data_3NHG # _model_server_result.job_id TZDZcEyepQkVeGaj_thN4g _model_server_result.datetime_utc '2024-10-26 00:34:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3nhg # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":904}' # _entry.id 3NHG # _exptl.entry_id 3NHG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 482.168 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3NHG _cell.length_a 75.052 _cell.length_b 119.999 _cell.length_c 130.382 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3NHG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 C O3' DA 12 P DA 114 1_555 C P DOC 13 P DOC 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 116 A GLU 116 1_555 G CA CA . A CA 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 116 A GLU 116 1_555 G CA CA . A CA 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 411 A ASP 411 1_555 F CA CA . A CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 411 A ASP 411 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 411 A ASP 411 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 411 A ASP 411 1_555 I CA CA . A CA 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc7 A O LEU 412 A LEU 412 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc8 A O ASN 505 A ASN 505 1_555 E CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 507 A ASN 507 1_555 E CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc10 A O LYS 531 A LYS 531 1_555 E CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 623 A ASP 623 1_555 F CA CA . A CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 623 A ASP 623 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc13 A OE1 GLU 660 A GLU 660 1_555 J CA CA . A CA 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.067 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 684 A ASP 684 1_555 J CA CA . A CA 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc15 D O2A TTP . A TTP 904 1_555 F CA CA . A CA 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc16 D O1G TTP . A TTP 904 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc17 D O2B TTP . A TTP 904 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc18 D O2A TTP . A TTP 904 1_555 H CA CA . A CA 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc19 D O1G TTP . A TTP 904 1_555 I CA CA . A CA 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc20 D O2G TTP . A TTP 904 1_555 I CA CA . A CA 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.062 ? metalc ? metalc21 E CA CA . A CA 905 1_555 K O HOH . A HOH 933 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc22 E CA CA . A CA 905 1_555 K O HOH . A HOH 1020 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc23 G CA CA . A CA 907 1_555 K O HOH . A HOH 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc24 G CA CA . A CA 907 1_555 K O HOH . A HOH 926 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc25 G CA CA . A CA 907 1_555 K O HOH . A HOH 927 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc26 I CA CA . A CA 909 1_555 K O HOH . A HOH 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? metalc ? metalc27 I CA CA . A CA 909 1_555 K O HOH . A HOH 1048 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc28 I CA CA . A CA 909 1_555 K O HOH . A HOH 1176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc29 J CA CA . A CA 910 1_555 K O HOH . A HOH 921 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc30 J CA CA . A CA 910 1_555 K O HOH . A HOH 1040 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc31 J CA CA . A CA 910 1_555 K O HOH . A HOH 1186 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 DG 5 T DG 5 1_555 C N3 DOC 13 P DOC 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 DG 5 T DG 5 1_555 C O2 DOC 13 P DOC 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 DG 5 T DG 5 1_555 C N4 DOC 13 P DOC 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N3 DT 6 T DT 6 1_555 C N1 DA 12 P DA 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B O4 DT 6 T DT 6 1_555 C N6 DA 12 P DA 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N1 DA 7 T DA 7 1_555 C N3 DT 11 P DT 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N6 DA 7 T DA 7 1_555 C O4 DT 11 P DT 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N1 DA 8 T DA 8 1_555 C N3 DT 10 P DT 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N6 DA 8 T DA 8 1_555 C O4 DT 10 P DT 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N1 DG 9 T DG 9 1_555 C N3 DC 9 P DC 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B N2 DG 9 T DG 9 1_555 C O2 DC 9 P DC 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B O6 DG 9 T DG 9 1_555 C N4 DC 9 P DC 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N3 DC 10 T DC 10 1_555 C N1 DG 8 P DG 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N4 DC 10 T DC 10 1_555 C O6 DG 8 P DG 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B O2 DC 10 T DC 10 1_555 C N2 DG 8 P DG 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N1 DA 11 T DA 11 1_555 C N3 DT 7 P DT 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N6 DA 11 T DA 11 1_555 C O4 DT 7 P DT 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 DG 12 T DG 12 1_555 C N3 DC 6 P DC 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N2 DG 12 T DG 12 1_555 C O2 DC 6 P DC 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B O6 DG 12 T DG 12 1_555 C N4 DC 6 P DC 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N3 DT 13 T DT 13 1_555 C N1 DA 5 P DA 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B O4 DT 13 T DT 13 1_555 C N6 DA 5 P DA 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B N3 DC 14 T DC 14 1_555 C N1 DG 4 P DG 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N4 DC 14 T DC 14 1_555 C O6 DG 4 P DG 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B O2 DC 14 T DC 14 1_555 C N2 DG 4 P DG 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N3 DC 15 T DC 15 1_555 C N1 DG 3 P DG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N4 DC 15 T DC 15 1_555 C O6 DG 3 P DG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B O2 DC 15 T DC 15 1_555 C N2 DG 3 P DG 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N1 DG 16 T DG 16 1_555 C N3 DC 2 P DC 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N2 DG 16 T DG 16 1_555 C O2 DC 2 P DC 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B O6 DG 16 T DG 16 1_555 C N4 DC 2 P DC 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B N3 DC 17 T DC 17 1_555 C N1 DG 1 P DG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N4 DC 17 T DC 17 1_555 C O6 DG 1 P DG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B O2 DC 17 T DC 17 1_555 C N2 DG 1 P DG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H17 N2 O14 P3' _chem_comp.formula_weight 482.168 _chem_comp.id TTP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A TTP doub 517 n n PA O2A TTP sing 518 n n PA O3A TTP sing 519 n n PA O5' TTP sing 520 n n O2A HOA2 TTP sing 521 n n O3A PB TTP sing 522 n n PB O1B TTP doub 523 n n PB O2B TTP sing 524 n n PB O3B TTP sing 525 n n O2B HOB2 TTP sing 526 n n O3B PG TTP sing 527 n n PG O1G TTP doub 528 n n PG O2G TTP sing 529 n n PG O3G TTP sing 530 n n O2G HOG2 TTP sing 531 n n O3G HOG3 TTP sing 532 n n O5' C5' TTP sing 533 n n C5' C4' TTP sing 534 n n C5' "H5'1" TTP sing 535 n n C5' "H5'2" TTP sing 536 n n C4' O4' TTP sing 537 n n C4' C3' TTP sing 538 n n C4' H4' TTP sing 539 n n O4' C1' TTP sing 540 n n C3' O3' TTP sing 541 n n C3' C2' TTP sing 542 n n C3' H3' TTP sing 543 n n O3' HO3' TTP sing 544 n n C2' C1' TTP sing 545 n n C2' "H2'1" TTP sing 546 n n C2' "H2'2" TTP sing 547 n n C1' N1 TTP sing 548 n n C1' H1' TTP sing 549 n n N1 C2 TTP sing 550 n n N1 C6 TTP sing 551 n n C2 O2 TTP doub 552 n n C2 N3 TTP sing 553 n n N3 C4 TTP sing 554 n n N3 HN3 TTP sing 555 n n C4 O4 TTP doub 556 n n C4 C5 TTP sing 557 n n C5 C5M TTP sing 558 n n C5 C6 TTP doub 559 n n C5M HM51 TTP sing 560 n n C5M HM52 TTP sing 561 n n C5M HM53 TTP sing 562 n n C6 H6 TTP sing 563 n n # _atom_sites.entry_id 3NHG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013324 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008333 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00767 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 TTP A 1 904 1 TTP TTP . E 5 CA A 1 905 1 CA CA . F 5 CA A 1 906 2 CA CA . G 5 CA A 1 907 3 CA CA . H 5 CA A 1 908 4 CA CA . I 5 CA A 1 909 5 CA CA . J 5 CA A 1 910 6 CA CA . K 6 HOH A 1 911 1 HOH HOH . K 6 HOH A 2 912 2 HOH HOH . K 6 HOH A 3 913 3 HOH HOH . K 6 HOH A 4 914 4 HOH HOH . K 6 HOH A 5 915 5 HOH HOH . K 6 HOH A 6 916 6 HOH HOH . K 6 HOH A 7 917 7 HOH HOH . K 6 HOH A 8 918 9 HOH HOH . K 6 HOH A 9 919 10 HOH HOH . K 6 HOH A 10 920 11 HOH HOH . K 6 HOH A 11 921 12 HOH HOH . K 6 HOH A 12 922 13 HOH HOH . K 6 HOH A 13 923 14 HOH HOH . K 6 HOH A 14 924 15 HOH HOH . K 6 HOH A 15 925 17 HOH HOH . K 6 HOH A 16 926 18 HOH HOH . K 6 HOH A 17 927 19 HOH HOH . K 6 HOH A 18 928 21 HOH HOH . K 6 HOH A 19 929 23 HOH HOH . K 6 HOH A 20 930 24 HOH HOH . K 6 HOH A 21 931 25 HOH HOH . K 6 HOH A 22 932 26 HOH HOH . K 6 HOH A 23 933 27 HOH HOH . K 6 HOH A 24 934 28 HOH HOH . K 6 HOH A 25 935 29 HOH HOH . K 6 HOH A 26 936 30 HOH HOH . K 6 HOH A 27 937 31 HOH HOH . K 6 HOH A 28 938 32 HOH HOH . K 6 HOH A 29 939 33 HOH HOH . K 6 HOH A 30 940 34 HOH HOH . K 6 HOH A 31 941 37 HOH HOH . K 6 HOH A 32 942 38 HOH HOH . K 6 HOH A 33 943 39 HOH HOH . K 6 HOH A 34 944 40 HOH HOH . K 6 HOH A 35 945 42 HOH HOH . K 6 HOH A 36 946 43 HOH HOH . K 6 HOH A 37 947 44 HOH HOH . K 6 HOH A 38 948 45 HOH HOH . K 6 HOH A 39 949 46 HOH HOH . K 6 HOH A 40 950 48 HOH HOH . K 6 HOH A 41 951 49 HOH HOH . K 6 HOH A 42 952 50 HOH HOH . K 6 HOH A 43 953 52 HOH HOH . K 6 HOH A 44 954 54 HOH HOH . K 6 HOH A 45 955 55 HOH HOH . K 6 HOH A 46 956 56 HOH HOH . K 6 HOH A 47 957 57 HOH HOH . K 6 HOH A 48 958 58 HOH HOH . K 6 HOH A 49 959 59 HOH HOH . K 6 HOH A 50 960 61 HOH HOH . K 6 HOH A 51 961 62 HOH HOH . K 6 HOH A 52 962 63 HOH HOH . K 6 HOH A 53 963 64 HOH HOH . K 6 HOH A 54 964 65 HOH HOH . K 6 HOH A 55 965 66 HOH HOH . K 6 HOH A 56 966 67 HOH HOH . K 6 HOH A 57 967 68 HOH HOH . K 6 HOH A 58 968 69 HOH HOH . K 6 HOH A 59 969 70 HOH HOH . K 6 HOH A 60 970 71 HOH HOH . K 6 HOH A 61 971 72 HOH HOH . K 6 HOH A 62 972 73 HOH HOH . K 6 HOH A 63 973 74 HOH HOH . K 6 HOH A 64 974 75 HOH HOH . K 6 HOH A 65 975 76 HOH HOH . K 6 HOH A 66 976 77 HOH HOH . K 6 HOH A 67 977 78 HOH HOH . K 6 HOH A 68 978 79 HOH HOH . K 6 HOH A 69 979 80 HOH HOH . K 6 HOH A 70 980 81 HOH HOH . K 6 HOH A 71 981 82 HOH HOH . K 6 HOH A 72 982 83 HOH HOH . K 6 HOH A 73 983 84 HOH HOH . K 6 HOH A 74 984 85 HOH HOH . K 6 HOH A 75 985 86 HOH HOH . K 6 HOH A 76 986 87 HOH HOH . K 6 HOH A 77 987 88 HOH HOH . K 6 HOH A 78 988 89 HOH HOH . K 6 HOH A 79 989 90 HOH HOH . K 6 HOH A 80 990 91 HOH HOH . K 6 HOH A 81 991 92 HOH HOH . K 6 HOH A 82 992 93 HOH HOH . K 6 HOH A 83 993 95 HOH HOH . K 6 HOH A 84 994 96 HOH HOH . K 6 HOH A 85 995 97 HOH HOH . K 6 HOH A 86 996 98 HOH HOH . K 6 HOH A 87 997 99 HOH HOH . K 6 HOH A 88 998 100 HOH HOH . K 6 HOH A 89 999 101 HOH HOH . K 6 HOH A 90 1000 105 HOH HOH . K 6 HOH A 91 1001 106 HOH HOH . K 6 HOH A 92 1002 108 HOH HOH . K 6 HOH A 93 1003 109 HOH HOH . K 6 HOH A 94 1004 112 HOH HOH . K 6 HOH A 95 1005 113 HOH HOH . K 6 HOH A 96 1006 116 HOH HOH . K 6 HOH A 97 1007 117 HOH HOH . K 6 HOH A 98 1008 118 HOH HOH . K 6 HOH A 99 1009 119 HOH HOH . K 6 HOH A 100 1010 120 HOH HOH . K 6 HOH A 101 1011 122 HOH HOH . K 6 HOH A 102 1012 123 HOH HOH . K 6 HOH A 103 1013 124 HOH HOH . K 6 HOH A 104 1014 128 HOH HOH . K 6 HOH A 105 1015 129 HOH HOH . K 6 HOH A 106 1016 130 HOH HOH . K 6 HOH A 107 1017 131 HOH HOH . K 6 HOH A 108 1018 132 HOH HOH . K 6 HOH A 109 1019 134 HOH HOH . K 6 HOH A 110 1020 135 HOH HOH . K 6 HOH A 111 1021 136 HOH HOH . K 6 HOH A 112 1022 137 HOH HOH . K 6 HOH A 113 1023 138 HOH HOH . K 6 HOH A 114 1024 139 HOH HOH . K 6 HOH A 115 1025 140 HOH HOH . K 6 HOH A 116 1026 141 HOH HOH . K 6 HOH A 117 1027 142 HOH HOH . K 6 HOH A 118 1028 143 HOH HOH . K 6 HOH A 119 1029 146 HOH HOH . K 6 HOH A 120 1030 147 HOH HOH . K 6 HOH A 121 1031 148 HOH HOH . K 6 HOH A 122 1032 149 HOH HOH . K 6 HOH A 123 1033 150 HOH HOH . K 6 HOH A 124 1034 151 HOH HOH . K 6 HOH A 125 1035 152 HOH HOH . K 6 HOH A 126 1036 153 HOH HOH . K 6 HOH A 127 1037 155 HOH HOH . K 6 HOH A 128 1038 156 HOH HOH . K 6 HOH A 129 1039 157 HOH HOH . K 6 HOH A 130 1040 158 HOH HOH . K 6 HOH A 131 1041 159 HOH HOH . K 6 HOH A 132 1042 160 HOH HOH . K 6 HOH A 133 1043 161 HOH HOH . K 6 HOH A 134 1044 162 HOH HOH . K 6 HOH A 135 1045 164 HOH HOH . K 6 HOH A 136 1046 165 HOH HOH . K 6 HOH A 137 1047 166 HOH HOH . K 6 HOH A 138 1048 167 HOH HOH . K 6 HOH A 139 1049 168 HOH HOH . K 6 HOH A 140 1050 170 HOH HOH . K 6 HOH A 141 1051 171 HOH HOH . K 6 HOH A 142 1052 172 HOH HOH . K 6 HOH A 143 1053 173 HOH HOH . K 6 HOH A 144 1054 174 HOH HOH . K 6 HOH A 145 1055 175 HOH HOH . K 6 HOH A 146 1056 176 HOH HOH . K 6 HOH A 147 1057 178 HOH HOH . K 6 HOH A 148 1058 179 HOH HOH . K 6 HOH A 149 1059 181 HOH HOH . K 6 HOH A 150 1060 184 HOH HOH . K 6 HOH A 151 1061 186 HOH HOH . K 6 HOH A 152 1062 187 HOH HOH . K 6 HOH A 153 1063 190 HOH HOH . K 6 HOH A 154 1064 191 HOH HOH . K 6 HOH A 155 1065 193 HOH HOH . K 6 HOH A 156 1066 195 HOH HOH . K 6 HOH A 157 1067 196 HOH HOH . K 6 HOH A 158 1068 197 HOH HOH . K 6 HOH A 159 1069 198 HOH HOH . K 6 HOH A 160 1070 201 HOH HOH . K 6 HOH A 161 1071 202 HOH HOH . K 6 HOH A 162 1072 203 HOH HOH . K 6 HOH A 163 1073 204 HOH HOH . K 6 HOH A 164 1074 206 HOH HOH . K 6 HOH A 165 1075 209 HOH HOH . K 6 HOH A 166 1076 210 HOH HOH . K 6 HOH A 167 1077 213 HOH HOH . K 6 HOH A 168 1078 214 HOH HOH . K 6 HOH A 169 1079 216 HOH HOH . K 6 HOH A 170 1080 217 HOH HOH . K 6 HOH A 171 1081 218 HOH HOH . K 6 HOH A 172 1082 219 HOH HOH . K 6 HOH A 173 1083 221 HOH HOH . K 6 HOH A 174 1084 222 HOH HOH . K 6 HOH A 175 1085 223 HOH HOH . K 6 HOH A 176 1086 227 HOH HOH . K 6 HOH A 177 1087 228 HOH HOH . K 6 HOH A 178 1088 229 HOH HOH . K 6 HOH A 179 1089 230 HOH HOH . K 6 HOH A 180 1090 231 HOH HOH . K 6 HOH A 181 1091 234 HOH HOH . K 6 HOH A 182 1092 236 HOH HOH . K 6 HOH A 183 1093 237 HOH HOH . K 6 HOH A 184 1094 239 HOH HOH . K 6 HOH A 185 1095 241 HOH HOH . K 6 HOH A 186 1096 242 HOH HOH . K 6 HOH A 187 1097 244 HOH HOH . K 6 HOH A 188 1098 246 HOH HOH . K 6 HOH A 189 1099 248 HOH HOH . K 6 HOH A 190 1100 249 HOH HOH . K 6 HOH A 191 1101 250 HOH HOH . K 6 HOH A 192 1102 252 HOH HOH . K 6 HOH A 193 1103 253 HOH HOH . K 6 HOH A 194 1104 254 HOH HOH . K 6 HOH A 195 1105 256 HOH HOH . K 6 HOH A 196 1106 257 HOH HOH . K 6 HOH A 197 1107 258 HOH HOH . K 6 HOH A 198 1108 260 HOH HOH . K 6 HOH A 199 1109 261 HOH HOH . K 6 HOH A 200 1110 262 HOH HOH . K 6 HOH A 201 1111 263 HOH HOH . K 6 HOH A 202 1112 265 HOH HOH . K 6 HOH A 203 1113 266 HOH HOH . K 6 HOH A 204 1114 268 HOH HOH . K 6 HOH A 205 1115 271 HOH HOH . K 6 HOH A 206 1116 272 HOH HOH . K 6 HOH A 207 1117 273 HOH HOH . K 6 HOH A 208 1118 274 HOH HOH . K 6 HOH A 209 1119 276 HOH HOH . K 6 HOH A 210 1120 277 HOH HOH . K 6 HOH A 211 1121 278 HOH HOH . K 6 HOH A 212 1122 279 HOH HOH . K 6 HOH A 213 1123 280 HOH HOH . K 6 HOH A 214 1124 281 HOH HOH . K 6 HOH A 215 1125 282 HOH HOH . K 6 HOH A 216 1126 285 HOH HOH . K 6 HOH A 217 1127 286 HOH HOH . K 6 HOH A 218 1128 287 HOH HOH . K 6 HOH A 219 1129 288 HOH HOH . K 6 HOH A 220 1130 289 HOH HOH . K 6 HOH A 221 1131 290 HOH HOH . K 6 HOH A 222 1132 291 HOH HOH . K 6 HOH A 223 1133 292 HOH HOH . K 6 HOH A 224 1134 293 HOH HOH . K 6 HOH A 225 1135 295 HOH HOH . K 6 HOH A 226 1136 296 HOH HOH . K 6 HOH A 227 1137 299 HOH HOH . K 6 HOH A 228 1138 300 HOH HOH . K 6 HOH A 229 1139 301 HOH HOH . K 6 HOH A 230 1140 302 HOH HOH . K 6 HOH A 231 1141 304 HOH HOH . K 6 HOH A 232 1142 306 HOH HOH . K 6 HOH A 233 1143 309 HOH HOH . K 6 HOH A 234 1144 310 HOH HOH . K 6 HOH A 235 1145 311 HOH HOH . K 6 HOH A 236 1146 312 HOH HOH . K 6 HOH A 237 1147 313 HOH HOH . K 6 HOH A 238 1148 314 HOH HOH . K 6 HOH A 239 1149 315 HOH HOH . K 6 HOH A 240 1150 319 HOH HOH . K 6 HOH A 241 1151 320 HOH HOH . K 6 HOH A 242 1152 322 HOH HOH . K 6 HOH A 243 1153 323 HOH HOH . K 6 HOH A 244 1154 324 HOH HOH . K 6 HOH A 245 1155 325 HOH HOH . K 6 HOH A 246 1156 326 HOH HOH . K 6 HOH A 247 1157 327 HOH HOH . K 6 HOH A 248 1158 328 HOH HOH . K 6 HOH A 249 1159 330 HOH HOH . K 6 HOH A 250 1160 332 HOH HOH . K 6 HOH A 251 1161 334 HOH HOH . K 6 HOH A 252 1162 336 HOH HOH . K 6 HOH A 253 1163 338 HOH HOH . K 6 HOH A 254 1164 339 HOH HOH . K 6 HOH A 255 1165 340 HOH HOH . K 6 HOH A 256 1166 341 HOH HOH . K 6 HOH A 257 1167 345 HOH HOH . K 6 HOH A 258 1168 346 HOH HOH . K 6 HOH A 259 1169 347 HOH HOH . K 6 HOH A 260 1170 349 HOH HOH . K 6 HOH A 261 1171 351 HOH HOH . K 6 HOH A 262 1172 352 HOH HOH . K 6 HOH A 263 1173 353 HOH HOH . K 6 HOH A 264 1174 354 HOH HOH . K 6 HOH A 265 1175 356 HOH HOH . K 6 HOH A 266 1176 357 HOH HOH . K 6 HOH A 267 1177 358 HOH HOH . K 6 HOH A 268 1178 362 HOH HOH . K 6 HOH A 269 1179 363 HOH HOH . K 6 HOH A 270 1180 364 HOH HOH . K 6 HOH A 271 1181 366 HOH HOH . K 6 HOH A 272 1182 368 HOH HOH . K 6 HOH A 273 1183 369 HOH HOH . K 6 HOH A 274 1184 370 HOH HOH . K 6 HOH A 275 1185 371 HOH HOH . K 6 HOH A 276 1186 372 HOH HOH . K 6 HOH A 277 1187 373 HOH HOH . K 6 HOH A 278 1188 374 HOH HOH . K 6 HOH A 279 1189 375 HOH HOH . L 6 HOH T 1 19 8 HOH HOH . L 6 HOH T 2 20 20 HOH HOH . L 6 HOH T 3 47 47 HOH HOH . L 6 HOH T 4 51 51 HOH HOH . L 6 HOH T 5 53 53 HOH HOH . L 6 HOH T 6 103 103 HOH HOH . L 6 HOH T 7 104 104 HOH HOH . L 6 HOH T 8 107 107 HOH HOH . L 6 HOH T 9 110 110 HOH HOH . L 6 HOH T 10 115 115 HOH HOH . L 6 HOH T 11 169 169 HOH HOH . L 6 HOH T 12 177 177 HOH HOH . L 6 HOH T 13 180 180 HOH HOH . L 6 HOH T 14 182 182 HOH HOH . L 6 HOH T 15 205 205 HOH HOH . L 6 HOH T 16 208 208 HOH HOH . L 6 HOH T 17 215 215 HOH HOH . L 6 HOH T 18 225 225 HOH HOH . L 6 HOH T 19 245 245 HOH HOH . L 6 HOH T 20 251 251 HOH HOH . L 6 HOH T 21 317 317 HOH HOH . L 6 HOH T 22 329 329 HOH HOH . L 6 HOH T 23 335 335 HOH HOH . L 6 HOH T 24 344 344 HOH HOH . L 6 HOH T 25 360 360 HOH HOH . L 6 HOH T 26 365 365 HOH HOH . M 6 HOH P 1 35 35 HOH HOH . M 6 HOH P 2 116 111 HOH HOH . M 6 HOH P 3 117 114 HOH HOH . M 6 HOH P 4 183 183 HOH HOH . M 6 HOH P 5 185 185 HOH HOH . M 6 HOH P 6 232 232 HOH HOH . M 6 HOH P 7 243 243 HOH HOH . M 6 HOH P 8 294 294 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PA TTP . . . D 4 0.086 -10.578 49.377 1 49.08 ? PA TTP 904 A 1 HETATM 2 O O1A TTP . . . D 4 0.756 -11.393 48.301 1 52.06 ? O1A TTP 904 A 1 HETATM 3 O O2A TTP . . . D 4 0.641 -10.954 50.727 1 51.27 ? O2A TTP 904 A 1 HETATM 4 O O3A TTP . . . D 4 -1.495 -10.857 49.36 1 49.98 ? O3A TTP 904 A 1 HETATM 5 P PB TTP . . . D 4 -2.61 -10.061 50.213 1 46.93 ? PB TTP 904 A 1 HETATM 6 O O1B TTP . . . D 4 -3.142 -8.924 49.39 1 47.1 ? O1B TTP 904 A 1 HETATM 7 O O2B TTP . . . D 4 -2.154 -9.576 51.557 1 46.94 ? O2B TTP 904 A 1 HETATM 8 O O3B TTP . . . D 4 -3.723 -11.195 50.363 1 45.65 ? O3B TTP 904 A 1 HETATM 9 P PG TTP . . . D 4 -3.436 -12.594 51.087 1 45.28 ? PG TTP 904 A 1 HETATM 10 O O1G TTP . . . D 4 -2.103 -12.534 51.787 1 46.33 ? O1G TTP 904 A 1 HETATM 11 O O2G TTP . . . D 4 -4.539 -12.856 52.083 1 46.66 ? O2G TTP 904 A 1 HETATM 12 O O3G TTP . . . D 4 -3.461 -13.692 50.055 1 45.82 ? O3G TTP 904 A 1 HETATM 13 O O5' TTP . . . D 4 0.239 -9.015 49.023 1 46.91 ? O5' TTP 904 A 1 HETATM 14 C C5' TTP . . . D 4 0.158 -7.982 50.003 1 41.89 ? C5' TTP 904 A 1 HETATM 15 C C4' TTP . . . D 4 -0.207 -6.681 49.311 1 40.25 ? C4' TTP 904 A 1 HETATM 16 O O4' TTP . . . D 4 0.643 -6.454 48.182 1 42.42 ? O4' TTP 904 A 1 HETATM 17 C C3' TTP . . . D 4 -1.597 -6.709 48.715 1 40.16 ? C3' TTP 904 A 1 HETATM 18 O O3' TTP . . . D 4 -2.604 -6.339 49.658 1 40.2 ? O3' TTP 904 A 1 HETATM 19 C C2' TTP . . . D 4 -1.497 -5.732 47.56 1 42.04 ? C2' TTP 904 A 1 HETATM 20 C C1' TTP . . . D 4 -0.064 -5.873 47.065 1 41.49 ? C1' TTP 904 A 1 HETATM 21 N N1 TTP . . . D 4 -0.121 -6.757 45.877 1 40.25 ? N1 TTP 904 A 1 HETATM 22 C C2 TTP . . . D 4 -0.46 -6.201 44.616 1 39.1 ? C2 TTP 904 A 1 HETATM 23 O O2 TTP . . . D 4 -0.677 -4.968 44.522 1 39.11 ? O2 TTP 904 A 1 HETATM 24 N N3 TTP . . . D 4 -0.549 -6.973 43.523 1 38.63 ? N3 TTP 904 A 1 HETATM 25 C C4 TTP . . . D 4 -0.324 -8.296 43.593 1 41.04 ? C4 TTP 904 A 1 HETATM 26 O O4 TTP . . . D 4 -0.414 -9.027 42.575 1 42.74 ? O4 TTP 904 A 1 HETATM 27 C C5 TTP . . . D 4 0.024 -8.908 44.901 1 40.47 ? C5 TTP 904 A 1 HETATM 28 C C5M TTP . . . D 4 0.28 -10.396 45.038 1 40.82 ? C5M TTP 904 A 1 HETATM 29 C C6 TTP . . . D 4 0.098 -8.076 46.003 1 39.02 ? C6 TTP 904 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 23 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 333 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 29 #