data_3HZI # _model_server_result.job_id 8en7LTECRFxzcVVPfzVwTw _model_server_result.datetime_utc '2025-03-06 07:37:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3hzi # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":878}' # _entry.id 3HZI # _exptl.entry_id 3HZI _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3HZI _cell.length_a 167.25 _cell.length_b 167.25 _cell.length_c 62.37 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3HZI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 89 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 4 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 5_655 -x+1,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 167.25 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 F N N ? 5 G N N ? 5 H N N ? 5 I N N ? 5 J N N ? 5 K N N ? 5 L N N ? 5 M N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C GLY 139 A GLY 139 1_555 A N MSE 140 A MSE 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale2 A C MSE 140 A MSE 140 1_555 A N ILE 141 A ILE 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale3 A C LEU 282 A LEU 282 1_555 A N MSE 283 A MSE 283 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale4 A C MSE 283 A MSE 283 1_555 A N GLY 284 A GLY 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale5 A C ARG 397 A ARG 397 1_555 A N MSE 398 A MSE 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale6 A C MSE 398 A MSE 398 1_555 A N ILE 399 A ILE 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N3 DC 2 T DC 700 1_555 C N1 DG 21 T DG 719 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N4 DC 2 T DC 700 1_555 C O6 DG 21 T DG 719 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C O2 DC 2 T DC 700 1_555 C N2 DG 21 T DG 719 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DA PAIR' hydrog4 C N3 DT 3 T DT 701 1_555 C N1 DA 20 T DA 718 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N1 DA 4 T DA 702 1_555 C N3 DT 19 T DT 717 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N6 DA 4 T DA 702 1_555 C O4 DT 19 T DT 717 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C N3 DT 5 T DT 703 1_555 C N1 DA 18 T DA 716 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C O4 DT 5 T DT 703 1_555 C N6 DA 18 T DA 716 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N3 DC 6 T DC 704 1_555 C N1 DG 17 T DG 715 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N4 DC 6 T DC 704 1_555 C O6 DG 17 T DG 715 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C O2 DC 6 T DC 704 1_555 C N2 DG 17 T DG 715 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N3 DC 7 T DC 705 1_555 C N1 DG 16 T DG 714 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N4 DC 7 T DC 705 1_555 C O6 DG 16 T DG 714 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O2 DC 7 T DC 705 1_555 C N2 DG 16 T DG 714 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog15 C O2 DC 8 T DC 706 1_555 C N1 DG 15 T DG 713 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N3 DC 9 T DC 707 1_555 C N1 DG 14 T DG 712 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N4 DC 9 T DC 707 1_555 C O6 DG 14 T DG 712 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C O2 DC 9 T DC 707 1_555 C N2 DG 14 T DG 712 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N3 DT 10 T DT 708 1_555 C N1 DA 13 T DA 711 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C O4 DT 10 T DT 708 1_555 C N6 DA 13 T DA 711 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N3 DT 11 T DT 709 1_555 C N1 DA 12 T DA 710 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C O4 DT 11 T DT 709 1_555 C N6 DA 12 T DA 710 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N1 DA 12 T DA 710 1_555 C N3 DT 11 T DT 709 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N6 DA 12 T DA 710 1_555 C O4 DT 11 T DT 709 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C N1 DA 13 T DA 711 1_555 C N3 DT 10 T DT 708 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N6 DA 13 T DA 711 1_555 C O4 DT 10 T DT 708 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N1 DG 14 T DG 712 1_555 C N3 DC 9 T DC 707 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 C N2 DG 14 T DG 712 1_555 C O2 DC 9 T DC 707 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C O6 DG 14 T DG 712 1_555 C N4 DC 9 T DC 707 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog30 C N1 DG 15 T DG 713 1_555 C O2 DC 8 T DC 706 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C N1 DG 16 T DG 714 1_555 C N3 DC 7 T DC 705 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N2 DG 16 T DG 714 1_555 C O2 DC 7 T DC 705 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C O6 DG 16 T DG 714 1_555 C N4 DC 7 T DC 705 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N1 DG 17 T DG 715 1_555 C N3 DC 6 T DC 704 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N2 DG 17 T DG 715 1_555 C O2 DC 6 T DC 704 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C O6 DG 17 T DG 715 1_555 C N4 DC 6 T DC 704 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N1 DA 18 T DA 716 1_555 C N3 DT 5 T DT 703 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C N6 DA 18 T DA 716 1_555 C O4 DT 5 T DT 703 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N3 DT 19 T DT 717 1_555 C N1 DA 4 T DA 702 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C O4 DT 19 T DT 717 1_555 C N6 DA 4 T DA 702 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DA-DT PAIR' hydrog41 C N1 DA 20 T DA 718 1_555 C N3 DT 3 T DT 701 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C N1 DG 21 T DG 719 1_555 C N3 DC 2 T DC 700 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 C N2 DG 21 T DG 719 1_555 C O2 DC 2 T DC 700 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 C O6 DG 21 T DG 719 1_555 C N4 DC 2 T DC 700 5_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 507 n n S O2 SO4 doub 508 n n S O3 SO4 sing 509 n n S O4 SO4 sing 510 n n # _atom_sites.entry_id 3HZI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005979 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005979 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016033 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 ATP A 1 500 500 ATP ATP . E 5 SO4 A 1 837 837 SO4 SO4 . F 5 SO4 A 1 838 838 SO4 SO4 . G 5 SO4 A 1 834 834 SO4 SO4 . H 5 SO4 A 1 833 833 SO4 SO4 . I 5 SO4 A 1 835 835 SO4 SO4 . J 5 SO4 A 1 836 836 SO4 SO4 . K 5 SO4 A 1 878 878 SO4 SO4 . L 5 SO4 A 1 879 879 SO4 SO4 . M 5 SO4 B 1 640 640 SO4 SO4 . N 6 HOH A 1 441 418 HOH TIP . N 6 HOH A 2 442 407 HOH TIP . N 6 HOH A 3 443 427 HOH TIP . N 6 HOH A 4 514 514 HOH TIP . O 6 HOH T 1 433 433 HOH TIP . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . K 5 65.383 146.645 -20.968 1 129.7 ? S SO4 878 A 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . K 5 66.051 146.98 -22.237 1 126.73 ? O1 SO4 878 A 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . K 5 65.922 145.384 -20.39 1 121.32 ? O2 SO4 878 A 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . K 5 65.526 147.768 -20.014 1 125.35 ? O3 SO4 878 A 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . K 5 63.969 146.488 -21.323 1 122.41 ? O4 SO4 878 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 78 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 314 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 5 #