data_3MUR # _model_server_result.job_id AMWHljtX_e8TLLfkFtcR7A _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 04:28:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3mur # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1}' # _entry.id 3MUR # _exptl.entry_id 3MUR _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 690.411 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "9,9'-[(2R,3R,3aS,5S,7aR,9R,10R,10aS,12S,14aR)-3,5,10,12-tetrahydroxy-5,12-dioxidooctahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]tetraoxadiphosphacyclododecine-2,9-diyl]bis(2-amino-1,9-dihydro-6H-purin-6-one)" _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 94.96 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3MUR _cell.length_a 49.915 _cell.length_b 45.272 _cell.length_c 78.616 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3MUR _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B O3' GTP 1 R GTP 8 1_555 B P G 2 R G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.601 ? metalc ? metalc1 D MG MG . R MG 670 1_555 G O HOH . R HOH 718 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc2 D MG MG . R MG 670 1_555 G O HOH . R HOH 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc3 D MG MG . R MG 670 1_555 G O HOH . R HOH 720 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc4 D MG MG . R MG 670 1_555 G O HOH . R HOH 721 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc5 D MG MG . R MG 670 1_555 G O HOH . R HOH 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc6 D MG MG . R MG 670 1_555 G O HOH . R HOH 723 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc7 E MG MG . R MG 671 1_555 G O HOH . R HOH 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc8 E MG MG . R MG 671 1_555 G O HOH . R HOH 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? metalc ? metalc9 E MG MG . R MG 671 1_555 G O HOH . R HOH 726 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc10 E MG MG . R MG 671 1_555 G O HOH . R HOH 727 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc11 E MG MG . R MG 671 1_555 G O HOH . R HOH 728 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc12 E MG MG . R MG 671 1_555 G O HOH . R HOH 729 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N3 C 4 R C 11 1_555 B N1 G 92 R G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N4 C 4 R C 11 1_555 B O6 G 92 R G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O2 C 4 R C 11 1_555 B N2 G 92 R G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog4 B N1 A 5 R A 12 1_555 B N1 G 91 R G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog5 B N6 A 5 R A 12 1_555 B O6 G 91 R G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog6 B N4 C 6 R C 13 1_555 B O6 G 88 R G 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog7 B N2 G 7 R G 14 1_555 B N7 A 9 R A 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N1 G 7 R G 14 1_555 B N3 C 87 R C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N2 G 7 R G 14 1_555 B O2 C 87 R C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B O6 G 7 R G 14 1_555 B N4 C 87 R C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog11 B N4 C 10 R C 17 1_555 B O2 C 87 R C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog12 B O6 G 12 R G 19 1_555 B N6 A 40 R A 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N1 G 14 R G 21 1_555 B N3 C 39 R C 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N2 G 14 R G 21 1_555 B O2 C 39 R C 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B O6 G 14 R G 21 1_555 B N4 C 39 R C 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N3 C 15 R C 22 1_555 B N1 G 38 R G 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N4 C 15 R C 22 1_555 B O6 G 38 R G 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B O2 C 15 R C 22 1_555 B N2 G 38 R G 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog19 B N3 A 16 R A 23 1_555 B N4 C 37 R C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog20 B N6 A 18 R A 25 1_555 B N3 G 35 R G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog21 B N7 A 18 R A 25 1_555 B N2 G 35 R G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N3 C 19 R C 26 1_555 B N1 G 34 R G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B N4 C 19 R C 26 1_555 B O6 G 34 R G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B O2 C 19 R C 26 1_555 B N2 G 34 R G 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N3 C 20 R C 27 1_555 B N1 G 33 R G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N4 C 20 R C 27 1_555 B O6 G 33 R G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B O2 C 20 R C 27 1_555 B N2 G 33 R G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N1 A 21 R A 28 1_555 B N3 U 32 R U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N6 A 21 R A 28 1_555 B O4 U 32 R U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog30 B N3 U 22 R U 29 1_555 B O6 G 31 R G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog31 B O2 U 22 R U 29 1_555 B N1 G 31 R G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B N3 U 23 R U 30 1_555 B N1 A 30 R A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B O4 U 23 R U 30 1_555 B N6 A 30 R A 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N3 C 24 R C 31 1_555 B N1 G 29 R G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B N4 C 24 R C 31 1_555 B O6 G 29 R G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B O2 C 24 R C 31 1_555 B N2 G 29 R G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog37 B N2 G 25 R G 32 1_555 B N7 A 28 R A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog38 B N3 A 28 R A 35 1_555 B N2 G 73 R G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N3 C 37 R C 44 1_555 B N1 G 77 R G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N4 C 37 R C 44 1_555 B O6 G 77 R G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O2 C 37 R C 44 1_555 B N2 G 77 R G 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog42 B N2 G 38 R G 45 1_555 B N3 A 42 R A 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog43 B N6 A 41 R A 48 1_555 B O2 U 84 R U 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog44 B N7 A 41 R A 48 1_555 B N3 U 84 R U 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog45 B N1 G 43 R G 50 1_555 B O2 U 83 R U 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog46 B O6 G 43 R G 50 1_555 B N3 U 83 R U 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B N3 C 44 R C 51 1_555 B N1 G 82 R G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B N4 C 44 R C 51 1_555 B O6 G 82 R G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B O2 C 44 R C 51 1_555 B N2 G 82 R G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B N3 C 45 R C 52 1_555 B N1 G 81 R G 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B N4 C 45 R C 52 1_555 B O6 G 81 R G 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B O2 C 45 R C 52 1_555 B N2 G 81 R G 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-C MISPAIR' hydrog53 B O2 U 46 R U 53 1_555 B N4 C 48 R C 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog54 B N4 C 47 R C 54 1_555 B N1 A 76 R A 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 B N3 C 47 R C 54 1_555 B N1 G 80 R G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N4 C 47 R C 54 1_555 B O6 G 80 R G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B O2 C 47 R C 54 1_555 B N2 G 80 R G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B N3 C 48 R C 55 1_555 B N1 G 79 R G 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 B N4 C 48 R C 55 1_555 B O6 G 79 R G 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B O2 C 48 R C 55 1_555 B N2 G 79 R G 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 B N1 G 49 R G 56 1_555 B N3 C 78 R C 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B N2 G 49 R G 56 1_555 B O2 C 78 R C 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B O6 G 49 R G 56 1_555 B N4 C 78 R C 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog64 B N1 G 50 R G 57 1_555 B O2 U 75 R U 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog65 B O6 G 50 R G 57 1_555 B N3 U 75 R U 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 B N3 C 51 R C 58 1_555 B N1 G 74 R G 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 B N4 C 51 R C 58 1_555 B O6 G 74 R G 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 B O2 C 51 R C 58 1_555 B N2 G 74 R G 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 B N3 C 52 R C 59 1_555 B N1 G 73 R G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 B N4 C 52 R C 59 1_555 B O6 G 73 R G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 B O2 C 52 R C 59 1_555 B N2 G 73 R G 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 B N3 U 53 R U 60 1_555 B N1 A 72 R A 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 B O4 U 53 R U 60 1_555 B N6 A 72 R A 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 B N1 A 54 R A 61 1_555 B N3 U 71 R U 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 B N6 A 54 R A 61 1_555 B O4 U 71 R U 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog76 B N6 A 56 R A 63 1_555 B O2 U 71 R U 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog77 B N4 C 57 R C 64 1_555 B O2 U 71 R U 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-G PAIR' hydrog78 B O2 C 58 R C 65 1_555 B N1 G 69 R G 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C20 H24 N10 O14 P2' _chem_comp.formula_weight 690.411 _chem_comp.id C2E _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "9,9'-[(2R,3R,3aS,5S,7aR,9R,10R,10aS,12S,14aR)-3,5,10,12-tetrahydroxy-5,12-dioxidooctahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]tetraoxadiphosphacyclododecine-2,9-diyl]bis(2-amino-1,9-dihydro-6H-purin-6-one)" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'c-di-GMP;Cyclic diguanosine monophosphate' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P1 O2P C2E sing 145 n n O1P P1 C2E doub 146 n n O5' P1 C2E sing 147 n n C5' O5' C2E sing 148 n n C4' O4' C2E sing 149 n n C4' C5' C2E sing 150 n n C3' C4' C2E sing 151 n n O3' P11 C2E sing 152 n n O3' C3' C2E sing 153 n n C2' C3' C2E sing 154 n n C2' C1' C2E sing 155 n n O2' C2' C2E sing 156 n n C1' O4' C2E sing 157 n n C1' N9 C2E sing 158 n n N9 C4 C2E sing 159 n y N9 C8 C2E sing 160 n y C8 N7 C2E doub 161 n y C5 N7 C2E sing 162 n y C5 C6 C2E sing 163 n n C6 O6 C2E doub 164 n n N1 C6 C2E sing 165 n n C2 N1 C2E sing 166 n n N2 C2 C2E sing 167 n n N3 C2 C2E doub 168 n n N3 C4 C2E sing 169 n n C4 C5 C2E doub 170 n y P11 O21 C2E sing 171 n n P11 O5A C2E sing 172 n n O11 P11 C2E doub 173 n n C5A O5A C2E sing 174 n n C5A C4A C2E sing 175 n n C4A O4A C2E sing 176 n n C4A C3A C2E sing 177 n n O4A C1A C2E sing 178 n n C3A C2A C2E sing 179 n n O3A C3A C2E sing 180 n n O3A P1 C2E sing 181 n n C2A O2A C2E sing 182 n n C1A C2A C2E sing 183 n n C1A N91 C2E sing 184 n n N91 C41 C2E sing 185 n y C81 N71 C2E doub 186 n y C81 N91 C2E sing 187 n y N71 C51 C2E sing 188 n y C51 C41 C2E doub 189 n y C51 C61 C2E sing 190 n n C61 O61 C2E doub 191 n n C61 N11 C2E sing 192 n n C21 N11 C2E sing 193 n n C21 N21 C2E sing 194 n n N31 C21 C2E doub 195 n n C41 N31 C2E sing 196 n n O2P HO2P C2E sing 197 n n C5' "H5'1" C2E sing 198 n n C5' "H5'2" C2E sing 199 n n C4' H4' C2E sing 200 n n C3' H3' C2E sing 201 n n C2' H2' C2E sing 202 n n O2' HO2' C2E sing 203 n n C1' H1' C2E sing 204 n n C8 H8 C2E sing 205 n n N1 HN1 C2E sing 206 n n N2 HN21 C2E sing 207 n n N2 HN22 C2E sing 208 n n O21 HO21 C2E sing 209 n n C5A H511 C2E sing 210 n n C5A H512 C2E sing 211 n n C4A H4A C2E sing 212 n n C3A H3A C2E sing 213 n n C2A H2A C2E sing 214 n n O2A HO2A C2E sing 215 n n C1A H1A C2E sing 216 n n C81 H81 C2E sing 217 n n N11 HN11 C2E sing 218 n n N21 HN24 C2E sing 219 n n N21 HN23 C2E sing 220 n n # _atom_sites.entry_id 3MUR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.020034 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001739 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.022089 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012768 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 C2E R 1 1 1 C2E C2E . D 4 MG R 1 670 670 MG MG . E 4 MG R 1 671 671 MG MG . F 5 HOH P 1 700 700 HOH HOH . F 5 HOH P 2 701 701 HOH HOH . F 5 HOH P 3 702 702 HOH HOH . F 5 HOH P 4 703 703 HOH HOH . G 5 HOH R 1 704 704 HOH HOH . G 5 HOH R 2 705 705 HOH HOH . G 5 HOH R 3 706 706 HOH HOH . G 5 HOH R 4 707 707 HOH HOH . G 5 HOH R 5 708 708 HOH HOH . G 5 HOH R 6 709 709 HOH HOH . G 5 HOH R 7 710 710 HOH HOH . G 5 HOH R 8 711 711 HOH HOH . G 5 HOH R 9 712 712 HOH HOH . G 5 HOH R 10 713 713 HOH HOH . G 5 HOH R 11 714 714 HOH HOH . G 5 HOH R 12 715 715 HOH HOH . G 5 HOH R 13 716 716 HOH HOH . G 5 HOH R 14 717 717 HOH HOH . G 5 HOH R 15 718 718 HOH HOH . G 5 HOH R 16 719 719 HOH HOH . G 5 HOH R 17 720 720 HOH HOH . G 5 HOH R 18 721 721 HOH HOH . G 5 HOH R 19 722 722 HOH HOH . G 5 HOH R 20 723 723 HOH HOH . G 5 HOH R 21 724 724 HOH HOH . G 5 HOH R 22 725 725 HOH HOH . G 5 HOH R 23 726 726 HOH HOH . G 5 HOH R 24 727 727 HOH HOH . G 5 HOH R 25 728 728 HOH HOH . G 5 HOH R 26 729 729 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P1 C2E . . . C 3 -10.16 4.457 15.395 1 48.01 ? P1 C2E 1 R 1 HETATM 2 O O2P C2E . . . C 3 -11.014 6.008 15.628 1 49.48 ? O2P C2E 1 R 1 HETATM 3 O O1P C2E . . . C 3 -11.049 3.446 14.221 1 46.1 ? O1P C2E 1 R 1 HETATM 4 O O5' C2E . . . C 3 -9.938 3.74 16.824 1 46.71 ? O5' C2E 1 R 1 HETATM 5 C C5' C2E . . . C 3 -9.385 4.515 17.885 1 47.26 ? C5' C2E 1 R 1 HETATM 6 C C4' C2E . . . C 3 -9.164 3.721 19.169 1 47.66 ? C4' C2E 1 R 1 HETATM 7 O O4' C2E . . . C 3 -10.388 3.13 19.621 1 46.01 ? O4' C2E 1 R 1 HETATM 8 C C3' C2E . . . C 3 -8.158 2.589 19.014 1 47.62 ? C3' C2E 1 R 1 HETATM 9 O O3' C2E . . . C 3 -6.833 2.959 19.39 1 48.77 ? O3' C2E 1 R 1 HETATM 10 C C2' C2E . . . C 3 -8.69 1.505 19.92 1 46.6 ? C2' C2E 1 R 1 HETATM 11 O O2' C2E . . . C 3 -8.145 1.647 21.228 1 47.05 ? O2' C2E 1 R 1 HETATM 12 C C1' C2E . . . C 3 -10.186 1.757 19.974 1 45.49 ? C1' C2E 1 R 1 HETATM 13 N N9 C2E . . . C 3 -10.882 0.879 18.992 1 44.11 ? N9 C2E 1 R 1 HETATM 14 C C8 C2E . . . C 3 -11.833 1.287 18.13 1 44.82 ? C8 C2E 1 R 1 HETATM 15 N N7 C2E . . . C 3 -12.286 0.265 17.365 1 45.38 ? N7 C2E 1 R 1 HETATM 16 C C5 C2E . . . C 3 -11.61 -0.831 17.736 1 44.46 ? C5 C2E 1 R 1 HETATM 17 C C6 C2E . . . C 3 -11.601 -2.249 17.324 1 45.69 ? C6 C2E 1 R 1 HETATM 18 O O6 C2E . . . C 3 -12.434 -2.672 16.337 1 47.38 ? O6 C2E 1 R 1 HETATM 19 N N1 C2E . . . C 3 -10.745 -3.089 17.952 1 44.82 ? N1 C2E 1 R 1 HETATM 20 C C2 C2E . . . C 3 -9.91 -2.661 18.939 1 43.84 ? C2 C2E 1 R 1 HETATM 21 N N2 C2E . . . C 3 -9.078 -3.55 19.53 1 44.62 ? N2 C2E 1 R 1 HETATM 22 N N3 C2E . . . C 3 -9.88 -1.372 19.359 1 42.85 ? N3 C2E 1 R 1 HETATM 23 C C4 C2E . . . C 3 -10.688 -0.431 18.808 1 43.2 ? C4 C2E 1 R 1 HETATM 24 P P11 C2E . . . C 3 -5.598 2.372 18.535 1 50.75 ? P11 C2E 1 R 1 HETATM 25 O O21 C2E . . . C 3 -4.055 3.154 18.967 1 48.65 ? O21 C2E 1 R 1 HETATM 26 O O11 C2E . . . C 3 -5.473 0.607 18.735 1 50.54 ? O11 C2E 1 R 1 HETATM 27 O O5A C2E . . . C 3 -5.998 2.722 17.016 1 49.13 ? O5A C2E 1 R 1 HETATM 28 C C5A C2E . . . C 3 -5.926 4.06 16.54 1 47.54 ? C5A C2E 1 R 1 HETATM 29 C C4A C2E . . . C 3 -6.306 4.094 15.07 1 46.42 ? C4A C2E 1 R 1 HETATM 30 O O4A C2E . . . C 3 -5.467 3.207 14.328 1 44.55 ? O4A C2E 1 R 1 HETATM 31 C C3A C2E . . . C 3 -7.73 3.62 14.836 1 46.04 ? C3A C2E 1 R 1 HETATM 32 O O3A C2E . . . C 3 -8.659 4.699 14.862 1 47.01 ? O3A C2E 1 R 1 HETATM 33 C C2A C2E . . . C 3 -7.681 2.938 13.484 1 45.13 ? C2A C2E 1 R 1 HETATM 34 O O2A C2E . . . C 3 -8.005 3.819 12.405 1 45.26 ? O2A C2E 1 R 1 HETATM 35 C C1A C2E . . . C 3 -6.234 2.518 13.338 1 43 ? C1A C2E 1 R 1 HETATM 36 N N91 C2E . . . C 3 -6.157 1.052 13.523 1 40.35 ? N91 C2E 1 R 1 HETATM 37 C C81 C2E . . . C 3 -5.501 0.391 14.493 1 40.08 ? C81 C2E 1 R 1 HETATM 38 N N71 C2E . . . C 3 -5.638 -0.952 14.359 1 39.23 ? N71 C2E 1 R 1 HETATM 39 C C51 C2E . . . C 3 -6.399 -1.16 13.272 1 40.18 ? C51 C2E 1 R 1 HETATM 40 C C61 C2E . . . C 3 -6.931 -2.338 12.554 1 39.89 ? C61 C2E 1 R 1 HETATM 41 O O61 C2E . . . C 3 -6.657 -3.589 13.004 1 39.57 ? O61 C2E 1 R 1 HETATM 42 N N11 C2E . . . C 3 -7.692 -2.124 11.45 1 40.37 ? N11 C2E 1 R 1 HETATM 43 C C21 C2E . . . C 3 -7.971 -0.868 10.991 1 39.21 ? C21 C2E 1 R 1 HETATM 44 N N21 C2E . . . C 3 -8.736 -0.715 9.885 1 38.26 ? N21 C2E 1 R 1 HETATM 45 N N31 C2E . . . C 3 -7.51 0.248 11.607 1 39.67 ? N31 C2E 1 R 1 HETATM 46 C C41 C2E . . . C 3 -6.74 0.163 12.724 1 40.41 ? C41 C2E 1 R 1 # _model_server_stats.io_time_ms 69 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 32 _model_server_stats.query_time_ms 307 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 46 #