data_3GTG # _model_server_result.job_id 1p9T7xFd5Fv4QpJZHAJkEQ _model_server_result.datetime_utc '2025-02-28 08:41:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3gtg # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":1735}' # _entry.id 3GTG # _exptl.entry_id 3GTG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 14 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 102.28 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3GTG _cell.length_a 170.956 _cell.length_b 223.004 _cell.length_c 195.412 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3GTG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tridecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 13 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 14 N N N ? 14 O N N ? 14 Q N N ? 14 R N N ? 14 S N N ? 14 T N N ? 14 U N N ? 14 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 110 A CYS 110 1_555 A SG CYS 167 A CYS 167 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? disulf ? disulf2 G SG CYS 103 I CYS 103 1_555 G SG CYS 106 I CYS 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf3 H SG CYS 7 J CYS 7 1_555 H SG CYS 10 J CYS 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.95 ? disulf ? disulf4 H SG CYS 10 J CYS 10 1_555 H SG CYS 46 J CYS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.003 ? disulf ? disulf5 J SG CYS 48 L CYS 48 1_555 J SG CYS 51 L CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 70 A CYS 70 1_555 O ZN ZN . A ZN 1735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 O ZN ZN . A ZN 1735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc3 A NE2 HIS 80 A HIS 80 1_555 O ZN ZN . A ZN 1735 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.767 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 N ZN ZN . A ZN 1734 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc5 P MG MG . A MG 1736 1_555 K O3' A 10 R A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? metalc ? metalc6 P MG MG . A MG 1736 1_555 K OP1 U 11 R U 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.945 ? metalc ? metalc7 P MG MG . A MG 1736 1_555 K O5' U 11 R U 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 1163 B CYS 1163 1_555 Q ZN ZN . B ZN 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc9 B SG CYS 1166 B CYS 1166 1_555 Q ZN ZN . B ZN 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? metalc ? metalc10 B SG CYS 1182 B CYS 1182 1_555 Q ZN ZN . B ZN 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.954 ? metalc ? metalc11 C SG CYS 86 C CYS 86 1_555 R ZN ZN . C ZN 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc12 C SG CYS 88 C CYS 88 1_555 R ZN ZN . C ZN 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc13 C SG CYS 92 C CYS 92 1_555 R ZN ZN . C ZN 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? metalc ? metalc14 C SG CYS 95 C CYS 95 1_555 R ZN ZN . C ZN 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc15 G SG CYS 7 I CYS 7 1_555 S ZN ZN . I ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc ? metalc16 G SG CYS 10 I CYS 10 1_555 S ZN ZN . I ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc17 G SG CYS 29 I CYS 29 1_555 S ZN ZN . I ZN 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? metalc ? metalc18 G SG CYS 75 I CYS 75 1_555 T ZN ZN . I ZN 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.9 ? metalc ? metalc19 G SG CYS 78 I CYS 78 1_555 T ZN ZN . I ZN 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc ? metalc20 G SG CYS 106 I CYS 106 1_555 T ZN ZN . I ZN 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc21 H SG CYS 10 J CYS 10 1_555 U ZN ZN . J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.623 ? metalc ? metalc22 H SG CYS 45 J CYS 45 1_555 U ZN ZN . J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? metalc ? metalc23 J SG CYS 31 L CYS 31 1_555 V ZN ZN . L ZN 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc24 J SG CYS 34 L CYS 34 1_555 V ZN ZN . L ZN 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.965 ? metalc ? metalc25 J SG CYS 48 L CYS 48 1_555 V ZN ZN . L ZN 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc26 J SG CYS 51 L CYS 51 1_555 V ZN ZN . L ZN 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 K N3 C 3 R C 3 1_555 L N1 DG 26 T DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 K N4 C 3 R C 3 1_555 L O6 DG 26 T DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 K O2 C 3 R C 3 1_555 L N2 DG 26 T DG 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-DC PAIR' hydrog4 K N1 G 4 R G 4 1_555 L N3 DC 25 T DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-DT PAIR' hydrog5 K N1 A 5 R A 5 1_555 L N3 DT 24 T DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 K N1 G 6 R G 6 1_555 L N3 DC 23 T DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 K N2 G 6 R G 6 1_555 L O2 DC 23 T DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 K O6 G 6 R G 6 1_555 L N4 DC 23 T DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 K N1 A 7 R A 7 1_555 L N3 DT 22 T DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 K N6 A 7 R A 7 1_555 L O4 DT 22 T DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 K N1 G 8 R G 8 1_555 L N3 DC 21 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 K N2 G 8 R G 8 1_555 L O2 DC 21 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 K O6 G 8 R G 8 1_555 L N4 DC 21 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 K N1 G 9 R G 9 1_555 L N3 DC 20 T DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 K N2 G 9 R G 9 1_555 L O2 DC 20 T DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 K O6 G 9 R G 9 1_555 L N4 DC 20 T DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 K N1 G 9 R G 9 1_555 L N3 DC 21 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 K N2 G 9 R G 9 1_555 L O2 DC 21 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 K O6 G 9 R G 9 1_555 L N4 DC 21 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-DT PAIR' hydrog20 K N1 A 10 R A 10 1_555 L N3 DT 19 T DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 K N3 U 11 R U 11 1_555 L N1 DA 18 T DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 K O4 U 11 R U 11 1_555 L N6 DA 18 T DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog23 L N3 DT 2 T DT 2 1_555 M N1 DA 13 N DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog24 L N1 DA 3 T DA 3 1_555 M N3 DT 12 N DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog25 L O2 DC 4 T DC 4 1_555 M N1 DG 11 N DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 L N3 DC 5 T DC 5 1_555 M N1 DG 10 N DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 L N4 DC 5 T DC 5 1_555 M O6 DG 10 N DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 L O2 DC 5 T DC 5 1_555 M N2 DG 10 N DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 L N1 DG 6 T DG 6 1_555 M N3 DC 9 N DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 L N2 DG 6 T DG 6 1_555 M O2 DC 9 N DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 L O6 DG 6 T DG 6 1_555 M N4 DC 9 N DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog32 L N1 DA 7 T DA 7 1_555 M N3 DT 8 N DT 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 L N3 DT 8 T DT 8 1_555 M N1 DA 7 N DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 L O4 DT 8 T DT 8 1_555 M N6 DA 7 N DA 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 L N1 DA 9 T DA 9 1_555 M N3 DT 6 N DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 L N6 DA 9 T DA 9 1_555 M O4 DT 6 N DT 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 L N1 DA 10 T DA 10 1_555 M N3 DT 5 N DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 L N6 DA 10 T DA 10 1_555 M O4 DT 5 N DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DG MISPAIR' hydrog39 L N1 DG 11 T DG 11 1_555 M O6 DG 3 N DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog40 L N2 DG 11 T DG 11 1_555 M O2 DC 4 N DC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 L N3 DC 12 T DC 12 1_555 M N1 DG 3 N DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 L N4 DC 12 T DC 12 1_555 M O6 DG 3 N DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 L O2 DC 12 T DC 12 1_555 M N2 DG 3 N DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 L N1 DA 13 T DA 13 1_555 M N3 DT 2 N DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 L N6 DA 13 T DA 13 1_555 M O4 DT 2 N DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog46 L N2 DG 14 T DG 14 1_555 M O2 DC 1 N DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3GTG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005849 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001273 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004484 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005237 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code N 14 ZN A 1 1734 1506 ZN ZN . O 14 ZN A 1 1735 1508 ZN ZN . P 15 MG A 1 1736 1 MG MG . Q 14 ZN B 1 1307 1307 ZN ZN . R 14 ZN C 1 319 302 ZN ZN . S 14 ZN I 1 203 203 ZN ZN . T 14 ZN I 1 204 204 ZN ZN . U 14 ZN J 1 101 101 ZN ZN . V 14 ZN L 1 105 105 ZN ZN . W 16 HOH R 1 13 1 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 14 _atom_site.Cartn_x 43.595 _atom_site.Cartn_y 4.073 _atom_site.Cartn_z 18.367 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 136.13 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1735 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 273 _model_server_stats.query_time_ms 366 _model_server_stats.encode_time_ms 11 _model_server_stats.element_count 1 #