data_3DDH
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_model_server_result.job_id            TKPFUDzijjLt1KfpRpMOsg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-29 09:14:49' 
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          3ddh 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":232}' 
#
_entry.id    3DDH 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            3DDH 
_cell.length_a            36.119 
_cell.length_b            104.222 
_cell.length_c            121.212 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3DDH 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 E N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C ALA 3 A ALA 0 1_555 A N MSE 4 A MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale2 A C MSE 4 A MSE 1 1_555 A N LYS 5 A LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale3 A C GLU 54 A GLU 51 1_555 A N MSE 55 A MSE 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale4 A C MSE 55 A MSE 52 1_555 A N ASN 56 A ASN 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale5 A C SER 71 A SER 68 1_555 A N MSE 72 A MSE 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale6 A C MSE 72 A MSE 69 1_555 A N VAL 73 A VAL 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale7 A C LYS 101 A LYS 98 1_555 A N MSE 102 A MSE 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale8 A C MSE 102 A MSE 99 1_555 A N PRO 103 A PRO 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale9 A C VAL 154 A VAL 151 1_555 A N MSE 155 A MSE 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.312 ? 
covale ? covale10 A C MSE 155 A MSE 152 1_555 A N SER 156 A SER 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale11 A C LEU 178 A LEU 175 1_555 A N MSE 179 A MSE 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale12 A C MSE 179 A MSE 176 1_555 A N VAL 180 A VAL 177 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale13 A C VAL 205 A VAL 202 1_555 A N MSE 206 A MSE 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale14 A C MSE 206 A MSE 203 1_555 A N TRP 207 A TRP 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale15 B C MSE 4 B MSE 1 1_555 B N LYS 5 B LYS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale16 B C GLU 54 B GLU 51 1_555 B N MSE 55 B MSE 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale17 B C MSE 55 B MSE 52 1_555 B N ASN 56 B ASN 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale18 B C SER 71 B SER 68 1_555 B N MSE 72 B MSE 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale19 B C MSE 72 B MSE 69 1_555 B N VAL 73 B VAL 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale20 B C LYS 101 B LYS 98 1_555 B N MSE 102 B MSE 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale21 B C MSE 102 B MSE 99 1_555 B N PRO 103 B PRO 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale22 B C VAL 154 B VAL 151 1_555 B N MSE 155 B MSE 152 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale23 B C MSE 155 B MSE 152 1_555 B N SER 156 B SER 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale24 B C LEU 178 B LEU 175 1_555 B N MSE 179 B MSE 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale25 B C MSE 179 B MSE 176 1_555 B N VAL 180 B VAL 177 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 14 A ASP 11 1_555 C MG MG . A MG 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? 
metalc ? metalc2 A O ASP 16 A ASP 13 1_555 C MG MG . A MG 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 132 A ASP 129 1_555 E MG MG . A MG 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 132 A ASP 129 1_555 E MG MG . A MG 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.85 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASN 182 A ASN 179 1_555 C MG MG . A MG 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? 
metalc ? metalc6 C MG MG . A MG 232 1_555 K O HOH . A HOH 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.132 ? 
metalc ? metalc7 C MG MG . A MG 232 1_555 K O HOH . A HOH 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? 
metalc ? metalc8 C MG MG . A MG 232 1_555 K O HOH . A HOH 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc9 K O HOH . A HOH 354 1_555 H MG MG . B MG 233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? 
metalc ? metalc10 B OD2 ASP 14 B ASP 11 1_555 G MG MG . B MG 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? 
metalc ? metalc11 B O ASP 16 B ASP 13 1_555 G MG MG . B MG 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? 
metalc ? metalc12 B OD1 ASN 182 B ASN 179 1_555 G MG MG . B MG 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
metalc ? metalc13 G MG MG . B MG 232 1_555 L O HOH . B HOH 444 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc14 G MG MG . B MG 232 1_555 L O HOH . B HOH 449 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? 
metalc ? metalc15 G MG MG . B MG 232 1_555 L O HOH . B HOH 452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? 
metalc ? metalc16 H MG MG . B MG 233 1_555 L O HOH . B HOH 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? 
metalc ? metalc17 H MG MG . B MG 233 1_555 L O HOH . B HOH 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc18 H MG MG . B MG 233 1_555 L O HOH . B HOH 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc19 H MG MG . B MG 233 1_555 L O HOH . B HOH 490 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3DDH 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.027686 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009595 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00825 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 MG A 1 232 1 MG MG . 
D 3 CL A 1 233 1 CL CL . 
E 2 MG A 1 234 1 MG MG . 
F 4 GOL A 1 235 1 GOL GOL . 
G 2 MG B 1 232 1 MG MG . 
H 2 MG B 1 233 1 MG MG . 
I 3 CL B 1 234 1 CL CL . 
J 4 GOL B 1 235 1 GOL GOL . 
K 5 HOH A 1 236 5 HOH HOH . 
K 5 HOH A 2 237 7 HOH HOH . 
K 5 HOH A 3 238 9 HOH HOH . 
K 5 HOH A 4 239 10 HOH HOH . 
K 5 HOH A 5 240 12 HOH HOH . 
K 5 HOH A 6 241 13 HOH HOH . 
K 5 HOH A 7 242 17 HOH HOH . 
K 5 HOH A 8 243 18 HOH HOH . 
K 5 HOH A 9 244 20 HOH HOH . 
K 5 HOH A 10 245 25 HOH HOH . 
K 5 HOH A 11 246 28 HOH HOH . 
K 5 HOH A 12 247 32 HOH HOH . 
K 5 HOH A 13 248 33 HOH HOH . 
K 5 HOH A 14 249 34 HOH HOH . 
K 5 HOH A 15 250 37 HOH HOH . 
K 5 HOH A 16 251 39 HOH HOH . 
K 5 HOH A 17 252 40 HOH HOH . 
K 5 HOH A 18 253 46 HOH HOH . 
K 5 HOH A 19 254 47 HOH HOH . 
K 5 HOH A 20 255 51 HOH HOH . 
K 5 HOH A 21 256 52 HOH HOH . 
K 5 HOH A 22 257 53 HOH HOH . 
K 5 HOH A 23 258 58 HOH HOH . 
K 5 HOH A 24 259 59 HOH HOH . 
K 5 HOH A 25 260 61 HOH HOH . 
K 5 HOH A 26 261 62 HOH HOH . 
K 5 HOH A 27 262 63 HOH HOH . 
K 5 HOH A 28 263 64 HOH HOH . 
K 5 HOH A 29 264 65 HOH HOH . 
K 5 HOH A 30 265 66 HOH HOH . 
K 5 HOH A 31 266 69 HOH HOH . 
K 5 HOH A 32 267 70 HOH HOH . 
K 5 HOH A 33 268 73 HOH HOH . 
K 5 HOH A 34 269 74 HOH HOH . 
K 5 HOH A 35 270 75 HOH HOH . 
K 5 HOH A 36 271 76 HOH HOH . 
K 5 HOH A 37 272 82 HOH HOH . 
K 5 HOH A 38 273 87 HOH HOH . 
K 5 HOH A 39 274 90 HOH HOH . 
K 5 HOH A 40 275 91 HOH HOH . 
K 5 HOH A 41 276 92 HOH HOH . 
K 5 HOH A 42 277 95 HOH HOH . 
K 5 HOH A 43 278 96 HOH HOH . 
K 5 HOH A 44 279 98 HOH HOH . 
K 5 HOH A 45 280 99 HOH HOH . 
K 5 HOH A 46 281 101 HOH HOH . 
K 5 HOH A 47 282 102 HOH HOH . 
K 5 HOH A 48 283 103 HOH HOH . 
K 5 HOH A 49 284 104 HOH HOH . 
K 5 HOH A 50 285 105 HOH HOH . 
K 5 HOH A 51 286 107 HOH HOH . 
K 5 HOH A 52 287 113 HOH HOH . 
K 5 HOH A 53 288 116 HOH HOH . 
K 5 HOH A 54 289 121 HOH HOH . 
K 5 HOH A 55 290 123 HOH HOH . 
K 5 HOH A 56 291 127 HOH HOH . 
K 5 HOH A 57 292 128 HOH HOH . 
K 5 HOH A 58 293 129 HOH HOH . 
K 5 HOH A 59 294 130 HOH HOH . 
K 5 HOH A 60 295 131 HOH HOH . 
K 5 HOH A 61 296 137 HOH HOH . 
K 5 HOH A 62 297 138 HOH HOH . 
K 5 HOH A 63 298 139 HOH HOH . 
K 5 HOH A 64 299 142 HOH HOH . 
K 5 HOH A 65 300 144 HOH HOH . 
K 5 HOH A 66 301 147 HOH HOH . 
K 5 HOH A 67 302 149 HOH HOH . 
K 5 HOH A 68 303 153 HOH HOH . 
K 5 HOH A 69 304 154 HOH HOH . 
K 5 HOH A 70 305 156 HOH HOH . 
K 5 HOH A 71 306 158 HOH HOH . 
K 5 HOH A 72 307 159 HOH HOH . 
K 5 HOH A 73 308 162 HOH HOH . 
K 5 HOH A 74 309 163 HOH HOH . 
K 5 HOH A 75 310 165 HOH HOH . 
K 5 HOH A 76 311 166 HOH HOH . 
K 5 HOH A 77 312 167 HOH HOH . 
K 5 HOH A 78 313 172 HOH HOH . 
K 5 HOH A 79 314 173 HOH HOH . 
K 5 HOH A 80 315 174 HOH HOH . 
K 5 HOH A 81 316 183 HOH HOH . 
K 5 HOH A 82 317 184 HOH HOH . 
K 5 HOH A 83 318 186 HOH HOH . 
K 5 HOH A 84 319 187 HOH HOH . 
K 5 HOH A 85 320 188 HOH HOH . 
K 5 HOH A 86 321 196 HOH HOH . 
K 5 HOH A 87 322 200 HOH HOH . 
K 5 HOH A 88 323 201 HOH HOH . 
K 5 HOH A 89 324 203 HOH HOH . 
K 5 HOH A 90 325 207 HOH HOH . 
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