data_3M1Y
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_model_server_result.job_id            BnKK3SX5eaWmpq6IBUbOnw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 04:35:31' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":300}' 
#
_entry.id    3M1Y 
#
_exptl.entry_id    3M1Y 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            3M1Y 
_cell.length_a            51.607 
_cell.length_b            84.719 
_cell.length_c            204.826 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3M1Y 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,O,P 1 1 
C,D,J,K,L,M,N,Q,R 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 H N N 
? 2 J N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C ASN 61 A ASN 59 1_555 A N MSE 62 A MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale2 A C MSE 62 A MSE 60 1_555 A N PRO 63 A PRO 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale3 A C HIS 136 A HIS 134 1_555 A N MSE 137 A MSE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale4 A C MSE 137 A MSE 135 1_555 A N MSE 138 A MSE 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale5 A C MSE 138 A MSE 136 1_555 A N PHE 139 A PHE 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale6 A C GLU 145 A GLU 143 1_555 A N MSE 146 A MSE 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale7 A C MSE 146 A MSE 144 1_555 A N LEU 147 A LEU 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale8 A C SER 172 A SER 170 1_555 A N MSE 173 A MSE 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale9 A C MSE 173 A MSE 171 1_555 A N PHE 174 A PHE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale10 B C ALA 41 B ALA 39 1_555 B N MSE 42 B MSE 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale11 B C MSE 42 B MSE 40 1_555 B N ASN 43 B ASN 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale12 B C ASN 61 B ASN 59 1_555 B N MSE 62 B MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale13 B C MSE 62 B MSE 60 1_555 B N PRO 63 B PRO 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? 
covale ? covale14 B C HIS 136 B HIS 134 1_555 B N MSE 137 B MSE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale15 B C MSE 137 B MSE 135 1_555 B N MSE 138 B MSE 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale16 B C MSE 138 B MSE 136 1_555 B N PHE 139 B PHE 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale17 B C GLU 145 B GLU 143 1_555 B N MSE 146 B MSE 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale18 B C MSE 146 B MSE 144 1_555 B N LEU 147 B LEU 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale19 B C SER 172 B SER 170 1_555 B N MSE 173 B MSE 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale20 B C MSE 173 B MSE 171 1_555 B N PHE 174 B PHE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale21 C C ALA 41 C ALA 39 1_555 C N MSE 42 C MSE 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale22 C C MSE 42 C MSE 40 1_555 C N ASN 43 C ASN 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale23 C C ASN 61 C ASN 59 1_555 C N MSE 62 C MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale24 C C MSE 62 C MSE 60 1_555 C N PRO 63 C PRO 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale25 C C HIS 136 C HIS 134 1_555 C N MSE 137 C MSE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale26 C C MSE 137 C MSE 135 1_555 C N MSE 138 C MSE 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale27 C C MSE 138 C MSE 136 1_555 C N PHE 139 C PHE 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale28 C C GLU 145 C GLU 143 1_555 C N MSE 146 C MSE 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale29 C C MSE 146 C MSE 144 1_555 C N LEU 147 C LEU 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale30 C C SER 172 C SER 170 1_555 C N MSE 173 C MSE 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale31 C C MSE 173 C MSE 171 1_555 C N PHE 174 C PHE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale32 D C ALA 41 D ALA 39 1_555 D N MSE 42 D MSE 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale33 D C MSE 42 D MSE 40 1_555 D N ASN 43 D ASN 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale34 D C ASN 61 D ASN 59 1_555 D N MSE 62 D MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale35 D C MSE 62 D MSE 60 1_555 D N PRO 63 D PRO 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? 
covale ? covale36 D C HIS 136 D HIS 134 1_555 D N MSE 137 D MSE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale37 D C MSE 137 D MSE 135 1_555 D N MSE 138 D MSE 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale38 D C MSE 138 D MSE 136 1_555 D N PHE 139 D PHE 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale39 D C GLU 145 D GLU 143 1_555 D N MSE 146 D MSE 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale40 D C MSE 146 D MSE 144 1_555 D N LEU 147 D LEU 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale41 D C SER 172 D SER 170 1_555 D N MSE 173 D MSE 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale42 D C MSE 173 D MSE 171 1_555 D N PHE 174 D PHE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
metalc ? metalc1 A OD2 ASP 10 A ASP 8 1_555 E MG MG . A MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc2 A O ASP 12 A ASP 10 1_555 E MG MG . A MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 166 A ASP 164 1_555 E MG MG . A MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? 
metalc ? metalc4 E MG MG . A MG 300 1_555 O O HOH . A HOH 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
metalc ? metalc5 E MG MG . A MG 300 1_555 O O HOH . A HOH 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? 
metalc ? metalc6 E MG MG . A MG 300 1_555 O O HOH . A HOH 323 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
metalc ? metalc7 B OD2 ASP 10 B ASP 8 1_555 H MG MG . B MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc8 B O ASP 12 B ASP 10 1_555 H MG MG . B MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc9 B OD2 ASP 166 B ASP 164 1_555 H MG MG . B MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc10 B OD1 ASP 166 B ASP 164 1_555 H MG MG . B MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? 
metalc ? metalc11 H MG MG . B MG 300 1_555 P O HOH . B HOH 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? 
metalc ? metalc12 H MG MG . B MG 300 1_555 P O HOH . B HOH 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc13 H MG MG . B MG 300 1_555 P O HOH . B HOH 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc14 C OD2 ASP 10 C ASP 8 1_555 J MG MG . C MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? 
metalc ? metalc15 C O ASP 12 C ASP 10 1_555 J MG MG . C MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
metalc ? metalc16 C OD2 ASP 166 C ASP 164 1_555 J MG MG . C MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc17 C OD1 ASP 166 C ASP 164 1_555 J MG MG . C MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? 
metalc ? metalc18 C OD2 ASP 201 C ASP 199 1_555 L MG MG . C MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc19 C OD1 ASP 201 C ASP 199 1_555 L MG MG . C MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.929 ? 
metalc ? metalc20 J MG MG . C MG 300 1_555 Q O HOH . C HOH 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc21 J MG MG . C MG 300 1_555 Q O HOH . C HOH 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc22 J MG MG . C MG 300 1_555 Q O HOH . C HOH 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.798 ? 
metalc ? metalc23 L MG MG . C MG 301 1_555 Q O HOH . C HOH 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc24 D OD2 ASP 10 D ASP 8 1_555 M MG MG . D MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? 
metalc ? metalc25 D O ASP 12 D ASP 10 1_555 M MG MG . D MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? 
metalc ? metalc26 D OD2 ASP 166 D ASP 164 1_555 M MG MG . D MG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc27 M MG MG . D MG 300 1_555 R O HOH . D HOH 328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3M1Y 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.019377 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011804 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004882 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 MG A 1 300 300 MG MG . 
F 3 CL A 1 302 302 CL CL . 
G 3 CL A 1 303 303 CL CL . 
H 2 MG B 1 300 300 MG MG . 
I 3 CL B 1 302 302 CL CL . 
J 2 MG C 1 300 300 MG MG . 
K 3 CL C 1 302 302 CL CL . 
L 2 MG C 1 301 301 MG MG . 
M 2 MG D 1 300 300 MG MG . 
N 3 CL D 1 302 302 CL CL . 
O 4 HOH A 1 314 314 HOH HOH . 
O 4 HOH A 2 318 318 HOH HOH . 
O 4 HOH A 3 319 319 HOH HOH . 
O 4 HOH A 4 320 320 HOH HOH . 
O 4 HOH A 5 321 321 HOH HOH . 
O 4 HOH A 6 322 322 HOH HOH . 
O 4 HOH A 7 323 323 HOH HOH . 
O 4 HOH A 8 334 334 HOH HOH . 
O 4 HOH A 9 339 339 HOH HOH . 
O 4 HOH A 10 342 342 HOH HOH . 
O 4 HOH A 11 347 347 HOH HOH . 
O 4 HOH A 12 352 352 HOH HOH . 
O 4 HOH A 13 357 357 HOH HOH . 
O 4 HOH A 14 362 362 HOH HOH . 
O 4 HOH A 15 364 364 HOH HOH . 
O 4 HOH A 16 365 365 HOH HOH . 
O 4 HOH A 17 372 372 HOH HOH . 
O 4 HOH A 18 373 373 HOH HOH . 
O 4 HOH A 19 374 374 HOH HOH . 
O 4 HOH A 20 380 380 HOH HOH . 
O 4 HOH A 21 386 386 HOH HOH . 
O 4 HOH A 22 393 393 HOH HOH . 
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