data_3K1F
#
_model_server_result.job_id            QHXkJ3mZG_hmHY4KLQ71Cw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-21 12:30:29' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3k1f 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":3001}' 
#
_entry.id    3K1F 
#
_exptl.entry_id    3K1F 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          14 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3K1F 
_cell.length_a            220.97 
_cell.length_b            408.27 
_cell.length_c            275.24 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3K1F 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        20 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 2 2 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tridecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      13 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 14 N N N 
? 14 O N N 
? 14 P N N 
? 14 Q N N 
? 14 R N N 
? 14 S N N 
? 14 T N N 
? 14 U N N 
? 14 V N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 O ZN ZN . A ZN 3008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 70 A CYS 70 1_555 O ZN ZN . A ZN 3008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 O ZN ZN . A ZN 3008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? 
metalc ? metalc4 A NE2 HIS 80 A HIS 80 1_555 O ZN ZN . A ZN 3008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 107 A CYS 107 1_555 N ZN ZN . A ZN 3006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 110 A CYS 110 1_555 N ZN ZN . A ZN 3006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 N ZN ZN . A ZN 3006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 167 A CYS 167 1_555 N ZN ZN . A ZN 3006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 1163 B CYS 1163 1_555 P ZN ZN . B ZN 3007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc10 B SG CYS 1166 B CYS 1166 1_555 P ZN ZN . B ZN 3007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 1182 B CYS 1182 1_555 P ZN ZN . B ZN 3007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 1185 B CYS 1185 1_555 P ZN ZN . B ZN 3007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc13 C SG CYS 86 C CYS 86 1_555 Q ZN ZN . C ZN 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc14 C SG CYS 88 C CYS 88 1_555 Q ZN ZN . C ZN 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc15 C SG CYS 92 C CYS 92 1_555 Q ZN ZN . C ZN 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? 
metalc ? metalc16 C SG CYS 95 C CYS 95 1_555 Q ZN ZN . C ZN 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc17 I SG CYS 7 I CYS 7 1_555 R ZN ZN . I ZN 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc18 I SG CYS 10 I CYS 10 1_555 R ZN ZN . I ZN 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc19 I SG CYS 29 I CYS 29 1_555 R ZN ZN . I ZN 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc20 I SG CYS 32 I CYS 32 1_555 R ZN ZN . I ZN 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc21 I SG CYS 75 I CYS 75 1_555 S ZN ZN . I ZN 3004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc22 I SG CYS 78 I CYS 78 1_555 S ZN ZN . I ZN 3004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? 
metalc ? metalc23 I SG CYS 103 I CYS 103 1_555 S ZN ZN . I ZN 3004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? 
metalc ? metalc24 I SG CYS 106 I CYS 106 1_555 S ZN ZN . I ZN 3004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? 
metalc ? metalc25 J SG CYS 7 J CYS 7 1_555 T ZN ZN . J ZN 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? 
metalc ? metalc26 J SG CYS 10 J CYS 10 1_555 T ZN ZN . J ZN 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? 
metalc ? metalc27 J SG CYS 45 J CYS 45 1_555 T ZN ZN . J ZN 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc28 J SG CYS 46 J CYS 46 1_555 T ZN ZN . J ZN 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? 
metalc ? metalc29 L SG CYS 31 L CYS 31 1_555 U ZN ZN . L ZN 3005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc30 L SG CYS 34 L CYS 34 1_555 U ZN ZN . L ZN 3005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc31 L SG CYS 48 L CYS 48 1_555 U ZN ZN . L ZN 3005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc32 L SG CYS 51 L CYS 51 1_555 U ZN ZN . L ZN 3005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc33 M SG CYS 24 M CYS 24 1_555 V ZN ZN . M ZN 3009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc34 M SG CYS 27 M CYS 27 1_555 V ZN ZN . M ZN 3009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? 
metalc ? metalc35 M SG CYS 45 M CYS 45 1_555 V ZN ZN . M ZN 3009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc36 M SG CYS 48 M CYS 48 1_555 V ZN ZN . M ZN 3009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3K1F 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.004526 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.002449 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.003633 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
N 14 ZN A 1 3006 3006 ZN ZN . 
O 14 ZN A 1 3008 3008 ZN ZN . 
P 14 ZN B 1 3007 3007 ZN ZN . 
Q 14 ZN C 1 3002 3002 ZN ZN . 
R 14 ZN I 1 3003 3003 ZN ZN . 
S 14 ZN I 1 3004 3004 ZN ZN . 
T 14 ZN J 1 3001 3001 ZN ZN . 
U 14 ZN L 1 3005 3005 ZN ZN . 
V 14 ZN M 1 3009 3009 ZN ZN . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         T 
_atom_site.label_entity_id       14 
_atom_site.Cartn_x               89.517 
_atom_site.Cartn_y               31.206 
_atom_site.Cartn_z               37.132 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        124.99 
_atom_site.pdbx_formal_charge    2 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           3001 
_atom_site.auth_asym_id          J 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              72 
_model_server_stats.parse_time_ms           16 
_model_server_stats.create_model_time_ms    29 
_model_server_stats.query_time_ms           311 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#