data_3F0Z # _model_server_result.job_id nYL-vRI91wZzWNZ_F1mRjA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-15 11:21:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3f0z # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":293}' # _entry.id 3F0Z # _exptl.entry_id 3F0Z _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3F0Z _cell.length_a 61.35 _cell.length_b 61.35 _cell.length_c 158.9 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3F0Z _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C MSE 1 A MSE 1 1_555 A N ASP 2 A ASP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale2 A C ASP 4 A ASP 4 1_555 A N MSE 5 A MSE 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale3 A C MSE 5 A MSE 5 1_555 A N ILE 6 A ILE 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale4 A C PRO 131 A PRO 131 1_555 A N MSE 132 A MSE 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale5 A C MSE 132 A MSE 132 1_555 A N ILE 133 A ILE 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale6 A C PHE 216 A PHE 216 1_555 A N MSE 217 A MSE 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale7 A C MSE 217 A MSE 217 1_555 A N GLY 218 A GLY 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale8 A C ILE 227 A ILE 227 1_555 A N MSE 228 A MSE 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale9 A C MSE 228 A MSE 228 1_555 A N LEU 229 A LEU 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale10 A C SER 231 A SER 231 1_555 A N MSE 232 A MSE 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale11 A C MSE 232 A MSE 232 1_555 A N GLN 233 A GLN 233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale12 A C ALA 247 A ALA 247 1_555 A N MSE 248 A MSE 248 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale13 A C MSE 248 A MSE 248 1_555 A N MSE 249 A MSE 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale14 A C MSE 249 A MSE 249 1_555 A N SER 250 A SER 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 129 n n C1 C2 GOL sing 130 n n C1 H11 GOL sing 131 n n C1 H12 GOL sing 132 n n O1 HO1 GOL sing 133 n n C2 O2 GOL sing 134 n n C2 C3 GOL sing 135 n n C2 H2 GOL sing 136 n n O2 HO2 GOL sing 137 n n C3 O3 GOL sing 138 n n C3 H31 GOL sing 139 n n C3 H32 GOL sing 140 n n O3 HO3 GOL sing 141 n n # _atom_sites.entry_id 3F0Z _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.0163 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.0163 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006293 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 GOL A 1 293 1 GOL GOL . C 3 HOH A 1 294 1 HOH WAT . C 3 HOH A 2 295 2 HOH WAT . C 3 HOH A 3 296 3 HOH WAT . C 3 HOH A 4 297 4 HOH WAT . C 3 HOH A 5 298 5 HOH WAT . C 3 HOH A 6 299 6 HOH WAT . C 3 HOH A 7 300 7 HOH WAT . C 3 HOH A 8 301 8 HOH WAT . C 3 HOH A 9 302 9 HOH WAT . C 3 HOH A 10 303 10 HOH WAT . C 3 HOH A 11 304 11 HOH WAT . C 3 HOH A 12 305 12 HOH WAT . C 3 HOH A 13 306 13 HOH WAT . C 3 HOH A 14 307 14 HOH WAT . C 3 HOH A 15 308 15 HOH WAT . C 3 HOH A 16 309 16 HOH WAT . C 3 HOH A 17 310 17 HOH WAT . C 3 HOH A 18 311 18 HOH WAT . C 3 HOH A 19 312 19 HOH WAT . C 3 HOH A 20 313 20 HOH WAT . C 3 HOH A 21 314 21 HOH WAT . C 3 HOH A 22 315 22 HOH WAT . C 3 HOH A 23 316 23 HOH WAT . C 3 HOH A 24 317 24 HOH WAT . C 3 HOH A 25 318 25 HOH WAT . C 3 HOH A 26 319 26 HOH WAT . C 3 HOH A 27 320 27 HOH WAT . C 3 HOH A 28 321 28 HOH WAT . C 3 HOH A 29 322 29 HOH WAT . C 3 HOH A 30 323 30 HOH WAT . C 3 HOH A 31 324 31 HOH WAT . C 3 HOH A 32 325 32 HOH WAT . C 3 HOH A 33 326 33 HOH WAT . C 3 HOH A 34 327 34 HOH WAT . C 3 HOH A 35 328 35 HOH WAT . C 3 HOH A 36 329 36 HOH WAT . C 3 HOH A 37 330 37 HOH WAT . C 3 HOH A 38 331 38 HOH WAT . C 3 HOH A 39 332 39 HOH WAT . C 3 HOH A 40 333 40 HOH WAT . C 3 HOH A 41 334 41 HOH WAT . C 3 HOH A 42 335 42 HOH WAT . C 3 HOH A 43 336 43 HOH WAT . C 3 HOH A 44 337 44 HOH WAT . C 3 HOH A 45 338 45 HOH WAT . C 3 HOH A 46 339 46 HOH WAT . C 3 HOH A 47 340 47 HOH WAT . C 3 HOH A 48 341 48 HOH WAT . C 3 HOH A 49 342 49 HOH WAT . C 3 HOH A 50 343 50 HOH WAT . C 3 HOH A 51 344 51 HOH WAT . C 3 HOH A 52 345 52 HOH WAT . C 3 HOH A 53 346 53 HOH WAT . C 3 HOH A 54 347 54 HOH WAT . C 3 HOH A 55 348 55 HOH WAT . C 3 HOH A 56 349 56 HOH WAT . C 3 HOH A 57 350 57 HOH WAT . C 3 HOH A 58 351 58 HOH WAT . C 3 HOH A 59 352 59 HOH WAT . C 3 HOH A 60 353 60 HOH WAT . C 3 HOH A 61 354 61 HOH WAT . C 3 HOH A 62 355 62 HOH WAT . C 3 HOH A 63 356 63 HOH WAT . C 3 HOH A 64 357 64 HOH WAT . C 3 HOH A 65 358 65 HOH WAT . C 3 HOH A 66 359 66 HOH WAT . C 3 HOH A 67 360 67 HOH WAT . C 3 HOH A 68 361 68 HOH WAT . C 3 HOH A 69 362 69 HOH WAT . C 3 HOH A 70 363 70 HOH WAT . C 3 HOH A 71 364 71 HOH WAT . C 3 HOH A 72 365 72 HOH WAT . C 3 HOH A 73 366 73 HOH WAT . C 3 HOH A 74 367 74 HOH WAT . C 3 HOH A 75 368 75 HOH WAT . C 3 HOH A 76 369 76 HOH WAT . C 3 HOH A 77 370 77 HOH WAT . C 3 HOH A 78 371 78 HOH WAT . C 3 HOH A 79 372 79 HOH WAT . C 3 HOH A 80 373 80 HOH WAT . C 3 HOH A 81 374 81 HOH WAT . C 3 HOH A 82 375 82 HOH WAT . C 3 HOH A 83 376 83 HOH WAT . C 3 HOH A 84 377 84 HOH WAT . C 3 HOH A 85 378 85 HOH WAT . C 3 HOH A 86 379 86 HOH WAT . C 3 HOH A 87 380 87 HOH WAT . C 3 HOH A 88 381 88 HOH WAT . C 3 HOH A 89 382 89 HOH WAT . C 3 HOH A 90 383 90 HOH WAT . C 3 HOH A 91 384 91 HOH WAT . C 3 HOH A 92 385 92 HOH WAT . C 3 HOH A 93 386 93 HOH WAT . C 3 HOH A 94 387 94 HOH WAT . C 3 HOH A 95 388 95 HOH WAT . C 3 HOH A 96 389 96 HOH WAT . C 3 HOH A 97 390 97 HOH WAT . C 3 HOH A 98 391 98 HOH WAT . C 3 HOH A 99 392 99 HOH WAT . C 3 HOH A 100 393 100 HOH WAT . C 3 HOH A 101 394 101 HOH WAT . C 3 HOH A 102 395 102 HOH WAT . C 3 HOH A 103 396 103 HOH WAT . C 3 HOH A 104 397 104 HOH WAT . C 3 HOH A 105 398 105 HOH WAT . C 3 HOH A 106 399 106 HOH WAT . C 3 HOH A 107 400 107 HOH WAT . C 3 HOH A 108 401 108 HOH WAT . C 3 HOH A 109 402 109 HOH WAT . C 3 HOH A 110 403 110 HOH WAT . C 3 HOH A 111 404 111 HOH WAT . C 3 HOH A 112 405 112 HOH WAT . C 3 HOH A 113 406 113 HOH WAT . C 3 HOH A 114 407 114 HOH WAT . C 3 HOH A 115 408 115 HOH WAT . C 3 HOH A 116 409 116 HOH WAT . C 3 HOH A 117 410 117 HOH WAT . C 3 HOH A 118 411 118 HOH WAT . C 3 HOH A 119 412 119 HOH WAT . C 3 HOH A 120 413 120 HOH WAT . C 3 HOH A 121 414 121 HOH WAT . C 3 HOH A 122 415 122 HOH WAT . C 3 HOH A 123 416 123 HOH WAT . C 3 HOH A 124 417 124 HOH WAT . C 3 HOH A 125 418 125 HOH WAT . C 3 HOH A 126 419 126 HOH WAT . C 3 HOH A 127 420 127 HOH WAT . C 3 HOH A 128 421 128 HOH WAT . C 3 HOH A 129 422 129 HOH WAT . C 3 HOH A 130 423 130 HOH WAT . C 3 HOH A 131 424 131 HOH WAT . C 3 HOH A 132 425 132 HOH WAT . C 3 HOH A 133 426 133 HOH WAT . C 3 HOH A 134 427 134 HOH WAT . C 3 HOH A 135 428 135 HOH WAT . C 3 HOH A 136 429 136 HOH WAT . C 3 HOH A 137 430 137 HOH WAT . C 3 HOH A 138 431 138 HOH WAT . C 3 HOH A 139 432 139 HOH WAT . C 3 HOH A 140 433 140 HOH WAT . C 3 HOH A 141 434 141 HOH WAT . C 3 HOH A 142 435 142 HOH WAT . C 3 HOH A 143 436 143 HOH WAT . C 3 HOH A 144 437 144 HOH WAT . C 3 HOH A 145 438 145 HOH WAT . C 3 HOH A 146 439 146 HOH WAT . C 3 HOH A 147 440 147 HOH WAT . C 3 HOH A 148 441 148 HOH WAT . C 3 HOH A 149 442 149 HOH WAT . C 3 HOH A 150 443 150 HOH WAT . C 3 HOH A 151 444 151 HOH WAT . C 3 HOH A 152 445 152 HOH WAT . C 3 HOH A 153 446 153 HOH WAT . C 3 HOH A 154 447 154 HOH WAT . C 3 HOH A 155 448 155 HOH WAT . C 3 HOH A 156 449 156 HOH WAT . C 3 HOH A 157 450 157 HOH WAT . C 3 HOH A 158 451 158 HOH WAT . C 3 HOH A 159 452 159 HOH WAT . C 3 HOH A 160 453 160 HOH WAT . C 3 HOH A 161 454 161 HOH WAT . C 3 HOH A 162 455 162 HOH WAT . C 3 HOH A 163 456 163 HOH WAT . C 3 HOH A 164 457 164 HOH WAT . C 3 HOH A 165 458 165 HOH WAT . C 3 HOH A 166 459 166 HOH WAT . C 3 HOH A 167 460 167 HOH WAT . C 3 HOH A 168 461 168 HOH WAT . C 3 HOH A 169 462 169 HOH WAT . C 3 HOH A 170 463 170 HOH WAT . C 3 HOH A 171 464 171 HOH WAT . C 3 HOH A 172 465 172 HOH WAT . C 3 HOH A 173 466 173 HOH WAT . C 3 HOH A 174 467 174 HOH WAT . C 3 HOH A 175 468 175 HOH WAT . C 3 HOH A 176 469 176 HOH WAT . C 3 HOH A 177 470 177 HOH WAT . C 3 HOH A 178 471 178 HOH WAT . C 3 HOH A 179 472 179 HOH WAT . C 3 HOH A 180 473 180 HOH WAT . C 3 HOH A 181 474 181 HOH WAT . C 3 HOH A 182 475 182 HOH WAT . C 3 HOH A 183 476 183 HOH WAT . C 3 HOH A 184 477 184 HOH WAT . C 3 HOH A 185 478 185 HOH WAT . C 3 HOH A 186 479 186 HOH WAT . C 3 HOH A 187 480 187 HOH WAT . C 3 HOH A 188 481 188 HOH WAT . C 3 HOH A 189 482 189 HOH WAT . C 3 HOH A 190 483 190 HOH WAT . C 3 HOH A 191 484 191 HOH WAT . C 3 HOH A 192 485 192 HOH WAT . C 3 HOH A 193 486 193 HOH WAT . C 3 HOH A 194 487 194 HOH WAT . C 3 HOH A 195 488 195 HOH WAT . C 3 HOH A 196 489 196 HOH WAT . C 3 HOH A 197 490 197 HOH WAT . C 3 HOH A 198 491 198 HOH WAT . C 3 HOH A 199 492 199 HOH WAT . C 3 HOH A 200 493 200 HOH WAT . C 3 HOH A 201 494 201 HOH WAT . C 3 HOH A 202 495 202 HOH WAT . C 3 HOH A 203 496 203 HOH WAT . C 3 HOH A 204 497 204 HOH WAT . C 3 HOH A 205 498 205 HOH WAT . C 3 HOH A 206 499 206 HOH WAT . C 3 HOH A 207 500 207 HOH WAT . C 3 HOH A 208 501 208 HOH WAT . C 3 HOH A 209 502 209 HOH WAT . C 3 HOH A 210 503 210 HOH WAT . C 3 HOH A 211 504 211 HOH WAT . C 3 HOH A 212 505 212 HOH WAT . C 3 HOH A 213 506 213 HOH WAT . C 3 HOH A 214 507 214 HOH WAT . C 3 HOH A 215 508 215 HOH WAT . C 3 HOH A 216 509 216 HOH WAT . C 3 HOH A 217 510 217 HOH WAT . C 3 HOH A 218 511 218 HOH WAT . C 3 HOH A 219 512 219 HOH WAT . C 3 HOH A 220 513 220 HOH WAT . C 3 HOH A 221 514 221 HOH WAT . C 3 HOH A 222 515 222 HOH WAT . C 3 HOH A 223 516 223 HOH WAT . C 3 HOH A 224 517 224 HOH WAT . C 3 HOH A 225 518 225 HOH WAT . C 3 HOH A 226 519 226 HOH WAT . C 3 HOH A 227 520 227 HOH WAT . C 3 HOH A 228 521 228 HOH WAT . C 3 HOH A 229 522 229 HOH WAT . C 3 HOH A 230 523 230 HOH WAT . C 3 HOH A 231 524 231 HOH WAT . C 3 HOH A 232 525 232 HOH WAT . C 3 HOH A 233 526 233 HOH WAT . C 3 HOH A 234 527 234 HOH WAT . C 3 HOH A 235 528 235 HOH WAT . C 3 HOH A 236 529 236 HOH WAT . C 3 HOH A 237 530 237 HOH WAT . C 3 HOH A 238 531 238 HOH WAT . C 3 HOH A 239 532 239 HOH WAT . C 3 HOH A 240 533 240 HOH WAT . C 3 HOH A 241 534 241 HOH WAT . C 3 HOH A 242 535 242 HOH WAT . C 3 HOH A 243 536 243 HOH WAT . C 3 HOH A 244 537 244 HOH WAT . C 3 HOH A 245 538 245 HOH WAT . C 3 HOH A 246 539 246 HOH WAT . C 3 HOH A 247 540 247 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . B 2 44.683 6.152 40.235 1 41.77 ? C1 GOL 293 A 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . B 2 45.29 7.431 40.443 1 40.61 ? O1 GOL 293 A 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . B 2 43.216 6.18 40.681 1 42.35 ? C2 GOL 293 A 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . B 2 42.504 7.177 39.938 1 41.46 ? O2 GOL 293 A 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . B 2 42.586 4.8 40.45 1 42.23 ? C3 GOL 293 A 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . B 2 41.219 4.807 40.862 1 43.22 ? O3 GOL 293 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 65 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 298 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 6 #