data_3JAL
#
_model_server_result.job_id            x9G9oALrvIhPxKqNSnij5Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-26 04:18:46' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3jal 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    3JAL 
#
_exptl.entry_id    3JAL 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3JAL 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               1 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3JAL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetradecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      14 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 O N N 
? 4 R N N 
? 4 U N N 
? 4 X N N 
? 4 AA N N 
? 4 DA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 71 E GLU 71 1_555 P MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? 
metalc ? metalc2 O O1B GTP . E GTP 501 1_555 P MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? 
metalc ? metalc3 O O3G GTP . E GTP 501 1_555 P MG MG . E MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc4 D OE2 GLU 71 J GLU 71 1_555 S MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? 
metalc ? metalc5 R O1B GTP . J GTP 501 1_555 S MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? 
metalc ? metalc6 R O3G GTP . J GTP 501 1_555 S MG MG . J MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? 
metalc ? metalc7 F OE2 GLU 71 C GLU 71 1_555 V MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.903 ? 
metalc ? metalc8 U O1B GTP . C GTP 501 1_555 V MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.962 ? 
metalc ? metalc9 U O3G GTP . C GTP 501 1_555 V MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc10 H OE2 GLU 71 L GLU 71 1_555 Y MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.763 ? 
metalc ? metalc11 X O1B GTP . L GTP 501 1_555 Y MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? 
metalc ? metalc12 X O3G GTP . L GTP 501 1_555 Y MG MG . L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc13 J OE2 GLU 71 A GLU 71 1_555 BA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? 
metalc ? metalc14 AA O1B GTP . A GTP 501 1_555 BA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.953 ? 
metalc ? metalc15 AA O3G GTP . A GTP 501 1_555 BA MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc16 M OE2 GLU 71 K GLU 71 1_555 EA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? 
metalc ? metalc17 DA O1B GTP . K GTP 501 1_555 EA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? 
metalc ? metalc18 DA O3G GTP . K GTP 501 1_555 EA MG MG . K MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 181 n n 
PG O2G GTP sing 182 n n 
PG O3G GTP sing 183 n n 
PG O3B GTP sing 184 n n 
O2G HOG2 GTP sing 185 n n 
O3G HOG3 GTP sing 186 n n 
O3B PB GTP sing 187 n n 
PB O1B GTP doub 188 n n 
PB O2B GTP sing 189 n n 
PB O3A GTP sing 190 n n 
O2B HOB2 GTP sing 191 n n 
O3A PA GTP sing 192 n n 
PA O1A GTP doub 193 n n 
PA O2A GTP sing 194 n n 
PA O5' GTP sing 195 n n 
O2A HOA2 GTP sing 196 n n 
O5' C5' GTP sing 197 n n 
C5' C4' GTP sing 198 n n 
C5' H5' GTP sing 199 n n 
C5' "H5''" GTP sing 200 n n 
C4' O4' GTP sing 201 n n 
C4' C3' GTP sing 202 n n 
C4' H4' GTP sing 203 n n 
O4' C1' GTP sing 204 n n 
C3' O3' GTP sing 205 n n 
C3' C2' GTP sing 206 n n 
C3' H3' GTP sing 207 n n 
O3' HO3' GTP sing 208 n n 
C2' O2' GTP sing 209 n n 
C2' C1' GTP sing 210 n n 
C2' H2' GTP sing 211 n n 
O2' HO2' GTP sing 212 n n 
C1' N9 GTP sing 213 n n 
C1' H1' GTP sing 214 n n 
N9 C8 GTP sing 215 n y 
N9 C4 GTP sing 216 n y 
C8 N7 GTP doub 217 n y 
C8 H8 GTP sing 218 n n 
N7 C5 GTP sing 219 n y 
C5 C6 GTP sing 220 n n 
C5 C4 GTP doub 221 n y 
C6 O6 GTP doub 222 n n 
C6 N1 GTP sing 223 n n 
N1 C2 GTP sing 224 n n 
N1 HN1 GTP sing 225 n n 
C2 N2 GTP sing 226 n n 
C2 N3 GTP doub 227 n n 
N2 HN21 GTP sing 228 n n 
N2 HN22 GTP sing 229 n n 
N3 C4 GTP sing 230 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3JAL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
O 4 GTP E 1 501 501 GTP GTP . 
P 5 MG E 1 502 502 MG MG . 
Q 6 G2P F 1 501 501 G2P G2P . 
R 4 GTP J 1 501 501 GTP GTP . 
S 5 MG J 1 502 502 MG MG . 
T 6 G2P G 1 501 501 G2P G2P . 
U 4 GTP C 1 501 501 GTP GTP . 
V 5 MG C 1 502 502 MG MG . 
W 6 G2P D 1 501 501 G2P G2P . 
X 4 GTP L 1 501 501 GTP GTP . 
Y 5 MG L 1 502 502 MG MG . 
Z 6 G2P I 1 501 501 G2P G2P . 
AA 4 GTP A 1 501 501 GTP GTP . 
BA 5 MG A 1 502 502 MG MG . 
CA 6 G2P B 1 501 501 G2P G2P . 
DA 4 GTP K 1 501 501 GTP GTP . 
EA 5 MG K 1 502 502 MG MG . 
FA 6 G2P H 1 501 501 G2P G2P . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . U 4 364.837 447.465 311.108 1 27.33 ? PG GTP 501 C 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . U 4 365.784 448.454 310.463 1 27.16 ? O1G GTP 501 C 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . U 4 363.387 447.885 311.146 1 27.47 ? O2G GTP 501 C 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . U 4 364.982 446.064 310.557 1 27.17 ? O3G GTP 501 C 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . U 4 365.274 447.487 312.659 1 26.23 ? O3B GTP 501 C 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . U 4 365.526 446.174 313.546 1 25.41 ? PB GTP 501 C 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . U 4 364.682 444.992 313.129 1 25.62 ? O1B GTP 501 C 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . U 4 365.368 446.56 314.995 1 25.12 ? O2B GTP 501 C 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . U 4 367.029 445.782 313.171 1 25.81 ? O3A GTP 501 C 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . U 4 367.901 444.692 313.95 1 26 ? PA GTP 501 C 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . U 4 368.055 443.543 312.982 1 25.98 ? O1A GTP 501 C 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . U 4 367.3 444.37 315.297 1 26.41 ? O2A GTP 501 C 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . U 4 369.259 445.513 314.158 1 25.22 ? O5' GTP 501 C 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . U 4 370.521 445.058 313.695 1 24.83 ? C5' GTP 501 C 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . U 4 371.416 444.975 314.91 1 24.27 ? C4' GTP 501 C 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . U 4 370.899 443.992 315.812 1 23.43 ? O4' GTP 501 C 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . U 4 372.806 444.526 314.516 1 23.95 ? C3' GTP 501 C 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . U 4 373.758 445.124 315.406 1 23.98 ? O3' GTP 501 C 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . U 4 372.715 443.027 314.694 1 23.43 ? C2' GTP 501 C 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . U 4 374 442.445 314.925 1 23.67 ? O2' GTP 501 C 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . U 4 371.83 442.913 315.924 1 23.04 ? C1' GTP 501 C 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . U 4 371.12 441.618 315.959 1 22.17 ? N9 GTP 501 C 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . U 4 370.19 441.18 315.097 1 22.09 ? C8 GTP 501 C 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . U 4 369.717 439.962 315.48 1 21.66 ? N7 GTP 501 C 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . U 4 370.324 439.627 316.626 1 21 ? C5 GTP 501 C 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . U 4 370.277 438.491 317.564 1 20.53 ? C6 GTP 501 C 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . U 4 369.53 437.52 317.356 1 20.32 ? O6 GTP 501 C 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . U 4 371.062 438.536 318.645 1 20.64 ? N1 GTP 501 C 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . U 4 371.888 439.577 318.885 1 20.89 ? C2 GTP 501 C 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . U 4 372.655 439.564 320.001 1 21.2 ? N2 GTP 501 C 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . U 4 371.978 440.654 318.069 1 20.94 ? N3 GTP 501 C 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . U 4 371.232 440.732 316.948 1 21.34 ? C4 GTP 501 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              22 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    53 
_model_server_stats.query_time_ms           248 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           32 
#