data_3HIX # _model_server_result.job_id lB10Nytp-TnOvNG97o5b1A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 01:00:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3hix # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":205}' # _entry.id 3HIX # _exptl.entry_id 3HIX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 54.938 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MANGANESE (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3HIX _cell.length_a 62.306 _cell.length_b 105.479 _cell.length_c 41.615 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3HIX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,F,I 1 1 B,G,H,J 2 1 C,K 3 1 A,D,E,F,I 4 1 B,G,H,J 4 2 C,K 5 1,3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 1_554 x,y,z-1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 -41.615 3 'crystal symmetry operation' 2_765 -x+2,-y+1,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 124.612 105.479 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ILE 30 A ILE 52 1_555 A N MSE 31 A MSE 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale2 A C MSE 31 A MSE 53 1_555 A N GLY 32 A GLY 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale3 A C ALA 33 A ALA 55 1_555 A N MSE 34 A MSE 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale4 A C MSE 34 A MSE 56 1_555 A N ALA 35 A ALA 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale5 A C ALA 35 A ALA 57 1_555 A N MSE 36 A MSE 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale6 A C MSE 36 A MSE 58 1_555 A N PRO 37 A PRO 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale7 B C ILE 30 B ILE 52 1_555 B N MSE 31 B MSE 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale8 B C MSE 31 B MSE 53 1_555 B N GLY 32 B GLY 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale9 B C ALA 33 B ALA 55 1_555 B N MSE 34 B MSE 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale10 B C MSE 34 B MSE 56 1_555 B N ALA 35 B ALA 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale11 B C ALA 35 B ALA 57 1_555 B N MSE 36 B MSE 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale12 B C MSE 36 B MSE 58 1_555 B N PRO 37 B PRO 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale13 C C ILE 30 C ILE 52 1_555 C N MSE 31 C MSE 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale14 C C MSE 31 C MSE 53 1_555 C N GLY 32 C GLY 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale15 C C ALA 33 C ALA 55 1_555 C N MSE 34 C MSE 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale16 C C MSE 34 C MSE 56 1_555 C N ALA 35 C ALA 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale17 C C ALA 35 C ALA 57 1_555 C N MSE 36 C MSE 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale18 C C MSE 36 C MSE 58 1_555 C N PRO 37 C PRO 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 27 A ASP 49 1_555 D MN MN . A MN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? metalc ? metalc2 D MN MN . A MN 201 1_555 I O HOH . A HOH 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc3 D MN MN . A MN 201 1_555 I O HOH . A HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc4 D MN MN . A MN 201 1_555 I O HOH . A HOH 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc5 B OD1 ASP 27 B ASP 49 1_555 H MN MN . B MN 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? # _chem_comp.formula 'Mn 2' _chem_comp.formula_weight 54.938 _chem_comp.id MN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MANGANESE (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3HIX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01605 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009481 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.02403 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 MN A 1 201 201 MN MN . E 2 MN A 1 202 202 MN MN . F 2 MN A 1 204 204 MN MN . G 2 MN B 1 203 203 MN MN . H 2 MN B 1 205 205 MN MN . I 3 HOH A 1 306 306 HOH WAT . I 3 HOH A 2 308 308 HOH WAT . I 3 HOH A 3 309 309 HOH WAT . I 3 HOH A 4 310 310 HOH WAT . I 3 HOH A 5 311 311 HOH WAT . I 3 HOH A 6 312 312 HOH WAT . I 3 HOH A 7 318 318 HOH WAT . I 3 HOH A 8 319 319 HOH WAT . I 3 HOH A 9 325 325 HOH WAT . I 3 HOH A 10 327 327 HOH WAT . I 3 HOH A 11 328 328 HOH WAT . I 3 HOH A 12 335 335 HOH WAT . I 3 HOH A 13 337 337 HOH WAT . I 3 HOH A 14 338 338 HOH WAT . I 3 HOH A 15 340 340 HOH WAT . I 3 HOH A 16 342 342 HOH WAT . I 3 HOH A 17 343 343 HOH WAT . I 3 HOH A 18 345 345 HOH WAT . I 3 HOH A 19 346 346 HOH WAT . I 3 HOH A 20 347 347 HOH WAT . I 3 HOH A 21 349 349 HOH WAT . I 3 HOH A 22 355 355 HOH WAT . I 3 HOH A 23 356 356 HOH WAT . I 3 HOH A 24 357 357 HOH WAT . I 3 HOH A 25 359 359 HOH WAT . I 3 HOH A 26 364 364 HOH WAT . I 3 HOH A 27 365 365 HOH WAT . I 3 HOH A 28 368 368 HOH WAT . I 3 HOH A 29 370 370 HOH WAT . I 3 HOH A 30 376 376 HOH WAT . I 3 HOH A 31 383 383 HOH WAT . I 3 HOH A 32 386 386 HOH WAT . I 3 HOH A 33 387 387 HOH WAT . I 3 HOH A 34 392 392 HOH WAT . I 3 HOH A 35 396 396 HOH WAT . I 3 HOH A 36 400 400 HOH WAT . I 3 HOH A 37 402 402 HOH WAT . I 3 HOH A 38 403 403 HOH WAT . I 3 HOH A 39 407 407 HOH WAT . I 3 HOH A 40 409 409 HOH WAT . I 3 HOH A 41 410 410 HOH WAT . I 3 HOH A 42 413 413 HOH WAT . I 3 HOH A 43 414 414 HOH WAT . I 3 HOH A 44 417 417 HOH WAT . I 3 HOH A 45 418 418 HOH WAT . I 3 HOH A 46 419 419 HOH WAT . I 3 HOH A 47 431 431 HOH WAT . I 3 HOH A 48 432 432 HOH WAT . I 3 HOH A 49 433 433 HOH WAT . I 3 HOH A 50 436 436 HOH WAT . I 3 HOH A 51 437 437 HOH WAT . I 3 HOH A 52 438 438 HOH WAT . I 3 HOH A 53 440 440 HOH WAT . I 3 HOH A 54 442 442 HOH WAT . I 3 HOH A 55 444 444 HOH WAT . I 3 HOH A 56 451 451 HOH WAT . I 3 HOH A 57 453 453 HOH WAT . I 3 HOH A 58 454 454 HOH WAT . I 3 HOH A 59 460 460 HOH WAT . I 3 HOH A 60 462 462 HOH WAT . I 3 HOH A 61 467 467 HOH WAT . I 3 HOH A 62 471 471 HOH WAT . I 3 HOH A 63 476 476 HOH WAT . I 3 HOH A 64 487 487 HOH WAT . I 3 HOH A 65 489 489 HOH WAT . I 3 HOH A 66 491 491 HOH WAT . I 3 HOH A 67 492 492 HOH WAT . I 3 HOH A 68 497 497 HOH WAT . I 3 HOH A 69 498 498 HOH WAT . I 3 HOH A 70 500 500 HOH WAT . I 3 HOH A 71 502 502 HOH WAT . I 3 HOH A 72 503 503 HOH WAT . I 3 HOH A 73 504 504 HOH WAT . I 3 HOH A 74 510 510 HOH WAT . I 3 HOH A 75 511 511 HOH WAT . I 3 HOH A 76 512 512 HOH WAT . I 3 HOH A 77 515 515 HOH WAT . J 3 HOH B 1 313 313 HOH WAT . J 3 HOH B 2 315 315 HOH WAT . J 3 HOH B 3 317 317 HOH WAT . J 3 HOH B 4 321 321 HOH WAT . J 3 HOH B 5 322 322 HOH WAT . J 3 HOH B 6 323 323 HOH WAT . J 3 HOH B 7 326 326 HOH WAT . J 3 HOH B 8 332 332 HOH WAT . J 3 HOH B 9 334 334 HOH WAT . J 3 HOH B 10 339 339 HOH WAT . J 3 HOH B 11 352 352 HOH WAT . J 3 HOH B 12 361 361 HOH WAT . J 3 HOH B 13 362 362 HOH WAT . J 3 HOH B 14 369 369 HOH WAT . J 3 HOH B 15 371 371 HOH WAT . J 3 HOH B 16 372 372 HOH WAT . J 3 HOH B 17 373 373 HOH WAT . J 3 HOH B 18 375 375 HOH WAT . J 3 HOH B 19 377 377 HOH WAT . J 3 HOH B 20 378 378 HOH WAT . J 3 HOH B 21 381 381 HOH WAT . J 3 HOH B 22 382 382 HOH WAT . J 3 HOH B 23 390 390 HOH WAT . J 3 HOH B 24 398 398 HOH WAT . J 3 HOH B 25 404 404 HOH WAT . J 3 HOH B 26 405 405 HOH WAT . J 3 HOH B 27 408 408 HOH WAT . J 3 HOH B 28 411 411 HOH WAT . J 3 HOH B 29 416 416 HOH WAT . J 3 HOH B 30 420 420 HOH WAT . J 3 HOH B 31 421 421 HOH WAT . J 3 HOH B 32 422 422 HOH WAT . J 3 HOH B 33 430 430 HOH WAT . J 3 HOH B 34 439 439 HOH WAT . J 3 HOH B 35 445 445 HOH WAT . J 3 HOH B 36 446 446 HOH WAT . J 3 HOH B 37 448 448 HOH WAT . J 3 HOH B 38 452 452 HOH WAT . J 3 HOH B 39 456 456 HOH WAT . J 3 HOH B 40 457 457 HOH WAT . J 3 HOH B 41 458 458 HOH WAT . J 3 HOH B 42 464 464 HOH WAT . J 3 HOH B 43 466 466 HOH WAT . J 3 HOH B 44 472 472 HOH WAT . J 3 HOH B 45 477 477 HOH WAT . J 3 HOH B 46 479 479 HOH WAT . J 3 HOH B 47 481 481 HOH WAT . J 3 HOH B 48 485 485 HOH WAT . J 3 HOH B 49 496 496 HOH WAT . K 3 HOH C 1 301 301 HOH WAT . K 3 HOH C 2 303 303 HOH WAT . K 3 HOH C 3 304 304 HOH WAT . K 3 HOH C 4 305 305 HOH WAT . K 3 HOH C 5 307 307 HOH WAT . K 3 HOH C 6 314 314 HOH WAT . K 3 HOH C 7 316 316 HOH WAT . K 3 HOH C 8 320 320 HOH WAT . K 3 HOH C 9 324 324 HOH WAT . K 3 HOH C 10 329 329 HOH WAT . K 3 HOH C 11 330 330 HOH WAT . K 3 HOH C 12 331 331 HOH WAT . K 3 HOH C 13 333 333 HOH WAT . K 3 HOH C 14 336 336 HOH WAT . K 3 HOH C 15 341 341 HOH WAT . K 3 HOH C 16 344 344 HOH WAT . K 3 HOH C 17 348 348 HOH WAT . K 3 HOH C 18 350 350 HOH WAT . K 3 HOH C 19 351 351 HOH WAT . K 3 HOH C 20 353 353 HOH WAT . K 3 HOH C 21 354 354 HOH WAT . K 3 HOH C 22 358 358 HOH WAT . K 3 HOH C 23 360 360 HOH WAT . K 3 HOH C 24 363 363 HOH WAT . K 3 HOH C 25 366 366 HOH WAT . K 3 HOH C 26 367 367 HOH WAT . K 3 HOH C 27 374 374 HOH WAT . K 3 HOH C 28 379 379 HOH WAT . K 3 HOH C 29 380 380 HOH WAT . K 3 HOH C 30 384 384 HOH WAT . K 3 HOH C 31 385 385 HOH WAT . K 3 HOH C 32 388 388 HOH WAT . K 3 HOH C 33 389 389 HOH WAT . K 3 HOH C 34 391 391 HOH WAT . K 3 HOH C 35 393 393 HOH WAT . K 3 HOH C 36 394 394 HOH WAT . K 3 HOH C 37 395 395 HOH WAT . K 3 HOH C 38 397 397 HOH WAT . K 3 HOH C 39 399 399 HOH WAT . K 3 HOH C 40 401 401 HOH WAT . K 3 HOH C 41 406 406 HOH WAT . K 3 HOH C 42 412 412 HOH WAT . K 3 HOH C 43 415 415 HOH WAT . K 3 HOH C 44 423 423 HOH WAT . K 3 HOH C 45 425 425 HOH WAT . K 3 HOH C 46 426 426 HOH WAT . K 3 HOH C 47 427 427 HOH WAT . K 3 HOH C 48 428 428 HOH WAT . K 3 HOH C 49 429 429 HOH WAT . K 3 HOH C 50 434 434 HOH WAT . K 3 HOH C 51 435 435 HOH WAT . K 3 HOH C 52 441 441 HOH WAT . K 3 HOH C 53 447 447 HOH WAT . K 3 HOH C 54 449 449 HOH WAT . K 3 HOH C 55 450 450 HOH WAT . K 3 HOH C 56 455 455 HOH WAT . K 3 HOH C 57 459 459 HOH WAT . K 3 HOH C 58 463 463 HOH WAT . K 3 HOH C 59 465 465 HOH WAT . K 3 HOH C 60 470 470 HOH WAT . K 3 HOH C 61 473 473 HOH WAT . K 3 HOH C 62 474 474 HOH WAT . K 3 HOH C 63 475 475 HOH WAT . K 3 HOH C 64 478 478 HOH WAT . K 3 HOH C 65 480 480 HOH WAT . K 3 HOH C 66 482 482 HOH WAT . K 3 HOH C 67 484 484 HOH WAT . K 3 HOH C 68 486 486 HOH WAT . K 3 HOH C 69 490 490 HOH WAT . K 3 HOH C 70 493 493 HOH WAT . K 3 HOH C 71 494 494 HOH WAT . K 3 HOH C 72 495 495 HOH WAT . K 3 HOH C 73 499 499 HOH WAT . K 3 HOH C 74 505 505 HOH WAT . K 3 HOH C 75 507 507 HOH WAT . K 3 HOH C 76 508 508 HOH WAT . K 3 HOH C 77 509 509 HOH WAT . K 3 HOH C 78 513 513 HOH WAT . K 3 HOH C 79 514 514 HOH WAT . K 3 HOH C 80 516 516 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MN _atom_site.label_atom_id MN _atom_site.label_comp_id MN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 37.054 _atom_site.Cartn_y 29.939 _atom_site.Cartn_z 8.77 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 23.67 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MN _atom_site.auth_comp_id MN _atom_site.auth_seq_id 205 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 61 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #