data_3C7X # _model_server_result.job_id KtspuVof5bRiKTXmRdiNeA _model_server_result.datetime_utc '2024-12-12 19:31:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3c7x # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 3C7X # _exptl.entry_id 3C7X _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 3C7X _cell.length_a 77.21 _cell.length_b 77.21 _cell.length_c 66.819 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3C7X _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 152 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 ? dimeric 2 author_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D 1 1 A,B,C,D 2 1,2 A,B,C,D 3 1,3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 6_665 -x+1,-x+y+1,-z+1/3 -0.5 -0.866025 0 -0.866025 0.5 0 0 0 -1 38.605 66.865821 22.273 3 'crystal symmetry operation' 2_655 -y+1,x-y,z+1/3 -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 77.21 0 22.273 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 4 A CYS 319 1_555 A SG CYS 193 A CYS 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc1 D O HOH . A HOH 56 1_555 B NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc2 A O ASN 54 A ASN 369 1_555 B NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 55 A THR 370 1_555 B NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? metalc ? metalc4 A O ASP 101 A ASP 416 1_555 B NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc5 A O ARG 149 A ARG 464 1_555 B NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3C7X _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012952 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.007478 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014955 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014966 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NA A 1 1001 1001 NA NA . C 3 CL A 1 1002 1002 CL CL . D 4 HOH A 1 1 1 HOH WAT . D 4 HOH A 2 2 2 HOH WAT . D 4 HOH A 3 3 3 HOH WAT . D 4 HOH A 4 4 4 HOH WAT . D 4 HOH A 5 5 5 HOH WAT . D 4 HOH A 6 6 6 HOH WAT . D 4 HOH A 7 7 7 HOH WAT . D 4 HOH A 8 8 8 HOH WAT . D 4 HOH A 9 9 9 HOH WAT . D 4 HOH A 10 10 10 HOH WAT . D 4 HOH A 11 11 11 HOH WAT . D 4 HOH A 12 12 12 HOH WAT . D 4 HOH A 13 13 13 HOH WAT . D 4 HOH A 14 14 14 HOH WAT . D 4 HOH A 15 15 15 HOH WAT . D 4 HOH A 16 16 16 HOH WAT . D 4 HOH A 17 17 17 HOH WAT . D 4 HOH A 18 18 18 HOH WAT . D 4 HOH A 19 19 19 HOH WAT . D 4 HOH A 20 20 20 HOH WAT . D 4 HOH A 21 21 21 HOH WAT . D 4 HOH A 22 22 22 HOH WAT . D 4 HOH A 23 23 23 HOH WAT . D 4 HOH A 24 24 24 HOH WAT . D 4 HOH A 25 25 25 HOH WAT . D 4 HOH A 26 26 26 HOH WAT . D 4 HOH A 27 27 27 HOH WAT . D 4 HOH A 28 28 28 HOH WAT . D 4 HOH A 29 29 29 HOH WAT . D 4 HOH A 30 30 30 HOH WAT . D 4 HOH A 31 31 31 HOH WAT . D 4 HOH A 32 32 32 HOH WAT . D 4 HOH A 33 33 33 HOH WAT . D 4 HOH A 34 34 34 HOH WAT . D 4 HOH A 35 35 35 HOH WAT . D 4 HOH A 36 36 36 HOH WAT . D 4 HOH A 37 37 37 HOH WAT . D 4 HOH A 38 38 38 HOH WAT . D 4 HOH A 39 39 39 HOH WAT . D 4 HOH A 40 40 40 HOH WAT . D 4 HOH A 41 41 41 HOH WAT . D 4 HOH A 42 42 42 HOH WAT . D 4 HOH A 43 43 43 HOH WAT . D 4 HOH A 44 44 44 HOH WAT . D 4 HOH A 45 45 45 HOH WAT . D 4 HOH A 46 46 46 HOH WAT . D 4 HOH A 47 47 47 HOH WAT . D 4 HOH A 48 48 48 HOH WAT . D 4 HOH A 49 49 49 HOH WAT . D 4 HOH A 50 50 50 HOH WAT . D 4 HOH A 51 51 51 HOH WAT . D 4 HOH A 52 52 52 HOH WAT . D 4 HOH A 53 53 53 HOH WAT . D 4 HOH A 54 54 54 HOH WAT . D 4 HOH A 55 55 55 HOH WAT . D 4 HOH A 56 56 56 HOH WAT . D 4 HOH A 57 57 57 HOH WAT . D 4 HOH A 58 58 58 HOH WAT . D 4 HOH A 59 59 59 HOH WAT . D 4 HOH A 60 60 60 HOH WAT . D 4 HOH A 61 61 61 HOH WAT . D 4 HOH A 62 62 62 HOH WAT . D 4 HOH A 63 63 63 HOH WAT . D 4 HOH A 64 64 64 HOH WAT . D 4 HOH A 65 65 65 HOH WAT . D 4 HOH A 66 66 66 HOH WAT . D 4 HOH A 67 67 67 HOH WAT . D 4 HOH A 68 68 68 HOH WAT . D 4 HOH A 69 69 69 HOH WAT . D 4 HOH A 70 70 70 HOH WAT . D 4 HOH A 71 71 71 HOH WAT . D 4 HOH A 72 72 72 HOH WAT . D 4 HOH A 73 73 73 HOH WAT . D 4 HOH A 74 74 74 HOH WAT . D 4 HOH A 75 75 75 HOH WAT . D 4 HOH A 76 76 76 HOH WAT . D 4 HOH A 77 77 77 HOH WAT . D 4 HOH A 78 78 78 HOH WAT . D 4 HOH A 79 79 79 HOH WAT . D 4 HOH A 80 80 80 HOH WAT . D 4 HOH A 81 81 81 HOH WAT . D 4 HOH A 82 82 82 HOH WAT . D 4 HOH A 83 83 83 HOH WAT . D 4 HOH A 84 84 84 HOH WAT . D 4 HOH A 85 85 85 HOH WAT . D 4 HOH A 86 86 86 HOH WAT . D 4 HOH A 87 87 87 HOH WAT . D 4 HOH A 88 88 88 HOH WAT . D 4 HOH A 89 89 89 HOH WAT . D 4 HOH A 90 90 90 HOH WAT . D 4 HOH A 91 91 91 HOH WAT . D 4 HOH A 92 92 92 HOH WAT . D 4 HOH A 93 93 93 HOH WAT . D 4 HOH A 94 94 94 HOH WAT . D 4 HOH A 95 95 95 HOH WAT . D 4 HOH A 96 96 96 HOH WAT . D 4 HOH A 97 97 97 HOH WAT . D 4 HOH A 98 98 98 HOH WAT . D 4 HOH A 99 99 99 HOH WAT . D 4 HOH A 100 100 100 HOH WAT . D 4 HOH A 101 101 101 HOH WAT . D 4 HOH A 102 102 102 HOH WAT . D 4 HOH A 103 103 103 HOH WAT . D 4 HOH A 104 104 104 HOH WAT . D 4 HOH A 105 105 105 HOH WAT . D 4 HOH A 106 106 106 HOH WAT . D 4 HOH A 107 107 107 HOH WAT . D 4 HOH A 108 108 108 HOH WAT . D 4 HOH A 109 109 109 HOH WAT . D 4 HOH A 110 110 110 HOH WAT . D 4 HOH A 111 111 111 HOH WAT . D 4 HOH A 112 112 112 HOH WAT . D 4 HOH A 113 113 113 HOH WAT . D 4 HOH A 114 114 114 HOH WAT . D 4 HOH A 115 115 115 HOH WAT . D 4 HOH A 116 116 116 HOH WAT . D 4 HOH A 117 117 117 HOH WAT . D 4 HOH A 118 118 118 HOH WAT . D 4 HOH A 119 119 119 HOH WAT . D 4 HOH A 120 120 120 HOH WAT . D 4 HOH A 121 121 121 HOH WAT . D 4 HOH A 122 122 122 HOH WAT . D 4 HOH A 123 123 123 HOH WAT . D 4 HOH A 124 124 124 HOH WAT . D 4 HOH A 125 125 125 HOH WAT . D 4 HOH A 126 126 126 HOH WAT . D 4 HOH A 127 127 127 HOH WAT . D 4 HOH A 128 128 128 HOH WAT . D 4 HOH A 129 129 129 HOH WAT . D 4 HOH A 130 130 130 HOH WAT . D 4 HOH A 131 131 131 HOH WAT . D 4 HOH A 132 132 132 HOH WAT . D 4 HOH A 133 133 133 HOH WAT . D 4 HOH A 134 134 134 HOH WAT . D 4 HOH A 135 135 135 HOH WAT . D 4 HOH A 136 136 136 HOH WAT . D 4 HOH A 137 137 137 HOH WAT . D 4 HOH A 138 138 138 HOH WAT . D 4 HOH A 139 139 139 HOH WAT . D 4 HOH A 140 140 140 HOH WAT . D 4 HOH A 141 141 141 HOH WAT . D 4 HOH A 142 142 142 HOH WAT . D 4 HOH A 143 143 143 HOH WAT . D 4 HOH A 144 144 144 HOH WAT . D 4 HOH A 145 145 145 HOH WAT . D 4 HOH A 146 146 146 HOH WAT . D 4 HOH A 147 147 147 HOH WAT . D 4 HOH A 148 148 148 HOH WAT . D 4 HOH A 149 149 149 HOH WAT . D 4 HOH A 150 150 150 HOH WAT . D 4 HOH A 151 151 151 HOH WAT . D 4 HOH A 152 152 152 HOH WAT . D 4 HOH A 153 153 153 HOH WAT . D 4 HOH A 154 154 154 HOH WAT . D 4 HOH A 155 155 155 HOH WAT . D 4 HOH A 156 156 156 HOH WAT . D 4 HOH A 157 157 157 HOH WAT . D 4 HOH A 158 158 158 HOH WAT . D 4 HOH A 159 159 159 HOH WAT . D 4 HOH A 160 160 160 HOH WAT . D 4 HOH A 161 161 161 HOH WAT . D 4 HOH A 162 162 162 HOH WAT . D 4 HOH A 163 163 163 HOH WAT . D 4 HOH A 164 164 164 HOH WAT . D 4 HOH A 165 165 165 HOH WAT . D 4 HOH A 166 166 166 HOH WAT . D 4 HOH A 167 167 167 HOH WAT . D 4 HOH A 168 168 168 HOH WAT . D 4 HOH A 169 169 169 HOH WAT . D 4 HOH A 170 170 170 HOH WAT . D 4 HOH A 171 171 171 HOH WAT . D 4 HOH A 172 172 172 HOH WAT . D 4 HOH A 173 173 173 HOH WAT . D 4 HOH A 174 174 174 HOH WAT . D 4 HOH A 175 175 175 HOH WAT . D 4 HOH A 176 176 176 HOH WAT . D 4 HOH A 177 177 177 HOH WAT . D 4 HOH A 178 178 178 HOH WAT . D 4 HOH A 179 179 179 HOH WAT . D 4 HOH A 180 180 180 HOH WAT . D 4 HOH A 181 181 181 HOH WAT . D 4 HOH A 182 182 182 HOH WAT . D 4 HOH A 183 183 183 HOH WAT . D 4 HOH A 184 184 184 HOH WAT . D 4 HOH A 185 185 185 HOH WAT . D 4 HOH A 186 186 186 HOH WAT . D 4 HOH A 187 187 187 HOH WAT . D 4 HOH A 188 188 188 HOH WAT . D 4 HOH A 189 189 189 HOH WAT . D 4 HOH A 190 190 190 HOH WAT . D 4 HOH A 191 191 191 HOH WAT . D 4 HOH A 192 192 192 HOH WAT . D 4 HOH A 193 193 193 HOH WAT . D 4 HOH A 194 194 194 HOH WAT . D 4 HOH A 195 195 195 HOH WAT . D 4 HOH A 196 196 196 HOH WAT . D 4 HOH A 197 197 197 HOH WAT . D 4 HOH A 198 198 198 HOH WAT . D 4 HOH A 199 199 199 HOH WAT . D 4 HOH A 200 200 200 HOH WAT . D 4 HOH A 201 201 201 HOH WAT . D 4 HOH A 202 202 202 HOH WAT . D 4 HOH A 203 203 203 HOH WAT . D 4 HOH A 204 204 204 HOH WAT . D 4 HOH A 205 205 205 HOH WAT . D 4 HOH A 206 206 206 HOH WAT . D 4 HOH A 207 207 207 HOH WAT . D 4 HOH A 208 208 208 HOH WAT . D 4 HOH A 209 209 209 HOH WAT . D 4 HOH A 210 210 210 HOH WAT . D 4 HOH A 211 211 211 HOH WAT . D 4 HOH A 212 212 212 HOH WAT . D 4 HOH A 213 213 213 HOH WAT . D 4 HOH A 214 214 214 HOH WAT . D 4 HOH A 215 215 215 HOH WAT . D 4 HOH A 216 216 216 HOH WAT . D 4 HOH A 217 217 217 HOH WAT . D 4 HOH A 218 218 218 HOH WAT . D 4 HOH A 219 219 219 HOH WAT . D 4 HOH A 220 220 220 HOH WAT . D 4 HOH A 221 221 221 HOH WAT . D 4 HOH A 222 222 222 HOH WAT . D 4 HOH A 223 223 223 HOH WAT . D 4 HOH A 224 224 224 HOH WAT . D 4 HOH A 225 225 225 HOH WAT . D 4 HOH A 226 226 226 HOH WAT . D 4 HOH A 227 227 227 HOH WAT . D 4 HOH A 228 228 228 HOH WAT . D 4 HOH A 229 229 229 HOH WAT . D 4 HOH A 230 230 230 HOH WAT . D 4 HOH A 231 231 231 HOH WAT . D 4 HOH A 232 232 232 HOH WAT . D 4 HOH A 233 233 233 HOH WAT . D 4 HOH A 234 234 234 HOH WAT . D 4 HOH A 235 235 235 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 29.796 _atom_site.Cartn_y 7.92 _atom_site.Cartn_z -1.446 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 22.85 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 1001 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 48 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 308 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 1 #