data_3GE1 # _model_server_result.job_id 6Yjd-20zAc3-xE1sK6KB-g _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 08:25:16' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3ge1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":499}' # _entry.id 3GE1 # _exptl.entry_id 3GE1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 427.201 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 106.01 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3GE1 _cell.length_a 63.412 _cell.length_b 193.651 _cell.length_c 91.844 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3GE1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 K N N ? 2 O N N ? 2 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ALA 3 A ALA 0 1_555 A N MSE 4 A MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.313 ? covale ? covale2 A C MSE 4 A MSE 1 1_555 A N GLU 5 A GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale3 A C VAL 61 A VAL 58 1_555 A N MSE 62 A MSE 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale4 A C MSE 62 A MSE 59 1_555 A N THR 63 A THR 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 A C LEU 192 A LEU 189 1_555 A N MSE 193 A MSE 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale6 A C MSE 193 A MSE 190 1_555 A N PHE 194 A PHE 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale7 A C ASN 214 A ASN 211 1_555 A N MSE 215 A MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale8 A C MSE 215 A MSE 212 1_555 A N LEU 216 A LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale9 A C PHE 272 A PHE 269 1_555 A N MSE 273 A MSE 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale10 A C MSE 273 A MSE 270 1_555 A N LEU 274 A LEU 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale11 A C LEU 274 A LEU 271 1_555 A N MSE 275 A MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale12 A C MSE 275 A MSE 272 1_555 A N ASN 276 A ASN 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale13 A C ARG 323 A ARG 320 1_555 A N MSE 324 A MSE 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale14 A C MSE 324 A MSE 321 1_555 A N ILE 325 A ILE 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale15 A C VAL 393 A VAL 390 1_555 A N MSE 394 A MSE 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale16 A C MSE 394 A MSE 391 1_555 A N GLU 395 A GLU 392 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale17 A C ALA 396 A ALA 393 1_555 A N MSE 397 A MSE 394 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale18 A C MSE 397 A MSE 394 1_555 A N SER 398 A SER 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale19 A C ILE 420 A ILE 417 1_555 A N MSE 421 A MSE 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale20 A C MSE 421 A MSE 418 1_555 A N GLN 422 A GLN 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale21 A C LYS 475 A LYS 472 1_555 A N MSE 476 A MSE 473 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale22 A C MSE 476 A MSE 473 1_555 A N ASP 477 A ASP 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale23 B C ALA 3 B ALA 0 1_555 B N MSE 4 B MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale24 B C MSE 4 B MSE 1 1_555 B N GLU 5 B GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale25 B C VAL 61 B VAL 58 1_555 B N MSE 62 B MSE 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale26 B C MSE 62 B MSE 59 1_555 B N THR 63 B THR 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale27 B C LEU 192 B LEU 189 1_555 B N MSE 193 B MSE 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale28 B C MSE 193 B MSE 190 1_555 B N PHE 194 B PHE 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale29 B C ASN 214 B ASN 211 1_555 B N MSE 215 B MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale30 B C MSE 215 B MSE 212 1_555 B N LEU 216 B LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale31 B C PHE 272 B PHE 269 1_555 B N MSE 273 B MSE 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale32 B C MSE 273 B MSE 270 1_555 B N LEU 274 B LEU 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale33 B C LEU 274 B LEU 271 1_555 B N MSE 275 B MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale34 B C MSE 275 B MSE 272 1_555 B N ASN 276 B ASN 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale35 B C ARG 323 B ARG 320 1_555 B N MSE 324 B MSE 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale36 B C MSE 324 B MSE 321 1_555 B N ILE 325 B ILE 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale37 B C VAL 393 B VAL 390 1_555 B N MSE 394 B MSE 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale38 B C MSE 394 B MSE 391 1_555 B N GLU 395 B GLU 392 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale39 B C ALA 396 B ALA 393 1_555 B N MSE 397 B MSE 394 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale40 B C MSE 397 B MSE 394 1_555 B N SER 398 B SER 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale41 B C ILE 420 B ILE 417 1_555 B N MSE 421 B MSE 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale42 B C MSE 421 B MSE 418 1_555 B N GLN 422 B GLN 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale43 B C LYS 475 B LYS 472 1_555 B N MSE 476 B MSE 473 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale44 B C MSE 476 B MSE 473 1_555 B N ASP 477 B ASP 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale45 C C MSE 4 C MSE 1 1_555 C N GLU 5 C GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale46 C C VAL 61 C VAL 58 1_555 C N MSE 62 C MSE 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale47 C C MSE 62 C MSE 59 1_555 C N THR 63 C THR 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale48 C C LEU 192 C LEU 189 1_555 C N MSE 193 C MSE 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale49 C C MSE 193 C MSE 190 1_555 C N PHE 194 C PHE 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale50 C C ASN 214 C ASN 211 1_555 C N MSE 215 C MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale51 C C MSE 215 C MSE 212 1_555 C N LEU 216 C LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale52 C C PHE 272 C PHE 269 1_555 C N MSE 273 C MSE 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale53 C C MSE 273 C MSE 270 1_555 C N LEU 274 C LEU 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale54 C C LEU 274 C LEU 271 1_555 C N MSE 275 C MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale55 C C MSE 275 C MSE 272 1_555 C N ASN 276 C ASN 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale56 C C ARG 323 C ARG 320 1_555 C N MSE 324 C MSE 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale57 C C MSE 324 C MSE 321 1_555 C N ILE 325 C ILE 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale58 C C VAL 393 C VAL 390 1_555 C N MSE 394 C MSE 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale59 C C MSE 394 C MSE 391 1_555 C N GLU 395 C GLU 392 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale60 C C ALA 396 C ALA 393 1_555 C N MSE 397 C MSE 394 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale61 C C MSE 397 C MSE 394 1_555 C N SER 398 C SER 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale62 C C ILE 420 C ILE 417 1_555 C N MSE 421 C MSE 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale63 C C MSE 421 C MSE 418 1_555 C N GLN 422 C GLN 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale64 C C LYS 475 C LYS 472 1_555 C N MSE 476 C MSE 473 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale65 C C MSE 476 C MSE 473 1_555 C N ASP 477 C ASP 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale66 D C VAL 61 D VAL 58 1_555 D N MSE 62 D MSE 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale67 D C MSE 62 D MSE 59 1_555 D N THR 63 D THR 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale68 D C LEU 192 D LEU 189 1_555 D N MSE 193 D MSE 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale69 D C MSE 193 D MSE 190 1_555 D N PHE 194 D PHE 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale70 D C ASN 214 D ASN 211 1_555 D N MSE 215 D MSE 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale71 D C MSE 215 D MSE 212 1_555 D N LEU 216 D LEU 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale72 D C PHE 272 D PHE 269 1_555 D N MSE 273 D MSE 270 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale73 D C MSE 273 D MSE 270 1_555 D N LEU 274 D LEU 271 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale74 D C LEU 274 D LEU 271 1_555 D N MSE 275 D MSE 272 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale75 D C MSE 275 D MSE 272 1_555 D N ASN 276 D ASN 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale76 D C ARG 323 D ARG 320 1_555 D N MSE 324 D MSE 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale77 D C MSE 324 D MSE 321 1_555 D N ILE 325 D ILE 322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale78 D C VAL 393 D VAL 390 1_555 D N MSE 394 D MSE 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale79 D C MSE 394 D MSE 391 1_555 D N GLU 395 D GLU 392 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale80 D C ALA 396 D ALA 393 1_555 D N MSE 397 D MSE 394 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale81 D C MSE 397 D MSE 394 1_555 D N SER 398 D SER 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale82 D C ILE 420 D ILE 417 1_555 D N MSE 421 D MSE 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale83 D C MSE 421 D MSE 418 1_555 D N GLN 422 D GLN 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale84 D C LYS 475 D LYS 472 1_555 D N MSE 476 D MSE 473 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale85 D C MSE 476 D MSE 473 1_555 D N ASP 477 D ASP 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O10 P2' _chem_comp.formula_weight 427.201 _chem_comp.id ADP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B ADP doub 1 n n PB O2B ADP sing 2 n n PB O3B ADP sing 3 n n PB O3A ADP sing 4 n n O2B HOB2 ADP sing 5 n n O3B HOB3 ADP sing 6 n n PA O1A ADP doub 7 n n PA O2A ADP sing 8 n n PA O3A ADP sing 9 n n PA O5' ADP sing 10 n n O2A HOA2 ADP sing 11 n n O5' C5' ADP sing 12 n n C5' C4' ADP sing 13 n n C5' "H5'1" ADP sing 14 n n C5' "H5'2" ADP sing 15 n n C4' O4' ADP sing 16 n n C4' C3' ADP sing 17 n n C4' H4' ADP sing 18 n n O4' C1' ADP sing 19 n n C3' O3' ADP sing 20 n n C3' C2' ADP sing 21 n n C3' H3' ADP sing 22 n n O3' HO3' ADP sing 23 n n C2' O2' ADP sing 24 n n C2' C1' ADP sing 25 n n C2' H2' ADP sing 26 n n O2' HO2' ADP sing 27 n n C1' N9 ADP sing 28 n n C1' H1' ADP sing 29 n n N9 C8 ADP sing 30 n y N9 C4 ADP sing 31 n y C8 N7 ADP doub 32 n y C8 H8 ADP sing 33 n n N7 C5 ADP sing 34 n y C5 C6 ADP sing 35 n y C5 C4 ADP doub 36 n y C6 N6 ADP sing 37 n n C6 N1 ADP doub 38 n y N6 HN61 ADP sing 39 n n N6 HN62 ADP sing 40 n n N1 C2 ADP sing 41 n y C2 N3 ADP doub 42 n y C2 H2 ADP sing 43 n n N3 C4 ADP sing 44 n y # _atom_sites.entry_id 3GE1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01577 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.004525 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005164 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011327 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 ADP A 1 499 1 ADP ADP . F 3 GOL A 1 500 5 GOL GOL . G 4 PO4 A 1 501 9 PO4 PO4 . H 4 PO4 A 1 502 10 PO4 PO4 . I 4 PO4 A 1 503 13 PO4 PO4 . J 5 CL A 1 504 17 CL CL . K 2 ADP B 1 499 2 ADP ADP . L 3 GOL B 1 500 6 GOL GOL . M 4 PO4 B 1 501 14 PO4 PO4 . N 5 CL B 1 502 18 CL CL . O 2 ADP C 1 499 3 ADP ADP . P 3 GOL C 1 500 7 GOL GOL . Q 4 PO4 C 1 501 15 PO4 PO4 . R 5 CL C 1 502 19 CL CL . S 2 ADP D 1 499 4 ADP ADP . T 3 GOL D 1 500 8 GOL GOL . U 4 PO4 D 1 501 11 PO4 PO4 . V 4 PO4 D 1 502 12 PO4 PO4 . W 4 PO4 D 1 503 16 PO4 PO4 . X 5 CL D 1 504 20 CL CL . Y 6 HOH A 1 505 24 HOH HOH . Y 6 HOH A 2 506 27 HOH HOH . Y 6 HOH A 3 507 29 HOH HOH . Y 6 HOH A 4 508 37 HOH HOH . Y 6 HOH A 5 509 39 HOH HOH . Y 6 HOH A 6 510 44 HOH HOH . Y 6 HOH A 7 511 45 HOH HOH . Y 6 HOH A 8 512 47 HOH HOH . Y 6 HOH A 9 513 48 HOH HOH . Y 6 HOH A 10 514 49 HOH HOH . Y 6 HOH A 11 515 57 HOH HOH . Y 6 HOH A 12 516 61 HOH HOH . Y 6 HOH A 13 517 66 HOH HOH . Y 6 HOH A 14 518 68 HOH HOH . Y 6 HOH A 15 519 77 HOH HOH . Y 6 HOH A 16 520 79 HOH HOH . Y 6 HOH A 17 521 83 HOH HOH . Y 6 HOH A 18 522 85 HOH HOH . Y 6 HOH A 19 523 86 HOH HOH . Y 6 HOH A 20 524 88 HOH HOH . Y 6 HOH A 21 525 93 HOH HOH . Y 6 HOH A 22 526 102 HOH HOH . Y 6 HOH A 23 527 103 HOH HOH . Y 6 HOH A 24 528 105 HOH HOH . Y 6 HOH A 25 529 106 HOH HOH . Y 6 HOH A 26 530 111 HOH HOH . Y 6 HOH A 27 531 115 HOH HOH . Y 6 HOH A 28 532 129 HOH HOH . Y 6 HOH A 29 533 133 HOH HOH . Y 6 HOH A 30 534 134 HOH HOH . Y 6 HOH A 31 535 135 HOH HOH . Y 6 HOH A 32 536 138 HOH HOH . Y 6 HOH A 33 537 139 HOH HOH . Y 6 HOH A 34 538 155 HOH HOH . Y 6 HOH A 35 539 174 HOH HOH . Y 6 HOH A 36 540 176 HOH HOH . Y 6 HOH A 37 541 187 HOH HOH . Y 6 HOH A 38 542 189 HOH HOH . Y 6 HOH A 39 543 190 HOH HOH . Y 6 HOH A 40 544 195 HOH HOH . Y 6 HOH A 41 545 197 HOH HOH . Y 6 HOH A 42 546 198 HOH HOH . Y 6 HOH A 43 547 201 HOH HOH . Y 6 HOH A 44 548 206 HOH HOH . Y 6 HOH A 45 549 209 HOH HOH . Y 6 HOH A 46 550 216 HOH HOH . Y 6 HOH A 47 551 221 HOH HOH . Y 6 HOH A 48 552 222 HOH HOH . Y 6 HOH A 49 553 226 HOH HOH . Y 6 HOH A 50 554 227 HOH HOH . Y 6 HOH A 51 555 228 HOH HOH . Y 6 HOH A 52 556 230 HOH HOH . Y 6 HOH A 53 557 234 HOH HOH . Y 6 HOH A 54 558 235 HOH HOH . Y 6 HOH A 55 559 236 HOH HOH . Y 6 HOH A 56 560 237 HOH HOH . Y 6 HOH A 57 561 242 HOH HOH . Y 6 HOH A 58 562 249 HOH HOH . Y 6 HOH A 59 563 251 HOH HOH . Y 6 HOH A 60 564 256 HOH HOH . Y 6 HOH A 61 565 259 HOH HOH . Y 6 HOH A 62 566 262 HOH HOH . Y 6 HOH A 63 567 263 HOH HOH . Y 6 HOH A 64 568 264 HOH HOH . Y 6 HOH A 65 569 267 HOH HOH . Y 6 HOH A 66 570 269 HOH HOH . Y 6 HOH A 67 571 271 HOH HOH . Y 6 HOH A 68 572 272 HOH HOH . Y 6 HOH A 69 573 273 HOH HOH . Y 6 HOH A 70 574 274 HOH HOH . Y 6 HOH A 71 575 275 HOH HOH . Y 6 HOH A 72 576 276 HOH HOH . Y 6 HOH A 73 577 277 HOH HOH . Y 6 HOH A 74 578 278 HOH HOH . Y 6 HOH A 75 579 279 HOH HOH . Y 6 HOH A 76 580 280 HOH HOH . Y 6 HOH A 77 581 281 HOH HOH . Y 6 HOH A 78 582 282 HOH HOH . Y 6 HOH A 79 583 283 HOH HOH . Y 6 HOH A 80 584 284 HOH HOH . Y 6 HOH A 81 585 285 HOH HOH . Y 6 HOH A 82 586 292 HOH HOH . Z 6 HOH B 1 503 21 HOH HOH . Z 6 HOH B 2 504 23 HOH HOH . Z 6 HOH B 3 505 25 HOH HOH . Z 6 HOH B 4 506 32 HOH HOH . Z 6 HOH B 5 507 33 HOH HOH . Z 6 HOH B 6 508 34 HOH HOH . Z 6 HOH B 7 509 36 HOH HOH . Z 6 HOH B 8 510 43 HOH HOH . Z 6 HOH B 9 511 51 HOH HOH . Z 6 HOH B 10 512 69 HOH HOH . Z 6 HOH B 11 513 73 HOH HOH . Z 6 HOH B 12 514 76 HOH HOH . Z 6 HOH B 13 515 84 HOH HOH . Z 6 HOH B 14 516 87 HOH HOH . Z 6 HOH B 15 517 89 HOH HOH . Z 6 HOH B 16 518 90 HOH HOH . Z 6 HOH B 17 519 91 HOH HOH . Z 6 HOH B 18 520 92 HOH HOH . Z 6 HOH B 19 521 94 HOH HOH . Z 6 HOH B 20 522 99 HOH HOH . Z 6 HOH B 21 523 101 HOH HOH . Z 6 HOH B 22 524 107 HOH HOH . Z 6 HOH B 23 525 113 HOH HOH . Z 6 HOH B 24 526 118 HOH HOH . Z 6 HOH B 25 527 120 HOH HOH . Z 6 HOH B 26 528 121 HOH HOH . Z 6 HOH B 27 529 122 HOH HOH . Z 6 HOH B 28 530 124 HOH HOH . Z 6 HOH B 29 531 126 HOH HOH . Z 6 HOH B 30 532 127 HOH HOH . Z 6 HOH B 31 533 128 HOH HOH . Z 6 HOH B 32 534 131 HOH HOH . Z 6 HOH B 33 535 142 HOH HOH . Z 6 HOH B 34 536 146 HOH HOH . Z 6 HOH B 35 537 147 HOH HOH . Z 6 HOH B 36 538 148 HOH HOH . Z 6 HOH B 37 539 149 HOH HOH . Z 6 HOH B 38 540 154 HOH HOH . Z 6 HOH B 39 541 158 HOH HOH . Z 6 HOH B 40 542 162 HOH HOH . Z 6 HOH B 41 543 163 HOH HOH . Z 6 HOH B 42 544 166 HOH HOH . Z 6 HOH B 43 545 170 HOH HOH . Z 6 HOH B 44 546 171 HOH HOH . Z 6 HOH B 45 547 181 HOH HOH . Z 6 HOH B 46 548 182 HOH HOH . Z 6 HOH B 47 549 184 HOH HOH . Z 6 HOH B 48 550 185 HOH HOH . Z 6 HOH B 49 551 186 HOH HOH . Z 6 HOH B 50 552 188 HOH HOH . Z 6 HOH B 51 553 200 HOH HOH . Z 6 HOH B 52 554 205 HOH HOH . Z 6 HOH B 53 555 212 HOH HOH . Z 6 HOH B 54 556 213 HOH HOH . Z 6 HOH B 55 557 218 HOH HOH . Z 6 HOH B 56 558 224 HOH HOH . Z 6 HOH B 57 559 229 HOH HOH . Z 6 HOH B 58 560 231 HOH HOH . Z 6 HOH B 59 561 245 HOH HOH . Z 6 HOH B 60 562 247 HOH HOH . Z 6 HOH B 61 563 255 HOH HOH . Z 6 HOH B 62 564 257 HOH HOH . Z 6 HOH B 63 565 268 HOH HOH . Z 6 HOH B 64 566 286 HOH HOH . Z 6 HOH B 65 567 287 HOH HOH . Z 6 HOH B 66 568 289 HOH HOH . Z 6 HOH B 67 569 291 HOH HOH . AA 6 HOH C 1 503 28 HOH HOH . AA 6 HOH C 2 504 38 HOH HOH . AA 6 HOH C 3 505 41 HOH HOH . AA 6 HOH C 4 506 52 HOH HOH . AA 6 HOH C 5 507 54 HOH HOH . AA 6 HOH C 6 508 55 HOH HOH . AA 6 HOH C 7 509 58 HOH HOH . AA 6 HOH C 8 510 64 HOH HOH . AA 6 HOH C 9 511 65 HOH HOH . AA 6 HOH C 10 512 71 HOH HOH . AA 6 HOH C 11 513 74 HOH HOH . AA 6 HOH C 12 514 75 HOH HOH . AA 6 HOH C 13 515 78 HOH HOH . AA 6 HOH C 14 516 82 HOH HOH . AA 6 HOH C 15 517 108 HOH HOH . AA 6 HOH C 16 518 114 HOH HOH . AA 6 HOH C 17 519 119 HOH HOH . AA 6 HOH C 18 520 123 HOH HOH . AA 6 HOH C 19 521 125 HOH HOH . AA 6 HOH C 20 522 137 HOH HOH . AA 6 HOH C 21 523 140 HOH HOH . AA 6 HOH C 22 524 145 HOH HOH . AA 6 HOH C 23 525 152 HOH HOH . AA 6 HOH C 24 526 153 HOH HOH . AA 6 HOH C 25 527 156 HOH HOH . AA 6 HOH C 26 528 157 HOH HOH . AA 6 HOH C 27 529 160 HOH HOH . AA 6 HOH C 28 530 161 HOH HOH . AA 6 HOH C 29 531 167 HOH HOH . AA 6 HOH C 30 532 168 HOH HOH . AA 6 HOH C 31 533 169 HOH HOH . AA 6 HOH C 32 534 173 HOH HOH . AA 6 HOH C 33 535 175 HOH HOH . AA 6 HOH C 34 536 177 HOH HOH . AA 6 HOH C 35 537 179 HOH HOH . AA 6 HOH C 36 538 183 HOH HOH . AA 6 HOH C 37 539 192 HOH HOH . AA 6 HOH C 38 540 194 HOH HOH . AA 6 HOH C 39 541 196 HOH HOH . AA 6 HOH C 40 542 202 HOH HOH . AA 6 HOH C 41 543 208 HOH HOH . AA 6 HOH C 42 544 210 HOH HOH . AA 6 HOH C 43 545 223 HOH HOH . AA 6 HOH C 44 546 238 HOH HOH . AA 6 HOH C 45 547 239 HOH HOH . AA 6 HOH C 46 548 241 HOH HOH . AA 6 HOH C 47 549 244 HOH HOH . AA 6 HOH C 48 550 248 HOH HOH . AA 6 HOH C 49 551 258 HOH HOH . AA 6 HOH C 50 552 265 HOH HOH . AA 6 HOH C 51 553 266 HOH HOH . AA 6 HOH C 52 554 297 HOH HOH . BA 6 HOH D 1 505 22 HOH HOH . BA 6 HOH D 2 506 26 HOH HOH . BA 6 HOH D 3 507 30 HOH HOH . BA 6 HOH D 4 508 31 HOH HOH . BA 6 HOH D 5 509 35 HOH HOH . BA 6 HOH D 6 510 40 HOH HOH . BA 6 HOH D 7 511 46 HOH HOH . BA 6 HOH D 8 512 50 HOH HOH . BA 6 HOH D 9 513 53 HOH HOH . BA 6 HOH D 10 514 56 HOH HOH . BA 6 HOH D 11 515 59 HOH HOH . BA 6 HOH D 12 516 60 HOH HOH . BA 6 HOH D 13 517 62 HOH HOH . BA 6 HOH D 14 518 63 HOH HOH . BA 6 HOH D 15 519 67 HOH HOH . BA 6 HOH D 16 520 70 HOH HOH . BA 6 HOH D 17 521 72 HOH HOH . BA 6 HOH D 18 522 80 HOH HOH . BA 6 HOH D 19 523 81 HOH HOH . BA 6 HOH D 20 524 95 HOH HOH . BA 6 HOH D 21 525 96 HOH HOH . BA 6 HOH D 22 526 97 HOH HOH . BA 6 HOH D 23 527 98 HOH HOH . BA 6 HOH D 24 528 100 HOH HOH . BA 6 HOH D 25 529 104 HOH HOH . BA 6 HOH D 26 530 109 HOH HOH . BA 6 HOH D 27 531 110 HOH HOH . BA 6 HOH D 28 532 112 HOH HOH . BA 6 HOH D 29 533 116 HOH HOH . BA 6 HOH D 30 534 117 HOH HOH . BA 6 HOH D 31 535 130 HOH HOH . BA 6 HOH D 32 536 132 HOH HOH . BA 6 HOH D 33 537 136 HOH HOH . BA 6 HOH D 34 538 141 HOH HOH . BA 6 HOH D 35 539 143 HOH HOH . BA 6 HOH D 36 540 144 HOH HOH . BA 6 HOH D 37 541 150 HOH HOH . BA 6 HOH D 38 542 151 HOH HOH . BA 6 HOH D 39 543 159 HOH HOH . BA 6 HOH D 40 544 164 HOH HOH . BA 6 HOH D 41 545 165 HOH HOH . BA 6 HOH D 42 546 172 HOH HOH . BA 6 HOH D 43 547 178 HOH HOH . BA 6 HOH D 44 548 180 HOH HOH . BA 6 HOH D 45 549 191 HOH HOH . BA 6 HOH D 46 550 193 HOH HOH . BA 6 HOH D 47 551 199 HOH HOH . BA 6 HOH D 48 552 203 HOH HOH . BA 6 HOH D 49 553 207 HOH HOH . BA 6 HOH D 50 554 211 HOH HOH . BA 6 HOH D 51 555 214 HOH HOH . BA 6 HOH D 52 556 215 HOH HOH . BA 6 HOH D 53 557 217 HOH HOH . BA 6 HOH D 54 558 219 HOH HOH . BA 6 HOH D 55 559 220 HOH HOH . BA 6 HOH D 56 560 225 HOH HOH . BA 6 HOH D 57 561 232 HOH HOH . BA 6 HOH D 58 562 233 HOH HOH . BA 6 HOH D 59 563 240 HOH HOH . BA 6 HOH D 60 564 243 HOH HOH . BA 6 HOH D 61 565 246 HOH HOH . BA 6 HOH D 62 566 250 HOH HOH . BA 6 HOH D 63 567 252 HOH HOH . BA 6 HOH D 64 568 253 HOH HOH . BA 6 HOH D 65 569 254 HOH HOH . BA 6 HOH D 66 570 260 HOH HOH . BA 6 HOH D 67 571 261 HOH HOH . BA 6 HOH D 68 572 270 HOH HOH . BA 6 HOH D 69 573 288 HOH HOH . BA 6 HOH D 70 574 293 HOH HOH . BA 6 HOH D 71 575 294 HOH HOH . BA 6 HOH D 72 576 295 HOH HOH . BA 6 HOH D 73 577 296 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB ADP . . . K 2 -8.372 -2.215 14.572 1 70.97 ? PB ADP 499 B 1 HETATM 2 O O1B ADP . . . K 2 -7.997 -1.067 15.478 1 71.77 ? O1B ADP 499 B 1 HETATM 3 O O2B ADP . . . K 2 -9.455 -3.114 15.128 1 72.05 ? O2B ADP 499 B 1 HETATM 4 O O3B ADP . . . K 2 -8.583 -1.802 13.138 1 63.38 ? O3B ADP 499 B 1 HETATM 5 P PA ADP . . . K 2 -6.281 -3.768 15.833 1 75.85 ? PA ADP 499 B 1 HETATM 6 O O1A ADP . . . K 2 -7.24 -3.794 17.004 1 75.01 ? O1A ADP 499 B 1 HETATM 7 O O2A ADP . . . K 2 -4.935 -3.082 15.948 1 75.33 ? O2A ADP 499 B 1 HETATM 8 O O3A ADP . . . K 2 -7.044 -3.157 14.523 1 74.94 ? O3A ADP 499 B 1 HETATM 9 O O5' ADP . . . K 2 -5.983 -5.307 15.438 1 71.04 ? O5' ADP 499 B 1 HETATM 10 C C5' ADP . . . K 2 -6.919 -6.344 15.74 1 66.02 ? C5' ADP 499 B 1 HETATM 11 C C4' ADP . . . K 2 -6.892 -7.415 14.652 1 60.67 ? C4' ADP 499 B 1 HETATM 12 O O4' ADP . . . K 2 -5.751 -8.256 14.851 1 49.68 ? O4' ADP 499 B 1 HETATM 13 C C3' ADP . . . K 2 -8.133 -8.312 14.678 1 57.52 ? C3' ADP 499 B 1 HETATM 14 O O3' ADP . . . K 2 -8.764 -8.346 13.393 1 49.24 ? O3' ADP 499 B 1 HETATM 15 C C2' ADP . . . K 2 -7.629 -9.693 15.057 1 60.92 ? C2' ADP 499 B 1 HETATM 16 O O2' ADP . . . K 2 -8.299 -10.715 14.3 1 56.31 ? O2' ADP 499 B 1 HETATM 17 C C1' ADP . . . K 2 -6.122 -9.631 14.784 1 55.56 ? C1' ADP 499 B 1 HETATM 18 N N9 ADP . . . K 2 -5.303 -10.363 15.774 1 56.79 ? N9 ADP 499 B 1 HETATM 19 C C8 ADP . . . K 2 -5.274 -10.137 17.104 1 58.98 ? C8 ADP 499 B 1 HETATM 20 N N7 ADP . . . K 2 -4.396 -10.992 17.71 1 62.19 ? N7 ADP 499 B 1 HETATM 21 C C5 ADP . . . K 2 -3.853 -11.769 16.757 1 62.61 ? C5 ADP 499 B 1 HETATM 22 C C6 ADP . . . K 2 -2.862 -12.868 16.711 1 66.6 ? C6 ADP 499 B 1 HETATM 23 N N6 ADP . . . K 2 -2.257 -13.322 17.834 1 71.06 ? N6 ADP 499 B 1 HETATM 24 N N1 ADP . . . K 2 -2.575 -13.413 15.508 1 66.59 ? N1 ADP 499 B 1 HETATM 25 C C2 ADP . . . K 2 -3.163 -12.98 14.372 1 65.73 ? C2 ADP 499 B 1 HETATM 26 N N3 ADP . . . K 2 -4.071 -11.98 14.35 1 62.9 ? N3 ADP 499 B 1 HETATM 27 C C4 ADP . . . K 2 -4.449 -11.348 15.487 1 61.3 ? C4 ADP 499 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 22 _model_server_stats.create_model_time_ms 42 _model_server_stats.query_time_ms 368 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 27 #