data_3J6G
#
_model_server_result.job_id            V3zUqJKU2VPuYz86pLBt5g 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-02-05 11:00:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3j6g 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"UA","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    3J6G 
#
_exptl.entry_id    3J6G 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3J6G 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               1 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3J6G 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    octadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      18 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 S N N 
? 3 W N N 
? 3 AA N N 
? 3 EA N N 
? 3 IA N N 
? 3 MA N N 
? 3 QA N N 
? 3 UA N N 
? 3 YA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 S O1G GTP . A GTP 501 1_555 T MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc2 T MG MG . A MG 502 1_555 CB O HOH . A HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc3 T MG MG . A MG 502 1_555 CB O HOH . A HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc4 T MG MG . A MG 502 1_555 CB O HOH . A HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc5 T MG MG . A MG 502 1_555 CB O HOH . A HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc6 W O1G GTP . C GTP 501 1_555 X MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc7 X MG MG . C MG 502 1_555 DB O HOH . C HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc8 X MG MG . C MG 502 1_555 DB O HOH . C HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc9 X MG MG . C MG 502 1_555 DB O HOH . C HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc10 X MG MG . C MG 502 1_555 DB O HOH . C HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc11 AA O1G GTP . E GTP 501 1_555 BA MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc12 BA MG MG . E MG 502 1_555 EB O HOH . E HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc13 BA MG MG . E MG 502 1_555 EB O HOH . E HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc14 BA MG MG . E MG 502 1_555 EB O HOH . E HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc15 BA MG MG . E MG 502 1_555 EB O HOH . E HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc16 EA O1G GTP . G GTP 501 1_555 FA MG MG . G MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc17 FA MG MG . G MG 502 1_555 FB O HOH . G HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc18 FA MG MG . G MG 502 1_555 FB O HOH . G HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc19 FA MG MG . G MG 502 1_555 FB O HOH . G HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc20 FA MG MG . G MG 502 1_555 FB O HOH . G HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc21 IA O1G GTP . I GTP 501 1_555 JA MG MG . I MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc22 JA MG MG . I MG 502 1_555 GB O HOH . I HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc23 JA MG MG . I MG 502 1_555 GB O HOH . I HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc24 JA MG MG . I MG 502 1_555 GB O HOH . I HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc25 JA MG MG . I MG 502 1_555 GB O HOH . I HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc26 MA O1G GTP . K GTP 501 1_555 NA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc27 NA MG MG . K MG 502 1_555 HB O HOH . K HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc28 NA MG MG . K MG 502 1_555 HB O HOH . K HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc29 NA MG MG . K MG 502 1_555 HB O HOH . K HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc30 NA MG MG . K MG 502 1_555 HB O HOH . K HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc31 QA O1G GTP . M GTP 501 1_555 RA MG MG . M MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc32 RA MG MG . M MG 502 1_555 IB O HOH . M HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc33 RA MG MG . M MG 502 1_555 IB O HOH . M HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc34 RA MG MG . M MG 502 1_555 IB O HOH . M HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc35 RA MG MG . M MG 502 1_555 IB O HOH . M HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? 
metalc ? metalc36 UA O1G GTP . O GTP 501 1_555 VA MG MG . O MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc37 VA MG MG . O MG 502 1_555 JB O HOH . O HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc38 VA MG MG . O MG 502 1_555 JB O HOH . O HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc39 VA MG MG . O MG 502 1_555 JB O HOH . O HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc40 VA MG MG . O MG 502 1_555 JB O HOH . O HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc41 YA O1G GTP . Q GTP 501 1_555 ZA MG MG . Q MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc42 ZA MG MG . Q MG 502 1_555 KB O HOH . Q HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc43 ZA MG MG . Q MG 502 1_555 KB O HOH . Q HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc44 ZA MG MG . Q MG 502 1_555 KB O HOH . Q HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc45 ZA MG MG . Q MG 502 1_555 KB O HOH . Q HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 174 n n 
PG O2G GTP sing 175 n n 
PG O3G GTP sing 176 n n 
PG O3B GTP sing 177 n n 
O2G HOG2 GTP sing 178 n n 
O3G HOG3 GTP sing 179 n n 
O3B PB GTP sing 180 n n 
PB O1B GTP doub 181 n n 
PB O2B GTP sing 182 n n 
PB O3A GTP sing 183 n n 
O2B HOB2 GTP sing 184 n n 
O3A PA GTP sing 185 n n 
PA O1A GTP doub 186 n n 
PA O2A GTP sing 187 n n 
PA O5' GTP sing 188 n n 
O2A HOA2 GTP sing 189 n n 
O5' C5' GTP sing 190 n n 
C5' C4' GTP sing 191 n n 
C5' H5' GTP sing 192 n n 
C5' "H5''" GTP sing 193 n n 
C4' O4' GTP sing 194 n n 
C4' C3' GTP sing 195 n n 
C4' H4' GTP sing 196 n n 
O4' C1' GTP sing 197 n n 
C3' O3' GTP sing 198 n n 
C3' C2' GTP sing 199 n n 
C3' H3' GTP sing 200 n n 
O3' HO3' GTP sing 201 n n 
C2' O2' GTP sing 202 n n 
C2' C1' GTP sing 203 n n 
C2' H2' GTP sing 204 n n 
O2' HO2' GTP sing 205 n n 
C1' N9 GTP sing 206 n n 
C1' H1' GTP sing 207 n n 
N9 C8 GTP sing 208 n y 
N9 C4 GTP sing 209 n y 
C8 N7 GTP doub 210 n y 
C8 H8 GTP sing 211 n n 
N7 C5 GTP sing 212 n y 
C5 C6 GTP sing 213 n n 
C5 C4 GTP doub 214 n y 
C6 O6 GTP doub 215 n n 
C6 N1 GTP sing 216 n n 
N1 C2 GTP sing 217 n n 
N1 HN1 GTP sing 218 n n 
C2 N2 GTP sing 219 n n 
C2 N3 GTP doub 220 n n 
N2 HN21 GTP sing 221 n n 
N2 HN22 GTP sing 222 n n 
N3 C4 GTP sing 223 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3J6G 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
S 3 GTP A 1 501 857 GTP GTP . 
T 4 MG A 1 502 862 MG MG . 
U 5 GDP B 1 501 863 GDP GDP . 
V 6 TA1 B 1 502 864 TA1 TA1 . 
W 3 GTP C 1 501 865 GTP GTP . 
X 4 MG C 1 502 870 MG MG . 
Y 5 GDP D 1 501 871 GDP GDP . 
Z 6 TA1 D 1 502 872 TA1 TA1 . 
AA 3 GTP E 1 501 873 GTP GTP . 
BA 4 MG E 1 502 878 MG MG . 
CA 5 GDP F 1 501 879 GDP GDP . 
DA 6 TA1 F 1 502 880 TA1 TA1 . 
EA 3 GTP G 1 501 881 GTP GTP . 
FA 4 MG G 1 502 886 MG MG . 
GA 5 GDP H 1 501 887 GDP GDP . 
HA 6 TA1 H 1 502 888 TA1 TA1 . 
IA 3 GTP I 1 501 889 GTP GTP . 
JA 4 MG I 1 502 894 MG MG . 
KA 5 GDP J 1 501 895 GDP GDP . 
LA 6 TA1 J 1 502 896 TA1 TA1 . 
MA 3 GTP K 1 501 897 GTP GTP . 
NA 4 MG K 1 502 902 MG MG . 
OA 5 GDP L 1 501 903 GDP GDP . 
PA 6 TA1 L 1 502 904 TA1 TA1 . 
QA 3 GTP M 1 501 905 GTP GTP . 
RA 4 MG M 1 502 910 MG MG . 
SA 5 GDP N 1 501 911 GDP GDP . 
TA 6 TA1 N 1 502 912 TA1 TA1 . 
UA 3 GTP O 1 501 913 GTP GTP . 
VA 4 MG O 1 502 918 MG MG . 
WA 5 GDP P 1 501 919 GDP GDP . 
XA 6 TA1 P 1 502 920 TA1 TA1 . 
YA 3 GTP Q 1 501 921 GTP GTP . 
ZA 4 MG Q 1 502 926 MG MG . 
AB 5 GDP R 1 501 927 GDP GDP . 
BB 6 TA1 R 1 502 928 TA1 TA1 . 
CB 7 HOH A 1 601 858 HOH HOH . 
CB 7 HOH A 2 602 859 HOH HOH . 
CB 7 HOH A 3 603 860 HOH HOH . 
CB 7 HOH A 4 604 861 HOH HOH . 
DB 7 HOH C 1 601 866 HOH HOH . 
DB 7 HOH C 2 602 867 HOH HOH . 
DB 7 HOH C 3 603 868 HOH HOH . 
DB 7 HOH C 4 604 869 HOH HOH . 
EB 7 HOH E 1 601 874 HOH HOH . 
EB 7 HOH E 2 602 875 HOH HOH . 
EB 7 HOH E 3 603 876 HOH HOH . 
EB 7 HOH E 4 604 877 HOH HOH . 
FB 7 HOH G 1 601 882 HOH HOH . 
FB 7 HOH G 2 602 883 HOH HOH . 
FB 7 HOH G 3 603 884 HOH HOH . 
FB 7 HOH G 4 604 885 HOH HOH . 
GB 7 HOH I 1 601 890 HOH HOH . 
GB 7 HOH I 2 602 891 HOH HOH . 
GB 7 HOH I 3 603 892 HOH HOH . 
GB 7 HOH I 4 604 893 HOH HOH . 
HB 7 HOH K 1 601 898 HOH HOH . 
HB 7 HOH K 2 602 899 HOH HOH . 
HB 7 HOH K 3 603 900 HOH HOH . 
HB 7 HOH K 4 604 901 HOH HOH . 
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