data_3HWX
#
_model_server_result.job_id            Zxxb1vxTdxHTdkipaebxVw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-01 10:36:58' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3hwx 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":558}' 
#
_entry.id    3HWX 
#
_exptl.entry_id    3HWX 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    15 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         75.99 
_cell.angle_beta          83 
_cell.angle_gamma         64.15 
_cell.entry_id            3HWX 
_cell.length_a            90.353 
_cell.length_b            90.463 
_cell.length_c            169.17 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3HWX 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 
PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 5 
PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 6 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,I,J,K,L,M,N,O,PA,QA 1 1 
C,D,P,Q,R,S,T,U,V,W,RA,SA 2 1 
E,F,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,TA,UA 3 1 
G,H,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,VA,WA 4 1 
A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,PA,QA,RA,SA 5 1 
E,F,G,H,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,TA,UA,VA,WA 6 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 M N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 X N N 
? 2 Y N N 
? 2 Z N N 
? 2 CA N N 
? 2 DA N N 
? 2 EA N N 
? 2 JA N N 
? 2 KA N N 
? 2 NA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASN 469 A ASN 469 1_555 L MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc2 A O GLY 471 A GLY 471 1_555 L MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.876 ? 
metalc ? metalc3 K O2A TPP . A TPP 601 1_555 L MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.797 ? 
metalc ? metalc4 K O3B TPP . A TPP 601 1_555 L MG MG . A MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? 
metalc ? metalc5 L MG MG . A MG 602 1_555 PA O HOH . A HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc6 B OD1 ASP 442 B ASP 442 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? 
metalc ? metalc7 B OD1 ASN 469 B ASN 469 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? 
metalc ? metalc8 B O GLY 471 B GLY 471 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.932 ? 
metalc ? metalc9 N O1A TPP . B TPP 601 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc10 N O1B TPP . B TPP 601 1_555 O MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.936 ? 
metalc ? metalc11 C OD1 ASN 469 I ASN 469 1_555 T MG MG . I MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? 
metalc ? metalc12 C O GLY 471 I GLY 471 1_555 T MG MG . I MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
metalc ? metalc13 S O2A TPP . I TPP 601 1_555 T MG MG . I MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.94 ? 
metalc ? metalc14 S O3B TPP . I TPP 601 1_555 T MG MG . I MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? 
metalc ? metalc15 D OD1 ASP 442 J ASP 442 1_555 W MG MG . J MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc16 D OD1 ASN 469 J ASN 469 1_555 W MG MG . J MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.83 ? 
metalc ? metalc17 D O GLY 471 J GLY 471 1_555 W MG MG . J MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.984 ? 
metalc ? metalc18 V O1A TPP . J TPP 601 1_555 W MG MG . J MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc19 V O1B TPP . J TPP 601 1_555 W MG MG . J MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.928 ? 
metalc ? metalc20 E OD1 ASP 442 R ASP 442 1_555 BA MG MG . R MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? 
metalc ? metalc21 E OD1 ASN 469 R ASN 469 1_555 BA MG MG . R MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc22 E O GLY 471 R GLY 471 1_555 BA MG MG . R MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.942 ? 
metalc ? metalc23 AA O2A TPP . R TPP 601 1_555 BA MG MG . R MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? 
metalc ? metalc24 AA O3B TPP . R TPP 601 1_555 BA MG MG . R MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.883 ? 
metalc ? metalc25 F OD1 ASP 442 S ASP 442 1_555 GA MG MG . S MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc26 F OD1 ASN 469 S ASN 469 1_555 GA MG MG . S MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? 
metalc ? metalc27 F O GLY 471 S GLY 471 1_555 GA MG MG . S MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? 
metalc ? metalc28 FA O1A TPP . S TPP 601 1_555 GA MG MG . S MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc29 FA O1B TPP . S TPP 601 1_555 GA MG MG . S MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.819 ? 
metalc ? metalc30 G OD1 ASP 442 Z ASP 442 1_555 IA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? 
metalc ? metalc31 G OD1 ASN 469 Z ASN 469 1_555 IA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? 
metalc ? metalc32 G O GLY 471 Z GLY 471 1_555 IA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc33 HA O2A TPP . Z TPP 601 1_555 IA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc34 HA O3B TPP . Z TPP 601 1_555 IA MG MG . Z MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? 
metalc ? metalc35 IA MG MG . Z MG 602 1_555 VA O HOH . Z HOH 876 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? 
metalc ? metalc36 H O GLY 471 1 GLY 471 1_555 MA MG MG . 1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? 
metalc ? metalc37 LA O1A TPP . 1 TPP 601 1_555 MA MG MG . 1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc38 LA O1B TPP . 1 TPP 601 1_555 MA MG MG . 1 MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.888 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3HWX 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011068 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    -0.005362 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    -0.00023 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012283 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    -0.002659 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006094 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 2 NA A 1 557 557 NA NA . 
J 2 NA A 1 558 558 NA NA . 
K 3 TPP A 1 601 601 TPP TPP . 
L 4 MG A 1 602 602 MG MG . 
M 2 NA B 1 557 557 NA NA . 
N 3 TPP B 1 601 601 TPP TPP . 
O 4 MG B 1 602 602 MG MG . 
P 2 NA I 1 557 557 NA NA . 
Q 2 NA I 1 558 558 NA NA . 
R 2 NA I 1 559 559 NA NA . 
S 3 TPP I 1 601 601 TPP TPP . 
T 4 MG I 1 602 602 MG MG . 
U 5 GOL J 1 557 557 GOL GOL . 
V 3 TPP J 1 601 601 TPP TPP . 
W 4 MG J 1 602 602 MG MG . 
X 2 NA R 1 557 557 NA NA . 
Y 2 NA R 1 558 558 NA NA . 
Z 2 NA R 1 559 559 NA NA . 
AA 3 TPP R 1 601 601 TPP TPP . 
BA 4 MG R 1 602 602 MG MG . 
CA 2 NA S 1 557 557 NA NA . 
DA 2 NA S 1 558 558 NA NA . 
EA 2 NA S 1 559 559 NA NA . 
FA 3 TPP S 1 601 601 TPP TPP . 
GA 4 MG S 1 602 602 MG MG . 
HA 3 TPP Z 1 601 601 TPP TPP . 
IA 4 MG Z 1 602 602 MG MG . 
JA 2 NA Z 1 557 557 NA NA . 
KA 2 NA Z 1 558 558 NA NA . 
LA 3 TPP 1 1 601 601 TPP TPP . 
MA 4 MG 1 1 602 602 MG MG . 
NA 2 NA 1 1 557 557 NA NA . 
OA 5 GOL 1 1 558 558 GOL GOL . 
PA 6 HOH A 1 559 559 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 2 560 560 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 3 561 561 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 4 562 562 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 5 563 563 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 6 564 564 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 7 565 565 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 8 566 566 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 9 567 567 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 10 568 568 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 11 569 569 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 12 613 613 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 13 634 634 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 14 637 637 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 15 640 640 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 16 642 642 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 17 659 659 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 18 694 694 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 19 697 697 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 20 700 700 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 21 702 702 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 22 707 707 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 23 714 714 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 24 720 720 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 25 737 737 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 26 739 739 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 27 740 740 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 28 750 750 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 29 755 755 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 30 760 760 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 31 769 769 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 32 770 770 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 33 771 771 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 34 785 785 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 35 786 786 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 36 799 799 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 37 809 809 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 38 815 815 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 39 825 825 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 40 830 830 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 41 842 842 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 42 843 843 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 43 867 867 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 44 887 887 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 45 893 893 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 46 895 895 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 47 896 896 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 48 897 897 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 49 915 915 HOH HOH . 
PA 6 HOH A 50 917 917 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 1 558 558 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 2 559 559 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 3 560 560 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 4 561 561 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 5 562 562 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 6 563 563 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 7 564 564 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 8 565 565 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 9 566 566 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 10 567 567 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 11 568 568 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 12 569 569 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 13 570 570 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 14 571 571 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 15 573 573 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 16 574 574 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 17 575 575 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 18 576 576 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 19 577 577 HOH HOH . 
QA 6 HOH B 20 578 578 HOH HOH . 
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