data_3MG4 # _model_server_result.job_id nVASoiFCX7CvQbiy-I0M9w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-02 17:33:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3mg4 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"IA","auth_seq_id":196}' # _entry.id 3MG4 # _exptl.entry_id 3MG4 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 15 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 112.73 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3MG4 _cell.length_a 134.561 _cell.length_b 300.791 _cell.length_c 144.707 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3MG4 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 28-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 28 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 15 CA N N ? 15 DA N N ? 15 EA N N ? 15 FA N N ? 15 GA N N ? 15 HA N N ? 15 IA N N ? 15 JA N N ? 15 MA N N ? 15 NA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 CA MG MG . D MG 2 1_555 D OE2 GLU 97 D GLU 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.917 ? metalc ? metalc2 CA MG MG . D MG 2 1_555 L OG SER 85 L SER 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? metalc ? metalc3 CA MG MG . D MG 2 1_555 L OG SER 88 L SER 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? metalc ? metalc4 EA MG MG . G MG 1 1_555 G OG1 THR 8 G THR 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? metalc ? metalc5 EA MG MG . G MG 1 1_555 G O TYR 119 G TYR 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc6 EA MG MG . G MG 1 1_555 G O ARG 122 G ARG 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc7 EA MG MG . G MG 1 1_555 G O MET 125 G MET 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc8 H O ILE 163 H ILE 163 1_555 GA MG MG . H MG 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc9 H O ASP 166 H ASP 166 1_555 GA MG MG . H MG 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc10 H O SER 169 H SER 169 1_555 GA MG MG . H MG 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc11 GA MG MG . H MG 224 1_555 Z OXT ASP 222 Z ASP 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc12 I O GLY 139 I GLY 128 1_555 HA MG MG . I MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc13 I OG SER 142 I SER 131 1_555 HA MG MG . I MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc ? metalc14 I O ALA 174 I ALA 163 1_555 IA MG MG . I MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc15 I O ASP 177 I ASP 166 1_555 IA MG MG . I MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc16 I O SER 180 I SER 169 1_555 IA MG MG . I MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc17 K O ALA 165 K ALA 163 1_555 JA MG MG . K MG 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc18 K O ASP 168 K ASP 166 1_555 JA MG MG . K MG 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc19 K O SER 171 K SER 169 1_555 JA MG MG . K MG 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc20 JA MG MG . K MG 212 1_555 W O ASP 204 W ASP 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc21 L O THR 192 L THR 163 1_555 MA MG MG . L MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc22 L O HIS 195 L HIS 166 1_555 MA MG MG . L MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc23 L O VAL 198 L VAL 169 1_555 MA MG MG . L MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc24 N O ILE 163 N ILE 163 1_555 NA MG MG . N MG 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc25 N O SER 169 N SER 169 1_555 NA MG MG . N MG 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3MG4 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007432 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.003113 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.003325 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007492 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 15 MG D 1 2 2 MG MG . DA 15 MG F 1 242 9 MG MG . EA 15 MG G 1 1 1 MG MG . FA 15 MG G 1 241 10 MG MG . GA 15 MG H 1 224 7 MG MG . HA 15 MG I 1 195 3 MG MG . IA 15 MG I 1 196 5 MG MG . JA 15 MG K 1 212 8 MG MG . KA 16 LXT K 1 213 1 LXT LXT . LA 17 MES K 1 214 1 MES MES . MA 15 MG L 1 195 4 MG MG . NA 15 MG N 1 188 6 MG MG . OA 16 LXT Y 1 212 1 LXT LXT . PA 17 MES Y 1 213 1 MES MES . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id IA _atom_site.label_entity_id 15 _atom_site.Cartn_x 65.232 _atom_site.Cartn_y -143.616 _atom_site.Cartn_z 12.131 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 57.42 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 196 _atom_site.auth_asym_id I _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 23 _model_server_stats.parse_time_ms 23 _model_server_stats.create_model_time_ms 392 _model_server_stats.query_time_ms 320 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #