data_3N1Q # _model_server_result.job_id JfWZAqF35ThCQitFcIs5iA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-01 04:34:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3n1q # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":191}' # _entry.id 3N1Q # _exptl.entry_id 3N1Q _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 98.98 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3N1Q _cell.length_a 45.715 _cell.length_b 100.265 _cell.length_c 97.26 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3N1Q _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 ? dimeric 2 author_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,G,H,I 1 1 C,D,J,K,L 2 1 E,F,M,N,O,P 3 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 I N N ? 4 K N N ? 4 L N N ? 4 N N N ? 4 O N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 71 B GLU 90 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 71 B GLU 90 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 72 B GLU 91 1_555 H CA CA . B CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 72 B GLU 91 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 77 B ASP 96 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 77 B ASP 96 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc7 A O THR 107 B THR 126 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 108 B GLU 127 1_555 H CA CA . B CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.788 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 108 B GLU 127 1_555 H CA CA . B CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 108 B GLU 127 1_555 I CA CA . B CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.013 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 111 B ASP 130 1_555 H CA CA . B CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 113 B ASP 132 1_555 H CA CA . B CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc ? metalc13 A NE2 HIS 122 B HIS 141 1_555 G ZN ZN . B ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 129 B ASP 148 1_555 G ZN ZN . B ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc15 A ND1 HIS 164 B HIS 183 1_555 G ZN ZN . B ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc16 C OE1 GLU 71 A GLU 90 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc17 C OE2 GLU 71 A GLU 90 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? metalc ? metalc18 C OE2 GLU 72 A GLU 91 1_555 K CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc ? metalc19 C OE2 GLU 72 A GLU 91 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.86 ? metalc ? metalc20 C OE1 GLU 72 A GLU 91 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.175 ? metalc ? metalc21 C OD2 ASP 77 A ASP 96 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.812 ? metalc ? metalc22 C OD1 ASP 77 A ASP 96 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? metalc ? metalc23 C O THR 107 A THR 126 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc24 C OE2 GLU 108 A GLU 127 1_555 K CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc25 C OE1 GLU 108 A GLU 127 1_555 K CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.957 ? metalc ? metalc26 C OE2 GLU 108 A GLU 127 1_555 L CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.025 ? metalc ? metalc27 C OD1 ASP 111 A ASP 130 1_555 K CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc28 C OD2 ASP 113 A ASP 132 1_555 K CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.082 ? metalc ? metalc29 C NE2 HIS 122 A HIS 141 1_555 J ZN ZN . A ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? metalc ? metalc30 C OD1 ASP 129 A ASP 148 1_555 J ZN ZN . A ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc31 C ND1 HIS 164 A HIS 183 1_555 J ZN ZN . A ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc32 E OE1 GLU 71 E GLU 90 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.911 ? metalc ? metalc33 E OE2 GLU 71 E GLU 90 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc34 E OE2 GLU 72 E GLU 91 1_555 O CA CA . E CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc35 E OE2 GLU 72 E GLU 91 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? metalc ? metalc36 E OE1 GLU 72 E GLU 91 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.15 ? metalc ? metalc37 E OD2 ASP 77 E ASP 96 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc38 E OD1 ASP 77 E ASP 96 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.88 ? metalc ? metalc39 E O THR 107 E THR 126 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc40 E OE2 GLU 108 E GLU 127 1_555 O CA CA . E CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? metalc ? metalc41 E OE1 GLU 108 E GLU 127 1_555 O CA CA . E CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? metalc ? metalc42 E OE2 GLU 108 E GLU 127 1_555 N CA CA . E CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? metalc ? metalc43 E OD1 ASP 111 E ASP 130 1_555 O CA CA . E CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? metalc ? metalc44 E OD2 ASP 113 E ASP 132 1_555 O CA CA . E CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc ? metalc45 E NE2 HIS 122 E HIS 141 1_555 M ZN ZN . E ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc46 E OD1 ASP 129 E ASP 148 1_555 M ZN ZN . E ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? metalc ? metalc47 E ND1 HIS 164 E HIS 183 1_555 M ZN ZN . E ZN 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3N1Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.021875 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.003457 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009974 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.010409 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 3 ZN B 1 190 190 ZN ZN . H 4 CA B 1 191 191 CA CA . I 4 CA B 1 192 192 CA CA . J 3 ZN A 1 190 190 ZN ZN . K 4 CA A 1 191 191 CA CA . L 4 CA A 1 192 192 CA CA . M 3 ZN E 1 190 190 ZN ZN . N 4 CA E 1 192 192 CA CA . O 4 CA E 1 191 191 CA CA . P 5 HOH E 1 1 1 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x -26.427 _atom_site.Cartn_y 9.837 _atom_site.Cartn_z -44.936 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 47.13 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 191 _atom_site.auth_asym_id E _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 16 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 302 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #