data_3E22
#
_model_server_result.job_id            Nw9-PXpBabycC9EifQmmLQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 20:28:42' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3e22 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":800}' 
#
_entry.id    3E22 
#
_exptl.entry_id    3E22 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              701.979 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            SOBLIDOTIN 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            3E22 
_cell.length_a            324.093 
_cell.length_b            324.093 
_cell.length_c            53.28 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3E22 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        170 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 65' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    pentameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      5 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      8 
_struct_asym.id                             J 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C39 H67 N5 O6' 
_chem_comp.formula_weight    701.979 
_chem_comp.id                TZT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              SOBLIDOTIN 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     TZT-1027 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C6 C5 TZT sing 507 n n 
C5 C7 TZT sing 508 n n 
C5 C4 TZT sing 509 n n 
C4 N2 TZT sing 510 n n 
C4 C8 TZT sing 511 n n 
N2 C3 TZT sing 512 n n 
N2 C1 TZT sing 513 n n 
C8 O9 TZT doub 514 n n 
C8 N10 TZT sing 515 n n 
N10 C11 TZT sing 516 n n 
C11 C12 TZT sing 517 n n 
C11 C15 TZT sing 518 n n 
C12 C14 TZT sing 519 n n 
C12 C13 TZT sing 520 n n 
C15 O16 TZT doub 521 n n 
C15 N17 TZT sing 522 n n 
N17 C78 TZT sing 523 n n 
N17 C18 TZT sing 524 n n 
C18 C19 TZT sing 525 n n 
C18 C23 TZT sing 526 n n 
C19 C22 TZT sing 527 n n 
C19 C20 TZT sing 528 n n 
C20 C21 TZT sing 529 n n 
C23 O24 TZT sing 530 n n 
C23 C26 TZT sing 531 n n 
O24 C25 TZT sing 532 n n 
C26 C27 TZT sing 533 n n 
C27 O28 TZT doub 534 n n 
C27 N29 TZT sing 535 n n 
N29 C30 TZT sing 536 n n 
N29 C33 TZT sing 537 n n 
C30 C31 TZT sing 538 n n 
C31 C32 TZT sing 539 n n 
C32 C33 TZT sing 540 n n 
C33 C34 TZT sing 541 n n 
C34 O35 TZT sing 542 n n 
C34 C37 TZT sing 543 n n 
O35 C36 TZT sing 544 n n 
C37 C38 TZT sing 545 n n 
C37 C39 TZT sing 546 n n 
C39 O40 TZT doub 547 n n 
C39 N41 TZT sing 548 n n 
N41 C42 TZT sing 549 n n 
C42 C43 TZT sing 550 n n 
C43 C44 TZT sing 551 n n 
C44 C45 TZT doub 552 n y 
C44 C49 TZT sing 553 n y 
C45 C46 TZT sing 554 n y 
C46 C47 TZT doub 555 n y 
C47 C48 TZT sing 556 n y 
C48 C49 TZT doub 557 n y 
C6 H6 TZT sing 558 n n 
C6 H6A TZT sing 559 n n 
C6 H6B TZT sing 560 n n 
C5 H5 TZT sing 561 n n 
C7 H7 TZT sing 562 n n 
C7 H7A TZT sing 563 n n 
C7 H7B TZT sing 564 n n 
C4 H4 TZT sing 565 n n 
C3 H3 TZT sing 566 n n 
C3 H3A TZT sing 567 n n 
C3 H3B TZT sing 568 n n 
C1 H1 TZT sing 569 n n 
C1 H1A TZT sing 570 n n 
C1 H1B TZT sing 571 n n 
N10 HN10 TZT sing 572 n n 
C11 H11 TZT sing 573 n n 
C12 H12 TZT sing 574 n n 
C14 H14 TZT sing 575 n n 
C14 H14A TZT sing 576 n n 
C14 H14B TZT sing 577 n n 
C13 H13 TZT sing 578 n n 
C13 H13A TZT sing 579 n n 
C13 H13B TZT sing 580 n n 
C78 H78 TZT sing 581 n n 
C78 H78A TZT sing 582 n n 
C78 H78B TZT sing 583 n n 
C18 H18 TZT sing 584 n n 
C19 H19 TZT sing 585 n n 
C22 H22 TZT sing 586 n n 
C22 H22A TZT sing 587 n n 
C22 H22B TZT sing 588 n n 
C20 H20 TZT sing 589 n n 
C20 H20A TZT sing 590 n n 
C21 H21 TZT sing 591 n n 
C21 H21A TZT sing 592 n n 
C21 H21B TZT sing 593 n n 
C23 H23 TZT sing 594 n n 
C25 H25 TZT sing 595 n n 
C25 H25A TZT sing 596 n n 
C25 H25B TZT sing 597 n n 
C26 H26 TZT sing 598 n n 
C26 H26A TZT sing 599 n n 
C30 H30 TZT sing 600 n n 
C30 H30A TZT sing 601 n n 
C31 H31 TZT sing 602 n n 
C31 H31A TZT sing 603 n n 
C32 H32 TZT sing 604 n n 
C32 H32A TZT sing 605 n n 
C33 H33 TZT sing 606 n n 
C34 H34 TZT sing 607 n n 
C36 H36 TZT sing 608 n n 
C36 H36A TZT sing 609 n n 
C36 H36B TZT sing 610 n n 
C37 H37 TZT sing 611 n n 
C38 H38 TZT sing 612 n n 
C38 H38A TZT sing 613 n n 
C38 H38B TZT sing 614 n n 
N41 HN41 TZT sing 615 n n 
C42 H42 TZT sing 616 n n 
C42 H42A TZT sing 617 n n 
C43 H43 TZT sing 618 n n 
C43 H43A TZT sing 619 n n 
C45 H45 TZT sing 620 n n 
C46 H46 TZT sing 621 n n 
C47 H47 TZT sing 622 n n 
C48 H48 TZT sing 623 n n 
C49 H49 TZT sing 624 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3E22 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.003086 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.001781 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.003563 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.018769 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
F 4 GTP A 1 600 600 GTP GTP . 
G 5 MG A 1 601 601 MG MG . 
H 6 GDP B 1 600 600 GDP GDP . 
I 7 LOC B 1 700 700 LOC COL . 
J 8 TZT B 1 800 800 TZT TZT . 
K 4 GTP C 1 600 600 GTP GTP . 
L 5 MG C 1 601 601 MG MG . 
M 6 GDP D 1 600 600 GDP GDP . 
N 7 LOC D 1 700 700 LOC COL . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C6 TZT . . . J 8 216.701 40.54 22.732 1 94.07 ? C6 TZT 800 B 1 
HETATM 2 C C5 TZT . . . J 8 217.066 39.053 22.659 1 94.16 ? C5 TZT 800 B 1 
HETATM 3 C C7 TZT . . . J 8 216.372 38.455 21.43 1 94.04 ? C7 TZT 800 B 1 
HETATM 4 C C4 TZT . . . J 8 218.603 38.671 22.678 1 94.24 ? C4 TZT 800 B 1 
HETATM 5 N N2 TZT . . . J 8 219.002 37.685 23.683 1 94.35 ? N2 TZT 800 B 1 
HETATM 6 C C3 TZT . . . J 8 219.403 36.483 22.94 1 94.31 ? C3 TZT 800 B 1 
HETATM 7 C C1 TZT . . . J 8 217.957 37.495 24.694 1 94.79 ? C1 TZT 800 B 1 
HETATM 8 C C8 TZT . . . J 8 219.641 39.754 22.92 1 94.25 ? C8 TZT 800 B 1 
HETATM 9 O O9 TZT . . . J 8 220.751 39.555 22.444 1 94.16 ? O9 TZT 800 B 1 
HETATM 10 N N10 TZT . . . J 8 219.313 40.805 23.683 1 94.47 ? N10 TZT 800 B 1 
HETATM 11 C C11 TZT . . . J 8 220.224 41.932 23.956 1 94.19 ? C11 TZT 800 B 1 
HETATM 12 C C12 TZT . . . J 8 220.594 42.606 22.605 1 95.32 ? C12 TZT 800 B 1 
HETATM 13 C C14 TZT . . . J 8 219.374 43.117 21.789 1 96.01 ? C14 TZT 800 B 1 
HETATM 14 C C13 TZT . . . J 8 221.496 41.77 21.694 1 95.69 ? C13 TZT 800 B 1 
HETATM 15 C C15 TZT . . . J 8 219.475 43.051 24.662 1 93.2 ? C15 TZT 800 B 1 
HETATM 16 O O16 TZT . . . J 8 218.256 43.14 24.515 1 92.79 ? O16 TZT 800 B 1 
HETATM 17 N N17 TZT . . . J 8 220.175 43.935 25.376 1 92.64 ? N17 TZT 800 B 1 
HETATM 18 C C78 TZT . . . J 8 221.628 43.735 25.453 1 92.34 ? C78 TZT 800 B 1 
HETATM 19 C C18 TZT . . . J 8 219.432 45.057 26.014 1 93.31 ? C18 TZT 800 B 1 
HETATM 20 C C19 TZT . . . J 8 218.002 44.587 26.385 1 92.52 ? C19 TZT 800 B 1 
HETATM 21 C C22 TZT . . . J 8 217.05 45.67 26.827 1 92.31 ? C22 TZT 800 B 1 
HETATM 22 C C20 TZT . . . J 8 217.99 43.432 27.344 1 92.88 ? C20 TZT 800 B 1 
HETATM 23 C C21 TZT . . . J 8 216.927 42.474 26.856 1 92.9 ? C21 TZT 800 B 1 
HETATM 24 C C23 TZT . . . J 8 220.257 45.976 27.023 1 94.36 ? C23 TZT 800 B 1 
HETATM 25 O O24 TZT . . . J 8 219.512 47.217 27.136 1 95.22 ? O24 TZT 800 B 1 
HETATM 26 C C25 TZT . . . J 8 219.969 47.949 25.986 1 96.03 ? C25 TZT 800 B 1 
HETATM 27 C C26 TZT . . . J 8 220.828 45.708 28.449 1 93.65 ? C26 TZT 800 B 1 
HETATM 28 C C27 TZT . . . J 8 221.002 46.942 29.404 1 93.5 ? C27 TZT 800 B 1 
HETATM 29 O O28 TZT . . . J 8 220.634 46.709 30.539 1 94.1 ? O28 TZT 800 B 1 
HETATM 30 N N29 TZT . . . J 8 221.482 48.227 29.191 1 93.32 ? N29 TZT 800 B 1 
HETATM 31 C C30 TZT . . . J 8 222.036 48.783 27.954 1 93.16 ? C30 TZT 800 B 1 
HETATM 32 C C31 TZT . . . J 8 223.272 49.543 28.422 1 93.35 ? C31 TZT 800 B 1 
HETATM 33 C C32 TZT . . . J 8 223.005 49.903 29.887 1 93.58 ? C32 TZT 800 B 1 
HETATM 34 C C33 TZT . . . J 8 221.628 49.313 30.239 1 93.7 ? C33 TZT 800 B 1 
HETATM 35 C C34 TZT . . . J 8 220.481 50.43 30.435 1 94.31 ? C34 TZT 800 B 1 
HETATM 36 O O35 TZT . . . J 8 220.542 51.63 29.53 1 93.74 ? O35 TZT 800 B 1 
HETATM 37 C C36 TZT . . . J 8 219.684 52.781 29.861 1 92.42 ? C36 TZT 800 B 1 
HETATM 38 C C37 TZT . . . J 8 220.285 51.08 31.875 1 94.66 ? C37 TZT 800 B 1 
HETATM 39 C C38 TZT . . . J 8 221.619 51.485 32.552 1 95.62 ? C38 TZT 800 B 1 
HETATM 40 C C39 TZT . . . J 8 219.42 50.293 32.905 1 94.22 ? C39 TZT 800 B 1 
HETATM 41 O O40 TZT . . . J 8 218.3 50.704 33.193 1 93.09 ? O40 TZT 800 B 1 
HETATM 42 N N41 TZT . . . J 8 220.026 49.215 33.44 1 94.84 ? N41 TZT 800 B 1 
HETATM 43 C C42 TZT . . . J 8 219.526 48.239 34.45 1 96.27 ? C42 TZT 800 B 1 
HETATM 44 C C43 TZT . . . J 8 220.414 48.22 35.768 1 99.64 ? C43 TZT 800 B 1 
HETATM 45 C C44 TZT . . . J 8 221.735 47.293 35.98 1 102.01 ? C44 TZT 800 B 1 
HETATM 46 C C45 TZT . . . J 8 221.725 45.862 35.974 1 102.39 ? C45 TZT 800 B 1 
HETATM 47 C C46 TZT . . . J 8 222.916 45.101 36.177 1 102.08 ? C46 TZT 800 B 1 
HETATM 48 C C47 TZT . . . J 8 224.16 45.728 36.411 1 101.64 ? C47 TZT 800 B 1 
HETATM 49 C C48 TZT . . . J 8 224.207 47.135 36.439 1 101.81 ? C48 TZT 800 B 1 
HETATM 50 C C49 TZT . . . J 8 223.016 47.89 36.235 1 102.42 ? C49 TZT 800 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              14 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    36 
_model_server_stats.query_time_ms           305 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           50 
#