data_3G6Q # _model_server_result.job_id CQ7NUOyQFK8abz5EwAA8iw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 02:43:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3g6q # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":526}' # _entry.id 3G6Q # _exptl.entry_id 3G6Q _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 122.07 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3G6Q _cell.length_a 116.042 _cell.length_b 38.866 _cell.length_c 95.521 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3G6Q _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA octameric 8 software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 1 1,2 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 2 1 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 E N N ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 5 B CYS 440 1_555 E ZN ZN . B ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 8 B CYS 443 1_555 E ZN ZN . B ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 22 B CYS 457 1_555 E ZN ZN . B ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 25 B CYS 460 1_555 E ZN ZN . B ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 41 B CYS 476 1_555 F ZN ZN . B ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 47 B CYS 482 1_555 F ZN ZN . B ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 57 B CYS 492 1_555 F ZN ZN . B ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 60 B CYS 495 1_555 F ZN ZN . B ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc9 B SG CYS 5 A CYS 440 1_555 G ZN ZN . A ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc10 B SG CYS 8 A CYS 443 1_555 G ZN ZN . A ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc11 B SG CYS 22 A CYS 457 1_555 G ZN ZN . A ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc12 B SG CYS 25 A CYS 460 1_555 G ZN ZN . A ZN 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc13 B SG CYS 41 A CYS 476 1_555 H ZN ZN . A ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc ? metalc14 B SG CYS 47 A CYS 482 1_555 H ZN ZN . A ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.256 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 57 A CYS 492 1_555 H ZN ZN . A ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 60 A CYS 495 1_555 H ZN ZN . A ZN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N1 DG 3 C DG 3 1_555 D N3 DC 15 D DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N2 DG 3 C DG 3 1_555 D O2 DC 15 D DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C O6 DG 3 C DG 3 1_555 D N4 DC 15 D DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N1 DA 4 C DA 4 1_555 D N3 DT 14 D DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N6 DA 4 C DA 4 1_555 D O4 DT 14 D DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N1 DA 5 C DA 5 1_555 D N3 DT 13 D DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C N6 DA 5 C DA 5 1_555 D O4 DT 13 D DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N3 DC 6 C DC 6 1_555 D N1 DG 12 D DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N4 DC 6 C DC 6 1_555 D O6 DG 12 D DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C O2 DC 6 C DC 6 1_555 D N2 DG 12 D DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N1 DA 7 C DA 7 1_555 D N3 DT 11 D DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N6 DA 7 C DA 7 1_555 D O4 DT 11 D DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N1 DG 8 C DG 8 1_555 D N3 DC 10 D DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C N2 DG 8 C DG 8 1_555 D O2 DC 10 D DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C O6 DG 8 C DG 8 1_555 D N4 DC 10 D DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N1 DG 9 C DG 9 1_555 D N3 DC 9 D DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N2 DG 9 C DG 9 1_555 D O2 DC 9 D DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C O6 DG 9 C DG 9 1_555 D N4 DC 9 D DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N1 DG 10 C DG 10 1_555 D N3 DC 8 D DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C N2 DG 10 C DG 10 1_555 D O2 DC 8 D DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C O6 DG 10 C DG 10 1_555 D N4 DC 8 D DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C N3 DT 11 C DT 11 1_555 D N1 DA 7 D DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C O4 DT 11 C DT 11 1_555 D N6 DA 7 D DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N1 DG 12 C DG 12 1_555 D N3 DC 6 D DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N2 DG 12 C DG 12 1_555 D O2 DC 6 D DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C O6 DG 12 C DG 12 1_555 D N4 DC 6 D DC 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N3 DT 13 C DT 13 1_555 D N1 DA 5 D DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C O4 DT 13 C DT 13 1_555 D N6 DA 5 D DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N3 DT 14 C DT 14 1_555 D N1 DA 4 D DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C O4 DT 14 C DT 14 1_555 D N6 DA 4 D DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N3 DC 15 C DC 15 1_555 D N1 DG 3 D DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N4 DC 15 C DC 15 1_555 D O6 DG 3 D DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C O2 DC 15 C DC 15 1_555 D N2 DG 3 D DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N3 DT 16 C DT 16 1_555 D N1 DA 2 D DA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C O4 DT 16 C DT 16 1_555 D N6 DA 2 D DA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3G6Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008618 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.0054 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.025729 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012354 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 4 ZN B 1 526 526 ZN ZN . F 4 ZN B 1 527 527 ZN ZN . G 4 ZN A 1 526 517 ZN ZN . H 4 ZN A 1 527 518 ZN ZN . I 5 HOH B 1 2 2 HOH HOH . I 5 HOH B 2 8 8 HOH HOH . I 5 HOH B 3 9 9 HOH HOH . I 5 HOH B 4 12 12 HOH HOH . I 5 HOH B 5 14 14 HOH HOH . I 5 HOH B 6 18 18 HOH HOH . I 5 HOH B 7 22 22 HOH HOH . I 5 HOH B 8 23 23 HOH HOH . I 5 HOH B 9 27 27 HOH HOH . I 5 HOH B 10 29 29 HOH HOH . J 5 HOH A 1 1 1 HOH HOH . J 5 HOH A 2 3 3 HOH HOH . J 5 HOH A 3 4 4 HOH HOH . J 5 HOH A 4 5 5 HOH HOH . J 5 HOH A 5 13 13 HOH HOH . J 5 HOH A 6 15 15 HOH HOH . J 5 HOH A 7 16 16 HOH HOH . J 5 HOH A 8 17 17 HOH HOH . J 5 HOH A 9 19 19 HOH HOH . J 5 HOH A 10 20 20 HOH HOH . J 5 HOH A 11 21 21 HOH HOH . J 5 HOH A 12 24 24 HOH HOH . J 5 HOH A 13 25 25 HOH HOH . J 5 HOH A 14 26 26 HOH HOH . J 5 HOH A 15 28 28 HOH HOH . J 5 HOH A 16 30 30 HOH HOH . J 5 HOH A 17 31 31 HOH HOH . J 5 HOH A 18 32 32 HOH HOH . J 5 HOH A 19 33 33 HOH HOH . J 5 HOH A 20 34 34 HOH HOH . J 5 HOH A 21 35 35 HOH HOH . J 5 HOH A 22 36 36 HOH HOH . K 5 HOH C 1 17 17 HOH HOH . K 5 HOH C 2 18 18 HOH HOH . L 5 HOH D 1 17 17 HOH HOH . L 5 HOH D 2 18 18 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 17.191 _atom_site.Cartn_y 13.43 _atom_site.Cartn_z -0.516 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 49.78 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 526 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 59 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 209 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #