data_3CPX
#
_model_server_result.job_id            Z2pBUVrP61zxPV-acPg-wg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-13 07:25:39' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3cpx 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":401}' 
#
_entry.id    3CPX 
#
_exptl.entry_id    3CPX 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              55.845 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'FE (III) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            3CPX 
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_cell.length_b            83.84 
_cell.length_c            682.31 
_cell.Z_PDB               36 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3CPX 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        178 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 61 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C GLY 19 A GLY 0 1_555 A N MSE 20 A MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale2 A C MSE 20 A MSE 1 1_555 A N GLN 21 A GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale3 A C HIS 84 A HIS 65 1_555 A N MSE 85 A MSE 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale4 A C MSE 85 A MSE 66 1_555 A N ASP 86 A ASP 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale5 A C TRP 132 A TRP 113 1_555 A N MSE 133 A MSE 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale6 A C MSE 133 A MSE 114 1_555 A N LEU 134 A LEU 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale7 A C SER 235 A SER 216 1_555 A N MSE 236 A MSE 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? 
covale ? covale8 A C MSE 236 A MSE 217 1_555 A N ARG 237 A ARG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale9 A C ARG 239 A ARG 220 1_555 A N MSE 240 A MSE 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? 
covale ? covale10 A C MSE 240 A MSE 221 1_555 A N ILE 241 A ILE 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale11 A C SER 309 A SER 290 1_555 A N MSE 310 A MSE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? 
covale ? covale12 A C MSE 310 A MSE 291 1_555 A N VAL 311 A VAL 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? 
covale ? covale13 A C LEU 317 A LEU 298 1_555 A N MSE 318 A MSE 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale14 A C MSE 318 A MSE 299 1_555 A N GLU 319 A GLU 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? 
covale ? covale15 B C GLY 19 B GLY 0 1_555 B N MSE 20 B MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale16 B C MSE 20 B MSE 1 1_555 B N GLN 21 B GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale17 B C HIS 84 B HIS 65 1_555 B N MSE 85 B MSE 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale18 B C MSE 85 B MSE 66 1_555 B N ASP 86 B ASP 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.309 ? 
covale ? covale19 B C TRP 132 B TRP 113 1_555 B N MSE 133 B MSE 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale20 B C MSE 133 B MSE 114 1_555 B N LEU 134 B LEU 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? 
covale ? covale21 B C SER 235 B SER 216 1_555 B N MSE 236 B MSE 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? 
covale ? covale22 B C MSE 236 B MSE 217 1_555 B N ARG 237 B ARG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale23 B C ARG 239 B ARG 220 1_555 B N MSE 240 B MSE 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale24 B C MSE 240 B MSE 221 1_555 B N ILE 241 B ILE 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale25 B C SER 309 B SER 290 1_555 B N MSE 310 B MSE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale26 B C MSE 310 B MSE 291 1_555 B N VAL 311 B VAL 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? 
covale ? covale27 B C LEU 317 B LEU 298 1_555 B N MSE 318 B MSE 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale28 B C MSE 318 B MSE 299 1_555 B N GLU 319 B GLU 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.308 ? 
covale ? covale29 C C GLY 19 C GLY 0 1_555 C N MSE 20 C MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale30 C C MSE 20 C MSE 1 1_555 C N GLN 21 C GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale31 C C HIS 84 C HIS 65 1_555 C N MSE 85 C MSE 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale32 C C MSE 85 C MSE 66 1_555 C N ASP 86 C ASP 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? 
covale ? covale33 C C TRP 132 C TRP 113 1_555 C N MSE 133 C MSE 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale34 C C MSE 133 C MSE 114 1_555 C N LEU 134 C LEU 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale35 C C SER 235 C SER 216 1_555 C N MSE 236 C MSE 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale36 C C MSE 236 C MSE 217 1_555 C N ARG 237 C ARG 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.314 ? 
covale ? covale37 C C ARG 239 C ARG 220 1_555 C N MSE 240 C MSE 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale38 C C MSE 240 C MSE 221 1_555 C N ILE 241 C ILE 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? 
covale ? covale39 C C SER 309 C SER 290 1_555 C N MSE 310 C MSE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? 
covale ? covale40 C C MSE 310 C MSE 291 1_555 C N VAL 311 C VAL 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? 
covale ? covale41 C C LEU 317 C LEU 298 1_555 C N MSE 318 C MSE 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? 
covale ? covale42 C C MSE 318 C MSE 299 1_555 C N GLU 319 C GLU 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 84 A HIS 65 1_555 D FE FE . A FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.994 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 165 A ASP 146 1_555 D FE FE . A FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 165 A ASP 146 1_555 E FE FE . A FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? 
metalc ? metalc4 A OE2 GLU 192 A GLU 173 1_555 E FE FE . A FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 218 A ASP 199 1_555 D FE FE . A FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
metalc ? metalc6 A OD2 ASP 218 A ASP 199 1_555 D FE FE . A FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc7 A NE2 HIS 296 A HIS 277 1_555 E FE FE . A FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc8 D FE FE . A FE 400 1_555 W O HOH . A HOH 462 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.827 ? 
metalc ? metalc9 D FE FE . A FE 400 1_555 W O HOH . A HOH 463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? 
metalc ? metalc10 E FE FE . A FE 401 1_555 W O HOH . A HOH 463 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc11 B NE2 HIS 84 B HIS 65 1_555 M FE FE . B FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? 
metalc ? metalc12 B OD2 ASP 165 B ASP 146 1_555 L FE FE . B FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASP 165 B ASP 146 1_555 M FE FE . B FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? 
metalc ? metalc14 B OE1 GLU 192 B GLU 173 1_555 L FE FE . B FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc15 B OE2 GLU 192 B GLU 173 1_555 L FE FE . B FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc16 B OD1 ASP 218 B ASP 199 1_555 M FE FE . B FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc17 B OD2 ASP 218 B ASP 199 1_555 M FE FE . B FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? 
metalc ? metalc18 B NE2 HIS 296 B HIS 277 1_555 L FE FE . B FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc19 L FE FE . B FE 400 1_555 X O HOH . B HOH 452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc20 M FE FE . B FE 401 1_555 X O HOH . B HOH 451 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc21 C NE2 HIS 84 C HIS 65 1_555 Q FE FE . C FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? 
metalc ? metalc22 C OD2 ASP 165 C ASP 146 1_555 P FE FE . C FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
metalc ? metalc23 C OD1 ASP 165 C ASP 146 1_555 Q FE FE . C FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? 
metalc ? metalc24 C OE2 GLU 192 C GLU 173 1_555 P FE FE . C FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
metalc ? metalc25 C OD1 ASP 218 C ASP 199 1_555 Q FE FE . C FE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
metalc ? metalc26 C NE2 HIS 296 C HIS 277 1_555 P FE FE . C FE 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc27 Q FE FE . C FE 401 1_555 Y O HOH . C HOH 450 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? 
#
_chem_comp.formula           'Fe 3' 
_chem_comp.formula_weight    55.845 
_chem_comp.id                FE 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'FE (III) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3CPX 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011927 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.006886 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013773 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.001466 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 2 FE A 1 400 400 FE FE . 
E 2 FE A 1 401 401 FE FE . 
F 3 EDO A 1 402 2 EDO EDO . 
G 3 EDO A 1 403 3 EDO EDO . 
H 3 EDO A 1 404 4 EDO EDO . 
I 3 EDO A 1 405 7 EDO EDO . 
J 3 EDO A 1 406 8 EDO EDO . 
K 3 EDO A 1 407 11 EDO EDO . 
L 2 FE B 1 400 400 FE FE . 
M 2 FE B 1 401 401 FE FE . 
N 4 CL B 1 402 1 CL CL . 
O 3 EDO B 1 403 5 EDO EDO . 
P 2 FE C 1 400 400 FE FE . 
Q 2 FE C 1 401 401 FE FE . 
R 3 EDO C 1 402 6 EDO EDO . 
S 3 EDO C 1 403 9 EDO EDO . 
T 3 EDO C 1 404 10 EDO EDO . 
U 3 EDO C 1 405 12 EDO EDO . 
V 3 EDO C 1 406 13 EDO EDO . 
W 5 HOH A 1 408 15 HOH HOH . 
W 5 HOH A 2 409 18 HOH HOH . 
W 5 HOH A 3 410 19 HOH HOH . 
W 5 HOH A 4 411 20 HOH HOH . 
W 5 HOH A 5 412 21 HOH HOH . 
W 5 HOH A 6 413 22 HOH HOH . 
W 5 HOH A 7 414 23 HOH HOH . 
W 5 HOH A 8 415 24 HOH HOH . 
W 5 HOH A 9 416 25 HOH HOH . 
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