10 3B6 1 A 1 HETATM 13 C C11 3B6 . . . B 2 29.719 0.706 3.96 1 18.77 ? C11 3B6 1 A 1 HETATM 14 O O11 3B6 . . . B 2 30.767 1.573 3.518 1 20.98 ? O11 3B6 1 A 1 HETATM 15 C C12 3B6 . . . B 2 29.597 -0.499 3.024 1 18.47 ? C12 3B6 1 A 1 HETATM 16 C C13 3B6 . . . B 2 30.02 0.218 5.369 1 17.36 ? C13 3B6 1 A 1 HETATM 17 O O14 3B6 . . . B 2 30.129 1.347 6.252 1 17.37 ? O14 3B6 1 A 1 HETATM 18 C C16 3B6 . . . B 2 29.871 1.064 7.56 1 17.32 ? C16 3B6 1 A 1 HETATM 19 C C17 3B6 . . . B 2 30.232 -0.151 8.138 1 18.66 ? C17 3B6 1 A 1 HETATM 20 C C18 3B6 . . . B 2 29.998 -0.386 9.49 1 16.64 ? C18 3B6 1 A 1 HETATM 21 C C19 3B6 . . . B 2 29.401 0.597 10.272 1 15.99 ? C19 3B6 1 A 1 HETATM 22 C C22 3B6 . . . B 2 29.215 0.385 11.676 1 17.7 ? C22 3B6 1 A 1 HETATM 23 N N22 3B6 . . . B 2 29.072 0.225 12.793 1 15.64 ? N22 3B6 1 A 1 HETATM 24 C C20 3B6 . . . B 2 29.032 1.811 9.698 1 15.74 ? C20 3B6 1 A 1 HETATM 25 C C21 3B6 . . . B 2 29.267 2.043 8.346 1 15.57 ? C21 3B6 1 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 326 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 25 #