data_3MZ8 # _model_server_result.job_id WCjX3_HoemZgoylSHVTZLA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 15:31:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3mz8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":501}' # _entry.id 3MZ8 # _exptl.entry_id 3MZ8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3MZ8 _cell.length_a 58.122 _cell.length_b 65.539 _cell.length_c 243.413 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3MZ8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E 1 1 B,D,F 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 56 A CYS 56 1_555 A SG CYS 134 A CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 73 A CYS 73 1_555 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 129 A CYS 129 1_555 A SG CYS 145 A CYS 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 167 A CYS 167 1_555 A SG CYS 174 A CYS 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 170 A CYS 170 1_555 A SG CYS 179 A CYS 179 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 183 A CYS 183 1_555 A SG CYS 216 A CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 192 A CYS 192 1_555 A SG CYS 210 A CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 201 A CYS 201 1_555 A SG CYS 214 A CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 56 B CYS 56 1_555 B SG CYS 134 B CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 73 B CYS 73 1_555 B SG CYS 148 B CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 129 B CYS 129 1_555 B SG CYS 145 B CYS 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 167 B CYS 167 1_555 B SG CYS 174 B CYS 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 170 B CYS 170 1_555 B SG CYS 179 B CYS 179 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 183 B CYS 183 1_555 B SG CYS 216 B CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 192 B CYS 192 1_555 B SG CYS 210 B CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 201 B CYS 201 1_555 B SG CYS 214 B CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc1 A NE2 HIS 60 A HIS 60 1_555 C ZN ZN . A ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 115 A HIS 115 1_555 C ZN ZN . A ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc3 E O HOH . A HOH 245 1_555 C ZN ZN . A ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc4 B NE2 HIS 60 B HIS 60 1_555 D ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc5 B NE2 HIS 115 B HIS 115 1_555 D ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3MZ8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.017205 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015258 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004108 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 ZN A 1 500 500 ZN ZN . D 2 ZN B 1 501 501 ZN ZN . E 3 HOH A 1 222 1 HOH WAT . E 3 HOH A 2 223 2 HOH WAT . E 3 HOH A 3 224 4 HOH WAT . E 3 HOH A 4 225 5 HOH WAT . E 3 HOH A 5 226 7 HOH WAT . E 3 HOH A 6 227 10 HOH WAT . E 3 HOH A 7 228 13 HOH WAT . E 3 HOH A 8 229 14 HOH WAT . E 3 HOH A 9 230 17 HOH WAT . E 3 HOH A 10 231 18 HOH WAT . E 3 HOH A 11 232 21 HOH WAT . E 3 HOH A 12 233 22 HOH WAT . E 3 HOH A 13 234 23 HOH WAT . E 3 HOH A 14 235 24 HOH WAT . E 3 HOH A 15 236 26 HOH WAT . E 3 HOH A 16 237 30 HOH WAT . E 3 HOH A 17 238 31 HOH WAT . E 3 HOH A 18 239 35 HOH WAT . E 3 HOH A 19 240 36 HOH WAT . E 3 HOH A 20 241 37 HOH WAT . E 3 HOH A 21 242 38 HOH WAT . E 3 HOH A 22 243 39 HOH WAT . E 3 HOH A 23 244 40 HOH WAT . E 3 HOH A 24 245 41 HOH WAT . E 3 HOH A 25 246 42 HOH WAT . E 3 HOH A 26 247 44 HOH WAT . E 3 HOH A 27 248 48 HOH WAT . E 3 HOH A 28 249 49 HOH WAT . E 3 HOH A 29 250 52 HOH WAT . E 3 HOH A 30 251 53 HOH WAT . E 3 HOH A 31 252 54 HOH WAT . E 3 HOH A 32 253 55 HOH WAT . E 3 HOH A 33 254 56 HOH WAT . E 3 HOH A 34 255 58 HOH WAT . E 3 HOH A 35 256 60 HOH WAT . E 3 HOH A 36 257 62 HOH WAT . E 3 HOH A 37 258 63 HOH WAT . E 3 HOH A 38 259 66 HOH WAT . E 3 HOH A 39 260 67 HOH WAT . E 3 HOH A 40 261 70 HOH WAT . E 3 HOH A 41 262 73 HOH WAT . E 3 HOH A 42 263 77 HOH WAT . E 3 HOH A 43 264 78 HOH WAT . E 3 HOH A 44 265 83 HOH WAT . E 3 HOH A 45 266 86 HOH WAT . E 3 HOH A 46 267 87 HOH WAT . E 3 HOH A 47 268 89 HOH WAT . E 3 HOH A 48 269 90 HOH WAT . E 3 HOH A 49 270 91 HOH WAT . E 3 HOH A 50 271 92 HOH WAT . E 3 HOH A 51 272 95 HOH WAT . E 3 HOH A 52 273 97 HOH WAT . E 3 HOH A 53 274 100 HOH WAT . E 3 HOH A 54 275 102 HOH WAT . E 3 HOH A 55 276 104 HOH WAT . E 3 HOH A 56 277 105 HOH WAT . E 3 HOH A 57 278 106 HOH WAT . E 3 HOH A 58 279 111 HOH WAT . E 3 HOH A 59 280 112 HOH WAT . E 3 HOH A 60 281 115 HOH WAT . E 3 HOH A 61 282 124 HOH WAT . E 3 HOH A 62 283 131 HOH WAT . E 3 HOH A 63 284 135 HOH WAT . E 3 HOH A 64 285 137 HOH WAT . E 3 HOH A 65 286 145 HOH WAT . E 3 HOH A 66 287 146 HOH WAT . E 3 HOH A 67 288 150 HOH WAT . E 3 HOH A 68 289 151 HOH WAT . E 3 HOH A 69 290 155 HOH WAT . E 3 HOH A 70 291 156 HOH WAT . E 3 HOH A 71 292 158 HOH WAT . E 3 HOH A 72 293 161 HOH WAT . E 3 HOH A 73 294 163 HOH WAT . E 3 HOH A 74 295 164 HOH WAT . E 3 HOH A 75 296 172 HOH WAT . E 3 HOH A 76 297 173 HOH WAT . E 3 HOH A 77 298 174 HOH WAT . E 3 HOH A 78 299 176 HOH WAT . E 3 HOH A 79 300 177 HOH WAT . E 3 HOH A 80 301 178 HOH WAT . E 3 HOH A 81 302 179 HOH WAT . E 3 HOH A 82 303 180 HOH WAT . E 3 HOH A 83 304 181 HOH WAT . E 3 HOH A 84 305 182 HOH WAT . E 3 HOH A 85 306 183 HOH WAT . E 3 HOH A 86 307 184 HOH WAT . E 3 HOH A 87 308 185 HOH WAT . E 3 HOH A 88 309 193 HOH WAT . F 3 HOH B 1 222 3 HOH WAT . F 3 HOH B 2 223 8 HOH WAT . F 3 HOH B 3 224 9 HOH WAT . F 3 HOH B 4 225 11 HOH WAT . F 3 HOH B 5 226 12 HOH WAT . F 3 HOH B 6 227 15 HOH WAT . F 3 HOH B 7 228 16 HOH WAT . F 3 HOH B 8 229 19 HOH WAT . F 3 HOH B 9 230 20 HOH WAT . F 3 HOH B 10 231 25 HOH WAT . F 3 HOH B 11 232 28 HOH WAT . F 3 HOH B 12 233 29 HOH WAT . F 3 HOH B 13 234 32 HOH WAT . F 3 HOH B 14 235 33 HOH WAT . F 3 HOH B 15 236 34 HOH WAT . F 3 HOH B 16 237 43 HOH WAT . F 3 HOH B 17 238 46 HOH WAT . F 3 HOH B 18 239 47 HOH WAT . F 3 HOH B 19 240 50 HOH WAT . F 3 HOH B 20 241 51 HOH WAT . F 3 HOH B 21 242 57 HOH WAT . F 3 HOH B 22 243 59 HOH WAT . F 3 HOH B 23 244 64 HOH WAT . F 3 HOH B 24 245 65 HOH WAT . F 3 HOH B 25 246 68 HOH WAT . F 3 HOH B 26 247 71 HOH WAT . F 3 HOH B 27 248 72 HOH WAT . F 3 HOH B 28 249 74 HOH WAT . F 3 HOH B 29 250 75 HOH WAT . F 3 HOH B 30 251 76 HOH WAT . F 3 HOH B 31 252 79 HOH WAT . F 3 HOH B 32 253 80 HOH WAT . F 3 HOH B 33 254 82 HOH WAT . F 3 HOH B 34 255 88 HOH WAT . F 3 HOH B 35 256 93 HOH WAT . F 3 HOH B 36 257 94 HOH WAT . F 3 HOH B 37 258 101 HOH WAT . F 3 HOH B 38 259 107 HOH WAT . F 3 HOH B 39 260 108 HOH WAT . F 3 HOH B 40 261 109 HOH WAT . F 3 HOH B 41 262 110 HOH WAT . F 3 HOH B 42 263 114 HOH WAT . F 3 HOH B 43 264 117 HOH WAT . F 3 HOH B 44 265 120 HOH WAT . F 3 HOH B 45 266 121 HOH WAT . F 3 HOH B 46 267 122 HOH WAT . F 3 HOH B 47 268 123 HOH WAT . F 3 HOH B 48 269 128 HOH WAT . F 3 HOH B 49 270 130 HOH WAT . F 3 HOH B 50 271 132 HOH WAT . F 3 HOH B 51 272 133 HOH WAT . F 3 HOH B 52 273 136 HOH WAT . F 3 HOH B 53 274 138 HOH WAT . F 3 HOH B 54 275 139 HOH WAT . F 3 HOH B 55 276 140 HOH WAT . F 3 HOH B 56 277 141 HOH WAT . F 3 HOH B 57 278 142 HOH WAT . F 3 HOH B 58 279 144 HOH WAT . F 3 HOH B 59 280 147 HOH WAT . F 3 HOH B 60 281 148 HOH WAT . F 3 HOH B 61 282 152 HOH WAT . F 3 HOH B 62 283 153 HOH WAT . F 3 HOH B 63 284 154 HOH WAT . F 3 HOH B 64 285 157 HOH WAT . F 3 HOH B 65 286 159 HOH WAT . F 3 HOH B 66 287 160 HOH WAT . F 3 HOH B 67 288 162 HOH WAT . F 3 HOH B 68 289 165 HOH WAT . F 3 HOH B 69 290 166 HOH WAT . F 3 HOH B 70 291 167 HOH WAT . F 3 HOH B 71 292 168 HOH WAT . F 3 HOH B 72 293 169 HOH WAT . F 3 HOH B 73 294 170 HOH WAT . F 3 HOH B 74 295 171 HOH WAT . F 3 HOH B 75 296 175 HOH WAT . F 3 HOH B 76 297 186 HOH WAT . F 3 HOH B 77 298 187 HOH WAT . F 3 HOH B 78 299 188 HOH WAT . F 3 HOH B 79 300 189 HOH WAT . F 3 HOH B 80 301 190 HOH WAT . F 3 HOH B 81 302 191 HOH WAT . F 3 HOH B 82 303 192 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 12.268 _atom_site.Cartn_y 12.076 _atom_site.Cartn_z 4.858 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 68.26 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 501 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 65 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 21 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #