data_3MG8 # _model_server_result.job_id FAjoSYNSu9vCj0l144WhRA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 21:27:09' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3mg8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":214}' # _entry.id 3MG8 # _exptl.entry_id 3MG8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 195.237 _entity.id 17 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 113.13 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3MG8 _cell.length_a 136.333 _cell.length_b 299.185 _cell.length_c 145.667 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3MG8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 28-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 28 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 17 KA N N ? 17 PA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 D OE2 GLU 105 D GLU 105 1_555 LA MG MG . L MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc2 F OG SER 13 F SER 13 1_555 DA MG MG . F MG 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc3 F O ALA 164 F ALA 164 1_555 CA MG MG . F MG 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc4 DA MG MG . F MG 243 1_555 G O ALA 132 G ALA 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.864 ? metalc ? metalc5 G OG1 THR 17 G THR 13 1_555 EA MG MG . G MG 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc6 G O TYR 128 G TYR 123 1_555 EA MG MG . G MG 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc7 G O ARG 131 G ARG 126 1_555 EA MG MG . G MG 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc8 G O MET 134 G MET 129 1_555 EA MG MG . G MG 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc9 H O ILE 163 H ILE 163 1_555 FA MG MG . H MG 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc10 H O ASP 166 H ASP 166 1_555 FA MG MG . H MG 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc11 H O SER 169 H SER 169 1_555 FA MG MG . H MG 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc12 FA MG MG . H MG 224 1_555 Z OXT ASP 241 Z ASP 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc13 I O GLY 140 I GLY 128 1_555 GA MG MG . I MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc14 I OG SER 143 I SER 131 1_555 GA MG MG . I MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc ? metalc15 I O ALA 175 I ALA 163 1_555 HA MG MG . I MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc16 I O ASP 178 I ASP 166 1_555 HA MG MG . I MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc17 I O SER 181 I SER 169 1_555 HA MG MG . I MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc ? metalc18 K O ALA 165 K ALA 163 1_555 IA MG MG . K MG 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc19 K O ASP 168 K ASP 166 1_555 IA MG MG . K MG 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc20 K O SER 171 K SER 169 1_555 IA MG MG . K MG 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc21 IA MG MG . K MG 212 1_555 W O ASP 205 W ASP 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? metalc ? metalc22 L OG SER 104 L SER 75 1_555 LA MG MG . L MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc23 L OG SER 107 L SER 78 1_555 LA MG MG . L MG 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc24 L O THR 211 L THR 163 1_555 MA MG MG . L MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc25 L O HIS 214 L HIS 166 1_555 MA MG MG . L MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc26 L O VAL 217 L VAL 169 1_555 MA MG MG . L MG 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? metalc ? metalc27 N O ILE 163 N ILE 163 1_555 NA MG MG . N MG 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc28 N O ASP 166 N ASP 166 1_555 NA MG MG . N MG 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc29 N O SER 169 N SER 169 1_555 NA MG MG . N MG 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? # _chem_comp.formula 'C6 H13 N O4 S' _chem_comp.formula_weight 195.237 _chem_comp.id MES _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O1 C2 MES sing 307 n n O1 C6 MES sing 308 n n C2 C3 MES sing 309 n n C2 H21 MES sing 310 n n C2 H22 MES sing 311 n n C3 N4 MES sing 312 n n C3 H31 MES sing 313 n n C3 H32 MES sing 314 n n N4 C5 MES sing 315 n n N4 C7 MES sing 316 n n N4 HN4 MES sing 317 n n C5 C6 MES sing 318 n n C5 H51 MES sing 319 n n C5 H52 MES sing 320 n n C6 H61 MES sing 321 n n C6 H62 MES sing 322 n n C7 C8 MES sing 323 n n C7 H71 MES sing 324 n n C7 H72 MES sing 325 n n C8 S MES sing 326 n n C8 H81 MES sing 327 n n C8 H82 MES sing 328 n n S O1S MES doub 329 n n S O2S MES doub 330 n n S O3S MES sing 331 n n # _atom_sites.entry_id 3MG8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007335 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.003133 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.003342 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007465 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 15 MG F 1 242 9 MG MG . DA 15 MG F 1 243 10 MG MG . EA 15 MG G 1 241 1 MG MG . FA 15 MG H 1 224 7 MG MG . GA 15 MG I 1 195 3 MG MG . HA 15 MG I 1 196 5 MG MG . IA 15 MG K 1 212 8 MG MG . JA 16 L3T K 1 213 1 L3T L3T . KA 17 MES K 1 214 1 MES MES . LA 15 MG L 1 195 2 MG MG . MA 15 MG L 1 196 4 MG MG . NA 15 MG N 1 188 6 MG MG . OA 16 L3T Y 1 212 1 L3T L3T . PA 17 MES Y 1 213 1 MES MES . QA 18 HOH K 1 215 4 HOH HOH . QA 18 HOH K 2 216 5 HOH HOH . RA 18 HOH L 1 197 1 HOH HOH . RA 18 HOH L 2 198 2 HOH HOH . RA 18 HOH L 3 199 3 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 O O1 MES . . . KA 17 15.838 -143.285 16.104 1 57.06 ? O1 MES 214 K 1 HETATM 2 C C2 MES . . . KA 17 14.677 -143.483 15.293 1 56.88 ? C2 MES 214 K 1 HETATM 3 C C3 MES . . . KA 17 14.864 -142.784 13.95 1 56.91 ? C3 MES 214 K 1 HETATM 4 N N4 MES . . . KA 17 15.173 -141.359 14.171 1 56.95 ? N4 MES 214 K 1 HETATM 5 C C5 MES . . . KA 17 16.389 -141.231 15.003 1 57.42 ? C5 MES 214 K 1 HETATM 6 C C6 MES . . . KA 17 16.142 -141.909 16.346 1 57.07 ? C6 MES 214 K 1 HETATM 7 C C7 MES . . . KA 17 15.373 -140.707 12.867 1 56.75 ? C7 MES 214 K 1 HETATM 8 C C8 MES . . . KA 17 15.489 -139.191 13.025 1 56.47 ? C8 MES 214 K 1 HETATM 9 S S MES . . . KA 17 14.96 -138.367 11.681 1 56.03 ? S MES 214 K 1 HETATM 10 O O1S MES . . . KA 17 13.916 -137.418 12.11 1 56.11 ? O1S MES 214 K 1 HETATM 11 O O2S MES . . . KA 17 16.097 -137.628 11.103 1 55.92 ? O2S MES 214 K 1 HETATM 12 O O3S MES . . . KA 17 14.406 -139.28 10.661 1 55.86 ? O3S MES 214 K 1 # _model_server_stats.io_time_ms 23 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 80 _model_server_stats.query_time_ms 300 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 12 #