data_3GX5 # _model_server_result.job_id hI2hQ-zEwqMPDh7ES6T0Fg _model_server_result.datetime_utc '2025-04-23 14:15:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3gx5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":301}' # _entry.id 3GX5 # _exptl.entry_id 3GX5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 398.437 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description S-ADENOSYLMETHIONINE _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3GX5 _cell.length_a 62.71 _cell.length_b 62.71 _cell.length_c 158.68 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3GX5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OP2 U 64 A U 64 1_555 F MG MG . A MG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? metalc ? metalc2 A O6 G 71 A G 71 1_555 D MG MG . A MG 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? metalc ? metalc3 A O6 G 79 A G 79 1_555 D MG MG . A MG 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? metalc ? metalc4 A O4 U 80 A U 80 1_555 D MG MG . A MG 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? metalc ? metalc5 F MG MG . A MG 400 1_555 L O HOH . A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.76 ? metalc ? metalc6 F MG MG . A MG 400 1_555 L O HOH . A HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.743 ? metalc ? metalc7 F MG MG . A MG 400 1_555 L O HOH . A HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.758 ? metalc ? metalc8 F MG MG . A MG 400 1_555 L O HOH . A HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.752 ? metalc ? metalc9 G MG MG . A MG 500 1_555 L O HOH . A HOH 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.76 ? metalc ? metalc10 G MG MG . A MG 500 1_555 L O HOH . A HOH 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.76 ? metalc ? metalc11 G MG MG . A MG 500 1_555 L O HOH . A HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.764 ? metalc ? metalc12 G MG MG . A MG 500 1_555 L O HOH . A HOH 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.753 ? metalc ? metalc13 H MG MG . A MG 600 1_555 L O HOH . A HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.76 ? metalc ? metalc14 H MG MG . A MG 600 1_555 L O HOH . A HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.762 ? metalc ? metalc15 H MG MG . A MG 600 1_555 L O HOH . A HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.756 ? metalc ? metalc16 H MG MG . A MG 600 1_555 L O HOH . A HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.757 ? metalc ? metalc17 I MG MG . A MG 700 1_555 L O HOH . A HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc18 I MG MG . A MG 700 1_555 L O HOH . A HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc19 I MG MG . A MG 700 1_555 L O HOH . A HOH 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc20 I MG MG . A MG 700 1_555 L O HOH . A HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc21 I MG MG . A MG 700 1_555 L O HOH . A HOH 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc22 I MG MG . A MG 700 1_555 L O HOH . A HOH 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc23 J MG MG . A MG 800 1_555 L O HOH . A HOH 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc24 J MG MG . A MG 800 1_555 L O HOH . A HOH 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc25 J MG MG . A MG 800 1_555 L O HOH . A HOH 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc26 J MG MG . A MG 800 1_555 L O HOH . A HOH 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc27 J MG MG . A MG 800 1_555 L O HOH . A HOH 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? metalc ? metalc28 J MG MG . A MG 800 1_555 L O HOH . A HOH 806 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 1 A G 1 1_555 A N3 C 93 A C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 1 A G 1 1_555 A O2 C 93 A C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 1 A G 1 1_555 A N4 C 93 A C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 2 A G 2 1_555 A N3 C 92 A C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 2 A G 2 1_555 A O2 C 92 A C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 2 A G 2 1_555 A N4 C 92 A C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 C 3 A C 3 1_555 A N1 G 91 A G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N4 C 3 A C 3 1_555 A O6 G 91 A G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O2 C 3 A C 3 1_555 A N2 G 91 A G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N3 U 4 A U 4 1_555 A N1 A 90 A A 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O4 U 4 A U 4 1_555 A N6 A 90 A A 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog12 A N3 U 5 A U 5 1_555 A O6 G 89 A G 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog13 A O2 U 5 A U 5 1_555 A N1 G 89 A G 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N1 A 6 A A 6 1_555 A N3 U 88 A U 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N6 A 6 A A 6 1_555 A O4 U 88 A U 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N3 U 7 A U 7 1_555 A N1 A 87 A A 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A O4 U 7 A U 7 1_555 A N6 A 87 A A 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N3 C 8 A C 8 1_555 A N1 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N4 C 8 A C 8 1_555 A O6 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A O2 C 8 A C 8 1_555 A N2 G 86 A G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog21 A N2 G 11 A G 11 1_555 A O2 C 44 A C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog22 A N3 A 12 A A 12 1_555 A N2 G 43 A G 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N1 G 13 A G 13 1_555 A N3 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N2 G 13 A G 13 1_555 A O2 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O6 G 13 A G 13 1_555 A N4 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N1 G 15 A G 15 1_555 A N3 C 40 A C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N2 G 15 A G 15 1_555 A O2 C 40 A C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A O6 G 15 A G 15 1_555 A N4 C 40 A C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N1 G 16 A G 16 1_555 A N3 C 39 A C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N2 G 16 A G 16 1_555 A O2 C 39 A C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O6 G 16 A G 16 1_555 A N4 C 39 A C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N3 U 17 A U 17 1_555 A N1 A 38 A A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A O4 U 17 A U 17 1_555 A N6 A 38 A A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog34 A N2 G 18 A G 18 1_555 A N7 A 37 A A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog35 A N3 G 18 A G 18 1_555 A N6 A 37 A A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog36 A N2 G 19 A G 19 1_555 A N7 A 36 A A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog37 A N3 G 19 A G 19 1_555 A N6 A 36 A A 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog38 A N3 A 20 A A 20 1_555 A N2 G 32 A G 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog39 A N6 A 20 A A 20 1_555 A N3 G 35 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog40 A N7 A 20 A A 20 1_555 A N2 G 35 A G 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A N1 G 21 A G 21 1_555 A N3 C 31 A C 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N2 G 21 A G 21 1_555 A O2 C 31 A C 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O6 G 21 A G 21 1_555 A N4 C 31 A C 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A N1 G 22 A G 22 1_555 A N3 C 30 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N2 G 22 A G 22 1_555 A O2 C 30 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A O6 G 22 A G 22 1_555 A N4 C 30 A C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A N1 G 23 A G 23 1_555 A N3 C 29 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A N2 G 23 A G 23 1_555 A O2 C 29 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A O6 G 23 A G 23 1_555 A N4 C 29 A C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog50 A N2 G 23 A G 23 1_555 A N1 A 62 A A 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog51 A N3 G 23 A G 23 1_555 A N6 A 62 A A 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A N3 C 25 A C 25 1_555 A N1 G 68 A G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A N4 C 25 A C 25 1_555 A O6 G 68 A G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A O2 C 25 A C 25 1_555 A N2 G 68 A G 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog55 A N3 U 26 A U 26 1_555 A O2 U 67 A U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog56 A O4 U 26 A U 26 1_555 A N3 U 67 A U 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 A N1 G 27 A G 27 1_555 A N3 C 66 A C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A N2 G 27 A G 27 1_555 A O2 C 66 A C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 A O6 G 27 A G 27 1_555 A N4 C 66 A C 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A N1 G 28 A G 28 1_555 A N3 C 65 A C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 A N2 G 28 A G 28 1_555 A O2 C 65 A C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 A O6 G 28 A G 28 1_555 A N4 C 65 A C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog63 A O2 C 30 A C 30 1_555 A N6 A 61 A A 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 A N1 G 42 A G 42 1_555 A N3 C 60 A C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A N2 G 42 A G 42 1_555 A O2 C 60 A C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 A O6 G 42 A G 42 1_555 A N4 C 60 A C 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 A N1 G 43 A G 43 1_555 A N3 C 59 A C 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 A N2 G 43 A G 43 1_555 A O2 C 59 A C 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 A O6 G 43 A G 43 1_555 A N4 C 59 A C 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A N3 C 44 A C 44 1_555 A N1 G 58 A G 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A N4 C 44 A C 44 1_555 A O6 G 58 A G 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A O2 C 44 A C 44 1_555 A N2 G 58 A G 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog73 A N3 A 46 A A 46 1_555 A N4 C 47 A C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 A N3 C 47 A C 47 1_555 A N1 G 56 A G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N4 C 47 A C 47 1_555 A O6 G 56 A G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 A O2 C 47 A C 47 1_555 A N2 G 56 A G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 A N3 C 48 A C 48 1_555 A N1 G 55 A G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 A N4 C 48 A C 48 1_555 A O6 G 55 A G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 A O2 C 48 A C 48 1_555 A N2 G 55 A G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 A N1 A 49 A A 49 1_555 A N3 U 54 A U 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 A N6 A 49 A A 49 1_555 A O4 U 54 A U 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog82 A N2 G 50 A G 50 1_555 A N7 A 53 A A 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 A N3 U 64 A U 64 1_555 A N1 A 85 A A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 A O4 U 64 A U 64 1_555 A N6 A 85 A A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 A N3 C 69 A C 69 1_555 A N1 G 82 A G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 A N4 C 69 A C 69 1_555 A O6 G 82 A G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 A O2 C 69 A C 69 1_555 A N2 G 82 A G 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 A N1 A 70 A A 70 1_555 A N3 U 81 A U 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 A N6 A 70 A A 70 1_555 A O4 U 81 A U 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog90 A N1 G 71 A G 71 1_555 A O2 U 80 A U 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog91 A O6 G 71 A G 71 1_555 A N3 U 80 A U 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 A N3 C 72 A C 72 1_555 A N1 G 79 A G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 A N4 C 72 A C 72 1_555 A O6 G 79 A G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 A O2 C 72 A C 72 1_555 A N2 G 79 A G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 A N1 G 73 A G 73 1_555 A N3 C 78 A C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 A N2 G 73 A G 73 1_555 A O2 C 78 A C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 A O6 G 73 A G 73 1_555 A N4 C 78 A C 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog98 A N2 G 74 A G 74 1_555 A N7 A 77 A A 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C15 H22 N6 O5 S' _chem_comp.formula_weight 398.437 _chem_comp.id SAM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name S-ADENOSYLMETHIONINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA SAM sing 118 n n N HN1 SAM sing 119 n n N HN2 SAM sing 120 n n CA C SAM sing 121 n n CA CB SAM sing 122 n n CA HA SAM sing 123 n n C O SAM doub 124 n n C OXT SAM sing 125 n n CB CG SAM sing 126 n n CB HB1 SAM sing 127 n n CB HB2 SAM sing 128 n n CG SD SAM sing 129 n n CG HG1 SAM sing 130 n n CG HG2 SAM sing 131 n n SD CE SAM sing 132 n n SD C5' SAM sing 133 n n CE HE1 SAM sing 134 n n CE HE2 SAM sing 135 n n CE HE3 SAM sing 136 n n C5' C4' SAM sing 137 n n C5' "H5'1" SAM sing 138 n n C5' "H5'2" SAM sing 139 n n C4' O4' SAM sing 140 n n C4' C3' SAM sing 141 n n C4' H4' SAM sing 142 n n O4' C1' SAM sing 143 n n C3' O3' SAM sing 144 n n C3' C2' SAM sing 145 n n C3' H3' SAM sing 146 n n O3' HO3' SAM sing 147 n n C2' O2' SAM sing 148 n n C2' C1' SAM sing 149 n n C2' H2' SAM sing 150 n n O2' HO2' SAM sing 151 n n C1' N9 SAM sing 152 n n C1' H1' SAM sing 153 n n N9 C8 SAM sing 154 n y N9 C4 SAM sing 155 n y C8 N7 SAM doub 156 n y C8 H8 SAM sing 157 n n N7 C5 SAM sing 158 n y C5 C6 SAM sing 159 n y C5 C4 SAM doub 160 n y C6 N6 SAM sing 161 n n C6 N1 SAM doub 162 n y N6 HN61 SAM sing 163 n n N6 HN62 SAM sing 164 n n N1 C2 SAM sing 165 n y C2 N3 SAM doub 166 n y C2 H2 SAM sing 167 n n N3 C4 SAM sing 168 n y # _atom_sites.entry_id 3GX5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.015946 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015946 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006302 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 SAM A 1 301 301 SAM SAM . C 3 MG A 1 204 204 MG MG . D 3 MG A 1 207 207 MG MG . E 3 MG A 1 208 208 MG MG . F 3 MG A 1 400 400 MG MG . G 3 MG A 1 500 500 MG MG . H 3 MG A 1 600 600 MG MG . I 3 MG A 1 700 700 MG MG . J 3 MG A 1 800 800 MG MG . K 4 K A 1 209 209 K K . L 5 HOH A 1 95 95 HOH HOH . L 5 HOH A 2 96 96 HOH HOH . L 5 HOH A 3 97 97 HOH HOH . L 5 HOH A 4 98 98 HOH HOH . L 5 HOH A 5 99 99 HOH HOH . L 5 HOH A 6 100 100 HOH HOH . L 5 HOH A 7 101 101 HOH HOH . L 5 HOH A 8 102 102 HOH HOH . L 5 HOH A 9 103 103 HOH HOH . L 5 HOH A 10 104 104 HOH HOH . L 5 HOH A 11 105 105 HOH HOH . L 5 HOH A 12 106 106 HOH HOH . L 5 HOH A 13 107 107 HOH HOH . L 5 HOH A 14 108 108 HOH HOH . L 5 HOH A 15 109 109 HOH HOH . L 5 HOH A 16 110 110 HOH HOH . L 5 HOH A 17 111 111 HOH HOH . L 5 HOH A 18 112 112 HOH HOH . L 5 HOH A 19 113 113 HOH HOH . L 5 HOH A 20 114 114 HOH HOH . L 5 HOH A 21 115 115 HOH HOH . L 5 HOH A 22 116 116 HOH HOH . L 5 HOH A 23 117 117 HOH HOH . L 5 HOH A 24 118 118 HOH HOH . L 5 HOH A 25 119 119 HOH HOH . L 5 HOH A 26 120 120 HOH HOH . L 5 HOH A 27 121 121 HOH HOH . L 5 HOH A 28 122 122 HOH HOH . L 5 HOH A 29 123 123 HOH HOH . L 5 HOH A 30 124 124 HOH HOH . L 5 HOH A 31 125 125 HOH HOH . L 5 HOH A 32 126 126 HOH HOH . L 5 HOH A 33 127 127 HOH HOH . L 5 HOH A 34 128 128 HOH HOH . L 5 HOH A 35 129 129 HOH HOH . L 5 HOH A 36 130 130 HOH HOH . L 5 HOH A 37 131 131 HOH HOH . L 5 HOH A 38 132 132 HOH HOH . L 5 HOH A 39 133 133 HOH HOH . L 5 HOH A 40 134 134 HOH HOH . L 5 HOH A 41 135 135 HOH HOH . L 5 HOH A 42 136 136 HOH HOH . L 5 HOH A 43 137 137 HOH HOH . L 5 HOH A 44 138 138 HOH HOH . L 5 HOH A 45 139 139 HOH HOH . L 5 HOH A 46 140 140 HOH HOH . L 5 HOH A 47 141 141 HOH HOH . L 5 HOH A 48 142 142 HOH HOH . L 5 HOH A 49 143 143 HOH HOH . L 5 HOH A 50 144 144 HOH HOH . L 5 HOH A 51 145 145 HOH HOH . L 5 HOH A 52 146 146 HOH HOH . L 5 HOH A 53 147 147 HOH HOH . L 5 HOH A 54 148 148 HOH HOH . L 5 HOH A 55 149 149 HOH HOH . L 5 HOH A 56 150 150 HOH HOH . L 5 HOH A 57 151 151 HOH HOH . L 5 HOH A 58 152 152 HOH HOH . L 5 HOH A 59 153 153 HOH HOH . L 5 HOH A 60 154 154 HOH HOH . L 5 HOH A 61 155 155 HOH HOH . L 5 HOH A 62 156 156 HOH HOH . L 5 HOH A 63 157 157 HOH HOH . L 5 HOH A 64 158 158 HOH HOH . L 5 HOH A 65 159 159 HOH HOH . L 5 HOH A 66 160 160 HOH HOH . L 5 HOH A 67 161 161 HOH HOH . L 5 HOH A 68 162 162 HOH HOH . L 5 HOH A 69 163 163 HOH HOH . L 5 HOH A 70 164 164 HOH HOH . L 5 HOH A 71 165 165 HOH HOH . L 5 HOH A 72 166 166 HOH HOH . L 5 HOH A 73 167 167 HOH HOH . L 5 HOH A 74 168 168 HOH HOH . L 5 HOH A 75 169 169 HOH HOH . L 5 HOH A 76 170 170 HOH HOH . L 5 HOH A 77 171 171 HOH HOH . L 5 HOH A 78 172 172 HOH HOH . L 5 HOH A 79 173 173 HOH HOH . L 5 HOH A 80 401 401 HOH HOH . L 5 HOH A 81 402 402 HOH HOH . L 5 HOH A 82 403 403 HOH HOH . L 5 HOH A 83 404 404 HOH HOH . L 5 HOH A 84 501 501 HOH HOH . L 5 HOH A 85 502 502 HOH HOH . L 5 HOH A 86 503 503 HOH HOH . L 5 HOH A 87 504 504 HOH HOH . L 5 HOH A 88 601 601 HOH HOH . L 5 HOH A 89 602 602 HOH HOH . L 5 HOH A 90 603 603 HOH HOH . L 5 HOH A 91 604 604 HOH HOH . L 5 HOH A 92 701 701 HOH HOH . L 5 HOH A 93 702 702 HOH HOH . L 5 HOH A 94 703 703 HOH HOH . L 5 HOH A 95 704 704 HOH HOH . L 5 HOH A 96 705 705 HOH HOH . L 5 HOH A 97 706 706 HOH HOH . L 5 HOH A 98 801 801 HOH HOH . L 5 HOH A 99 802 802 HOH HOH . L 5 HOH A 100 803 803 HOH HOH . L 5 HOH A 101 804 804 HOH HOH . L 5 HOH A 102 805 805 HOH HOH . L 5 HOH A 103 806 806 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N SAM . . . B 2 13.442 -4.519 10.723 1 38.99 ? N SAM 301 A 1 HETATM 2 C CA SAM . . . B 2 14.054 -5.503 11.618 1 39.75 ? CA SAM 301 A 1 HETATM 3 C C SAM . . . B 2 15.378 -5.083 12.261 1 41.05 ? C SAM 301 A 1 HETATM 4 O O SAM . . . B 2 15.787 -5.709 13.238 1 37.1 ? O SAM 301 A 1 HETATM 5 O OXT SAM . . . B 2 16.055 -4.138 11.847 1 42.17 ? OXT SAM 301 A 1 HETATM 6 C CB SAM . . . B 2 14.199 -6.849 10.928 1 32.71 ? CB SAM 301 A 1 HETATM 7 C CG SAM . . . B 2 12.851 -7.41 10.509 1 34.13 ? CG SAM 301 A 1 HETATM 8 S SD SAM . . . B 2 13.035 -9.068 9.829 1 38.63 ? SD SAM 301 A 1 HETATM 9 C CE SAM . . . B 2 13.965 -9.852 11.163 1 29.15 ? CE SAM 301 A 1 HETATM 10 C C5' SAM . . . B 2 14.376 -8.793 8.648 1 36.75 ? C5' SAM 301 A 1 HETATM 11 C C4' SAM . . . B 2 13.836 -8.282 7.325 1 40.53 ? C4' SAM 301 A 1 HETATM 12 O O4' SAM . . . B 2 13.221 -7.025 7.492 1 37.35 ? O4' SAM 301 A 1 HETATM 13 C C3' SAM . . . B 2 14.925 -8.055 6.295 1 43.26 ? C3' SAM 301 A 1 HETATM 14 O O3' SAM . . . B 2 15.053 -9.221 5.521 1 46.35 ? O3' SAM 301 A 1 HETATM 15 C C2' SAM . . . B 2 14.393 -6.905 5.464 1 41.83 ? C2' SAM 301 A 1 HETATM 16 O O2' SAM . . . B 2 13.843 -7.455 4.288 1 44.78 ? O2' SAM 301 A 1 HETATM 17 C C1' SAM . . . B 2 13.305 -6.244 6.313 1 37.67 ? C1' SAM 301 A 1 HETATM 18 N N9 SAM . . . B 2 13.739 -4.897 6.734 1 34.43 ? N9 SAM 301 A 1 HETATM 19 C C8 SAM . . . B 2 12.975 -3.756 6.73 1 36.79 ? C8 SAM 301 A 1 HETATM 20 N N7 SAM . . . B 2 13.713 -2.73 7.213 1 39.34 ? N7 SAM 301 A 1 HETATM 21 C C5 SAM . . . B 2 14.947 -3.204 7.524 1 40.88 ? C5 SAM 301 A 1 HETATM 22 C C6 SAM . . . B 2 16.089 -2.601 8.047 1 38.3 ? C6 SAM 301 A 1 HETATM 23 N N6 SAM . . . B 2 16.108 -1.3 8.338 1 32.91 ? N6 SAM 301 A 1 HETATM 24 N N1 SAM . . . B 2 17.22 -3.361 8.257 1 36.94 ? N1 SAM 301 A 1 HETATM 25 C C2 SAM . . . B 2 17.228 -4.702 7.959 1 33.31 ? C2 SAM 301 A 1 HETATM 26 N N3 SAM . . . B 2 16.088 -5.286 7.452 1 36.2 ? N3 SAM 301 A 1 HETATM 27 C C4 SAM . . . B 2 14.966 -4.562 7.241 1 36.62 ? C4 SAM 301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 24 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 327 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 27 #