data_3CYL
#
_model_server_result.job_id            pEqAkp01WsUx4Rry497ygg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 21:55:00' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          3cyl 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":306}' 
#
_entry.id    3CYL 
#
_exptl.entry_id    3CYL 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              430.706 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'VITAMIN E' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            3CYL 
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_cell.length_c            44.259 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3CYL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 I N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 26 A CYS 27 1_555 A SG CYS 115 A CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 28 A CYS 29 1_555 A SG CYS 44 A CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 43 A CYS 44 1_555 A SG CYS 95 A CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 49 A CYS 50 1_555 A SG CYS 121 A CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 50 A CYS 51 1_555 A SG CYS 88 A CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 57 A CYS 61 1_555 A SG CYS 81 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 75 A CYS 84 1_555 A SG CYS 86 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 26 B CYS 27 1_555 B SG CYS 115 B CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf9 B SG CYS 28 B CYS 29 1_555 B SG CYS 44 B CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf10 B SG CYS 43 B CYS 44 1_555 B SG CYS 95 B CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? 
disulf ? disulf11 B SG CYS 49 B CYS 50 1_555 B SG CYS 121 B CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf12 B SG CYS 50 B CYS 51 1_555 B SG CYS 88 B CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
disulf ? disulf13 B SG CYS 57 B CYS 61 1_555 B SG CYS 81 B CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
disulf ? disulf14 B SG CYS 75 B CYS 84 1_555 B SG CYS 86 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
#
_chem_comp.formula           'C29 H50 O2' 
_chem_comp.formula_weight    430.706 
_chem_comp.id                VIT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'VITAMIN E' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     2,5,7,8-TETRAMETHYL-2-(4,8,12-TRIMETHYLTRIDECYL)-6-CHROMANOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C23 VIT sing 437 n n 
C1 HC11 VIT sing 438 n n 
C1 HC12 VIT sing 439 n n 
C1 HC13 VIT sing 440 n n 
C2 C3 VIT doub 441 n y 
C2 C7 VIT sing 442 n y 
C2 C8 VIT sing 443 n n 
C3 C4 VIT sing 444 n y 
C3 C10 VIT sing 445 n n 
C4 C5 VIT doub 446 n y 
C4 O1 VIT sing 447 n n 
C5 C6 VIT sing 448 n y 
C5 C12 VIT sing 449 n n 
C6 C7 VIT doub 450 n y 
C6 C13 VIT sing 451 n n 
C7 O2 VIT sing 452 n n 
C8 HC81 VIT sing 453 n n 
C8 HC82 VIT sing 454 n n 
C8 HC83 VIT sing 455 n n 
O1 C9 VIT sing 456 n n 
C9 C11 VIT sing 457 n n 
C9 C14 VIT sing 458 n n 
C9 C15 VIT sing 459 n n 
C10 C11 VIT sing 460 n n 
C10 H101 VIT sing 461 n n 
C10 H102 VIT sing 462 n n 
C11 H111 VIT sing 463 n n 
C11 H112 VIT sing 464 n n 
C12 H121 VIT sing 465 n n 
C12 H122 VIT sing 466 n n 
C12 H123 VIT sing 467 n n 
C13 H131 VIT sing 468 n n 
C13 H132 VIT sing 469 n n 
C13 H133 VIT sing 470 n n 
O2 HO21 VIT sing 471 n n 
C14 H141 VIT sing 472 n n 
C14 H142 VIT sing 473 n n 
C14 H143 VIT sing 474 n n 
C15 C16 VIT sing 475 n n 
C15 H151 VIT sing 476 n n 
C15 H152 VIT sing 477 n n 
C16 C17 VIT sing 478 n n 
C16 H161 VIT sing 479 n n 
C16 H162 VIT sing 480 n n 
C17 C18 VIT sing 481 n n 
C17 H171 VIT sing 482 n n 
C17 H172 VIT sing 483 n n 
C18 C19 VIT sing 484 n n 
C18 C20 VIT sing 485 n n 
C18 H18 VIT sing 486 n n 
C19 H191 VIT sing 487 n n 
C19 H192 VIT sing 488 n n 
C19 H193 VIT sing 489 n n 
C20 C21 VIT sing 490 n n 
C20 H201 VIT sing 491 n n 
C20 H202 VIT sing 492 n n 
C21 C22 VIT sing 493 n n 
C21 H211 VIT sing 494 n n 
C21 H212 VIT sing 495 n n 
C22 C23 VIT sing 496 n n 
C22 H221 VIT sing 497 n n 
C22 H222 VIT sing 498 n n 
C23 C24 VIT sing 499 n n 
C23 H23 VIT sing 500 n n 
C24 C25 VIT sing 501 n n 
C24 H241 VIT sing 502 n n 
C24 H242 VIT sing 503 n n 
C25 C26 VIT sing 504 n n 
C25 H251 VIT sing 505 n n 
C25 H252 VIT sing 506 n n 
C26 C27 VIT sing 507 n n 
C26 H261 VIT sing 508 n n 
C26 H262 VIT sing 509 n n 
C27 C28 VIT sing 510 n n 
C27 C29 VIT sing 511 n n 
C27 H27 VIT sing 512 n n 
C28 H281 VIT sing 513 n n 
C28 H282 VIT sing 514 n n 
C28 H283 VIT sing 515 n n 
C29 H291 VIT sing 516 n n 
C29 H292 VIT sing 517 n n 
C29 H293 VIT sing 518 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3CYL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.025692 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.005607 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.014012 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.023126 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 SO4 A 1 301 301 SO4 SO4 . 
D 2 SO4 A 1 303 303 SO4 SO4 . 
E 2 SO4 A 1 305 305 SO4 SO4 . 
F 3 VIT A 1 306 1 VIT VIT . 
G 2 SO4 B 1 308 308 SO4 SO4 . 
H 2 SO4 B 1 309 309 SO4 SO4 . 
I 3 VIT B 1 310 1 VIT VIT . 
J 4 PE4 B 1 311 1 PE4 PE4 . 
K 5 HOH A 1 307 1 HOH WAT . 
K 5 HOH A 2 308 2 HOH WAT . 
K 5 HOH A 3 309 7 HOH WAT . 
K 5 HOH A 4 310 8 HOH WAT . 
K 5 HOH A 5 311 9 HOH WAT . 
K 5 HOH A 6 312 13 HOH WAT . 
K 5 HOH A 7 313 14 HOH WAT . 
K 5 HOH A 8 314 15 HOH WAT . 
K 5 HOH A 9 315 16 HOH WAT . 
K 5 HOH A 10 316 17 HOH WAT . 
K 5 HOH A 11 317 20 HOH WAT . 
K 5 HOH A 12 318 21 HOH WAT . 
K 5 HOH A 13 319 23 HOH WAT . 
K 5 HOH A 14 320 24 HOH WAT . 
K 5 HOH A 15 321 25 HOH WAT . 
K 5 HOH A 16 322 28 HOH WAT . 
K 5 HOH A 17 323 29 HOH WAT . 
K 5 HOH A 18 324 32 HOH WAT . 
K 5 HOH A 19 325 33 HOH WAT . 
K 5 HOH A 20 326 34 HOH WAT . 
K 5 HOH A 21 327 35 HOH WAT . 
K 5 HOH A 22 328 36 HOH WAT . 
K 5 HOH A 23 329 38 HOH WAT . 
K 5 HOH A 24 330 40 HOH WAT . 
K 5 HOH A 25 331 42 HOH WAT . 
K 5 HOH A 26 332 43 HOH WAT . 
K 5 HOH A 27 333 44 HOH WAT . 
K 5 HOH A 28 334 46 HOH WAT . 
K 5 HOH A 29 335 49 HOH WAT . 
K 5 HOH A 30 336 51 HOH WAT . 
K 5 HOH A 31 337 52 HOH WAT . 
K 5 HOH A 32 338 53 HOH WAT . 
K 5 HOH A 33 339 56 HOH WAT . 
K 5 HOH A 34 340 57 HOH WAT . 
K 5 HOH A 35 341 58 HOH WAT . 
K 5 HOH A 36 342 59 HOH WAT . 
K 5 HOH A 37 343 61 HOH WAT . 
K 5 HOH A 38 344 64 HOH WAT . 
K 5 HOH A 39 345 65 HOH WAT . 
K 5 HOH A 40 346 66 HOH WAT . 
K 5 HOH A 41 347 67 HOH WAT . 
K 5 HOH A 42 348 70 HOH WAT . 
K 5 HOH A 43 349 72 HOH WAT . 
K 5 HOH A 44 350 75 HOH WAT . 
K 5 HOH A 45 351 77 HOH WAT . 
K 5 HOH A 46 352 78 HOH WAT . 
K 5 HOH A 47 353 79 HOH WAT . 
K 5 HOH A 48 354 82 HOH WAT . 
K 5 HOH A 49 355 84 HOH WAT . 
K 5 HOH A 50 356 86 HOH WAT . 
K 5 HOH A 51 357 90 HOH WAT . 
K 5 HOH A 52 358 91 HOH WAT . 
K 5 HOH A 53 359 93 HOH WAT . 
K 5 HOH A 54 360 94 HOH WAT . 
K 5 HOH A 55 361 96 HOH WAT . 
K 5 HOH A 56 362 101 HOH WAT . 
K 5 HOH A 57 363 104 HOH WAT . 
K 5 HOH A 58 364 107 HOH WAT . 
K 5 HOH A 59 365 110 HOH WAT . 
K 5 HOH A 60 366 111 HOH WAT . 
K 5 HOH A 61 367 113 HOH WAT . 
K 5 HOH A 62 368 114 HOH WAT . 
K 5 HOH A 63 369 115 HOH WAT . 
K 5 HOH A 64 370 116 HOH WAT . 
K 5 HOH A 65 371 118 HOH WAT . 
K 5 HOH A 66 372 120 HOH WAT . 
K 5 HOH A 67 373 123 HOH WAT . 
K 5 HOH A 68 374 125 HOH WAT . 
K 5 HOH A 69 375 128 HOH WAT . 
K 5 HOH A 70 376 129 HOH WAT . 
K 5 HOH A 71 377 130 HOH WAT . 
K 5 HOH A 72 378 132 HOH WAT . 
K 5 HOH A 73 379 133 HOH WAT . 
K 5 HOH A 74 380 134 HOH WAT . 
K 5 HOH A 75 381 136 HOH WAT . 
K 5 HOH A 76 382 138 HOH WAT . 
K 5 HOH A 77 383 139 HOH WAT . 
K 5 HOH A 78 384 140 HOH WAT . 
K 5 HOH A 79 385 141 HOH WAT . 
K 5 HOH A 80 386 144 HOH WAT . 
K 5 HOH A 81 387 150 HOH WAT . 
K 5 HOH A 82 388 153 HOH WAT . 
K 5 HOH A 83 389 154 HOH WAT . 
K 5 HOH A 84 390 155 HOH WAT . 
K 5 HOH A 85 391 157 HOH WAT . 
K 5 HOH A 86 392 159 HOH WAT . 
K 5 HOH A 87 393 160 HOH WAT . 
K 5 HOH A 88 394 161 HOH WAT . 
K 5 HOH A 89 395 163 HOH WAT . 
K 5 HOH A 90 396 165 HOH WAT . 
K 5 HOH A 91 397 167 HOH WAT . 
K 5 HOH A 92 398 169 HOH WAT . 
K 5 HOH A 93 399 172 HOH WAT . 
K 5 HOH A 94 400 174 HOH WAT . 
K 5 HOH A 95 401 175 HOH WAT . 
K 5 HOH A 96 402 176 HOH WAT . 
K 5 HOH A 97 403 179 HOH WAT . 
K 5 HOH A 98 404 180 HOH WAT . 
K 5 HOH A 99 405 181 HOH WAT . 
K 5 HOH A 100 406 184 HOH WAT . 
K 5 HOH A 101 407 188 HOH WAT . 
K 5 HOH A 102 408 189 HOH WAT . 
K 5 HOH A 103 409 190 HOH WAT . 
K 5 HOH A 104 410 191 HOH WAT . 
K 5 HOH A 105 411 196 HOH WAT . 
K 5 HOH A 106 412 197 HOH WAT . 
K 5 HOH A 107 413 198 HOH WAT . 
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