data_3E3R
#
_model_server_result.job_id            T5q2AgmwOWe_EOVSUTKBpA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-02-05 14:56:22' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3e3r 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":196}' 
#
_entry.id    3E3R 
#
_exptl.entry_id    3E3R 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3E3R 
_cell.length_a            70.593 
_cell.length_b            130.411 
_cell.length_c            46.199 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3E3R 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        18 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? dimeric 2 author_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 1 1 
B,H,I,J,K,M 2 1 
A,C,D,E,F,G,L 2 2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 4_554 x+1/2,-y+1/2,-z-1 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 35.2965 65.2055 -46.199 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 47 A ASP 34 1_555 F CA CA . A CA 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 49 A ASP 36 1_555 F CA CA . A CA 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc3 A OG SER 51 A SER 38 1_555 F CA CA . A CA 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
metalc ? metalc4 A O SER 53 A SER 40 1_555 F CA CA . A CA 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? 
metalc ? metalc5 A OE1 GLU 58 A GLU 45 1_555 F CA CA . A CA 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc6 A OE2 GLU 58 A GLU 45 1_555 F CA CA . A CA 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.972 ? 
metalc ? metalc7 A OD1 ASP 83 A ASP 70 1_555 C CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASN 85 A ASN 72 1_555 C CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc9 A OG SER 87 A SER 74 1_555 C CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
metalc ? metalc10 A O THR 89 A THR 76 1_555 C CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc11 A OE1 GLU 94 A GLU 81 1_555 C CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc12 A OE2 GLU 94 A GLU 81 1_555 C CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? 
metalc ? metalc13 A OD1 ASP 119 A ASP 106 1_555 G CA CA . A CA 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc14 A OG SER 121 A SER 108 1_555 G CA CA . A CA 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 123 A ASP 110 1_555 G CA CA . A CA 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
metalc ? metalc16 A O VAL 125 A VAL 112 1_555 G CA CA . A CA 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc17 A OD1 ASP 130 A ASP 117 1_555 G CA CA . A CA 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.888 ? 
metalc ? metalc18 A OD2 ASP 130 A ASP 117 1_555 G CA CA . A CA 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? 
metalc ? metalc19 A OD2 ASP 162 A ASP 149 1_555 D CA CA . A CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc20 A OD1 ASP 167 A ASP 154 1_555 D CA CA . A CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc21 A O GLN 169 A GLN 156 1_555 D CA CA . A CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc22 A OE1 GLU 174 A GLU 161 1_555 D CA CA . A CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? 
metalc ? metalc23 A OE2 GLU 174 A GLU 161 1_555 D CA CA . A CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
metalc ? metalc24 G CA CA . A CA 196 1_555 L O HOH . A HOH 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? 
metalc ? metalc25 B OD2 ASP 47 B ASP 34 1_555 K CA CA . B CA 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc26 B OD1 ASP 49 B ASP 36 1_555 K CA CA . B CA 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc27 B OG SER 51 B SER 38 1_555 K CA CA . B CA 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? 
metalc ? metalc28 B O SER 53 B SER 40 1_555 K CA CA . B CA 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc29 B OE2 GLU 58 B GLU 45 1_555 K CA CA . B CA 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc30 B OD2 ASP 83 B ASP 70 1_555 H CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? 
metalc ? metalc31 B OD1 ASN 85 B ASN 72 1_555 H CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc32 B OG SER 87 B SER 74 1_555 H CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc33 B O THR 89 B THR 76 1_555 H CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc34 B OE1 GLU 94 B GLU 81 1_555 H CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? 
metalc ? metalc35 B OE2 GLU 94 B GLU 81 1_555 H CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? 
metalc ? metalc36 B OD1 ASP 119 B ASP 106 1_555 J CA CA . B CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc37 B OG SER 121 B SER 108 1_555 J CA CA . B CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.884 ? 
metalc ? metalc38 B OD1 ASP 123 B ASP 110 1_555 J CA CA . B CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc39 B O VAL 125 B VAL 112 1_555 J CA CA . B CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? 
metalc ? metalc40 B OD1 ASP 130 B ASP 117 1_555 J CA CA . B CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? 
metalc ? metalc41 B OD2 ASP 130 B ASP 117 1_555 J CA CA . B CA 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc42 B OD2 ASP 162 B ASP 149 1_555 I CA CA . B CA 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc43 B OD1 ASP 167 B ASP 154 1_555 I CA CA . B CA 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? 
metalc ? metalc44 B O GLN 169 B GLN 156 1_555 I CA CA . B CA 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? 
metalc ? metalc45 B OE1 GLU 174 B GLU 161 1_555 I CA CA . B CA 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? 
metalc ? metalc46 B OE2 GLU 174 B GLU 161 1_555 I CA CA . B CA 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3E3R 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014166 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007668 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.021645 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 192 192 CA CA . 
D 2 CA A 1 194 194 CA CA . 
E 2 CA A 1 195 195 CA CA . 
F 2 CA A 1 197 195 CA CA . 
G 2 CA A 1 196 196 CA CA . 
H 2 CA B 1 192 192 CA CA . 
I 2 CA B 1 193 193 CA CA . 
J 2 CA B 1 194 193 CA CA . 
K 2 CA B 1 195 194 CA CA . 
L 3 HOH A 1 198 1 HOH HOH . 
L 3 HOH A 2 199 3 HOH HOH . 
L 3 HOH A 3 200 9 HOH HOH . 
L 3 HOH A 4 201 11 HOH HOH . 
L 3 HOH A 5 202 13 HOH HOH . 
L 3 HOH A 6 203 16 HOH HOH . 
L 3 HOH A 7 204 17 HOH HOH . 
L 3 HOH A 8 205 19 HOH HOH . 
L 3 HOH A 9 206 21 HOH HOH . 
L 3 HOH A 10 207 23 HOH HOH . 
L 3 HOH A 11 208 24 HOH HOH . 
L 3 HOH A 12 209 29 HOH HOH . 
L 3 HOH A 13 210 30 HOH HOH . 
L 3 HOH A 14 211 31 HOH HOH . 
L 3 HOH A 15 212 35 HOH HOH . 
L 3 HOH A 16 213 36 HOH HOH . 
L 3 HOH A 17 214 37 HOH HOH . 
L 3 HOH A 18 215 38 HOH HOH . 
L 3 HOH A 19 216 44 HOH HOH . 
L 3 HOH A 20 217 49 HOH HOH . 
L 3 HOH A 21 218 50 HOH HOH . 
L 3 HOH A 22 219 53 HOH HOH . 
L 3 HOH A 23 220 56 HOH HOH . 
L 3 HOH A 24 221 57 HOH HOH . 
L 3 HOH A 25 222 58 HOH HOH . 
M 3 HOH B 1 196 2 HOH HOH . 
M 3 HOH B 2 197 5 HOH HOH . 
M 3 HOH B 3 198 7 HOH HOH . 
M 3 HOH B 4 199 10 HOH HOH . 
M 3 HOH B 5 200 12 HOH HOH . 
M 3 HOH B 6 201 14 HOH HOH . 
M 3 HOH B 7 202 18 HOH HOH . 
M 3 HOH B 8 203 22 HOH HOH . 
M 3 HOH B 9 204 25 HOH HOH . 
M 3 HOH B 10 205 26 HOH HOH . 
M 3 HOH B 11 206 27 HOH HOH . 
M 3 HOH B 12 207 28 HOH HOH . 
M 3 HOH B 13 208 32 HOH HOH . 
M 3 HOH B 14 209 33 HOH HOH . 
M 3 HOH B 15 210 34 HOH HOH . 
M 3 HOH B 16 211 39 HOH HOH . 
M 3 HOH B 17 212 41 HOH HOH . 
M 3 HOH B 18 213 43 HOH HOH . 
M 3 HOH B 19 214 45 HOH HOH . 
M 3 HOH B 20 215 46 HOH HOH . 
M 3 HOH B 21 216 51 HOH HOH . 
M 3 HOH B 22 217 52 HOH HOH . 
M 3 HOH B 23 218 54 HOH HOH . 
M 3 HOH B 24 219 55 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         G 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               65.211 
_atom_site.Cartn_y               30.54 
_atom_site.Cartn_z               7.74 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        37.78 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           196 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    8 
_model_server_stats.query_time_ms           267 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#