data_3CFK
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_model_server_result.job_id            el2ZcHZOnBpL7w9WD6xzfQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-12 20:43:00' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          3cfk 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":309}' 
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_entry.id    3CFK 
#
_exptl.entry_id    3CFK 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CADMIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    23 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         89.89 
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_cell.length_b            106.299 
_cell.length_c            116.109 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3CFK 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 5 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 6 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 7 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 8 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,Q,R,S,RA,SA 1 1 
C,D,T,U,V,W,TA,UA 2 1 
E,F,X,Y,Z,AA,BA,VA,WA 3 1 
G,H,CA,DA,EA,XA,YA 4 1 
I,J,FA,GA,HA,IA,ZA,AB 5 1 
K,L,JA,KA,LA,MA,BB,CB 6 1 
M,N,NA,OA,DB,EB 7 1 
O,P,PA,QA,FB,GB 8 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 Q N N 
? 3 R N N 
? 3 S N N 
? 3 T N N 
? 3 U N N 
? 3 W N N 
? 3 X N N 
? 3 Y N N 
? 3 Z N N 
? 3 AA N N 
? 3 BA N N 
? 3 CA N N 
? 3 DA N N 
? 3 FA N N 
? 3 GA N N 
? 3 HA N N 
? 3 IA N N 
? 3 JA N N 
? 3 KA N N 
? 3 LA N N 
? 3 MA N N 
? 3 NA N N 
? 3 PA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 22 L CYS 23 1_555 A SG CYS 90 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 136 L CYS 134 1_555 A SG CYS 196 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 22 H CYS 22 1_555 B SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 150 H CYS 142 1_555 B SG CYS 206 H CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 22 A CYS 23 1_555 C SG CYS 90 A CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
disulf ? disulf6 C SG CYS 136 A CYS 134 1_555 C SG CYS 196 A CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? 
disulf ? disulf7 D SG CYS 22 B CYS 22 1_555 D SG CYS 96 B CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
disulf ? disulf8 D SG CYS 150 B CYS 142 1_555 D SG CYS 206 B CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf9 E SG CYS 22 C CYS 23 1_555 E SG CYS 90 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? 
disulf ? disulf10 E SG CYS 136 C CYS 134 1_555 E SG CYS 196 C CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? 
disulf ? disulf11 F SG CYS 22 D CYS 22 1_555 F SG CYS 96 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
disulf ? disulf12 F SG CYS 150 D CYS 142 1_555 F SG CYS 206 D CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? 
disulf ? disulf13 G SG CYS 22 E CYS 23 1_555 G SG CYS 90 E CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? 
disulf ? disulf14 G SG CYS 136 E CYS 134 1_555 G SG CYS 196 E CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf15 H SG CYS 22 F CYS 22 1_555 H SG CYS 96 F CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? 
disulf ? disulf16 H SG CYS 150 F CYS 142 1_555 H SG CYS 206 F CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
disulf ? disulf17 I SG CYS 22 G CYS 23 1_555 I SG CYS 90 G CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
disulf ? disulf18 I SG CYS 136 G CYS 134 1_555 I SG CYS 196 G CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? 
disulf ? disulf19 J SG CYS 22 I CYS 22 1_555 J SG CYS 96 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
disulf ? disulf20 J SG CYS 150 I CYS 142 1_555 J SG CYS 206 I CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
disulf ? disulf21 K SG CYS 22 J CYS 23 1_555 K SG CYS 90 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
disulf ? disulf22 K SG CYS 136 J CYS 134 1_555 K SG CYS 196 J CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
disulf ? disulf23 L SG CYS 22 K CYS 22 1_555 L SG CYS 96 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
disulf ? disulf24 L SG CYS 150 K CYS 142 1_555 L SG CYS 206 K CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? 
disulf ? disulf25 M SG CYS 22 M CYS 23 1_555 M SG CYS 90 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
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disulf ? disulf27 N SG CYS 22 N CYS 22 1_555 N SG CYS 96 N CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
disulf ? disulf28 N SG CYS 150 N CYS 142 1_555 N SG CYS 206 N CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? 
disulf ? disulf29 O SG CYS 22 O CYS 23 1_555 O SG CYS 90 O CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? 
disulf ? disulf30 O SG CYS 136 O CYS 134 1_555 O SG CYS 196 O CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
disulf ? disulf31 P SG CYS 22 P CYS 22 1_555 P SG CYS 96 P CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
disulf ? disulf32 P SG CYS 150 P CYS 142 1_555 P SG CYS 206 P CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc1 A ND2 ASN 140 L ASN 138 1_555 S CD CD . L CD 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? 
metalc ? metalc2 Q CD CD . L CD 301 1_555 RA O HOH . L HOH 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc3 R CD CD . L CD 319 1_555 RA O HOH . L HOH 330 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc4 R CD CD . L CD 319 1_555 RA O HOH . L HOH 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc5 R CD CD . L CD 319 1_555 BB O HOH . J HOH 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc6 S CD CD . L CD 323 1_555 B NE2 HIS 174 H HIS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? 
metalc ? metalc7 C O GLY 59 A GLY 57 1_555 NA CD CD . M CD 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc8 C NE2 GLN 81 A GLN 79 1_555 T CD CD . A CD 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? 
metalc ? metalc9 C OE2 GLU 83 A GLU 81 1_555 T CD CD . A CD 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? 
metalc ? metalc10 T CD CD . A CD 317 1_555 TA O HOH . A HOH 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? 
metalc ? metalc11 T CD CD . A CD 317 1_555 M O GLY 59 M GLY 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc12 U CD CD . A CD 318 1_555 TA O HOH . A HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc13 D OE1 GLU 222 B GLU 226 1_555 W CD CD . B CD 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? 
metalc ? metalc14 E ND2 ASN 154 C ASN 152 1_555 Z CD CD . C CD 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc15 X CD CD . C CD 308 1_555 VA O HOH . C HOH 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? 
metalc ? metalc16 X CD CD . C CD 308 1_555 I O GLY 59 G GLY 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? 
metalc ? metalc17 Y CD CD . C CD 309 1_555 F NE2 HIS 174 D HIS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc18 Z CD CD . C CD 310 1_555 VA O HOH . C HOH 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc19 Z CD CD . C CD 310 1_555 VA O HOH . C HOH 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc20 VA O HOH . C HOH 319 1_555 HA CD CD . G CD 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc21 F OD2 ASP 66 D ASP 65 1_555 AA CD CD . D CD 311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc22 F OE1 GLU 222 D GLU 226 1_555 BA CD CD . D CD 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? 
metalc ? metalc23 BA CD CD . D CD 312 1_555 P OE1 GLU 222 P GLU 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc24 BA CD CD . D CD 312 1_555 P OE2 GLU 222 P GLU 226 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc25 G O GLY 59 E GLY 57 1_555 PA CD CD . O CD 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc26 G ND2 ASN 140 E ASN 138 1_555 DA CD CD . E CD 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? 
metalc ? metalc27 CA CD CD . E CD 314 1_555 O O GLY 59 O GLY 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc28 I OE1 GLU 16 G GLU 17 1_555 IA CD CD . G CD 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? 
metalc ? metalc29 I OE2 GLU 16 G GLU 17 1_555 IA CD CD . G CD 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.573 ? 
metalc ? metalc30 I ND2 ASN 140 G ASN 138 1_555 GA CD CD . G CD 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc31 GA CD CD . G CD 315 1_555 J NE2 HIS 174 I HIS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc32 IA CD CD . G CD 321 1_555 ZA O HOH . G HOH 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc33 K ND2 ASN 140 J ASN 138 1_555 JA CD CD . J CD 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.87 ? 
metalc ? metalc34 K ND2 ASN 154 J ASN 152 1_555 KA CD CD . J CD 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? 
metalc ? metalc35 JA CD CD . J CD 302 1_555 L NE2 HIS 174 K HIS 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? 
metalc ? metalc36 KA CD CD . J CD 303 1_555 BB O HOH . J HOH 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc37 KA CD CD . J CD 303 1_555 BB O HOH . J HOH 351 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc38 L OD2 ASP 66 K ASP 65 1_555 MA CD CD . K CD 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc39 M NE2 GLN 81 M GLN 79 1_555 NA CD CD . M CD 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc40 O NE2 GLN 81 O GLN 79 1_555 PA CD CD . O CD 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3CFK 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012335 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    -0.000113 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000008 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009408 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    -0.000019 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008613 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
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R 3 CD L 1 319 319 CD CD . 
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