data_3BB5
#
_model_server_result.job_id            o69yh0vgtnTDCLe7gqwe-A 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 00:56:04' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3bb5 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":104}' 
#
_entry.id    3BB5 
#
_exptl.entry_id    3BB5 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              192.124 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CITRIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          93.41 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3BB5 
_cell.length_a            147.721 
_cell.length_b            66.323 
_cell.length_c            110.452 
_cell.Z_PDB               24 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3BB5 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,G,H,P,Q 1 1 
C,D,I,J,K,R,S 2 1 
E,F,L,M,N,O,T,U 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 M N N 
? 3 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C GLY 19 A GLY 0 1_555 A N MSE 20 A MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale2 A C MSE 20 A MSE 1 1_555 A N LEU 21 A LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale3 A C VAL 25 A VAL 6 1_555 A N MSE 26 A MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale4 A C MSE 26 A MSE 7 1_555 A N LEU 27 A LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale5 A C ALA 34 A ALA 15 1_555 A N MSE 35 A MSE 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale6 A C MSE 35 A MSE 16 1_555 A N ASP 36 A ASP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale7 A C ILE 38 A ILE 19 1_555 A N MSE 39 A MSE 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale8 A C MSE 39 A MSE 20 1_555 A N GLU 40 A GLU 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale9 A C ALA 41 A ALA 22 1_555 A N MSE 42 A MSE 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale10 A C MSE 42 A MSE 23 1_555 A N ALA 43 A ALA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale11 A C GLY 101 A GLY 82 1_555 A N MSE 102 A MSE 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale12 A C MSE 102 A MSE 83 1_555 A N LEU 103 A LEU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale13 B C GLY 19 B GLY 0 1_555 B N MSE 20 B MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale14 B C MSE 20 B MSE 1 1_555 B N LEU 21 B LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale15 B C VAL 25 B VAL 6 1_555 B N MSE 26 B MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale16 B C MSE 26 B MSE 7 1_555 B N LEU 27 B LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale17 B C ALA 34 B ALA 15 1_555 B N MSE 35 B MSE 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale18 B C MSE 35 B MSE 16 1_555 B N ASP 36 B ASP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale19 B C ILE 38 B ILE 19 1_555 B N MSE 39 B MSE 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale20 B C MSE 39 B MSE 20 1_555 B N GLU 40 B GLU 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale21 B C ALA 41 B ALA 22 1_555 B N MSE 42 B MSE 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale22 B C MSE 42 B MSE 23 1_555 B N ALA 43 B ALA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale23 B C GLY 101 B GLY 82 1_555 B N MSE 102 B MSE 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? 
covale ? covale24 B C MSE 102 B MSE 83 1_555 B N LEU 103 B LEU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale25 C C GLY 19 C GLY 0 1_555 C N MSE 20 C MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale26 C C MSE 20 C MSE 1 1_555 C N LEU 21 C LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale27 C C VAL 25 C VAL 6 1_555 C N MSE 26 C MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale28 C C MSE 26 C MSE 7 1_555 C N LEU 27 C LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale29 C C ALA 34 C ALA 15 1_555 C N MSE 35 C MSE 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale30 C C MSE 35 C MSE 16 1_555 C N ASP 36 C ASP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? 
covale ? covale31 C C ILE 38 C ILE 19 1_555 C N MSE 39 C MSE 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale32 C C MSE 39 C MSE 20 1_555 C N GLU 40 C GLU 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale33 C C ALA 41 C ALA 22 1_555 C N MSE 42 C MSE 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale34 C C MSE 42 C MSE 23 1_555 C N ALA 43 C ALA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale35 C C GLY 101 C GLY 82 1_555 C N MSE 102 C MSE 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale36 C C MSE 102 C MSE 83 1_555 C N LEU 103 C LEU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale37 D C GLY 19 D GLY 0 1_555 D N MSE 20 D MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale38 D C MSE 20 D MSE 1 1_555 D N LEU 21 D LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale39 D C VAL 25 D VAL 6 1_555 D N MSE 26 D MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale40 D C MSE 26 D MSE 7 1_555 D N LEU 27 D LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? 
covale ? covale41 D C ALA 34 D ALA 15 1_555 D N MSE 35 D MSE 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale42 D C MSE 35 D MSE 16 1_555 D N ASP 36 D ASP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale43 D C ILE 38 D ILE 19 1_555 D N MSE 39 D MSE 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale44 D C MSE 39 D MSE 20 1_555 D N GLU 40 D GLU 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale45 D C ALA 41 D ALA 22 1_555 D N MSE 42 D MSE 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale46 D C MSE 42 D MSE 23 1_555 D N ALA 43 D ALA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale47 D C GLY 101 D GLY 82 1_555 D N MSE 102 D MSE 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale48 D C MSE 102 D MSE 83 1_555 D N LEU 103 D LEU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale49 E C GLY 19 E GLY 0 1_555 E N MSE 20 E MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale50 E C MSE 20 E MSE 1 1_555 E N LEU 21 E LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale51 E C VAL 25 E VAL 6 1_555 E N MSE 26 E MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale52 E C MSE 26 E MSE 7 1_555 E N LEU 27 E LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale53 E C ALA 34 E ALA 15 1_555 E N MSE 35 E MSE 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale54 E C MSE 35 E MSE 16 1_555 E N ASP 36 E ASP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? 
covale ? covale55 E C ILE 38 E ILE 19 1_555 E N MSE 39 E MSE 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale56 E C MSE 39 E MSE 20 1_555 E N GLU 40 E GLU 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale57 E C ALA 41 E ALA 22 1_555 E N MSE 42 E MSE 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale58 E C MSE 42 E MSE 23 1_555 E N ALA 43 E ALA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale59 E C GLY 101 E GLY 82 1_555 E N MSE 102 E MSE 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale60 E C MSE 102 E MSE 83 1_555 E N LEU 103 E LEU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale61 F C GLY 19 F GLY 0 1_555 F N MSE 20 F MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale62 F C MSE 20 F MSE 1 1_555 F N LEU 21 F LEU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale63 F C VAL 25 F VAL 6 1_555 F N MSE 26 F MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? 
covale ? covale64 F C MSE 26 F MSE 7 1_555 F N LEU 27 F LEU 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale65 F C ALA 34 F ALA 15 1_555 F N MSE 35 F MSE 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale66 F C MSE 35 F MSE 16 1_555 F N ASP 36 F ASP 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale67 F C ILE 38 F ILE 19 1_555 F N MSE 39 F MSE 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale68 F C MSE 39 F MSE 20 1_555 F N GLU 40 F GLU 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale69 F C ALA 41 F ALA 22 1_555 F N MSE 42 F MSE 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale70 F C MSE 42 F MSE 23 1_555 F N ALA 43 F ALA 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale71 F C GLY 101 F GLY 82 1_555 F N MSE 102 F MSE 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale72 F C MSE 102 F MSE 83 1_555 F N LEU 103 F LEU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H8 O7' 
_chem_comp.formula_weight    192.124 
_chem_comp.id                CIT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CITRIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3BB5 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.00677 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000403 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.015078 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00907 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 EDO A 1 103 2 EDO EDO . 
H 3 CIT B 1 103 8 CIT CIT . 
I 2 EDO C 1 103 1 EDO EDO . 
J 3 CIT C 1 104 9 CIT CIT . 
K 3 CIT D 1 103 5 CIT CIT . 
L 2 EDO E 1 103 3 EDO EDO . 
M 3 CIT E 1 104 6 CIT CIT . 
N 2 EDO F 1 103 4 EDO EDO . 
O 3 CIT F 1 104 7 CIT CIT . 
P 4 HOH A 1 104 10 HOH HOH . 
P 4 HOH A 2 105 22 HOH HOH . 
P 4 HOH A 3 106 25 HOH HOH . 
P 4 HOH A 4 107 29 HOH HOH . 
P 4 HOH A 5 108 32 HOH HOH . 
P 4 HOH A 6 109 47 HOH HOH . 
P 4 HOH A 7 110 50 HOH HOH . 
P 4 HOH A 8 111 53 HOH HOH . 
P 4 HOH A 9 112 58 HOH HOH . 
P 4 HOH A 10 113 59 HOH HOH . 
P 4 HOH A 11 114 60 HOH HOH . 
P 4 HOH A 12 115 61 HOH HOH . 
P 4 HOH A 13 116 66 HOH HOH . 
P 4 HOH A 14 117 71 HOH HOH . 
P 4 HOH A 15 118 92 HOH HOH . 
P 4 HOH A 16 119 94 HOH HOH . 
P 4 HOH A 17 120 99 HOH HOH . 
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