data_3NNG # _model_server_result.job_id zP0BnOA_pp9J6Ec5YtUECA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 15:33:09' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3nng # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":402}' # _entry.id 3NNG # _exptl.entry_id 3NNG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3NNG _cell.length_a 57.208 _cell.length_b 62.463 _cell.length_c 72.001 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3NNG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E 1 1 B,D,F 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O LEU 41 A LEU 218 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 44 A ASP 221 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? metalc ? metalc3 A O GLU 46 A GLU 223 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc4 A O THR 49 A THR 226 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc5 A OG1 THR 49 A THR 226 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? metalc ? metalc6 A O ALA 152 A ALA 329 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 153 A GLU 330 1_555 C CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc8 B O LEU 41 B LEU 218 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc9 B OD1 ASP 44 B ASP 221 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc10 B O GLU 46 B GLU 223 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc11 B OG1 THR 49 B THR 226 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc ? metalc12 B O THR 49 B THR 226 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc13 B O ALA 152 B ALA 329 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc14 B OE2 GLU 153 B GLU 330 1_555 D CA CA . B CA 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3NNG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01748 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016009 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013889 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 402 402 CA CA . D 2 CA B 1 401 401 CA CA . E 3 HOH A 1 502 502 HOH WAT . E 3 HOH A 2 504 504 HOH WAT . E 3 HOH A 3 506 506 HOH WAT . E 3 HOH A 4 508 508 HOH WAT . E 3 HOH A 5 509 509 HOH WAT . E 3 HOH A 6 510 510 HOH WAT . E 3 HOH A 7 511 511 HOH WAT . E 3 HOH A 8 512 512 HOH WAT . E 3 HOH A 9 513 513 HOH WAT . E 3 HOH A 10 514 514 HOH WAT . E 3 HOH A 11 515 515 HOH WAT . E 3 HOH A 12 516 516 HOH WAT . E 3 HOH A 13 517 517 HOH WAT . E 3 HOH A 14 520 520 HOH WAT . E 3 HOH A 15 521 521 HOH WAT . E 3 HOH A 16 523 523 HOH WAT . E 3 HOH A 17 525 525 HOH WAT . E 3 HOH A 18 526 526 HOH WAT . E 3 HOH A 19 527 527 HOH WAT . E 3 HOH A 20 529 529 HOH WAT . E 3 HOH A 21 530 530 HOH WAT . E 3 HOH A 22 531 531 HOH WAT . E 3 HOH A 23 532 532 HOH WAT . E 3 HOH A 24 534 534 HOH WAT . E 3 HOH A 25 535 535 HOH WAT . E 3 HOH A 26 536 536 HOH WAT . E 3 HOH A 27 537 537 HOH WAT . E 3 HOH A 28 538 538 HOH WAT . E 3 HOH A 29 541 541 HOH WAT . E 3 HOH A 30 543 543 HOH WAT . E 3 HOH A 31 544 544 HOH WAT . E 3 HOH A 32 545 545 HOH WAT . E 3 HOH A 33 546 546 HOH WAT . E 3 HOH A 34 549 549 HOH WAT . E 3 HOH A 35 550 550 HOH WAT . E 3 HOH A 36 551 551 HOH WAT . E 3 HOH A 37 552 552 HOH WAT . E 3 HOH A 38 555 555 HOH WAT . E 3 HOH A 39 556 556 HOH WAT . E 3 HOH A 40 558 558 HOH WAT . E 3 HOH A 41 561 561 HOH WAT . E 3 HOH A 42 562 562 HOH WAT . E 3 HOH A 43 564 564 HOH WAT . E 3 HOH A 44 565 565 HOH WAT . E 3 HOH A 45 566 566 HOH WAT . E 3 HOH A 46 570 570 HOH WAT . E 3 HOH A 47 571 571 HOH WAT . E 3 HOH A 48 574 574 HOH WAT . E 3 HOH A 49 576 576 HOH WAT . E 3 HOH A 50 579 579 HOH WAT . E 3 HOH A 51 580 580 HOH WAT . E 3 HOH A 52 583 583 HOH WAT . E 3 HOH A 53 584 584 HOH WAT . E 3 HOH A 54 587 587 HOH WAT . E 3 HOH A 55 592 592 HOH WAT . E 3 HOH A 56 596 596 HOH WAT . E 3 HOH A 57 598 598 HOH WAT . E 3 HOH A 58 602 602 HOH WAT . E 3 HOH A 59 604 604 HOH WAT . E 3 HOH A 60 605 605 HOH WAT . E 3 HOH A 61 606 606 HOH WAT . E 3 HOH A 62 607 607 HOH WAT . E 3 HOH A 63 608 608 HOH WAT . E 3 HOH A 64 609 609 HOH WAT . F 3 HOH B 1 501 501 HOH WAT . F 3 HOH B 2 503 503 HOH WAT . F 3 HOH B 3 505 505 HOH WAT . F 3 HOH B 4 507 507 HOH WAT . F 3 HOH B 5 518 518 HOH WAT . F 3 HOH B 6 519 519 HOH WAT . F 3 HOH B 7 522 522 HOH WAT . F 3 HOH B 8 524 524 HOH WAT . F 3 HOH B 9 528 528 HOH WAT . F 3 HOH B 10 533 533 HOH WAT . F 3 HOH B 11 539 539 HOH WAT . F 3 HOH B 12 540 540 HOH WAT . F 3 HOH B 13 542 542 HOH WAT . F 3 HOH B 14 547 547 HOH WAT . F 3 HOH B 15 548 548 HOH WAT . F 3 HOH B 16 553 553 HOH WAT . F 3 HOH B 17 554 554 HOH WAT . F 3 HOH B 18 557 557 HOH WAT . F 3 HOH B 19 559 559 HOH WAT . F 3 HOH B 20 560 560 HOH WAT . F 3 HOH B 21 563 563 HOH WAT . F 3 HOH B 22 567 567 HOH WAT . F 3 HOH B 23 568 568 HOH WAT . F 3 HOH B 24 569 569 HOH WAT . F 3 HOH B 25 572 572 HOH WAT . F 3 HOH B 26 573 573 HOH WAT . F 3 HOH B 27 575 575 HOH WAT . F 3 HOH B 28 577 577 HOH WAT . F 3 HOH B 29 578 578 HOH WAT . F 3 HOH B 30 581 581 HOH WAT . F 3 HOH B 31 582 582 HOH WAT . F 3 HOH B 32 585 585 HOH WAT . F 3 HOH B 33 586 586 HOH WAT . F 3 HOH B 34 588 588 HOH WAT . F 3 HOH B 35 589 589 HOH WAT . F 3 HOH B 36 590 590 HOH WAT . F 3 HOH B 37 591 591 HOH WAT . F 3 HOH B 38 593 593 HOH WAT . F 3 HOH B 39 594 594 HOH WAT . F 3 HOH B 40 595 595 HOH WAT . F 3 HOH B 41 597 597 HOH WAT . F 3 HOH B 42 599 599 HOH WAT . F 3 HOH B 43 600 600 HOH WAT . F 3 HOH B 44 601 601 HOH WAT . F 3 HOH B 45 603 603 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 64.927 _atom_site.Cartn_y 16.831 _atom_site.Cartn_z 45.527 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 22.95 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 402 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 58 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 1 #